MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p1META1

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012807	TCGG	2	8	894	901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012807	CGGA	2	8	1212	1219	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_012807	GCCT	2	8	1243	1250	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012807	TCGA	2	8	1390	1397	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012807	GCTG	2	8	1491	1498	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012807	CGCC	2	8	1544	1551	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_012807	CACG	2	8	2004	2011	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012807	ACCG	2	8	2029	2036	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012807	CCAC	2	8	3510	3517	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_012807	GAGC	2	8	3832	3839	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012807	TTGT	2	8	3928	3935	0 %	75 %	25 %	0 %	240111941
12	NC_012807	TCGG	2	8	5663	5670	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012807	CCGA	2	8	5752	5759	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012807	TGCA	2	8	5828	5835	25 %	25 %	25 %	25 %	240111943
15	NC_012807	GGCG	2	8	6240	6247	0 %	0 %	75 %	25 %	240111943
16	NC_012807	TCCA	2	8	6290	6297	25 %	25 %	0 %	50 %	240111943
17	NC_012807	CCGG	2	8	6634	6641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_012807	GGGA	2	8	6733	6740	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012807	AGCC	2	8	6911	6918	25 %	0 %	25 %	50 %	240111944
20	NC_012807	GGCG	2	8	7050	7057	0 %	0 %	75 %	25 %	240111944
21	NC_012807	CCGG	2	8	7342	7349	0 %	0 %	50 %	50 %	240111944
22	NC_012807	CCGC	2	8	7389	7396	0 %	0 %	25 %	75 %	240111944
23	NC_012807	CCGG	2	8	7458	7465	0 %	0 %	50 %	50 %	240111944
24	NC_012807	TCCT	2	8	7616	7623	0 %	50 %	0 %	50 %	240111944
25	NC_012807	TCGC	2	8	8282	8289	0 %	25 %	25 %	50 %	240111944
26	NC_012807	GGGC	2	8	8307	8314	0 %	0 %	75 %	25 %	240111944
27	NC_012807	CGGC	2	8	8531	8538	0 %	0 %	50 %	50 %	240111944
28	NC_012807	CGTC	2	8	9405	9412	0 %	25 %	25 %	50 %	240111945
29	NC_012807	CGGG	2	8	9414	9421	0 %	0 %	75 %	25 %	240111945
30	NC_012807	CCAG	2	8	9660	9667	25 %	0 %	25 %	50 %	240111945
31	NC_012807	GCGG	2	8	9971	9978	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012807	CGGC	2	8	10204	10211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012807	GCGG	2	8	10564	10571	0 %	0 %	75 %	25 %	240111946
34	NC_012807	GCAG	2	8	11186	11193	25 %	0 %	50 %	25 %	240111948
35	NC_012807	CGGC	2	8	11483	11490	0 %	0 %	50 %	50 %	240111949
36	NC_012807	ATCG	2	8	11532	11539	25 %	25 %	25 %	25 %	240111949
37	NC_012807	GCCG	2	8	11667	11674	0 %	0 %	50 %	50 %	240111949
38	NC_012807	GCCG	2	8	11895	11902	0 %	0 %	50 %	50 %	240111949
39	NC_012807	CGAA	2	8	12497	12504	50 %	0 %	25 %	25 %	240111950
40	NC_012807	AGGA	2	8	12695	12702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012807	CCGC	2	8	12879	12886	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_012807	GCGT	2	8	13228	13235	0 %	25 %	50 %	25 %	240111951
43	NC_012807	CGCC	2	8	13385	13392	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_012807	GGCG	2	8	13724	13731	0 %	0 %	75 %	25 %	240111953
45	NC_012807	GGCC	2	8	13875	13882	0 %	0 %	50 %	50 %	240111953
46	NC_012807	GGCT	2	8	14966	14973	0 %	25 %	50 %	25 %	240111955
47	NC_012807	TCGC	2	8	15023	15030	0 %	25 %	25 %	50 %	240111955
48	NC_012807	CGGG	2	8	15351	15358	0 %	0 %	75 %	25 %	240111955
49	NC_012807	GGAG	2	8	15704	15711	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012807	GAGG	2	8	16114	16121	25 %	0 %	75 %	0 %	240111957
51	NC_012807	GCCG	2	8	16697	16704	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
52	NC_012807	GCTC	2	8	16913	16920	0 %	25 %	25 %	50 %	240111957
53	NC_012807	CCGG	2	8	17740	17747	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
54	NC_012807	TTCC	2	8	17902	17909	0 %	50 %	0 %	50 %	240111957
55	NC_012807	CCCG	2	8	18499	18506	0 %	0 %	25 %	75 %	240111957
56	NC_012807	CCGT	2	8	18897	18904	0 %	25 %	25 %	50 %	240111957
57	NC_012807	CGGA	2	8	19382	19389	25 %	0 %	50 %	25 %	240111957
58	NC_012807	GCGG	2	8	20321	20328	0 %	0 %	75 %	25 %	240111958
59	NC_012807	CGTC	2	8	20431	20438	0 %	25 %	25 %	50 %	240111958
60	NC_012807	CAAT	2	8	21098	21105	50 %	25 %	0 %	25 %	240111959
61	NC_012807	GCCG	2	8	21135	21142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012807	CGGG	2	8	21468	21475	0 %	0 %	75 %	25 %	240111960
63	NC_012807	CAGG	2	8	21480	21487	25 %	0 %	50 %	25 %	240111960
64	NC_012807	TGAG	2	8	21523	21530	25 %	25 %	50 %	0 %	240111960
65	NC_012807	AGGC	2	8	21659	21666	25 %	0 %	50 %	25 %	240111961
66	NC_012807	CGAC	2	8	21773	21780	25 %	0 %	25 %	50 %	240111961
67	NC_012807	ACCG	2	8	22107	22114	25 %	0 %	25 %	50 %	240111961
68	NC_012807	CCGG	2	8	22554	22561	0 %	0 %	50 %	50 %	240111961
69	NC_012807	GGCT	2	8	22624	22631	0 %	25 %	50 %	25 %	240111961
70	NC_012807	GGCC	2	8	22715	22722	0 %	0 %	50 %	50 %	240111961
71	NC_012807	GCCA	2	8	22842	22849	25 %	0 %	25 %	50 %	240111961
72	NC_012807	TGCC	2	8	22874	22881	0 %	25 %	25 %	50 %	240111962
73	NC_012807	TGGT	2	8	23343	23350	0 %	50 %	50 %	0 %	240111962
74	NC_012807	GGCC	2	8	23425	23432	0 %	0 %	50 %	50 %	240111962
75	NC_012807	CATG	2	8	23802	23809	25 %	25 %	25 %	25 %	240111963
76	NC_012807	CGGC	2	8	24332	24339	0 %	0 %	50 %	50 %	240111963
77	NC_012807	CAGG	2	8	25237	25244	25 %	0 %	50 %	25 %	240111964
78	NC_012807	GCAG	2	8	25383	25390	25 %	0 %	50 %	25 %	240111964
79	NC_012807	GCCA	2	8	26025	26032	25 %	0 %	25 %	50 %	240111965
80	NC_012807	GATG	2	8	26096	26103	25 %	25 %	50 %	0 %	240111965
81	NC_012807	TCGC	2	8	26804	26811	0 %	25 %	25 %	50 %	240111967
82	NC_012807	GCCC	2	8	26953	26960	0 %	0 %	25 %	75 %	240111967
83	NC_012807	CTGC	2	8	27036	27043	0 %	25 %	25 %	50 %	240111967
84	NC_012807	GCTC	2	8	27066	27073	0 %	25 %	25 %	50 %	240111967
85	NC_012807	GGCC	2	8	27282	27289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_012807	GCAC	2	8	27980	27987	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_012807	GCCG	2	8	28003	28010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012807	GGGC	2	8	29138	29145	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_012807	CCTG	2	8	29527	29534	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012807	TGCC	2	8	29897	29904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_012807	CGCC	2	8	30000	30007	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
92	NC_012807	CGGC	2	8	30284	30291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012807	TTCC	2	8	30687	30694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012807	GCTG	2	8	31137	31144	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_012807	CTCG	2	8	31460	31467	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_012807	CGAC	2	8	31880	31887	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012807	CGGC	2	8	32050	32057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012807	CTCG	2	8	32451	32458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012807	CGGC	2	8	32633	32640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_012807	GACG	2	8	32674	32681	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_012807	CGCC	2	8	33131	33138	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
102	NC_012807	GCTC	2	8	34027	34034	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_012807	GTTG	2	8	34266	34273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012807	GCGG	2	8	34811	34818	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_012807	GACC	2	8	35365	35372	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_012807	CGAA	2	8	35429	35436	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_012807	ACGC	2	8	35781	35788	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012807	CGGG	2	8	35834	35841	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_012807	TGCG	2	8	36343	36350	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_012807	AAAT	2	8	36573	36580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012807	CCGG	2	8	36966	36973	0 %	0 %	50 %	50 %	240111970
112	NC_012807	AGGC	2	8	37071	37078	25 %	0 %	50 %	25 %	240111970
113	NC_012807	CGTC	2	8	37504	37511	0 %	25 %	25 %	50 %	240111970
114	NC_012807	GCCC	2	8	37620	37627	0 %	0 %	25 %	75 %	240111971
115	NC_012807	GGAC	2	8	37675	37682	25 %	0 %	50 %	25 %	240111971
116	NC_012807	CGGC	2	8	38238	38245	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
117	NC_012807	CGGC	2	8	38535	38542	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
118	NC_012807	GTCC	2	8	38725	38732	0 %	25 %	25 %	50 %	240111971
119	NC_012807	GCTC	2	8	39149	39156	0 %	25 %	25 %	50 %	240111971
120	NC_012807	GCCC	2	8	39719	39726	0 %	0 %	25 %	75 %	240111971
121	NC_012807	TCGG	2	8	40164	40171	0 %	25 %	50 %	25 %	240111971
122	NC_012807	GCGA	2	8	40198	40205	25 %	0 %	50 %	25 %	240111971
123	NC_012807	CGAA	2	8	40489	40496	50 %	0 %	25 %	25 %	240111971
124	NC_012807	CCGC	2	8	40926	40933	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_012807	GAGG	2	8	41065	41072	25 %	0 %	75 %	0 %	240111972
126	NC_012807	CTCA	2	8	41602	41609	25 %	25 %	0 %	50 %	240111973
127	NC_012807	CTCG	2	8	42931	42938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_012807	CGGC	2	8	43305	43312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_012807	CGGC	2	8	43461	43468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_012807	GCCT	2	8	44015	44022	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.