MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p2META1

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012809	TCGG	2	8	907	914	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012809	CGGA	2	8	1225	1232	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_012809	GCCT	2	8	1256	1263	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012809	TCGA	2	8	1403	1410	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012809	GCTG	2	8	1504	1511	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012809	CGCC	2	8	1557	1564	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_012809	TGGG	2	8	2983	2990	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012809	GGGC	2	8	3715	3722	0 %	0 %	75 %	25 %	240141744
9	NC_012809	CGGC	2	8	3936	3943	0 %	0 %	50 %	50 %	240141744
10	NC_012809	CTGG	2	8	3982	3989	0 %	25 %	50 %	25 %	240141744
11	NC_012809	AGCG	2	8	4236	4243	25 %	0 %	50 %	25 %	240141744
12	NC_012809	GTGG	2	8	4383	4390	0 %	25 %	75 %	0 %	240141744
13	NC_012809	CCGG	2	8	4402	4409	0 %	0 %	50 %	50 %	240141744
14	NC_012809	GGCG	2	8	5404	5411	0 %	0 %	75 %	25 %	240141746
15	NC_012809	CGGG	2	8	5456	5463	0 %	0 %	75 %	25 %	240141746
16	NC_012809	CGGT	2	8	6557	6564	0 %	25 %	50 %	25 %	240141747
17	NC_012809	GGCG	2	8	7768	7775	0 %	0 %	75 %	25 %	240141749
18	NC_012809	TAAA	2	8	7978	7985	75 %	25 %	0 %	0 %	240141749
19	NC_012809	TTCG	2	8	8318	8325	0 %	50 %	25 %	25 %	240141750
20	NC_012809	TGCC	2	8	9314	9321	0 %	25 %	25 %	50 %	240141750
21	NC_012809	CTCG	2	8	9354	9361	0 %	25 %	25 %	50 %	240141750
22	NC_012809	AGTG	2	8	9439	9446	25 %	25 %	50 %	0 %	240141750
23	NC_012809	GCAC	2	8	9689	9696	25 %	0 %	25 %	50 %	240141750
24	NC_012809	GGCA	2	8	9938	9945	25 %	0 %	50 %	25 %	240141751
25	NC_012809	GCGG	2	8	9966	9973	0 %	0 %	75 %	25 %	240141751
26	NC_012809	CGGC	2	8	10051	10058	0 %	0 %	50 %	50 %	240141751
27	NC_012809	GCCC	2	8	10082	10089	0 %	0 %	25 %	75 %	240141751
28	NC_012809	CCGC	2	8	10174	10181	0 %	0 %	25 %	75 %	240141751
29	NC_012809	AGCG	2	8	10479	10486	25 %	0 %	50 %	25 %	240141752
30	NC_012809	GGAG	2	8	10537	10544	25 %	0 %	75 %	0 %	240141752
31	NC_012809	GGGA	2	8	10837	10844	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012809	CGCT	2	8	11175	11182	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012809	TCGC	2	8	11484	11491	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012809	CTGG	2	8	12257	12264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_012809	AGGC	2	8	12340	12347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_012809	GCAA	2	8	12560	12567	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012809	GGCC	2	8	12849	12856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_012809	TCGG	2	8	13062	13069	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_012809	GGAT	2	8	14949	14956	25 %	25 %	50 %	0 %	240141754
40	NC_012809	GTTG	2	8	15547	15554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012809	CGCC	2	8	15642	15649	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_012809	TCGG	2	8	15704	15711	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_012809	GGCC	2	8	15717	15724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012809	GATC	2	8	15759	15766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_012809	CCGA	2	8	16751	16758	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012809	CGAT	2	8	16944	16951	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012809	CGGC	2	8	17320	17327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012809	GCCT	2	8	17859	17866	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012809	CTGG	2	8	17881	17888	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_012809	CGGC	2	8	17929	17936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012809	AGCC	2	8	18223	18230	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012809	GCGA	2	8	18371	18378	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_012809	CGCC	2	8	18430	18437	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
54	NC_012809	GCCT	2	8	18692	18699	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012809	GGCG	2	8	18811	18818	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
56	NC_012809	GCCG	2	8	18896	18903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_012809	TGGA	2	8	18932	18939	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012809	CAGC	2	8	19833	19840	25 %	0 %	25 %	50 %	240141755
59	NC_012809	CGGC	2	8	19967	19974	0 %	0 %	50 %	50 %	240141756
60	NC_012809	GCTC	2	8	20262	20269	0 %	25 %	25 %	50 %	240141756
61	NC_012809	CGGC	2	8	21137	21144	0 %	0 %	50 %	50 %	240141758
62	NC_012809	CCAC	2	8	22095	22102	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
63	NC_012809	TCTG	2	8	22171	22178	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_012809	CGGG	2	8	22367	22374	0 %	0 %	75 %	25 %	240141761
65	NC_012809	TCCG	2	8	22424	22431	0 %	25 %	25 %	50 %	240141761
66	NC_012809	CGCC	2	8	23180	23187	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
67	NC_012809	CGAT	2	8	24214	24221	25 %	25 %	25 %	25 %	240141763
68	NC_012809	GCAT	2	8	24726	24733	25 %	25 %	25 %	25 %	240141764
69	NC_012809	TCCG	2	8	24982	24989	0 %	25 %	25 %	50 %	240141764
70	NC_012809	GCCA	2	8	25289	25296	25 %	0 %	25 %	50 %	240141764
71	NC_012809	TGCC	2	8	25420	25427	0 %	25 %	25 %	50 %	240141764
72	NC_012809	ATCC	2	8	25841	25848	25 %	25 %	0 %	50 %	240141764
73	NC_012809	AAAG	2	8	26620	26627	75 %	0 %	25 %	0 %	240141764
74	NC_012809	TCGC	2	8	26968	26975	0 %	25 %	25 %	50 %	240141765
75	NC_012809	CCCA	2	8	27022	27029	25 %	0 %	0 %	75 %	240141765
76	NC_012809	GTGG	2	8	27289	27296	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012809	GGTG	2	8	27525	27532	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012809	CGAC	2	8	27615	27622	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_012809	GATG	2	8	27700	27707	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012809	GGGA	2	8	27755	27762	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012809	CTGC	2	8	28165	28172	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_012809	GCCG	2	8	28818	28825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_012809	CGGT	2	8	28857	28864	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_012809	CAGG	2	8	29351	29358	25 %	0 %	50 %	25 %	240141768
85	NC_012809	CTGG	2	8	30022	30029	0 %	25 %	50 %	25 %	240141770
86	NC_012809	CCGC	2	8	30890	30897	0 %	0 %	25 %	75 %	240141771
87	NC_012809	GCCC	2	8	30958	30965	0 %	0 %	25 %	75 %	240141771
88	NC_012809	CGTT	2	8	31444	31451	0 %	50 %	25 %	25 %	240141771
89	NC_012809	GTCG	2	8	31466	31473	0 %	25 %	50 %	25 %	240141771
90	NC_012809	GCCG	2	8	32115	32122	0 %	0 %	50 %	50 %	240141771
91	NC_012809	AATC	2	8	32475	32482	50 %	25 %	0 %	25 %	240141771
92	NC_012809	TCGC	2	8	33040	33047	0 %	25 %	25 %	50 %	240141771
93	NC_012809	GACA	2	8	33408	33415	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_012809	CGCC	2	8	34574	34581	0 %	0 %	25 %	75 %	240141774
95	NC_012809	CTTC	2	8	34754	34761	0 %	50 %	0 %	50 %	240141775
96	NC_012809	CTCG	2	8	36607	36614	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012809	CGGC	2	8	36981	36988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012809	CGGC	2	8	37137	37144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012809	GCCT	2	8	37691	37698	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.