MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Methylobacterium extorquens AM1 plasmid p1META1

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012807	CG	3	6	26	31	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012807	CG	3	6	1107	1112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_012807	GC	3	6	1260	1265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_012807	CG	3	6	1658	1663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012807	CG	4	8	2254	2261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012807	CG	4	8	2610	2617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_012807	GC	3	6	2836	2841	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012807	GC	3	6	2940	2945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012807	GC	3	6	3009	3014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012807	GC	3	6	4133	4138	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012807	GC	3	6	4225	4230	0 %	0 %	50 %	50 %	240111942
12	NC_012807	GC	3	6	4480	4485	0 %	0 %	50 %	50 %	240111942
13	NC_012807	GC	3	6	4981	4986	0 %	0 %	50 %	50 %	240111942
14	NC_012807	CA	3	6	5408	5413	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012807	GC	3	6	5448	5453	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012807	CA	3	6	5834	5839	50 %	0 %	0 %	50 %	240111943
17	NC_012807	GC	3	6	5918	5923	0 %	0 %	50 %	50 %	240111943
18	NC_012807	CG	3	6	6628	6633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012807	CG	3	6	6940	6945	0 %	0 %	50 %	50 %	240111944
20	NC_012807	GC	4	8	7706	7713	0 %	0 %	50 %	50 %	240111944
21	NC_012807	GC	4	8	8166	8173	0 %	0 %	50 %	50 %	240111944
22	NC_012807	GC	3	6	8981	8986	0 %	0 %	50 %	50 %	240111945
23	NC_012807	GC	3	6	9811	9816	0 %	0 %	50 %	50 %	240111945
24	NC_012807	GC	3	6	9996	10001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012807	AG	3	6	10703	10708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012807	CG	3	6	11252	11257	0 %	0 %	50 %	50 %	240111948
27	NC_012807	CG	3	6	11347	11352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_012807	CG	3	6	11703	11708	0 %	0 %	50 %	50 %	240111949
29	NC_012807	GC	3	6	11809	11814	0 %	0 %	50 %	50 %	240111949
30	NC_012807	CG	3	6	11852	11857	0 %	0 %	50 %	50 %	240111949
31	NC_012807	CG	3	6	11901	11906	0 %	0 %	50 %	50 %	240111949
32	NC_012807	AG	3	6	11966	11971	50 %	0 %	50 %	0 %	240111949
33	NC_012807	GC	3	6	12249	12254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012807	TC	3	6	12537	12542	0 %	50 %	0 %	50 %	240111950
35	NC_012807	GC	4	8	12573	12580	0 %	0 %	50 %	50 %	240111950
36	NC_012807	CG	3	6	12646	12651	0 %	0 %	50 %	50 %	240111950
37	NC_012807	TC	3	6	13245	13250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_012807	GC	3	6	13472	13477	0 %	0 %	50 %	50 %	240111952
39	NC_012807	TC	3	6	13625	13630	0 %	50 %	0 %	50 %	240111952
40	NC_012807	CG	4	8	13914	13921	0 %	0 %	50 %	50 %	240111953
41	NC_012807	GA	3	6	14769	14774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012807	GA	3	6	14782	14787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012807	GC	3	6	14840	14845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012807	CA	3	6	14927	14932	50 %	0 %	0 %	50 %	240111955
45	NC_012807	TC	3	6	15015	15020	0 %	50 %	0 %	50 %	240111955
46	NC_012807	GC	3	6	15315	15320	0 %	0 %	50 %	50 %	240111955
47	NC_012807	GC	3	6	16377	16382	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
48	NC_012807	GC	3	6	16585	16590	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
49	NC_012807	GC	3	6	17692	17697	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
50	NC_012807	GC	3	6	18271	18276	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
51	NC_012807	GC	3	6	18606	18611	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
52	NC_012807	CG	3	6	18652	18657	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
53	NC_012807	GC	3	6	18934	18939	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
54	NC_012807	GC	4	8	19177	19184	0 %	0 %	50 %	50 %	240111957
55	NC_012807	GA	3	6	20181	20186	50 %	0 %	50 %	0 %	240111958
56	NC_012807	CG	3	6	20187	20192	0 %	0 %	50 %	50 %	240111958
57	NC_012807	CG	3	6	20531	20536	0 %	0 %	50 %	50 %	240111958
58	NC_012807	GC	3	6	20641	20646	0 %	0 %	50 %	50 %	240111958
59	NC_012807	AC	3	6	21204	21209	50 %	0 %	0 %	50 %	240111960
60	NC_012807	GT	3	6	23349	23354	0 %	50 %	50 %	0 %	240111962
61	NC_012807	CG	3	6	23564	23569	0 %	0 %	50 %	50 %	240111962
62	NC_012807	AT	3	6	23653	23658	50 %	50 %	0 %	0 %	240111963
63	NC_012807	GC	3	6	23702	23707	0 %	0 %	50 %	50 %	240111963
64	NC_012807	GC	3	6	23871	23876	0 %	0 %	50 %	50 %	240111963
65	NC_012807	GC	3	6	23999	24004	0 %	0 %	50 %	50 %	240111963
66	NC_012807	CG	3	6	24262	24267	0 %	0 %	50 %	50 %	240111963
67	NC_012807	GC	3	6	24667	24672	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012807	CG	3	6	24730	24735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_012807	CG	3	6	25302	25307	0 %	0 %	50 %	50 %	240111964
70	NC_012807	TC	3	6	25509	25514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_012807	CA	3	6	26165	26170	50 %	0 %	0 %	50 %	240111965
72	NC_012807	GC	4	8	26198	26205	0 %	0 %	50 %	50 %	240111965
73	NC_012807	GA	3	6	26512	26517	50 %	0 %	50 %	0 %	240111966
74	NC_012807	GC	3	6	26680	26685	0 %	0 %	50 %	50 %	240111966
75	NC_012807	TC	3	6	26728	26733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_012807	GC	3	6	26942	26947	0 %	0 %	50 %	50 %	240111967
77	NC_012807	TA	3	6	27608	27613	50 %	50 %	0 %	0 %	240111969
78	NC_012807	GC	3	6	27674	27679	0 %	0 %	50 %	50 %	240111969
79	NC_012807	CG	3	6	28440	28445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_012807	GC	3	6	29407	29412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_012807	GC	3	6	30406	30411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_012807	CG	3	6	30599	30604	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_012807	GA	3	6	30643	30648	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012807	CG	3	6	31267	31272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012807	CG	3	6	31406	31411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_012807	CG	3	6	31781	31786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_012807	CG	3	6	32273	32278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_012807	GC	3	6	33531	33536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_012807	TC	3	6	34114	34119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012807	CG	3	6	34251	34256	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_012807	GC	3	6	34498	34503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_012807	CG	3	6	34698	34703	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_012807	GC	3	6	34974	34979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012807	GC	3	6	35314	35319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012807	AG	3	6	36082	36087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012807	TC	3	6	36110	36115	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012807	GC	3	6	37219	37224	0 %	0 %	50 %	50 %	240111970
98	NC_012807	GC	3	6	37254	37259	0 %	0 %	50 %	50 %	240111970
99	NC_012807	CG	3	6	37269	37274	0 %	0 %	50 %	50 %	240111970
100	NC_012807	CG	3	6	37470	37475	0 %	0 %	50 %	50 %	240111970
101	NC_012807	GC	3	6	37630	37635	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
102	NC_012807	CG	3	6	37744	37749	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
103	NC_012807	GC	3	6	37805	37810	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
104	NC_012807	CG	3	6	37858	37863	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
105	NC_012807	GC	3	6	37887	37892	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
106	NC_012807	GC	5	10	38317	38326	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
107	NC_012807	CG	3	6	38386	38391	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
108	NC_012807	GC	4	8	38862	38869	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
109	NC_012807	GC	3	6	38936	38941	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
110	NC_012807	CG	3	6	38998	39003	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
111	NC_012807	GC	3	6	39019	39024	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
112	NC_012807	CG	3	6	39055	39060	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
113	NC_012807	CG	3	6	39170	39175	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
114	NC_012807	GC	3	6	39320	39325	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
115	NC_012807	CG	3	6	39373	39378	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
116	NC_012807	GC	3	6	39679	39684	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
117	NC_012807	CG	3	6	39824	39829	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
118	NC_012807	GC	3	6	39860	39865	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
119	NC_012807	CG	3	6	40574	40579	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
120	NC_012807	CG	3	6	40679	40684	0 %	0 %	50 %	50 %	240111971
121	NC_012807	GA	3	6	40797	40802	50 %	0 %	50 %	0 %	240111971
122	NC_012807	CG	3	6	41350	41355	0 %	0 %	50 %	50 %	240111972
123	NC_012807	AG	3	6	41368	41373	50 %	0 %	50 %	0 %	240111972
124	NC_012807	GC	3	6	41650	41655	0 %	0 %	50 %	50 %	240111973
125	NC_012807	CG	3	6	41840	41845	0 %	0 %	50 %	50 %	240111973
126	NC_012807	GC	3	6	42102	42107	0 %	0 %	50 %	50 %	240111973
127	NC_012807	GC	3	6	42449	42454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_012807	GC	3	6	43522	43527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.