MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1

Total Repeats: 4593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_012808	CGCGG	2	10	5389439	5389448	0 %	0 %	60 %	40 %	240141632
4502	NC_012808	CGGGC	2	10	5390486	5390495	0 %	0 %	60 %	40 %	240141633
4503	NC_012808	GCCCT	2	10	5393807	5393816	0 %	20 %	20 %	60 %	240141637
4504	NC_012808	GCCCG	2	10	5396976	5396985	0 %	0 %	40 %	60 %	240141640
4505	NC_012808	CGACG	2	10	5397251	5397260	20 %	0 %	40 %	40 %	240141640
4506	NC_012808	CCTGC	2	10	5399237	5399246	0 %	20 %	20 %	60 %	240141642
4507	NC_012808	GCTCG	2	10	5400547	5400556	0 %	20 %	40 %	40 %	240141643
4508	NC_012808	CGGCG	2	10	5400694	5400703	0 %	0 %	60 %	40 %	240141643
4509	NC_012808	GCGAC	2	10	5400750	5400759	20 %	0 %	40 %	40 %	240141643
4510	NC_012808	CTCGT	2	10	5401516	5401525	0 %	40 %	20 %	40 %	240141644
4511	NC_012808	CGAGG	2	10	5401596	5401605	20 %	0 %	60 %	20 %	240141644
4512	NC_012808	CCGAT	2	10	5402228	5402237	20 %	20 %	20 %	40 %	240141644
4513	NC_012808	GCGCG	2	10	5406443	5406452	0 %	0 %	60 %	40 %	240141649
4514	NC_012808	GGCGC	2	10	5408382	5408391	0 %	0 %	60 %	40 %	240141650
4515	NC_012808	TCATC	2	10	5408748	5408757	20 %	40 %	0 %	40 %	240141650
4516	NC_012808	GCTCG	2	10	5410726	5410735	0 %	20 %	40 %	40 %	240141652
4517	NC_012808	GAGCG	2	10	5414079	5414088	20 %	0 %	60 %	20 %	240141656
4518	NC_012808	CGACG	2	10	5416717	5416726	20 %	0 %	40 %	40 %	240141658
4519	NC_012808	ATCCA	2	10	5418116	5418125	40 %	20 %	0 %	40 %	240141658
4520	NC_012808	CCGCC	2	10	5419979	5419988	0 %	0 %	20 %	80 %	240141660
4521	NC_012808	TCCCC	2	10	5420540	5420549	0 %	20 %	0 %	80 %	240141661
4522	NC_012808	GGAAC	2	10	5421990	5421999	40 %	0 %	40 %	20 %	240141662
4523	NC_012808	GCGCC	2	10	5423472	5423481	0 %	0 %	40 %	60 %	240141665
4524	NC_012808	CGGGC	2	10	5423507	5423516	0 %	0 %	60 %	40 %	240141665
4525	NC_012808	TCGGG	2	10	5424180	5424189	0 %	20 %	60 %	20 %	240141666
4526	NC_012808	GCGCC	2	10	5424623	5424632	0 %	0 %	40 %	60 %	240141667
4527	NC_012808	GCGCC	2	10	5425160	5425169	0 %	0 %	40 %	60 %	240141667
4528	NC_012808	GCCCG	2	10	5426404	5426413	0 %	0 %	40 %	60 %	240141668
4529	NC_012808	GGCGA	2	10	5428406	5428415	20 %	0 %	60 %	20 %	240141670
4530	NC_012808	GCGGG	2	10	5429026	5429035	0 %	0 %	80 %	20 %	240141670
4531	NC_012808	CGGTG	2	10	5430020	5430029	0 %	20 %	60 %	20 %	240141670
4532	NC_012808	GCCGC	2	10	5434044	5434053	0 %	0 %	40 %	60 %	240141673
4533	NC_012808	CGCGT	2	10	5434435	5434444	0 %	20 %	40 %	40 %	240141673
4534	NC_012808	CGGAT	2	10	5435457	5435466	20 %	20 %	40 %	20 %	240141674
4535	NC_012808	GGGCA	2	10	5435858	5435867	20 %	0 %	60 %	20 %	240141675
4536	NC_012808	CGGCG	2	10	5438438	5438447	0 %	0 %	60 %	40 %	240141677
4537	NC_012808	GTCCT	2	10	5438499	5438508	0 %	40 %	20 %	40 %	240141677
4538	NC_012808	GGCCG	2	10	5438784	5438793	0 %	0 %	60 %	40 %	240141677
4539	NC_012808	GGCGG	2	10	5439639	5439648	0 %	0 %	80 %	20 %	240141678
4540	NC_012808	CGATC	2	10	5443836	5443845	20 %	20 %	20 %	40 %	240141682
4541	NC_012808	CGCCA	2	10	5444032	5444041	20 %	0 %	20 %	60 %	240141682
4542	NC_012808	ATCGC	2	10	5445419	5445428	20 %	20 %	20 %	40 %	240141684
4543	NC_012808	CCGCC	2	10	5449362	5449371	0 %	0 %	20 %	80 %	240141687
4544	NC_012808	ACCGA	2	10	5449472	5449481	40 %	0 %	20 %	40 %	240141687
4545	NC_012808	AGCCG	2	10	5449789	5449798	20 %	0 %	40 %	40 %	240141688
4546	NC_012808	ATTGT	2	10	5454798	5454807	20 %	60 %	20 %	0 %	240141692
4547	NC_012808	GAAGG	2	10	5454878	5454887	40 %	0 %	60 %	0 %	240141692
4548	NC_012808	GTCCA	2	10	5455769	5455778	20 %	20 %	20 %	40 %	240141693
4549	NC_012808	CGATG	2	10	5456493	5456502	20 %	20 %	40 %	20 %	240141693
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4551	NC_012808	GCCGC	2	10	5462668	5462677	0 %	0 %	40 %	60 %	240141698
4552	NC_012808	CCCGC	2	10	5463172	5463181	0 %	0 %	20 %	80 %	240141698
4553	NC_012808	GCGCT	2	10	5463307	5463316	0 %	20 %	40 %	40 %	240141698
4554	NC_012808	CTTCC	2	10	5464108	5464117	0 %	40 %	0 %	60 %	240141699
4555	NC_012808	GGACG	2	10	5465734	5465743	20 %	0 %	60 %	20 %	240141701
4556	NC_012808	CGCAG	2	10	5466127	5466136	20 %	0 %	40 %	40 %	240141702
4557	NC_012808	GGCGC	3	15	5466488	5466502	0 %	0 %	60 %	40 %	240141703
4558	NC_012808	AGCCG	2	10	5466818	5466827	20 %	0 %	40 %	40 %	240141703
4559	NC_012808	TCGCG	2	10	5467540	5467549	0 %	20 %	40 %	40 %	240141704
4560	NC_012808	CGTCT	2	10	5468237	5468246	0 %	40 %	20 %	40 %	240141704
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4563	NC_012808	CCCCG	2	10	5470996	5471005	0 %	0 %	20 %	80 %	240141706
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4565	NC_012808	GGCCG	2	10	5473606	5473615	0 %	0 %	60 %	40 %	240141708
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4569	NC_012808	GCCGA	2	10	5475507	5475516	20 %	0 %	40 %	40 %	240141709
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4576	NC_012808	CGGGT	2	10	5485331	5485340	0 %	20 %	60 %	20 %	240141718
4577	NC_012808	CGACC	2	10	5485993	5486002	20 %	0 %	20 %	60 %	240141718
4578	NC_012808	GACCG	2	10	5489439	5489448	20 %	0 %	40 %	40 %	240141720
4579	NC_012808	GCGCG	2	10	5490327	5490336	0 %	0 %	60 %	40 %	240141721
4580	NC_012808	CGCTT	2	10	5491744	5491753	0 %	40 %	20 %	40 %	240141723
4581	NC_012808	CGCGA	2	10	5491922	5491931	20 %	0 %	40 %	40 %	240141723
4582	NC_012808	CCATG	2	10	5492289	5492298	20 %	20 %	20 %	40 %	240141723
4583	NC_012808	CCTTC	2	10	5494730	5494739	0 %	40 %	0 %	60 %	240141725
4584	NC_012808	AGCCG	2	10	5496651	5496660	20 %	0 %	40 %	40 %	240141726
4585	NC_012808	CGGTC	2	10	5498670	5498679	0 %	20 %	40 %	40 %	240141728
4586	NC_012808	TCCCC	2	10	5499490	5499499	0 %	20 %	0 %	80 %	240141730
4587	NC_012808	GGCCG	2	10	5499615	5499624	0 %	0 %	60 %	40 %	240141730
4588	NC_012808	AAGCC	2	10	5501081	5501090	40 %	0 %	20 %	40 %	240141730
4589	NC_012808	TCCGG	2	10	5502933	5502942	0 %	20 %	40 %	40 %	240141732
4590	NC_012808	CAGCC	2	10	5503820	5503829	20 %	0 %	20 %	60 %	240141732
4591	NC_012808	TCCGG	2	10	5504130	5504139	0 %	20 %	40 %	40 %	240141732
4592	NC_012808	GCGTG	2	10	5506054	5506063	0 %	20 %	60 %	20 %	240141734
4593	NC_012808	CGTGC	2	10	5509472	5509481	0 %	20 %	40 %	40 %	240141736

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.