MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma conjunctivae HRC/581 chromosome

Total Repeats: 746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012806	TAAAA	2	10	1648	1657	80 %	20 %	0 %	0 %	240047137
2	NC_012806	ATCAG	2	10	3478	3487	40 %	20 %	20 %	20 %	240047139
3	NC_012806	AATTA	2	10	3502	3511	60 %	40 %	0 %	0 %	240047139
4	NC_012806	TATAA	2	10	4876	4885	60 %	40 %	0 %	0 %	240047140
5	NC_012806	CTTTT	2	10	4985	4994	0 %	80 %	0 %	20 %	240047140
6	NC_012806	GATTT	2	10	5815	5824	20 %	60 %	20 %	0 %	240047141
7	NC_012806	AAATT	2	10	5829	5838	60 %	40 %	0 %	0 %	240047141
8	NC_012806	GAATT	2	10	6488	6497	40 %	40 %	20 %	0 %	240047142
9	NC_012806	ACAAA	2	10	7181	7190	80 %	0 %	0 %	20 %	240047142
10	NC_012806	AAATT	2	10	7252	7261	60 %	40 %	0 %	0 %	240047143
11	NC_012806	AAAAC	2	10	9688	9697	80 %	0 %	0 %	20 %	240047144
12	NC_012806	TTTTA	2	10	10893	10902	20 %	80 %	0 %	0 %	240047145
13	NC_012806	TAATT	2	10	11976	11985	40 %	60 %	0 %	0 %	240047147
14	NC_012806	TTATT	2	10	12508	12517	20 %	80 %	0 %	0 %	240047147
15	NC_012806	TTTAT	2	10	12687	12696	20 %	80 %	0 %	0 %	240047147
16	NC_012806	GATAT	2	10	14181	14190	40 %	40 %	20 %	0 %	240047148
17	NC_012806	ATTTT	2	10	14727	14736	20 %	80 %	0 %	0 %	240047148
18	NC_012806	CAACT	2	10	15042	15051	40 %	20 %	0 %	40 %	240047148
19	NC_012806	ATGAC	2	10	16462	16471	40 %	20 %	20 %	20 %	240047149
20	NC_012806	TAATT	2	10	18047	18056	40 %	60 %	0 %	0 %	240047149
21	NC_012806	ATAAA	2	10	18463	18472	80 %	20 %	0 %	0 %	240047150
22	NC_012806	AATTT	2	10	20965	20974	40 %	60 %	0 %	0 %	240047152
23	NC_012806	TAAAT	2	10	24411	24420	60 %	40 %	0 %	0 %	240047155
24	NC_012806	CTGAT	2	10	24945	24954	20 %	40 %	20 %	20 %	240047156
25	NC_012806	TTTAA	2	10	26842	26851	40 %	60 %	0 %	0 %	240047157
26	NC_012806	TAAAT	2	10	27737	27746	60 %	40 %	0 %	0 %	240047159
27	NC_012806	TCTTG	2	10	28768	28777	0 %	60 %	20 %	20 %	240047160
28	NC_012806	ATTAT	2	10	28858	28867	40 %	60 %	0 %	0 %	240047160
29	NC_012806	AAATA	2	10	30374	30383	80 %	20 %	0 %	0 %	240047161
30	NC_012806	GAAAA	2	10	31007	31016	80 %	0 %	20 %	0 %	240047162
31	NC_012806	ATAAA	2	10	31054	31063	80 %	20 %	0 %	0 %	240047162
32	NC_012806	ATTAG	2	10	32005	32014	40 %	40 %	20 %	0 %	240047164
33	NC_012806	CATTT	2	10	33199	33208	20 %	60 %	0 %	20 %	240047166
34	NC_012806	ATATT	2	10	33350	33359	40 %	60 %	0 %	0 %	240047166
35	NC_012806	TAATT	2	10	35258	35267	40 %	60 %	0 %	0 %	240047167
36	NC_012806	CAATT	2	10	35839	35848	40 %	40 %	0 %	20 %	240047167
37	NC_012806	TTTGC	2	10	36147	36156	0 %	60 %	20 %	20 %	240047168
38	NC_012806	TTTTA	2	10	36707	36716	20 %	80 %	0 %	0 %	240047168
39	NC_012806	TCAGC	2	10	37716	37725	20 %	20 %	20 %	40 %	240047168
40	NC_012806	ATTTA	2	10	37757	37766	40 %	60 %	0 %	0 %	240047168
41	NC_012806	AAGTG	2	10	38518	38527	40 %	20 %	40 %	0 %	240047169
42	NC_012806	CAATT	2	10	42211	42220	40 %	40 %	0 %	20 %	240047172
43	NC_012806	CAGAA	2	10	44011	44020	60 %	0 %	20 %	20 %	240047174
44	NC_012806	AAATG	2	10	45476	45485	60 %	20 %	20 %	0 %	240047175
45	NC_012806	TAAAA	2	10	48545	48554	80 %	20 %	0 %	0 %	240047177
46	NC_012806	TTGTA	2	10	48826	48835	20 %	60 %	20 %	0 %	240047178
47	NC_012806	TAAAA	2	10	49816	49825	80 %	20 %	0 %	0 %	240047179
48	NC_012806	AATTA	2	10	50134	50143	60 %	40 %	0 %	0 %	240047179
49	NC_012806	AACAA	2	10	50600	50609	80 %	0 %	0 %	20 %	240047179
50	NC_012806	TAATT	2	10	50794	50803	40 %	60 %	0 %	0 %	240047180
51	NC_012806	TAAAA	2	10	51062	51071	80 %	20 %	0 %	0 %	240047180
52	NC_012806	TAAAA	2	10	54330	54339	80 %	20 %	0 %	0 %	240047184
53	NC_012806	ATTTG	2	10	56730	56739	20 %	60 %	20 %	0 %	240047185
54	NC_012806	TTAAA	2	10	57010	57019	60 %	40 %	0 %	0 %	240047185
55	NC_012806	ACTTT	2	10	57987	57996	20 %	60 %	0 %	20 %	240047186
56	NC_012806	TAATT	2	10	58710	58719	40 %	60 %	0 %	0 %	240047186
57	NC_012806	TTATT	2	10	61384	61393	20 %	80 %	0 %	0 %	240047191
58	NC_012806	ATTTC	2	10	61633	61642	20 %	60 %	0 %	20 %	240047191
59	NC_012806	CATTG	2	10	61760	61769	20 %	40 %	20 %	20 %	240047191
60	NC_012806	CTCTT	2	10	61778	61787	0 %	60 %	0 %	40 %	240047191
61	NC_012806	AGAAT	2	10	62269	62278	60 %	20 %	20 %	0 %	240047191
62	NC_012806	AAAAG	2	10	63106	63115	80 %	0 %	20 %	0 %	240047193
63	NC_012806	ATTTA	2	10	64411	64420	40 %	60 %	0 %	0 %	240047194
64	NC_012806	ATTGA	2	10	68012	68021	40 %	40 %	20 %	0 %	240047197
65	NC_012806	GATAT	2	10	68202	68211	40 %	40 %	20 %	0 %	240047197
66	NC_012806	ATTGA	2	10	72154	72163	40 %	40 %	20 %	0 %	240047202
67	NC_012806	TTGTA	2	10	72963	72972	20 %	60 %	20 %	0 %	240047203
68	NC_012806	GTTGC	2	10	73090	73099	0 %	40 %	40 %	20 %	240047203
69	NC_012806	TTTGT	2	10	74169	74178	0 %	80 %	20 %	0 %	240047203
70	NC_012806	ATTGT	2	10	74349	74358	20 %	60 %	20 %	0 %	240047203
71	NC_012806	TTATT	2	10	77488	77497	20 %	80 %	0 %	0 %	240047205
72	NC_012806	TCAAT	2	10	81281	81290	40 %	40 %	0 %	20 %	240047211
73	NC_012806	TTTTC	2	10	81605	81614	0 %	80 %	0 %	20 %	240047212
74	NC_012806	TTTGC	2	10	82707	82716	0 %	60 %	20 %	20 %	240047213
75	NC_012806	AGATA	2	10	85059	85068	60 %	20 %	20 %	0 %	240047215
76	NC_012806	CTTCA	2	10	86405	86414	20 %	40 %	0 %	40 %	240047217
77	NC_012806	AGAAA	2	10	86614	86623	80 %	0 %	20 %	0 %	240047217
78	NC_012806	ATTAA	2	10	87628	87637	60 %	40 %	0 %	0 %	240047218
79	NC_012806	AAAAT	2	10	88607	88616	80 %	20 %	0 %	0 %	240047219
80	NC_012806	ATTTT	2	10	90958	90967	20 %	80 %	0 %	0 %	240047221
81	NC_012806	TAAAT	2	10	91576	91585	60 %	40 %	0 %	0 %	240047222
82	NC_012806	AGTTA	2	10	94564	94573	40 %	40 %	20 %	0 %	240047225
83	NC_012806	ATAAA	2	10	94587	94596	80 %	20 %	0 %	0 %	240047225
84	NC_012806	TAAAT	2	10	96479	96488	60 %	40 %	0 %	0 %	240047226
85	NC_012806	TAAAT	2	10	98728	98737	60 %	40 %	0 %	0 %	240047227
86	NC_012806	TTTTA	2	10	99609	99618	20 %	80 %	0 %	0 %	240047228
87	NC_012806	ATTGG	2	10	101586	101595	20 %	40 %	40 %	0 %	240047230
88	NC_012806	AAGAA	2	10	102711	102720	80 %	0 %	20 %	0 %	240047231
89	NC_012806	TCCTA	2	10	102781	102790	20 %	40 %	0 %	40 %	240047231
90	NC_012806	CTAAA	2	10	103035	103044	60 %	20 %	0 %	20 %	240047232
91	NC_012806	TTGTT	2	10	103218	103227	0 %	80 %	20 %	0 %	240047232
92	NC_012806	AAGAT	2	10	104213	104222	60 %	20 %	20 %	0 %	240047234
93	NC_012806	TAAAT	2	10	104917	104926	60 %	40 %	0 %	0 %	240047236
94	NC_012806	AAATA	2	10	108929	108938	80 %	20 %	0 %	0 %	240047239
95	NC_012806	TTTAT	2	10	111355	111364	20 %	80 %	0 %	0 %	240047242
96	NC_012806	TGATC	2	10	111382	111391	20 %	40 %	20 %	20 %	240047242
97	NC_012806	TCAAT	2	10	113721	113730	40 %	40 %	0 %	20 %	240047244
98	NC_012806	AAATT	2	10	116304	116313	60 %	40 %	0 %	0 %	240047245
99	NC_012806	AAAAC	2	10	116682	116691	80 %	0 %	0 %	20 %	240047245
100	NC_012806	TTTAA	2	10	117362	117371	40 %	60 %	0 %	0 %	240047246
101	NC_012806	TTTTG	2	10	118145	118154	0 %	80 %	20 %	0 %	240047247
102	NC_012806	TAAAA	2	10	120305	120314	80 %	20 %	0 %	0 %	240047249
103	NC_012806	ATTGT	2	10	120609	120618	20 %	60 %	20 %	0 %	240047249
104	NC_012806	ATTTT	2	10	123329	123338	20 %	80 %	0 %	0 %	240047254
105	NC_012806	TTTTC	2	10	124283	124292	0 %	80 %	0 %	20 %	240047254
106	NC_012806	AAAAT	2	10	124700	124709	80 %	20 %	0 %	0 %	240047254
107	NC_012806	ATTTT	2	10	124923	124932	20 %	80 %	0 %	0 %	240047254
108	NC_012806	AATTT	2	10	124939	124948	40 %	60 %	0 %	0 %	240047254
109	NC_012806	ATTTA	2	10	125187	125196	40 %	60 %	0 %	0 %	240047254
110	NC_012806	AAAAT	2	10	127429	127438	80 %	20 %	0 %	0 %	240047256
111	NC_012806	TATGC	2	10	127455	127464	20 %	40 %	20 %	20 %	240047256
112	NC_012806	GTTCA	2	10	128414	128423	20 %	40 %	20 %	20 %	240047258
113	NC_012806	ACTCA	2	10	131630	131639	40 %	20 %	0 %	40 %	240047264
114	NC_012806	TGAAA	2	10	132352	132361	60 %	20 %	20 %	0 %	240047265
115	NC_012806	TAATT	2	10	136491	136500	40 %	60 %	0 %	0 %	240047275
116	NC_012806	AATTA	2	10	136808	136817	60 %	40 %	0 %	0 %	240047276
117	NC_012806	AATTG	2	10	138200	138209	40 %	40 %	20 %	0 %	240047277
118	NC_012806	AAAAT	2	10	140072	140081	80 %	20 %	0 %	0 %	240047280
119	NC_012806	GAAAA	2	10	143426	143435	80 %	0 %	20 %	0 %	240047285
120	NC_012806	GAATT	2	10	145829	145838	40 %	40 %	20 %	0 %	240047288
121	NC_012806	ATATT	2	10	146245	146254	40 %	60 %	0 %	0 %	240047288
122	NC_012806	AAGGA	2	10	147369	147378	60 %	0 %	40 %	0 %	240047288
123	NC_012806	TAGAC	2	10	148913	148922	40 %	20 %	20 %	20 %	240047291
124	NC_012806	CAAAA	2	10	150298	150307	80 %	0 %	0 %	20 %	240047293
125	NC_012806	ATGGG	2	10	153963	153972	20 %	20 %	60 %	0 %	240047297
126	NC_012806	TTTGG	2	10	156921	156930	0 %	60 %	40 %	0 %	240047298
127	NC_012806	ATTGA	2	10	156945	156954	40 %	40 %	20 %	0 %	240047298
128	NC_012806	TAATT	2	10	157574	157583	40 %	60 %	0 %	0 %	240047298
129	NC_012806	TTAAA	2	10	158345	158354	60 %	40 %	0 %	0 %	240047299
130	NC_012806	TAAAA	2	10	158487	158496	80 %	20 %	0 %	0 %	240047299
131	NC_012806	ATTTT	2	10	160274	160283	20 %	80 %	0 %	0 %	240047301
132	NC_012806	AAATC	2	10	161225	161234	60 %	20 %	0 %	20 %	240047302
133	NC_012806	TTTTG	2	10	162282	162291	0 %	80 %	20 %	0 %	240047303
134	NC_012806	AGCAA	2	10	163146	163155	60 %	0 %	20 %	20 %	240047304
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136	NC_012806	TTATT	2	10	164606	164615	20 %	80 %	0 %	0 %	240047306
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