MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 megaplasmid

Total Repeats: 2201

< Previous12345Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_012811	GC	3	6	1172346	1172351	0 %	0 %	50 %	50 %	240142836
2002	NC_012811	GC	3	6	1175483	1175488	0 %	0 %	50 %	50 %	240142842
2003	NC_012811	GC	3	6	1175835	1175840	0 %	0 %	50 %	50 %	240142843
2004	NC_012811	TC	3	6	1177479	1177484	0 %	50 %	0 %	50 %	240142845
2005	NC_012811	CG	3	6	1179360	1179365	0 %	0 %	50 %	50 %	240142848
2006	NC_012811	GC	3	6	1180914	1180919	0 %	0 %	50 %	50 %	240142850
2007	NC_012811	CG	3	6	1181261	1181266	0 %	0 %	50 %	50 %	240142851
2008	NC_012811	GC	3	6	1181569	1181574	0 %	0 %	50 %	50 %	240142851
2009	NC_012811	CG	3	6	1181690	1181695	0 %	0 %	50 %	50 %	240142851
2010	NC_012811	GC	3	6	1182458	1182463	0 %	0 %	50 %	50 %	240142852
2011	NC_012811	TC	3	6	1182717	1182722	0 %	50 %	0 %	50 %	240142853
2012	NC_012811	CG	3	6	1183386	1183391	0 %	0 %	50 %	50 %	240142854
2013	NC_012811	GC	3	6	1184518	1184523	0 %	0 %	50 %	50 %	240142856
2014	NC_012811	GC	3	6	1184813	1184818	0 %	0 %	50 %	50 %	240142856
2015	NC_012811	AG	3	6	1185393	1185398	50 %	0 %	50 %	0 %	240142856
2016	NC_012811	CT	3	6	1185785	1185790	0 %	50 %	0 %	50 %	240142857
2017	NC_012811	GC	3	6	1185855	1185860	0 %	0 %	50 %	50 %	240142857
2018	NC_012811	GC	3	6	1187316	1187321	0 %	0 %	50 %	50 %	240142860
2019	NC_012811	GC	4	8	1187913	1187920	0 %	0 %	50 %	50 %	240142862
2020	NC_012811	CG	3	6	1188930	1188935	0 %	0 %	50 %	50 %	240142863
2021	NC_012811	CG	3	6	1188951	1188956	0 %	0 %	50 %	50 %	240142863
2022	NC_012811	GA	3	6	1189225	1189230	50 %	0 %	50 %	0 %	240142863
2023	NC_012811	CG	3	6	1190031	1190036	0 %	0 %	50 %	50 %	240142865
2024	NC_012811	GC	4	8	1190174	1190181	0 %	0 %	50 %	50 %	240142865
2025	NC_012811	CG	3	6	1190516	1190521	0 %	0 %	50 %	50 %	240142865
2026	NC_012811	CG	3	6	1190960	1190965	0 %	0 %	50 %	50 %	240142866
2027	NC_012811	GC	3	6	1191053	1191058	0 %	0 %	50 %	50 %	240142866
2028	NC_012811	GC	3	6	1192054	1192059	0 %	0 %	50 %	50 %	240142869
2029	NC_012811	CG	3	6	1192235	1192240	0 %	0 %	50 %	50 %	240142869
2030	NC_012811	CG	3	6	1193437	1193442	0 %	0 %	50 %	50 %	240142870
2031	NC_012811	CG	3	6	1194327	1194332	0 %	0 %	50 %	50 %	240142871
2032	NC_012811	CG	3	6	1194889	1194894	0 %	0 %	50 %	50 %	240142872
2033	NC_012811	CG	7	14	1197246	1197259	0 %	0 %	50 %	50 %	240142873
2034	NC_012811	CG	3	6	1197290	1197295	0 %	0 %	50 %	50 %	240142873
2035	NC_012811	CG	3	6	1197387	1197392	0 %	0 %	50 %	50 %	240142873
2036	NC_012811	CG	3	6	1197419	1197424	0 %	0 %	50 %	50 %	240142873
2037	NC_012811	GC	3	6	1198097	1198102	0 %	0 %	50 %	50 %	240142874
2038	NC_012811	GC	3	6	1198537	1198542	0 %	0 %	50 %	50 %	240142874
2039	NC_012811	GC	3	6	1198782	1198787	0 %	0 %	50 %	50 %	240142874
2040	NC_012811	GC	4	8	1199573	1199580	0 %	0 %	50 %	50 %	240142876
2041	NC_012811	GC	3	6	1200326	1200331	0 %	0 %	50 %	50 %	240142877
2042	NC_012811	GC	3	6	1200616	1200621	0 %	0 %	50 %	50 %	240142877
2043	NC_012811	AC	3	6	1201700	1201705	50 %	0 %	0 %	50 %	240142877
2044	NC_012811	CG	3	6	1201866	1201871	0 %	0 %	50 %	50 %	240142877
2045	NC_012811	CG	3	6	1202399	1202404	0 %	0 %	50 %	50 %	240142877
2046	NC_012811	CG	3	6	1203945	1203950	0 %	0 %	50 %	50 %	240142878
2047	NC_012811	CG	3	6	1204040	1204045	0 %	0 %	50 %	50 %	240142878
2048	NC_012811	GC	3	6	1204778	1204783	0 %	0 %	50 %	50 %	240142878
2049	NC_012811	GC	3	6	1205032	1205037	0 %	0 %	50 %	50 %	240142878
2050	NC_012811	CG	3	6	1205693	1205698	0 %	0 %	50 %	50 %	240142879
2051	NC_012811	CG	3	6	1205731	1205736	0 %	0 %	50 %	50 %	240142879
2052	NC_012811	GC	3	6	1207559	1207564	0 %	0 %	50 %	50 %	240142880
2053	NC_012811	GC	3	6	1207982	1207987	0 %	0 %	50 %	50 %	240142880
2054	NC_012811	CA	3	6	1208233	1208238	50 %	0 %	0 %	50 %	240142880
2055	NC_012811	GC	3	6	1208364	1208369	0 %	0 %	50 %	50 %	240142880
2056	NC_012811	CG	3	6	1209611	1209616	0 %	0 %	50 %	50 %	240142882
2057	NC_012811	CG	3	6	1209644	1209649	0 %	0 %	50 %	50 %	240142882
2058	NC_012811	GC	3	6	1209722	1209727	0 %	0 %	50 %	50 %	240142882
2059	NC_012811	CG	3	6	1209830	1209835	0 %	0 %	50 %	50 %	240142882
2060	NC_012811	GC	4	8	1210005	1210012	0 %	0 %	50 %	50 %	240142882
2061	NC_012811	GC	4	8	1210832	1210839	0 %	0 %	50 %	50 %	240142884
2062	NC_012811	GC	3	6	1210990	1210995	0 %	0 %	50 %	50 %	240142884
2063	NC_012811	GC	3	6	1211194	1211199	0 %	0 %	50 %	50 %	240142884
2064	NC_012811	CG	3	6	1211368	1211373	0 %	0 %	50 %	50 %	240142884
2065	NC_012811	CG	3	6	1211811	1211816	0 %	0 %	50 %	50 %	240142885
2066	NC_012811	GC	3	6	1211857	1211862	0 %	0 %	50 %	50 %	240142885
2067	NC_012811	GC	3	6	1212020	1212025	0 %	0 %	50 %	50 %	240142885
2068	NC_012811	CG	3	6	1212800	1212805	0 %	0 %	50 %	50 %	240142885
2069	NC_012811	GC	3	6	1213290	1213295	0 %	0 %	50 %	50 %	240142886
2070	NC_012811	GC	3	6	1213493	1213498	0 %	0 %	50 %	50 %	240142886
2071	NC_012811	GC	3	6	1213545	1213550	0 %	0 %	50 %	50 %	240142886
2072	NC_012811	CG	3	6	1213574	1213579	0 %	0 %	50 %	50 %	240142886
2073	NC_012811	CG	3	6	1213666	1213671	0 %	0 %	50 %	50 %	240142886
2074	NC_012811	TC	3	6	1213969	1213974	0 %	50 %	0 %	50 %	240142886
2075	NC_012811	GC	3	6	1214324	1214329	0 %	0 %	50 %	50 %	240142886
2076	NC_012811	GC	3	6	1214566	1214571	0 %	0 %	50 %	50 %	240142886
2077	NC_012811	GC	3	6	1214626	1214631	0 %	0 %	50 %	50 %	240142886
2078	NC_012811	CG	4	8	1214991	1214998	0 %	0 %	50 %	50 %	240142887
2079	NC_012811	CG	3	6	1215480	1215485	0 %	0 %	50 %	50 %	240142888
2080	NC_012811	CT	3	6	1215588	1215593	0 %	50 %	0 %	50 %	240142888
2081	NC_012811	GC	3	6	1215767	1215772	0 %	0 %	50 %	50 %	240142888
2082	NC_012811	CG	3	6	1216623	1216628	0 %	0 %	50 %	50 %	240142889
2083	NC_012811	CG	3	6	1216678	1216683	0 %	0 %	50 %	50 %	240142889
2084	NC_012811	GC	4	8	1216855	1216862	0 %	0 %	50 %	50 %	240142889
2085	NC_012811	GC	3	6	1217469	1217474	0 %	0 %	50 %	50 %	240142890
2086	NC_012811	GC	4	8	1219302	1219309	0 %	0 %	50 %	50 %	240142894
2087	NC_012811	GC	3	6	1220149	1220154	0 %	0 %	50 %	50 %	240142894
2088	NC_012811	CG	4	8	1221298	1221305	0 %	0 %	50 %	50 %	240142896
2089	NC_012811	GC	3	6	1222448	1222453	0 %	0 %	50 %	50 %	240142897
2090	NC_012811	GC	3	6	1222488	1222493	0 %	0 %	50 %	50 %	240142897
2091	NC_012811	CG	4	8	1222726	1222733	0 %	0 %	50 %	50 %	240142897
2092	NC_012811	CG	3	6	1223030	1223035	0 %	0 %	50 %	50 %	240142897
2093	NC_012811	CG	3	6	1223045	1223050	0 %	0 %	50 %	50 %	240142897
2094	NC_012811	GC	4	8	1223079	1223086	0 %	0 %	50 %	50 %	240142897
2095	NC_012811	CG	3	6	1223139	1223144	0 %	0 %	50 %	50 %	240142897
2096	NC_012811	CG	3	6	1223185	1223190	0 %	0 %	50 %	50 %	240142897
2097	NC_012811	GC	3	6	1223271	1223276	0 %	0 %	50 %	50 %	240142897
2098	NC_012811	CT	3	6	1223527	1223532	0 %	50 %	0 %	50 %	240142897
2099	NC_012811	GC	3	6	1223715	1223720	0 %	0 %	50 %	50 %	240142897
2100	NC_012811	CG	3	6	1223855	1223860	0 %	0 %	50 %	50 %	240142897
2101	NC_012811	GC	3	6	1223898	1223903	0 %	0 %	50 %	50 %	240142897
2102	NC_012811	GC	3	6	1223961	1223966	0 %	0 %	50 %	50 %	240142897
2103	NC_012811	TC	3	6	1224251	1224256	0 %	50 %	0 %	50 %	240142897
2104	NC_012811	CG	3	6	1224500	1224505	0 %	0 %	50 %	50 %	240142897
2105	NC_012811	CG	3	6	1225260	1225265	0 %	0 %	50 %	50 %	240142897
2106	NC_012811	GC	3	6	1225295	1225300	0 %	0 %	50 %	50 %	240142897
2107	NC_012811	CG	3	6	1225743	1225748	0 %	0 %	50 %	50 %	240142898
2108	NC_012811	CT	3	6	1226090	1226095	0 %	50 %	0 %	50 %	240142898
2109	NC_012811	CG	3	6	1226448	1226453	0 %	0 %	50 %	50 %	240142899
2110	NC_012811	GC	3	6	1226458	1226463	0 %	0 %	50 %	50 %	240142899
2111	NC_012811	GC	3	6	1226509	1226514	0 %	0 %	50 %	50 %	240142899
2112	NC_012811	GC	4	8	1227050	1227057	0 %	0 %	50 %	50 %	240142899
2113	NC_012811	GC	3	6	1228136	1228141	0 %	0 %	50 %	50 %	240142900
2114	NC_012811	CG	3	6	1228333	1228338	0 %	0 %	50 %	50 %	240142900
2115	NC_012811	GC	4	8	1228648	1228655	0 %	0 %	50 %	50 %	240142901
2116	NC_012811	CG	3	6	1228660	1228665	0 %	0 %	50 %	50 %	240142901
2117	NC_012811	GC	4	8	1228873	1228880	0 %	0 %	50 %	50 %	240142901
2118	NC_012811	CG	3	6	1229023	1229028	0 %	0 %	50 %	50 %	240142901
2119	NC_012811	CG	3	6	1229198	1229203	0 %	0 %	50 %	50 %	240142901
2120	NC_012811	GC	3	6	1229419	1229424	0 %	0 %	50 %	50 %	240142901
2121	NC_012811	CG	3	6	1229759	1229764	0 %	0 %	50 %	50 %	240142902
2122	NC_012811	CG	3	6	1229775	1229780	0 %	0 %	50 %	50 %	240142902
2123	NC_012811	CG	3	6	1229791	1229796	0 %	0 %	50 %	50 %	240142902
2124	NC_012811	GC	3	6	1230151	1230156	0 %	0 %	50 %	50 %	240142902
2125	NC_012811	CG	3	6	1230427	1230432	0 %	0 %	50 %	50 %	240142902
2126	NC_012811	CG	3	6	1230532	1230537	0 %	0 %	50 %	50 %	240142902
2127	NC_012811	CG	3	6	1230979	1230984	0 %	0 %	50 %	50 %	240142903
2128	NC_012811	CG	3	6	1231007	1231012	0 %	0 %	50 %	50 %	240142903
2129	NC_012811	GC	3	6	1231770	1231775	0 %	0 %	50 %	50 %	240142903
2130	NC_012811	GC	3	6	1232602	1232607	0 %	0 %	50 %	50 %	240142904
2131	NC_012811	CG	3	6	1232729	1232734	0 %	0 %	50 %	50 %	240142904
2132	NC_012811	GC	3	6	1233461	1233466	0 %	0 %	50 %	50 %	240142905
2133	NC_012811	GC	3	6	1234549	1234554	0 %	0 %	50 %	50 %	240142906
2134	NC_012811	GC	3	6	1234764	1234769	0 %	0 %	50 %	50 %	240142907
2135	NC_012811	GC	3	6	1234974	1234979	0 %	0 %	50 %	50 %	240142907
2136	NC_012811	GC	3	6	1235311	1235316	0 %	0 %	50 %	50 %	240142907
2137	NC_012811	CG	3	6	1236285	1236290	0 %	0 %	50 %	50 %	240142908
2138	NC_012811	GC	3	6	1236294	1236299	0 %	0 %	50 %	50 %	240142908
2139	NC_012811	CG	3	6	1236451	1236456	0 %	0 %	50 %	50 %	240142908
2140	NC_012811	GC	3	6	1236789	1236794	0 %	0 %	50 %	50 %	240142908
2141	NC_012811	CG	3	6	1237089	1237094	0 %	0 %	50 %	50 %	240142909
2142	NC_012811	TC	3	6	1237298	1237303	0 %	50 %	0 %	50 %	240142909
2143	NC_012811	CG	3	6	1237344	1237349	0 %	0 %	50 %	50 %	240142909
2144	NC_012811	CG	3	6	1238676	1238681	0 %	0 %	50 %	50 %	240142910
2145	NC_012811	CG	3	6	1239246	1239251	0 %	0 %	50 %	50 %	240142911
2146	NC_012811	CG	3	6	1240030	1240035	0 %	0 %	50 %	50 %	240142912
2147	NC_012811	GC	3	6	1241761	1241766	0 %	0 %	50 %	50 %	240142914
2148	NC_012811	GC	3	6	1242116	1242121	0 %	0 %	50 %	50 %	240142914
2149	NC_012811	GC	3	6	1242228	1242233	0 %	0 %	50 %	50 %	240142914
2150	NC_012811	CG	3	6	1242333	1242338	0 %	0 %	50 %	50 %	240142915
2151	NC_012811	GC	3	6	1242794	1242799	0 %	0 %	50 %	50 %	240142915
2152	NC_012811	CG	3	6	1242858	1242863	0 %	0 %	50 %	50 %	240142915
2153	NC_012811	GC	3	6	1243927	1243932	0 %	0 %	50 %	50 %	240142916
2154	NC_012811	GC	3	6	1243954	1243959	0 %	0 %	50 %	50 %	240142916
2155	NC_012811	GC	3	6	1244011	1244016	0 %	0 %	50 %	50 %	240142917
2156	NC_012811	CG	3	6	1244442	1244447	0 %	0 %	50 %	50 %	240142917
2157	NC_012811	CT	3	6	1244799	1244804	0 %	50 %	0 %	50 %	240142918
2158	NC_012811	AG	3	6	1244816	1244821	50 %	0 %	50 %	0 %	240142918
2159	NC_012811	GC	3	6	1244980	1244985	0 %	0 %	50 %	50 %	240142918
2160	NC_012811	GC	3	6	1245183	1245188	0 %	0 %	50 %	50 %	240142918
2161	NC_012811	CG	4	8	1245360	1245367	0 %	0 %	50 %	50 %	240142918
2162	NC_012811	CG	3	6	1245571	1245576	0 %	0 %	50 %	50 %	240142919
2163	NC_012811	GC	3	6	1245632	1245637	0 %	0 %	50 %	50 %	240142919
2164	NC_012811	CG	4	8	1245690	1245697	0 %	0 %	50 %	50 %	240142919
2165	NC_012811	CG	3	6	1246070	1246075	0 %	0 %	50 %	50 %	240142919
2166	NC_012811	CG	4	8	1246611	1246618	0 %	0 %	50 %	50 %	240142920
2167	NC_012811	TG	3	6	1248160	1248165	0 %	50 %	50 %	0 %	240142922
2168	NC_012811	GC	3	6	1248823	1248828	0 %	0 %	50 %	50 %	240142923
2169	NC_012811	GC	3	6	1248982	1248987	0 %	0 %	50 %	50 %	240142923
2170	NC_012811	CG	3	6	1249453	1249458	0 %	0 %	50 %	50 %	240142924
2171	NC_012811	GC	4	8	1250322	1250329	0 %	0 %	50 %	50 %	240142925
2172	NC_012811	GC	3	6	1250390	1250395	0 %	0 %	50 %	50 %	240142925
2173	NC_012811	CG	3	6	1250465	1250470	0 %	0 %	50 %	50 %	240142925
2174	NC_012811	CG	3	6	1250518	1250523	0 %	0 %	50 %	50 %	240142925
2175	NC_012811	GC	3	6	1251100	1251105	0 %	0 %	50 %	50 %	240142925
2176	NC_012811	GC	3	6	1251140	1251145	0 %	0 %	50 %	50 %	240142925
2177	NC_012811	CG	3	6	1251514	1251519	0 %	0 %	50 %	50 %	240142926
2178	NC_012811	GC	3	6	1252044	1252049	0 %	0 %	50 %	50 %	240142927
2179	NC_012811	CG	3	6	1252174	1252179	0 %	0 %	50 %	50 %	240142927
2180	NC_012811	CG	3	6	1252311	1252316	0 %	0 %	50 %	50 %	240142928
2181	NC_012811	GC	3	6	1252966	1252971	0 %	0 %	50 %	50 %	240142929
2182	NC_012811	GC	3	6	1253498	1253503	0 %	0 %	50 %	50 %	240142930
2183	NC_012811	CG	3	6	1253519	1253524	0 %	0 %	50 %	50 %	240142930
2184	NC_012811	GA	3	6	1253675	1253680	50 %	0 %	50 %	0 %	240142930
2185	NC_012811	GC	3	6	1253765	1253770	0 %	0 %	50 %	50 %	240142930
2186	NC_012811	GC	4	8	1253808	1253815	0 %	0 %	50 %	50 %	240142930
2187	NC_012811	CG	3	6	1254416	1254421	0 %	0 %	50 %	50 %	240142930
2188	NC_012811	GC	3	6	1254532	1254537	0 %	0 %	50 %	50 %	240142930
2189	NC_012811	CG	3	6	1256260	1256265	0 %	0 %	50 %	50 %	240142932
2190	NC_012811	GA	3	6	1257008	1257013	50 %	0 %	50 %	0 %	240142933
2191	NC_012811	GC	3	6	1257563	1257568	0 %	0 %	50 %	50 %	240142934
2192	NC_012811	CG	3	6	1257592	1257597	0 %	0 %	50 %	50 %	240142934
2193	NC_012811	CG	3	6	1258051	1258056	0 %	0 %	50 %	50 %	240142935
2194	NC_012811	CG	3	6	1258139	1258144	0 %	0 %	50 %	50 %	240142935
2195	NC_012811	CG	3	6	1258464	1258469	0 %	0 %	50 %	50 %	240142935
2196	NC_012811	GA	3	6	1258759	1258764	50 %	0 %	50 %	0 %	240142935
2197	NC_012811	GC	4	8	1258868	1258875	0 %	0 %	50 %	50 %	240142935
2198	NC_012811	GC	3	6	1259092	1259097	0 %	0 %	50 %	50 %	240142936
2199	NC_012811	CG	4	8	1259632	1259639	0 %	0 %	50 %	50 %	240142936
2200	NC_012811	GC	3	6	1259816	1259821	0 %	0 %	50 %	50 %	240142937
2201	NC_012811	CT	3	6	1260045	1260050	0 %	50 %	0 %	50 %	240142937

< Previous12345Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.