MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p1META1

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012807	GCGCG	2	10	666	675	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_012807	GCACG	3	15	2007	2021	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3	NC_012807	GTGGA	2	10	5714	5723	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012807	CGGCG	2	10	5736	5745	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_012807	GGGGA	2	10	8847	8856	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012807	GAGAG	2	10	10714	10723	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012807	ACAGG	2	10	13430	13439	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_012807	GTGCG	2	10	20805	20814	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_012807	GCAGT	2	10	29045	29054	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_012807	GCCGC	2	10	31198	31207	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_012807	CGACG	2	10	31286	31295	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_012807	TCCCG	2	10	32815	32824	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_012807	GTTTG	2	10	32865	32874	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012807	CGAGC	2	10	33271	33280	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_012807	GTCCG	2	10	35989	35998	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_012807	GCGTT	2	10	36422	36431	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012807	TTAAT	2	10	36599	36608	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012807	CGCTC	2	10	40899	40908	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_012807	GCCGA	2	10	42427	42436	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_012807	GCCGG	2	10	43906	43915	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.