MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p3META1

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012810	GCCG	2	8	321	328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012810	GCGA	2	8	850	857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_012810	GCGG	2	8	1800	1807	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_012810	CCGG	2	8	1879	1886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012810	CAGG	2	8	2681	2688	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012810	ACGG	2	8	3318	3325	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012810	GATG	2	8	7320	7327	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012810	CGGC	2	8	10273	10280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012810	GCCG	2	8	16269	16276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012810	CGAT	2	8	16410	16417	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012810	AATT	2	8	17647	17654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012810	GCAT	2	8	17660	17667	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012810	CCGG	2	8	17713	17720	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012810	AAAG	2	8	17759	17766	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012810	CGGC	2	8	17831	17838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012810	AATT	2	8	18355	18362	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012810	GCTC	2	8	18532	18539	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012810	GGGC	2	8	19002	19009	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012810	GAGC	2	8	21986	21993	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012810	TGCA	2	8	22096	22103	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012810	CGGC	2	8	22402	22409	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012810	GGCG	2	8	22986	22993	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012810	CAGC	2	8	23039	23046	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012810	TCGA	2	8	23140	23147	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_012810	AGGC	2	8	23287	23294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012810	TCCG	2	8	23318	23325	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012810	CCGA	2	8	23636	23643	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012810	CAGG	2	8	24709	24716	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.