MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p3META1

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012810	TCG	3	9	53	61	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012810	GAA	2	6	66	71	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012810	CCG	2	6	80	85	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_012810	GAG	2	6	127	132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012810	CGC	2	6	143	148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_012810	ATC	2	6	160	165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012810	GCC	2	6	229	234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_012810	GGC	3	9	255	263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012810	GGC	2	6	348	353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012810	GCC	2	6	387	392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_012810	GCC	2	6	474	479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_012810	CGC	2	6	501	506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_012810	GCA	2	6	582	587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012810	CGC	2	6	657	662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_012810	CGT	2	6	698	703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012810	CGG	2	6	732	737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012810	CGG	2	6	747	752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012810	ATC	2	6	835	840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012810	GCC	2	6	841	846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_012810	GGC	3	9	928	936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012810	TGC	2	6	1052	1057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012810	CCG	2	6	1095	1100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_012810	TGC	2	6	1166	1171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012810	CGC	2	6	1187	1192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_012810	CAA	2	6	1305	1310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012810	TGG	2	6	1418	1423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012810	CAT	2	6	1431	1436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012810	CGT	2	6	1464	1469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012810	ACC	2	6	1505	1510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_012810	GGA	2	6	1572	1577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012810	TCG	2	6	1693	1698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012810	GCT	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012810	GGC	3	9	1812	1820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012810	GAG	2	6	1827	1832	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012810	CTG	2	6	1873	1878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012810	GCG	2	6	1887	1892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012810	CGG	2	6	1901	1906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012810	GCC	2	6	1956	1961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_012810	AGC	2	6	1966	1971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012810	GAA	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012810	CGG	3	9	2197	2205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012810	GCG	2	6	2206	2211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012810	CGC	2	6	2303	2308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_012810	ACG	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012810	ACC	2	6	2361	2366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_012810	GCC	2	6	2367	2372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_012810	CGA	2	6	2417	2422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012810	GCC	2	6	2469	2474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_012810	GAA	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012810	GCC	2	6	2529	2534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_012810	GAT	2	6	2535	2540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012810	AGG	2	6	2563	2568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012810	CCG	2	6	2638	2643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_012810	CGG	2	6	2776	2781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012810	GCG	2	6	2868	2873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012810	TTG	2	6	2881	2886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012810	CAG	2	6	3017	3022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012810	CAG	2	6	3033	3038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012810	CAA	2	6	3044	3049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012810	CGA	2	6	3137	3142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012810	CTT	2	6	3176	3181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012810	CGC	2	6	3244	3249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_012810	CGG	2	6	3275	3280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012810	AAG	2	6	3330	3335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012810	GGC	2	6	3357	3362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012810	CGG	2	6	3422	3427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012810	CTG	2	6	3456	3461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_012810	CGG	2	6	3521	3526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_012810	GCC	2	6	5276	5281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_012810	GAA	2	6	5300	5305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012810	TCG	2	6	5344	5349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012810	GAG	2	6	6263	6268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012810	CGC	2	6	7949	7954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_012810	GAC	2	6	8481	8486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012810	GCT	2	6	8832	8837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012810	GCG	2	6	9762	9767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_012810	GCT	2	6	9806	9811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012810	CGG	2	6	10206	10211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012810	TCC	2	6	10611	10616	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_012810	GCG	2	6	12751	12756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012810	CCT	2	6	13429	13434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_012810	CGG	2	6	15081	15086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012810	CGC	2	6	15491	15496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_012810	AGG	2	6	15506	15511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012810	GGC	2	6	15975	15980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012810	GCC	2	6	15997	16002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_012810	GCT	2	6	16045	16050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012810	TCC	2	6	16325	16330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_012810	CCG	2	6	16392	16397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_012810	CGG	2	6	16561	16566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012810	CAT	2	6	16578	16583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_012810	CCG	2	6	16591	16596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_012810	TCG	2	6	16615	16620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_012810	TCC	2	6	16635	16640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_012810	CAG	2	6	16995	17000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012810	GCA	2	6	17001	17006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012810	CAC	2	6	17135	17140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_012810	AGG	2	6	17560	17565	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012810	GCC	2	6	17621	17626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_012810	CGC	2	6	17638	17643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_012810	GCC	2	6	17678	17683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_012810	GAT	2	6	17731	17736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012810	CCG	2	6	17770	17775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_012810	CAG	2	6	17784	17789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012810	GCG	2	6	18060	18065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012810	TGC	2	6	18107	18112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012810	GTG	3	9	18142	18150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012810	GCC	2	6	18210	18215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_012810	ACC	2	6	18222	18227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_012810	GTC	2	6	18299	18304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012810	GCC	2	6	18335	18340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_012810	TCC	2	6	18446	18451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_012810	TCG	2	6	18477	18482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012810	GGT	2	6	18500	18505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012810	ATC	2	6	18524	18529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012810	GGA	2	6	18543	18548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012810	CCT	2	6	18608	18613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_012810	GCG	2	6	18661	18666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012810	GGA	2	6	19024	19029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012810	GGC	2	6	19032	19037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012810	GGT	2	6	19198	19203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012810	GGC	2	6	19382	19387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012810	ATC	2	6	19391	19396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012810	CGC	2	6	20906	20911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_012810	GTT	2	6	21315	21320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012810	TCG	3	9	21325	21333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_012810	GCG	2	6	21498	21503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_012810	TCG	2	6	21526	21531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012810	TGC	2	6	21578	21583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012810	GCG	2	6	21636	21641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_012810	GCG	2	6	21663	21668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_012810	ACG	2	6	21669	21674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012810	GCC	2	6	21681	21686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_012810	GTC	2	6	21690	21695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012810	GCC	4	12	21723	21734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_012810	CGC	3	9	21743	21751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_012810	CCG	2	6	21838	21843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_012810	GCC	2	6	21912	21917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_012810	GCA	2	6	21920	21925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012810	AGG	2	6	22018	22023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012810	GGT	2	6	22037	22042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012810	CCG	2	6	22060	22065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_012810	GAT	2	6	22148	22153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012810	GTC	2	6	22163	22168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_012810	GGC	2	6	22239	22244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_012810	AGG	2	6	22249	22254	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012810	CGC	2	6	22334	22339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_012810	CGG	2	6	22374	22379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_012810	CCG	2	6	22474	22479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_012810	CGC	2	6	22565	22570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
151	NC_012810	CTG	2	6	22668	22673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_012810	CAG	2	6	22734	22739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_012810	AAG	2	6	22842	22847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_012810	CGA	2	6	22883	22888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_012810	GCC	2	6	23010	23015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_012810	GTG	3	9	23131	23139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_012810	GTC	2	6	23310	23315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_012810	GCG	2	6	23614	23619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_012810	CTC	2	6	23693	23698	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_012810	CGG	2	6	23705	23710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_012810	CGA	2	6	23713	23718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_012810	GCC	2	6	23766	23771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_012810	CGG	2	6	23805	23810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_012810	GCC	2	6	23931	23936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
165	NC_012810	GCG	2	6	23943	23948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_012810	TCG	2	6	23952	23957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_012810	TCG	2	6	24000	24005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_012810	GAG	2	6	24020	24025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
169	NC_012810	GCG	4	12	24028	24039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_012810	GGC	2	6	24129	24134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_012810	GCT	2	6	24166	24171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_012810	GCC	2	6	24238	24243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
173	NC_012810	CCG	2	6	24249	24254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_012810	CGG	2	6	24258	24263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_012810	TCG	2	6	24276	24281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_012810	CCG	2	6	24352	24357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
177	NC_012810	GCC	2	6	24414	24419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
178	NC_012810	GCC	2	6	24434	24439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
179	NC_012810	GCG	2	6	24473	24478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_012810	CGT	2	6	24556	24561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_012810	CGG	2	6	24564	24569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
182	NC_012810	CTT	2	6	24583	24588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_012810	GCG	2	6	24644	24649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_012810	CGG	2	6	24693	24698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_012810	GAC	2	6	24728	24733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_012810	CAT	2	6	24755	24760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_012810	GCC	2	6	24812	24817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
188	NC_012810	CCG	2	6	24840	24845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
189	NC_012810	CGC	2	6	24907	24912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.