MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p2META1

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012809	TCGG	2	8	907	914	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012809	CGGA	2	8	1225	1232	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_012809	GCCT	2	8	1256	1263	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012809	TCGA	2	8	1403	1410	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012809	GCTG	2	8	1504	1511	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012809	CGCC	2	8	1557	1564	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_012809	TGGG	2	8	2983	2990	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012809	GGGA	2	8	10837	10844	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012809	CGCT	2	8	11175	11182	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012809	TCGC	2	8	11484	11491	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012809	CTGG	2	8	12257	12264	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012809	AGGC	2	8	12340	12347	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012809	GCAA	2	8	12560	12567	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012809	GGCC	2	8	12849	12856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012809	TCGG	2	8	13062	13069	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012809	GTTG	2	8	15547	15554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012809	CGCC	2	8	15642	15649	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_012809	TCGG	2	8	15704	15711	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012809	GGCC	2	8	15717	15724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_012809	GATC	2	8	15759	15766	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_012809	CCGA	2	8	16751	16758	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012809	CGAT	2	8	16944	16951	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_012809	CGGC	2	8	17320	17327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012809	GCCT	2	8	17859	17866	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012809	CTGG	2	8	17881	17888	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012809	CGGC	2	8	17929	17936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012809	AGCC	2	8	18223	18230	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012809	GCGA	2	8	18371	18378	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_012809	CGCC	2	8	18430	18437	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_012809	GCCT	2	8	18692	18699	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012809	GGCG	2	8	18811	18818	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012809	GCCG	2	8	18896	18903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012809	TGGA	2	8	18932	18939	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012809	CCAC	2	8	22095	22102	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
35	NC_012809	TCTG	2	8	22171	22178	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_012809	CGCC	2	8	23180	23187	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_012809	GTGG	2	8	27289	27296	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012809	GGTG	2	8	27525	27532	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012809	CGAC	2	8	27615	27622	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_012809	GATG	2	8	27700	27707	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012809	GGGA	2	8	27755	27762	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012809	CTGC	2	8	28165	28172	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012809	GCCG	2	8	28818	28825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012809	CGGT	2	8	28857	28864	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_012809	GACA	2	8	33408	33415	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_012809	CTCG	2	8	36607	36614	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012809	CGGC	2	8	36981	36988	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012809	CGGC	2	8	37137	37144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012809	GCCT	2	8	37691	37698	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.