MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p3META1

Total Repeats: 232

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012810	CGG	2	6	3593	3598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114608
2	NC_012810	GAA	2	6	3623	3628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240114608
3	NC_012810	TGA	2	6	3677	3682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240114608
4	NC_012810	GGT	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114608
5	NC_012810	CGA	2	6	3840	3845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114608
6	NC_012810	GCG	2	6	3876	3881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114608
7	NC_012810	ACC	2	6	3919	3924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240114608
8	NC_012810	TGC	2	6	3980	3985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114608
9	NC_012810	ACG	2	6	4037	4042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114608
10	NC_012810	AGG	2	6	4043	4048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114608
11	NC_012810	GCT	2	6	4052	4057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114608
12	NC_012810	GGC	2	6	4088	4093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114608
13	NC_012810	CGC	2	6	4183	4188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114608
14	NC_012810	TGC	2	6	4200	4205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114608
15	NC_012810	GCC	2	6	4219	4224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114608
16	NC_012810	GAC	2	6	4226	4231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114608
17	NC_012810	GGC	2	6	4240	4245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114608
18	NC_012810	GGT	2	6	4260	4265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114608
19	NC_012810	GAT	2	6	4345	4350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240114608
20	NC_012810	CGG	2	6	4506	4511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114608
21	NC_012810	GCA	2	6	4521	4526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114608
22	NC_012810	GCC	3	9	4534	4542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114608
23	NC_012810	GAA	2	6	4551	4556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240114608
24	NC_012810	CCG	2	6	4768	4773	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114609
25	NC_012810	GTG	2	6	4800	4805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114609
26	NC_012810	CGG	2	6	4866	4871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114609
27	NC_012810	GGC	2	6	4891	4896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114609
28	NC_012810	TCC	2	6	4941	4946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240114609
29	NC_012810	CCG	2	6	5010	5015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114609
30	NC_012810	GAG	2	6	5018	5023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114609
31	NC_012810	TCG	2	6	5055	5060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114609
32	NC_012810	CTT	2	6	5077	5082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240114609
33	NC_012810	GTT	2	6	5099	5104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240114609
34	NC_012810	GGA	3	9	5128	5136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114609
35	NC_012810	GAT	2	6	5365	5370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240114610
36	NC_012810	CGG	2	6	5489	5494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114610
37	NC_012810	ACC	2	6	5653	5658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240114611
38	NC_012810	CGC	2	6	6070	6075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114611
39	NC_012810	CGA	2	6	6187	6192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114611
40	NC_012810	CAT	2	6	6200	6205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240114611
41	NC_012810	CGA	2	6	6302	6307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114612
42	NC_012810	GCG	2	6	6311	6316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114612
43	NC_012810	ACG	2	6	6325	6330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114612
44	NC_012810	CGG	2	6	6347	6352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114612
45	NC_012810	CGG	2	6	6363	6368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114612
46	NC_012810	GCC	2	6	6412	6417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114612
47	NC_012810	GGA	2	6	6465	6470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114612
48	NC_012810	GGC	2	6	6489	6494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114612
49	NC_012810	CGT	2	6	6531	6536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114612
50	NC_012810	TCG	2	6	6587	6592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114612
51	NC_012810	CGG	2	6	6681	6686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114612
52	NC_012810	GTG	2	6	6709	6714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114612
53	NC_012810	CGT	2	6	6753	6758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114612
54	NC_012810	CCG	2	6	6793	6798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114612
55	NC_012810	ATG	2	6	6978	6983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240114613
56	NC_012810	GCC	2	6	6984	6989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114613
57	NC_012810	CCG	2	6	7059	7064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114613
58	NC_012810	GCC	2	6	7082	7087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114613
59	NC_012810	CTC	2	6	7090	7095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240114613
60	NC_012810	GCC	2	6	7115	7120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114613
61	NC_012810	CCG	2	6	7235	7240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114613
62	NC_012810	CTC	2	6	7375	7380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240114614
63	NC_012810	ACG	2	6	7466	7471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114614
64	NC_012810	GCG	2	6	7482	7487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114614
65	NC_012810	AGC	2	6	7493	7498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114614
66	NC_012810	CGA	2	6	7527	7532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114614
67	NC_012810	ATG	2	6	7627	7632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240114614
68	NC_012810	CCG	2	6	7830	7835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114614
69	NC_012810	GAA	2	6	8089	8094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240114615
70	NC_012810	GTC	2	6	8260	8265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114615
71	NC_012810	CGC	2	6	8280	8285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114615
72	NC_012810	CGC	2	6	8301	8306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114615
73	NC_012810	GCT	2	6	8382	8387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114615
74	NC_012810	GAA	2	6	8409	8414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240114615
75	NC_012810	CAC	2	6	8440	8445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240114615
76	NC_012810	CAT	2	6	8520	8525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240114616
77	NC_012810	GTT	2	6	8546	8551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240114616
78	NC_012810	GCT	2	6	8583	8588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114616
79	NC_012810	GCA	3	9	8620	8628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114616
80	NC_012810	CCT	2	6	8633	8638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240114616
81	NC_012810	TCG	2	6	8659	8664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114616
82	NC_012810	CCG	2	6	8996	9001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114617
83	NC_012810	CGC	2	6	9065	9070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114617
84	NC_012810	GCC	2	6	9256	9261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114617
85	NC_012810	GCC	2	6	9270	9275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114617
86	NC_012810	GGA	2	6	9361	9366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114617
87	NC_012810	GCC	2	6	9373	9378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114617
88	NC_012810	GGC	2	6	9395	9400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114617
89	NC_012810	ACC	2	6	9420	9425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240114617
90	NC_012810	GCT	2	6	9461	9466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114617
91	NC_012810	GTC	2	6	9513	9518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114617
92	NC_012810	TCA	2	6	9863	9868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240114618
93	NC_012810	GCG	2	6	9997	10002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114618
94	NC_012810	GCT	2	6	10307	10312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114619
95	NC_012810	GAA	2	6	10341	10346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240114619
96	NC_012810	CCT	2	6	10370	10375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240114619
97	NC_012810	CTC	2	6	10569	10574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240114619
98	NC_012810	AAG	2	6	10575	10580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240114619
99	NC_012810	AGC	2	6	10952	10957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114620
100	NC_012810	CGG	2	6	11239	11244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114620
101	NC_012810	TCC	2	6	11274	11279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240114620
102	NC_012810	TGG	2	6	11293	11298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114620
103	NC_012810	CGG	2	6	11330	11335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114620
104	NC_012810	CAG	2	6	11369	11374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114620
105	NC_012810	TGA	2	6	11432	11437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240114621
106	NC_012810	GGA	2	6	11444	11449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114621
107	NC_012810	AGG	2	6	11504	11509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114621
108	NC_012810	GGA	2	6	11514	11519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114621
109	NC_012810	AGG	2	6	11630	11635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114621
110	NC_012810	TGG	2	6	11636	11641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114621
111	NC_012810	GGC	2	6	11659	11664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114621
112	NC_012810	GTG	2	6	11668	11673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114621
113	NC_012810	CGA	2	6	11682	11687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114621
114	NC_012810	GCG	2	6	11690	11695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114621
115	NC_012810	CTC	2	6	11728	11733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240114621
116	NC_012810	CAT	2	6	11784	11789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240114621
117	NC_012810	CCG	2	6	11794	11799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114621
118	NC_012810	TGG	2	6	12050	12055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114621
119	NC_012810	TGA	2	6	12168	12173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240114621
120	NC_012810	CAT	2	6	12192	12197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240114621
121	NC_012810	CAG	2	6	12300	12305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114621
122	NC_012810	TCG	2	6	12491	12496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114621
123	NC_012810	TCA	2	6	12509	12514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240114621
124	NC_012810	CGA	2	6	12621	12626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114621
125	NC_012810	CTG	2	6	12798	12803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114622
126	NC_012810	CTT	2	6	12857	12862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240114622
127	NC_012810	CCG	2	6	12874	12879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114622
128	NC_012810	GCT	2	6	12968	12973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114622
129	NC_012810	CGC	2	6	12980	12985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114622
130	NC_012810	GGC	2	6	13007	13012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114622
131	NC_012810	CAG	2	6	13026	13031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114622
132	NC_012810	CGG	2	6	13063	13068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114623
133	NC_012810	CGC	2	6	13090	13095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114623
134	NC_012810	GGT	3	9	13147	13155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114623
135	NC_012810	GGT	2	6	13248	13253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114623
136	NC_012810	GGA	2	6	13396	13401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114623
137	NC_012810	CTC	2	6	13447	13452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240114624
138	NC_012810	GGC	2	6	13523	13528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114624
139	NC_012810	CTC	2	6	13662	13667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	240114624
140	NC_012810	GGC	2	6	13686	13691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114624
141	NC_012810	CAG	2	6	13712	13717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114624
142	NC_012810	TCG	2	6	13747	13752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240114624
143	NC_012810	AGG	2	6	13799	13804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	240114624
144	NC_012810	GTG	2	6	13862	13867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114624
145	NC_012810	CGG	2	6	13868	13873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114624
146	NC_012810	GCG	2	6	13876	13881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114624
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150	NC_012810	GCG	2	6	14045	14050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114625
151	NC_012810	GCG	3	9	14104	14112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114625
152	NC_012810	GTG	2	6	14171	14176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240114625
153	NC_012810	AGC	2	6	14212	14217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114626
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159	NC_012810	CCG	2	6	14437	14442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	240114626
160	NC_012810	CAG	2	6	14529	14534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	240114626
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231	NC_012810	GGC	2	6	21237	21242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114637
232	NC_012810	GCG	2	6	21292	21297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	240114637

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.