MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p2META1

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012809	GCGCG	2	10	679	688	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_012809	CCCCT	2	10	2647	2656	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3	NC_012809	CCCTG	2	10	3410	3419	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_012809	TCGCG	2	10	4465	4474	0 %	20 %	40 %	40 %	240141744
5	NC_012809	GCGCG	2	10	4574	4583	0 %	0 %	60 %	40 %	240141744
6	NC_012809	CTGGC	2	10	5054	5063	0 %	20 %	40 %	40 %	240141745
7	NC_012809	CTTCC	2	10	5162	5171	0 %	40 %	0 %	60 %	240141745
8	NC_012809	CCCTG	2	10	5247	5256	0 %	20 %	20 %	60 %	240141745
9	NC_012809	GGCCG	2	10	5427	5436	0 %	0 %	60 %	40 %	240141746
10	NC_012809	GCAAA	2	10	8843	8852	60 %	0 %	20 %	20 %	240141750
11	NC_012809	AGGCG	2	10	11365	11374	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_012809	CCGTA	2	10	12901	12910	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_012809	CCGAT	2	10	13613	13622	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_012809	CGCGG	2	10	14476	14485	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15	NC_012809	TTGCC	2	10	14669	14678	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_012809	GGCGC	2	10	20808	20817	0 %	0 %	60 %	40 %	240141757
17	NC_012809	CGGAA	2	10	21945	21954	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012809	GCTCA	2	10	23450	23459	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_012809	TCCCA	2	10	24384	24393	20 %	20 %	0 %	60 %	240141763
20	NC_012809	GGGTT	2	10	25065	25074	0 %	40 %	60 %	0 %	240141764
21	NC_012809	CCGTT	2	10	26323	26332	0 %	40 %	20 %	40 %	240141764
22	NC_012809	CCGGC	2	10	28205	28214	0 %	0 %	40 %	60 %	240141766
23	NC_012809	GATCC	2	10	28371	28380	20 %	20 %	20 %	40 %	240141766
24	NC_012809	CCAGC	2	10	29070	29079	20 %	0 %	20 %	60 %	240141767
25	NC_012809	CGCTC	2	10	30401	30410	0 %	20 %	20 %	60 %	240141771
26	NC_012809	CGGCC	2	10	30692	30701	0 %	0 %	40 %	60 %	240141771
27	NC_012809	GGCCG	2	10	32640	32649	0 %	0 %	60 %	40 %	240141771
28	NC_012809	GCCGG	2	10	33814	33823	0 %	0 %	60 %	40 %	240141772
29	NC_012809	GCTGC	2	10	34608	34617	0 %	20 %	40 %	40 %	240141774
30	NC_012809	GCTTG	2	10	34735	34744	0 %	40 %	40 %	20 %	240141775
31	NC_012809	CCGAT	2	10	35354	35363	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_012809	GCCGA	2	10	36103	36112	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_012809	GCCGG	2	10	37582	37591	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.