MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p2META1

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012809	CG	3	6	39	44	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012809	CG	3	6	1120	1125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012809	GC	3	6	1273	1278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012809	CG	3	6	1671	1676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012809	CG	3	6	1899	1904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012809	GC	3	6	2364	2369	0 %	0 %	50 %	50 %	240141742
7	NC_012809	CG	3	6	2595	2600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012809	CT	3	6	2802	2807	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012809	CA	3	6	2904	2909	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012809	TA	3	6	3145	3150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012809	GC	3	6	3897	3902	0 %	0 %	50 %	50 %	240141744
12	NC_012809	CG	3	6	4202	4207	0 %	0 %	50 %	50 %	240141744
13	NC_012809	AC	3	6	4534	4539	50 %	0 %	0 %	50 %	240141744
14	NC_012809	GC	3	6	4664	4669	0 %	0 %	50 %	50 %	240141744
15	NC_012809	GT	3	6	4812	4817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012809	CG	3	6	6299	6304	0 %	0 %	50 %	50 %	240141747
17	NC_012809	TG	3	6	7573	7578	0 %	50 %	50 %	0 %	240141748
18	NC_012809	GC	4	8	7703	7710	0 %	0 %	50 %	50 %	240141749
19	NC_012809	AC	3	6	7930	7935	50 %	0 %	0 %	50 %	240141749
20	NC_012809	GA	4	8	8017	8024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012809	GA	3	6	8177	8182	50 %	0 %	50 %	0 %	240141750
22	NC_012809	CG	3	6	9189	9194	0 %	0 %	50 %	50 %	240141750
23	NC_012809	GC	3	6	9242	9247	0 %	0 %	50 %	50 %	240141750
24	NC_012809	GC	3	6	9325	9330	0 %	0 %	50 %	50 %	240141750
25	NC_012809	TC	3	6	9593	9598	0 %	50 %	0 %	50 %	240141750
26	NC_012809	GC	4	8	10190	10197	0 %	0 %	50 %	50 %	240141751
27	NC_012809	CG	3	6	10289	10294	0 %	0 %	50 %	50 %	240141751
28	NC_012809	GC	3	6	10587	10592	0 %	0 %	50 %	50 %	240141752
29	NC_012809	GC	3	6	10635	10640	0 %	0 %	50 %	50 %	240141752
30	NC_012809	CG	4	8	10729	10736	0 %	0 %	50 %	50 %	240141752
31	NC_012809	GC	3	6	11320	11325	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012809	TC	3	6	11998	12003	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012809	CT	3	6	13282	13287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012809	GC	3	6	14437	14442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012809	AG	3	6	15535	15540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012809	CG	3	6	15673	15678	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012809	GC	5	10	16384	16393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_012809	GC	3	6	16840	16845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_012809	CG	4	8	16859	16866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_012809	CG	4	8	17281	17288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012809	CG	3	6	17310	17315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012809	GC	3	6	17491	17496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012809	GC	4	8	17564	17571	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012809	CG	3	6	17894	17899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012809	GC	3	6	18048	18053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_012809	GC	3	6	18095	18100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_012809	CG	3	6	18240	18245	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_012809	CG	3	6	18261	18266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_012809	CG	3	6	18767	18772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012809	CG	3	6	21258	21263	0 %	0 %	50 %	50 %	240141758
51	NC_012809	TG	3	6	21679	21684	0 %	50 %	50 %	0 %	240141759
52	NC_012809	GC	3	6	22208	22213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012809	GC	3	6	22401	22406	0 %	0 %	50 %	50 %	240141761
54	NC_012809	CG	3	6	23119	23124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012809	GA	3	6	23824	23829	50 %	0 %	50 %	0 %	240141763
56	NC_012809	TC	3	6	25645	25650	0 %	50 %	0 %	50 %	240141764
57	NC_012809	GC	3	6	26343	26348	0 %	0 %	50 %	50 %	240141764
58	NC_012809	GC	3	6	26450	26455	0 %	0 %	50 %	50 %	240141764
59	NC_012809	CG	4	8	26506	26513	0 %	0 %	50 %	50 %	240141764
60	NC_012809	GA	3	6	27207	27212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012809	GA	3	6	27739	27744	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012809	GA	3	6	28000	28005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012809	CG	3	6	28107	28112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_012809	CG	3	6	28311	28316	0 %	0 %	50 %	50 %	240141766
65	NC_012809	GC	3	6	28540	28545	0 %	0 %	50 %	50 %	240141766
66	NC_012809	CG	3	6	28948	28953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012809	GC	3	6	29664	29669	0 %	0 %	50 %	50 %	240141769
68	NC_012809	CG	3	6	30094	30099	0 %	0 %	50 %	50 %	240141770
69	NC_012809	CG	3	6	30265	30270	0 %	0 %	50 %	50 %	240141770
70	NC_012809	CG	3	6	30311	30316	0 %	0 %	50 %	50 %	240141770
71	NC_012809	CG	5	10	30414	30423	0 %	0 %	50 %	50 %	240141771
72	NC_012809	CG	3	6	30553	30558	0 %	0 %	50 %	50 %	240141771
73	NC_012809	GC	3	6	30579	30584	0 %	0 %	50 %	50 %	240141771
74	NC_012809	GC	3	6	30615	30620	0 %	0 %	50 %	50 %	240141771
75	NC_012809	CG	3	6	30744	30749	0 %	0 %	50 %	50 %	240141771
76	NC_012809	CG	3	6	30853	30858	0 %	0 %	50 %	50 %	240141771
77	NC_012809	TC	3	6	31035	31040	0 %	50 %	0 %	50 %	240141771
78	NC_012809	CG	3	6	31138	31143	0 %	0 %	50 %	50 %	240141771
79	NC_012809	GA	3	6	31416	31421	50 %	0 %	50 %	0 %	240141771
80	NC_012809	GC	3	6	31486	31491	0 %	0 %	50 %	50 %	240141771
81	NC_012809	GC	3	6	31529	31534	0 %	0 %	50 %	50 %	240141771
82	NC_012809	GA	3	6	32044	32049	50 %	0 %	50 %	0 %	240141771
83	NC_012809	GA	3	6	32089	32094	50 %	0 %	50 %	0 %	240141771
84	NC_012809	CG	3	6	32383	32388	0 %	0 %	50 %	50 %	240141771
85	NC_012809	CG	3	6	32785	32790	0 %	0 %	50 %	50 %	240141771
86	NC_012809	CG	3	6	32832	32837	0 %	0 %	50 %	50 %	240141771
87	NC_012809	CG	4	8	32951	32958	0 %	0 %	50 %	50 %	240141771
88	NC_012809	CG	3	6	32987	32992	0 %	0 %	50 %	50 %	240141771
89	NC_012809	GC	3	6	33092	33097	0 %	0 %	50 %	50 %	240141771
90	NC_012809	GC	3	6	33377	33382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_012809	CG	3	6	33826	33831	0 %	0 %	50 %	50 %	240141772
92	NC_012809	CG	3	6	34059	34064	0 %	0 %	50 %	50 %	240141773
93	NC_012809	GC	3	6	34191	34196	0 %	0 %	50 %	50 %	240141773
94	NC_012809	GC	3	6	34224	34229	0 %	0 %	50 %	50 %	240141773
95	NC_012809	GA	3	6	34280	34285	50 %	0 %	50 %	0 %	240141773
96	NC_012809	CG	3	6	34387	34392	0 %	0 %	50 %	50 %	240141774
97	NC_012809	CG	5	10	34487	34496	0 %	0 %	50 %	50 %	240141774
98	NC_012809	CG	3	6	34864	34869	0 %	0 %	50 %	50 %	240141775
99	NC_012809	GC	3	6	34911	34916	0 %	0 %	50 %	50 %	240141775
100	NC_012809	CT	3	6	35023	35028	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_012809	GC	3	6	36125	36130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_012809	GC	3	6	37198	37203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.