MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p3META1

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012810	GCCG	2	8	321	328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012810	GCGA	2	8	850	857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_012810	GCGG	2	8	1800	1807	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_012810	CCGG	2	8	1879	1886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012810	CAGG	2	8	2681	2688	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012810	ACGG	2	8	3318	3325	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012810	CGGC	2	8	3580	3587	0 %	0 %	50 %	50 %	240114608
8	NC_012810	CCTG	2	8	3705	3712	0 %	25 %	25 %	50 %	240114608
9	NC_012810	CCGG	2	8	3776	3783	0 %	0 %	50 %	50 %	240114608
10	NC_012810	GAGC	2	8	3948	3955	25 %	0 %	50 %	25 %	240114608
11	NC_012810	CCAG	2	8	4329	4336	25 %	0 %	25 %	50 %	240114608
12	NC_012810	GGGC	2	8	4830	4837	0 %	0 %	75 %	25 %	240114609
13	NC_012810	CGGG	2	8	4898	4905	0 %	0 %	75 %	25 %	240114609
14	NC_012810	CGTC	2	8	5838	5845	0 %	25 %	25 %	50 %	240114611
15	NC_012810	CGTC	2	8	5877	5884	0 %	25 %	25 %	50 %	240114611
16	NC_012810	GGCG	2	8	6023	6030	0 %	0 %	75 %	25 %	240114611
17	NC_012810	GCAA	2	8	6220	6227	50 %	0 %	25 %	25 %	240114611
18	NC_012810	CGGC	2	8	6690	6697	0 %	0 %	50 %	50 %	240114612
19	NC_012810	GCCG	2	8	6849	6856	0 %	0 %	50 %	50 %	240114612
20	NC_012810	GATG	2	8	7320	7327	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012810	GGCG	2	8	7853	7860	0 %	0 %	75 %	25 %	240114614
22	NC_012810	GCAC	2	8	8363	8370	25 %	0 %	25 %	50 %	240114615
23	NC_012810	CCGC	2	8	9288	9295	0 %	0 %	25 %	75 %	240114617
24	NC_012810	GGAG	2	8	9568	9575	25 %	0 %	75 %	0 %	240114617
25	NC_012810	AGCG	2	8	9696	9703	25 %	0 %	50 %	25 %	240114617
26	NC_012810	CGGC	2	8	10273	10280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012810	CGGA	2	8	10962	10969	25 %	0 %	50 %	25 %	240114620
28	NC_012810	GGGC	2	8	11063	11070	0 %	0 %	75 %	25 %	240114620
29	NC_012810	CGAG	2	8	12081	12088	25 %	0 %	50 %	25 %	240114621
30	NC_012810	CGAG	2	8	12651	12658	25 %	0 %	50 %	25 %	240114621
31	NC_012810	TGGC	2	8	12718	12725	0 %	25 %	50 %	25 %	240114621
32	NC_012810	GTGG	2	8	12842	12849	0 %	25 %	75 %	0 %	240114622
33	NC_012810	CGAC	2	8	12992	12999	25 %	0 %	25 %	50 %	240114622
34	NC_012810	GGCT	2	8	13359	13366	0 %	25 %	50 %	25 %	240114623
35	NC_012810	CGGC	2	8	13382	13389	0 %	0 %	50 %	50 %	240114623
36	NC_012810	GCGT	2	8	14704	14711	0 %	25 %	50 %	25 %	240114626
37	NC_012810	GGCG	2	8	14966	14973	0 %	0 %	75 %	25 %	240114627
38	NC_012810	GCCG	2	8	15006	15013	0 %	0 %	50 %	50 %	240114627
39	NC_012810	GCCG	2	8	15555	15562	0 %	0 %	50 %	50 %	240114629
40	NC_012810	GCCG	2	8	16269	16276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012810	CGAT	2	8	16410	16417	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012810	CCGG	2	8	16771	16778	0 %	0 %	50 %	50 %	240114631
43	NC_012810	AATT	2	8	17647	17654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012810	GCAT	2	8	17660	17667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_012810	CCGG	2	8	17713	17720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012810	AAAG	2	8	17759	17766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012810	CGGC	2	8	17831	17838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012810	AATT	2	8	18355	18362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012810	GCTC	2	8	18532	18539	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012810	GCCT	2	8	18899	18906	0 %	25 %	25 %	50 %	240114633
51	NC_012810	GGGC	2	8	19002	19009	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_012810	GGTG	2	8	19856	19863	0 %	25 %	75 %	0 %	240114634
53	NC_012810	AGCC	2	8	19955	19962	25 %	0 %	25 %	50 %	240114634
54	NC_012810	CGGG	2	8	20415	20422	0 %	0 %	75 %	25 %	240114635
55	NC_012810	CGGC	2	8	20587	20594	0 %	0 %	50 %	50 %	240114636
56	NC_012810	GCCG	2	8	20707	20714	0 %	0 %	50 %	50 %	240114636
57	NC_012810	CGGC	2	8	21024	21031	0 %	0 %	50 %	50 %	240114637
58	NC_012810	GAGC	2	8	21986	21993	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_012810	TGCA	2	8	22096	22103	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012810	CGGC	2	8	22402	22409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_012810	GGCG	2	8	22986	22993	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_012810	CAGC	2	8	23039	23046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012810	TCGA	2	8	23140	23147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_012810	AGGC	2	8	23287	23294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012810	TCCG	2	8	23318	23325	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_012810	CCGA	2	8	23636	23643	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012810	CAGG	2	8	24709	24716	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.