MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycoplasma conjunctivae HRC/581 chromosome

Total Repeats: 13113

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_012806	AGA	2	6	839210	839215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047826
13002	NC_012806	TAA	2	6	839222	839227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047826
13003	NC_012806	TGA	2	6	839372	839377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047826
13004	NC_012806	AAG	2	6	839386	839391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047826
13005	NC_012806	TCA	2	6	839500	839505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047826
13006	NC_012806	TAT	2	6	839529	839534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047826
13007	NC_012806	ACC	2	6	839580	839585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	240047826
13008	NC_012806	TGC	2	6	839609	839614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	240047826
13009	NC_012806	TCT	2	6	839918	839923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047826
13010	NC_012806	AGA	2	6	839930	839935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047826
13011	NC_012806	ATT	2	6	839940	839945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047826
13012	NC_012806	TGA	2	6	839972	839977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047826
13013	NC_012806	AAT	2	6	839978	839983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047826
13014	NC_012806	TGA	2	6	840153	840158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047826
13015	NC_012806	GAT	2	6	840186	840191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047826
13016	NC_012806	ATG	2	6	840241	840246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047826
13017	NC_012806	TTC	2	6	840263	840268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047826
13018	NC_012806	ATC	2	6	840363	840368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047826
13019	NC_012806	TTA	2	6	840409	840414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047826
13020	NC_012806	TAA	3	9	840626	840634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047826
13021	NC_012806	TGA	2	6	840698	840703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047826
13022	NC_012806	TAA	2	6	840743	840748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047826
13023	NC_012806	TCA	2	6	840816	840821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047826
13024	NC_012806	TAA	2	6	840835	840840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047826
13025	NC_012806	ATC	2	6	840859	840864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047826
13026	NC_012806	GAA	2	6	840868	840873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047826
13027	NC_012806	ATT	2	6	840891	840896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047826
13028	NC_012806	ATT	2	6	840925	840930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047826
13029	NC_012806	AAG	2	6	840949	840954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047826
13030	NC_012806	TGA	2	6	841010	841015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047826
13031	NC_012806	ATT	2	6	841017	841022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047826
13032	NC_012806	TAA	2	6	841100	841105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047826
13033	NC_012806	TAA	2	6	841132	841137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047826
13034	NC_012806	GTT	3	9	841176	841184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	240047826
13035	NC_012806	AAT	2	6	841191	841196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047826
13036	NC_012806	TTA	2	6	841212	841217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047826
13037	NC_012806	AAT	2	6	841254	841259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047826
13038	NC_012806	ATT	2	6	841263	841268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047826
13039	NC_012806	TAT	2	6	841303	841308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047826
13040	NC_012806	GAA	4	12	841350	841361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047826
13041	NC_012806	GTT	2	6	841445	841450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_012806	GAA	2	6	841547	841552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047827
13043	NC_012806	ATC	2	6	841581	841586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047827
13044	NC_012806	TTA	2	6	841656	841661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047827
13045	NC_012806	TAA	2	6	841712	841717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047827
13046	NC_012806	CTT	2	6	841834	841839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047827
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13049	NC_012806	GAA	2	6	841950	841955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047827
13050	NC_012806	CTT	2	6	841972	841977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047827
13051	NC_012806	ATG	2	6	841992	841997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	240047827
13052	NC_012806	AAT	2	6	842024	842029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047827
13053	NC_012806	TCA	2	6	842157	842162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047827
13054	NC_012806	GGT	2	6	842257	842262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	240047827
13055	NC_012806	TCA	2	6	842304	842309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	240047827
13056	NC_012806	ATA	2	6	842638	842643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047827
13057	NC_012806	TTC	2	6	842705	842710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047827
13058	NC_012806	ATT	2	6	842778	842783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047827
13059	NC_012806	GAA	2	6	842865	842870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	240047827
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13062	NC_012806	AAT	2	6	843102	843107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	240047827
13063	NC_012806	TAT	2	6	843167	843172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	240047827
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13068	NC_012806	TTC	2	6	843507	843512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047828
13069	NC_012806	TTC	2	6	843534	843539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047828
13070	NC_012806	TCT	2	6	843660	843665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047828
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13073	NC_012806	TCT	2	6	843862	843867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	240047829
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13102	NC_012806	AAC	2	6	845501	845506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	240047829
13103	NC_012806	CAA	2	6	845679	845684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13105	NC_012806	CTT	2	6	845711	845716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13106	NC_012806	AAT	2	6	845760	845765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13107	NC_012806	TTA	2	6	845792	845797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_012806	TAA	2	6	845905	845910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13110	NC_012806	ATT	2	6	845950	845955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_012806	CTT	2	6	846055	846060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13112	NC_012806	CTG	2	6	846083	846088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_012806	CAA	2	6	846193	846198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.