MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p2META1

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012809	GGGC	2	8	3715	3722	0 %	0 %	75 %	25 %	240141744
2	NC_012809	CGGC	2	8	3936	3943	0 %	0 %	50 %	50 %	240141744
3	NC_012809	CTGG	2	8	3982	3989	0 %	25 %	50 %	25 %	240141744
4	NC_012809	AGCG	2	8	4236	4243	25 %	0 %	50 %	25 %	240141744
5	NC_012809	GTGG	2	8	4383	4390	0 %	25 %	75 %	0 %	240141744
6	NC_012809	CCGG	2	8	4402	4409	0 %	0 %	50 %	50 %	240141744
7	NC_012809	GGCG	2	8	5404	5411	0 %	0 %	75 %	25 %	240141746
8	NC_012809	CGGG	2	8	5456	5463	0 %	0 %	75 %	25 %	240141746
9	NC_012809	CGGT	2	8	6557	6564	0 %	25 %	50 %	25 %	240141747
10	NC_012809	GGCG	2	8	7768	7775	0 %	0 %	75 %	25 %	240141749
11	NC_012809	TAAA	2	8	7978	7985	75 %	25 %	0 %	0 %	240141749
12	NC_012809	TTCG	2	8	8318	8325	0 %	50 %	25 %	25 %	240141750
13	NC_012809	TGCC	2	8	9314	9321	0 %	25 %	25 %	50 %	240141750
14	NC_012809	CTCG	2	8	9354	9361	0 %	25 %	25 %	50 %	240141750
15	NC_012809	AGTG	2	8	9439	9446	25 %	25 %	50 %	0 %	240141750
16	NC_012809	GCAC	2	8	9689	9696	25 %	0 %	25 %	50 %	240141750
17	NC_012809	GGCA	2	8	9938	9945	25 %	0 %	50 %	25 %	240141751
18	NC_012809	GCGG	2	8	9966	9973	0 %	0 %	75 %	25 %	240141751
19	NC_012809	CGGC	2	8	10051	10058	0 %	0 %	50 %	50 %	240141751
20	NC_012809	GCCC	2	8	10082	10089	0 %	0 %	25 %	75 %	240141751
21	NC_012809	CCGC	2	8	10174	10181	0 %	0 %	25 %	75 %	240141751
22	NC_012809	AGCG	2	8	10479	10486	25 %	0 %	50 %	25 %	240141752
23	NC_012809	GGAG	2	8	10537	10544	25 %	0 %	75 %	0 %	240141752
24	NC_012809	GGAT	2	8	14949	14956	25 %	25 %	50 %	0 %	240141754
25	NC_012809	CAGC	2	8	19833	19840	25 %	0 %	25 %	50 %	240141755
26	NC_012809	CGGC	2	8	19967	19974	0 %	0 %	50 %	50 %	240141756
27	NC_012809	GCTC	2	8	20262	20269	0 %	25 %	25 %	50 %	240141756
28	NC_012809	CGGC	2	8	21137	21144	0 %	0 %	50 %	50 %	240141758
29	NC_012809	CGGG	2	8	22367	22374	0 %	0 %	75 %	25 %	240141761
30	NC_012809	TCCG	2	8	22424	22431	0 %	25 %	25 %	50 %	240141761
31	NC_012809	CGAT	2	8	24214	24221	25 %	25 %	25 %	25 %	240141763
32	NC_012809	GCAT	2	8	24726	24733	25 %	25 %	25 %	25 %	240141764
33	NC_012809	TCCG	2	8	24982	24989	0 %	25 %	25 %	50 %	240141764
34	NC_012809	GCCA	2	8	25289	25296	25 %	0 %	25 %	50 %	240141764
35	NC_012809	TGCC	2	8	25420	25427	0 %	25 %	25 %	50 %	240141764
36	NC_012809	ATCC	2	8	25841	25848	25 %	25 %	0 %	50 %	240141764
37	NC_012809	AAAG	2	8	26620	26627	75 %	0 %	25 %	0 %	240141764
38	NC_012809	TCGC	2	8	26968	26975	0 %	25 %	25 %	50 %	240141765
39	NC_012809	CCCA	2	8	27022	27029	25 %	0 %	0 %	75 %	240141765
40	NC_012809	CAGG	2	8	29351	29358	25 %	0 %	50 %	25 %	240141768
41	NC_012809	CTGG	2	8	30022	30029	0 %	25 %	50 %	25 %	240141770
42	NC_012809	CCGC	2	8	30890	30897	0 %	0 %	25 %	75 %	240141771
43	NC_012809	GCCC	2	8	30958	30965	0 %	0 %	25 %	75 %	240141771
44	NC_012809	CGTT	2	8	31444	31451	0 %	50 %	25 %	25 %	240141771
45	NC_012809	GTCG	2	8	31466	31473	0 %	25 %	50 %	25 %	240141771
46	NC_012809	GCCG	2	8	32115	32122	0 %	0 %	50 %	50 %	240141771
47	NC_012809	AATC	2	8	32475	32482	50 %	25 %	0 %	25 %	240141771
48	NC_012809	TCGC	2	8	33040	33047	0 %	25 %	25 %	50 %	240141771
49	NC_012809	CGCC	2	8	34574	34581	0 %	0 %	25 %	75 %	240141774
50	NC_012809	CTTC	2	8	34754	34761	0 %	50 %	0 %	50 %	240141775

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.