MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p1META1

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012807	TCGG	2	8	894	901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012807	CGGA	2	8	1212	1219	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_012807	GCCT	2	8	1243	1250	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012807	TCGA	2	8	1390	1397	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012807	GCTG	2	8	1491	1498	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012807	CGCC	2	8	1544	1551	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7	NC_012807	CACG	2	8	2004	2011	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012807	ACCG	2	8	2029	2036	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012807	CCAC	2	8	3510	3517	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_012807	GAGC	2	8	3832	3839	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_012807	TCGG	2	8	5663	5670	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012807	CCGA	2	8	5752	5759	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_012807	CCGG	2	8	6634	6641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_012807	GGGA	2	8	6733	6740	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012807	GCGG	2	8	9971	9978	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012807	CGGC	2	8	10204	10211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_012807	AGGA	2	8	12695	12702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012807	CCGC	2	8	12879	12886	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19	NC_012807	CGCC	2	8	13385	13392	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
20	NC_012807	GGAG	2	8	15704	15711	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012807	GCCG	2	8	21135	21142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012807	GGCC	2	8	27282	27289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012807	GCAC	2	8	27980	27987	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_012807	GCCG	2	8	28003	28010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012807	GGGC	2	8	29138	29145	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012807	CCTG	2	8	29527	29534	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_012807	TGCC	2	8	29897	29904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012807	CGCC	2	8	30000	30007	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_012807	CGGC	2	8	30284	30291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012807	TTCC	2	8	30687	30694	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012807	GCTG	2	8	31137	31144	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012807	CTCG	2	8	31460	31467	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_012807	CGAC	2	8	31880	31887	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012807	CGGC	2	8	32050	32057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012807	CTCG	2	8	32451	32458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012807	CGGC	2	8	32633	32640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012807	GACG	2	8	32674	32681	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_012807	CGCC	2	8	33131	33138	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_012807	GCTC	2	8	34027	34034	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_012807	GTTG	2	8	34266	34273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012807	GCGG	2	8	34811	34818	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012807	GACC	2	8	35365	35372	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_012807	CGAA	2	8	35429	35436	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_012807	ACGC	2	8	35781	35788	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_012807	CGGG	2	8	35834	35841	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
46	NC_012807	TGCG	2	8	36343	36350	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012807	AAAT	2	8	36573	36580	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012807	CCGC	2	8	40926	40933	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
49	NC_012807	CTCG	2	8	42931	42938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_012807	CGGC	2	8	43305	43312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_012807	CGGC	2	8	43461	43468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_012807	GCCT	2	8	44015	44022	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.