MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma conjunctivae HRC/581 chromosome

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012806	TCATA	2	10	10926	10935	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_012806	CTTTC	2	10	22093	22102	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_012806	TAATT	2	10	23316	23325	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012806	ATTTT	3	15	35106	35120	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012806	AAAAG	2	10	42533	42542	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012806	TAAAT	2	10	60286	60295	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012806	TAAAA	2	10	62579	62588	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012806	TTATT	2	10	72619	72628	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012806	ATTTA	2	10	78996	79005	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012806	TAAAT	2	10	79671	79680	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012806	AATTA	2	10	80665	80674	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012806	TGCTT	2	10	88382	88391	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012806	AAATT	2	10	92605	92614	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012806	AAAAT	2	10	92702	92711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012806	TCAAA	2	10	93512	93521	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012806	ATTTA	2	10	97203	97212	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012806	AATTA	2	10	98804	98813	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012806	TAATA	2	10	153725	153734	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012806	TAATT	2	10	163809	163818	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012806	TAAAA	2	10	175268	175277	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012806	TAAAT	2	10	177998	178007	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012806	TTTTA	2	10	180857	180866	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012806	CAAAA	2	10	181378	181387	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_012806	CATTA	2	10	196836	196845	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012806	AAATC	2	10	198146	198155	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_012806	TGAAA	2	10	199881	199890	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012806	TATAA	2	10	202549	202558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012806	AATTA	2	10	203718	203727	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012806	ATACA	2	10	206222	206231	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_012806	AATTA	2	10	210478	210487	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012806	TAAAA	2	10	213611	213620	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012806	TAAAA	2	10	220775	220784	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012806	AAAAT	2	10	231074	231083	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012806	AAATT	2	10	266170	266179	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012806	TTTTC	2	10	300195	300204	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_012806	AAATA	2	10	301717	301726	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012806	ACAAA	2	10	301888	301897	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_012806	AAAAG	2	10	307233	307242	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012806	TTTTA	2	10	307341	307350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012806	TTTTG	2	10	307361	307370	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012806	AATAA	2	10	324837	324846	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012806	TATAA	2	10	342056	342065	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012806	TATAA	2	10	342073	342082	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012806	TAAAA	2	10	349744	349753	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012806	ATTAT	2	10	349940	349949	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012806	TAAAA	2	10	352889	352898	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012806	TTTCT	2	10	358958	358967	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_012806	GGAGT	2	10	367379	367388	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012806	TTTAT	2	10	401353	401362	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012806	TTATT	2	10	401450	401459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012806	AAAAT	2	10	401611	401620	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012806	ATATT	2	10	411265	411274	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012806	ATTAT	2	10	414206	414215	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012806	ATTAA	2	10	414558	414567	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012806	TAAAA	2	10	428392	428401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012806	ATTTT	2	10	428426	428435	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012806	AGTTA	2	10	442424	442433	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012806	AGTAA	2	10	442477	442486	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012806	TATAA	2	10	466323	466332	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012806	TAATA	2	10	481116	481125	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012806	TTTGT	2	10	481766	481775	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012806	TAAAG	2	10	482293	482302	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012806	ATTTT	2	10	501447	501456	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012806	TATAA	2	10	501582	501591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012806	TTTAT	2	10	501811	501820	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012806	TTAAA	2	10	520111	520120	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012806	AATTT	2	10	520217	520226	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012806	ATTTA	2	10	522039	522048	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012806	AAGTT	2	10	522310	522319	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012806	ATTAA	2	10	540481	540490	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012806	TATAT	2	10	540716	540725	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012806	TGGGG	2	10	550048	550057	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012806	AATTT	2	10	552962	552971	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012806	GAAAT	2	10	582266	582275	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012806	ATTTT	2	10	597852	597861	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012806	AGAAA	2	10	597892	597901	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012806	TTTGC	2	10	604316	604325	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_012806	TTTTA	2	10	609954	609963	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012806	TTTAT	2	10	611583	611592	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012806	TATAT	2	10	622790	622799	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012806	TATTT	2	10	623903	623912	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012806	GTTTG	2	10	639545	639554	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012806	TATTT	2	10	639892	639901	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012806	ATAAA	2	10	640153	640162	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012806	TTTTA	2	10	647720	647729	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012806	TTATT	2	10	659711	659720	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012806	ATATT	2	10	672145	672154	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012806	TTTTA	2	10	700365	700374	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012806	AAAAT	2	10	709026	709035	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012806	CAAAA	2	10	726383	726392	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_012806	TAAAT	2	10	731610	731619	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012806	AAGGA	2	10	752650	752659	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012806	AGCAC	2	10	752808	752817	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_012806	TATAA	2	10	770449	770458	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012806	TAAAA	2	10	775614	775623	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012806	TTTTA	2	10	785030	785039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012806	TTTTA	2	10	803296	803305	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012806	ATAAA	2	10	805142	805151	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012806	AAAAT	2	10	810116	810125	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012806	TTAAT	2	10	816712	816721	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012806	AATTT	2	10	823790	823799	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012806	TATAA	2	10	823837	823846	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012806	TTTTC	2	10	830908	830917	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_012806	TAAAA	2	10	831383	831392	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012806	CACGA	2	10	831946	831955	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_012806	TTTAA	2	10	833027	833036	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.