MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Desulfovibrio magneticus RS-1 plasmid pDMC1

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012797	CCGC	2	8	123	130	0 %	0 %	25 %	75 %	239835335
2	NC_012797	CGAC	2	8	373	380	25 %	0 %	25 %	50 %	239835335
3	NC_012797	GCCC	2	8	426	433	0 %	0 %	25 %	75 %	239835335
4	NC_012797	TCCA	2	8	449	456	25 %	25 %	0 %	50 %	239835335
5	NC_012797	GTTT	2	8	1038	1045	0 %	75 %	25 %	0 %	239835336
6	NC_012797	GCAG	2	8	1117	1124	25 %	0 %	50 %	25 %	239835336
7	NC_012797	CAGA	2	8	1139	1146	50 %	0 %	25 %	25 %	239835336
8	NC_012797	CAGA	2	8	1256	1263	50 %	0 %	25 %	25 %	239835336
9	NC_012797	GCCG	2	8	1484	1491	0 %	0 %	50 %	50 %	239835336
10	NC_012797	TACA	2	8	1565	1572	50 %	25 %	0 %	25 %	239835336
11	NC_012797	AGAA	3	12	1669	1680	75 %	0 %	25 %	0 %	239835336
12	NC_012797	CCTG	2	8	1719	1726	0 %	25 %	25 %	50 %	239835336
13	NC_012797	CCGG	2	8	1937	1944	0 %	0 %	50 %	50 %	239835336
14	NC_012797	TTTA	2	8	2393	2400	25 %	75 %	0 %	0 %	239835337
15	NC_012797	GGCG	2	8	3034	3041	0 %	0 %	75 %	25 %	239835337
16	NC_012797	GTTT	2	8	3234	3241	0 %	75 %	25 %	0 %	239835337
17	NC_012797	TTCT	2	8	3458	3465	0 %	75 %	0 %	25 %	239835337
18	NC_012797	GATT	2	8	3836	3843	25 %	50 %	25 %	0 %	239835337
19	NC_012797	CGTC	2	8	3927	3934	0 %	25 %	25 %	50 %	239835338
20	NC_012797	TTTC	2	8	4169	4176	0 %	75 %	0 %	25 %	239835338
21	NC_012797	TTGT	2	8	4204	4211	0 %	75 %	25 %	0 %	239835338
22	NC_012797	TGAT	2	8	5171	5178	25 %	50 %	25 %	0 %	239835339
23	NC_012797	CCCA	2	8	5401	5408	25 %	0 %	0 %	75 %	239835340
24	NC_012797	GGAT	2	8	5494	5501	25 %	25 %	50 %	0 %	239835340
25	NC_012797	TCGC	2	8	7272	7279	0 %	25 %	25 %	50 %	239835343
26	NC_012797	TCCG	2	8	7915	7922	0 %	25 %	25 %	50 %	239835344
27	NC_012797	CGCT	2	8	8728	8735	0 %	25 %	25 %	50 %	239835344
28	NC_012797	TGCC	2	8	9663	9670	0 %	25 %	25 %	50 %	239835345
29	NC_012797	GATG	2	8	9795	9802	25 %	25 %	50 %	0 %	239835346
30	NC_012797	ATCA	2	8	9817	9824	50 %	25 %	0 %	25 %	239835346
31	NC_012797	CAGT	2	8	10056	10063	25 %	25 %	25 %	25 %	239835346
32	NC_012797	CAGC	2	8	10795	10802	25 %	0 %	25 %	50 %	239835347
33	NC_012797	ACCT	2	8	11015	11022	25 %	25 %	0 %	50 %	239835348
34	NC_012797	TAAA	2	8	11464	11471	75 %	25 %	0 %	0 %	239835349
35	NC_012797	TCTT	2	8	11734	11741	0 %	75 %	0 %	25 %	239835349
36	NC_012797	TAAA	2	8	12049	12056	75 %	25 %	0 %	0 %	239835349
37	NC_012797	AATG	2	8	12134	12141	50 %	25 %	25 %	0 %	239835349
38	NC_012797	TTTC	2	8	12212	12219	0 %	75 %	0 %	25 %	239835349
39	NC_012797	GCAT	2	8	12700	12707	25 %	25 %	25 %	25 %	239835349
40	NC_012797	AAAG	2	8	13005	13012	75 %	0 %	25 %	0 %	239835350
41	NC_012797	TGCC	2	8	13243	13250	0 %	25 %	25 %	50 %	239835350
42	NC_012797	AATT	2	8	13555	13562	50 %	50 %	0 %	0 %	239835350
43	NC_012797	TCAA	2	8	14128	14135	50 %	25 %	0 %	25 %	239835350
44	NC_012797	GGGT	2	8	14603	14610	0 %	25 %	75 %	0 %	239835351
45	NC_012797	CCTT	2	8	14942	14949	0 %	50 %	0 %	50 %	239835351
46	NC_012797	ATTT	2	8	15359	15366	25 %	75 %	0 %	0 %	239835351
47	NC_012797	GTAT	2	8	15427	15434	25 %	50 %	25 %	0 %	239835351
48	NC_012797	TAAT	2	8	15448	15455	50 %	50 %	0 %	0 %	239835351
49	NC_012797	TCAA	2	8	15525	15532	50 %	25 %	0 %	25 %	239835351
50	NC_012797	AGCC	2	8	15801	15808	25 %	0 %	25 %	50 %	239835351
51	NC_012797	GAGG	2	8	15975	15982	25 %	0 %	75 %	0 %	239835351
52	NC_012797	TAAT	2	8	16099	16106	50 %	50 %	0 %	0 %	239835351
53	NC_012797	ATTT	2	8	16690	16697	25 %	75 %	0 %	0 %	239835351
54	NC_012797	ATTC	2	8	16763	16770	25 %	50 %	0 %	25 %	239835351
55	NC_012797	ATTT	2	8	16859	16866	25 %	75 %	0 %	0 %	239835351
56	NC_012797	TGAT	2	8	17833	17840	25 %	50 %	25 %	0 %	239835353
57	NC_012797	TCGC	2	8	19447	19454	0 %	25 %	25 %	50 %	239835356
58	NC_012797	CTGG	3	12	19482	19493	0 %	25 %	50 %	25 %	239835356
59	NC_012797	GCGG	2	8	19976	19983	0 %	0 %	75 %	25 %	239835356
60	NC_012797	CGGC	2	8	20123	20130	0 %	0 %	50 %	50 %	239835356
61	NC_012797	CCTG	2	8	20388	20395	0 %	25 %	25 %	50 %	239835356
62	NC_012797	GGCT	2	8	21815	21822	0 %	25 %	50 %	25 %	239835358
63	NC_012797	TGAA	2	8	22542	22549	50 %	25 %	25 %	0 %	239835359
64	NC_012797	TGGG	2	8	23905	23912	0 %	25 %	75 %	0 %	239835360
65	NC_012797	TGCT	2	8	24634	24641	0 %	50 %	25 %	25 %	239835361
66	NC_012797	GGCC	2	8	25056	25063	0 %	0 %	50 %	50 %	239835361
67	NC_012797	TGGT	2	8	25110	25117	0 %	50 %	50 %	0 %	239835361
68	NC_012797	CGAG	2	8	25208	25215	25 %	0 %	50 %	25 %	239835361
69	NC_012797	CCAG	2	8	26202	26209	25 %	0 %	25 %	50 %	239835362
70	NC_012797	CTTC	2	8	26290	26297	0 %	50 %	0 %	50 %	239835362
71	NC_012797	CTGG	2	8	26394	26401	0 %	25 %	50 %	25 %	239835363
72	NC_012797	GAAG	2	8	26971	26978	50 %	0 %	50 %	0 %	239835363
73	NC_012797	CCAG	2	8	27812	27819	25 %	0 %	25 %	50 %	239835364
74	NC_012797	AACG	2	8	28602	28609	50 %	0 %	25 %	25 %	239835365
75	NC_012797	CGGC	2	8	29356	29363	0 %	0 %	50 %	50 %	239835365
76	NC_012797	CCAC	2	8	29728	29735	25 %	0 %	0 %	75 %	239835366
77	NC_012797	TACC	2	8	30362	30369	25 %	25 %	0 %	50 %	239835366
78	NC_012797	ACGG	2	8	31059	31066	25 %	0 %	50 %	25 %	239835367
79	NC_012797	GAAC	2	8	31183	31190	50 %	0 %	25 %	25 %	239835367
80	NC_012797	CCCA	2	8	31451	31458	25 %	0 %	0 %	75 %	239835367
81	NC_012797	GCCG	2	8	32712	32719	0 %	0 %	50 %	50 %	239835369
82	NC_012797	GCCG	2	8	33439	33446	0 %	0 %	50 %	50 %	239835370
83	NC_012797	CCCA	2	8	34145	34152	25 %	0 %	0 %	75 %	239835371
84	NC_012797	GTCC	2	8	34792	34799	0 %	25 %	25 %	50 %	239835371
85	NC_012797	CCTT	2	8	35343	35350	0 %	50 %	0 %	50 %	239835371
86	NC_012797	AAGC	2	8	35505	35512	50 %	0 %	25 %	25 %	239835372
87	NC_012797	GGCC	2	8	35629	35636	0 %	0 %	50 %	50 %	239835372
88	NC_012797	ATCT	2	8	35858	35865	25 %	50 %	0 %	25 %	239835372
89	NC_012797	GGCC	2	8	36007	36014	0 %	0 %	50 %	50 %	239835372
90	NC_012797	TCTG	2	8	36048	36055	0 %	50 %	25 %	25 %	239835372
91	NC_012797	CGGC	2	8	36198	36205	0 %	0 %	50 %	50 %	239835372
92	NC_012797	GGCC	2	8	36382	36389	0 %	0 %	50 %	50 %	239835372
93	NC_012797	CGGC	2	8	36524	36531	0 %	0 %	50 %	50 %	239835372
94	NC_012797	GGCC	2	8	36556	36563	0 %	0 %	50 %	50 %	239835372
95	NC_012797	CGGC	2	8	37102	37109	0 %	0 %	50 %	50 %	239835372
96	NC_012797	CCCA	2	8	37209	37216	25 %	0 %	0 %	75 %	239835373
97	NC_012797	GCCG	2	8	38096	38103	0 %	0 %	50 %	50 %	239835374
98	NC_012797	GCCG	2	8	38183	38190	0 %	0 %	50 %	50 %	239835374
99	NC_012797	GAAC	2	8	39115	39122	50 %	0 %	25 %	25 %	239835375
100	NC_012797	TGCC	2	8	39214	39221	0 %	25 %	25 %	50 %	239835375
101	NC_012797	AGCA	2	8	40246	40253	50 %	0 %	25 %	25 %	239835376
102	NC_012797	CAGC	2	8	42625	42632	25 %	0 %	25 %	50 %	239835382
103	NC_012797	CTCG	2	8	42835	42842	0 %	25 %	25 %	50 %	239835382
104	NC_012797	CCGG	2	8	43117	43124	0 %	0 %	50 %	50 %	239835382
105	NC_012797	TGGC	2	8	43544	43551	0 %	25 %	50 %	25 %	239835383
106	NC_012797	GTTT	2	8	44803	44810	0 %	75 %	25 %	0 %	239835386
107	NC_012797	GGCG	2	8	45054	45061	0 %	0 %	75 %	25 %	239835387
108	NC_012797	TCGC	2	8	47743	47750	0 %	25 %	25 %	50 %	239835390
109	NC_012797	GCTC	2	8	47787	47794	0 %	25 %	25 %	50 %	239835390
110	NC_012797	ACGA	2	8	47902	47909	50 %	0 %	25 %	25 %	239835390
111	NC_012797	CGCC	2	8	47938	47945	0 %	0 %	25 %	75 %	239835391
112	NC_012797	ACCG	2	8	48318	48325	25 %	0 %	25 %	50 %	239835391
113	NC_012797	GGGC	2	8	48686	48693	0 %	0 %	75 %	25 %	239835391
114	NC_012797	AGCC	2	8	48724	48731	25 %	0 %	25 %	50 %	239835391
115	NC_012797	CGAT	2	8	48806	48813	25 %	25 %	25 %	25 %	239835391
116	NC_012797	GGCA	2	8	49186	49193	25 %	0 %	50 %	25 %	239835391
117	NC_012797	TCGT	2	8	49221	49228	0 %	50 %	25 %	25 %	239835391
118	NC_012797	GCGG	2	8	50585	50592	0 %	0 %	75 %	25 %	239835391
119	NC_012797	TGCT	2	8	50869	50876	0 %	50 %	25 %	25 %	239835391
120	NC_012797	GCCG	2	8	51098	51105	0 %	0 %	50 %	50 %	239835392
121	NC_012797	CCCG	2	8	51209	51216	0 %	0 %	25 %	75 %	239835393
122	NC_012797	AAGC	2	8	51307	51314	50 %	0 %	25 %	25 %	239835393
123	NC_012797	AAGC	2	8	53522	53529	50 %	0 %	25 %	25 %	239835394
124	NC_012797	AGCC	2	8	53689	53696	25 %	0 %	25 %	50 %	239835395
125	NC_012797	CAGC	2	8	53712	53719	25 %	0 %	25 %	50 %	239835395
126	NC_012797	CAGC	2	8	53744	53751	25 %	0 %	25 %	50 %	239835395
127	NC_012797	CCAG	3	12	53759	53770	25 %	0 %	25 %	50 %	239835395
128	NC_012797	AGCC	2	8	53801	53808	25 %	0 %	25 %	50 %	239835395
129	NC_012797	AAAC	2	8	54244	54251	75 %	0 %	0 %	25 %	239835395
130	NC_012797	AGCC	2	8	54297	54304	25 %	0 %	25 %	50 %	239835395
131	NC_012797	CAGC	2	8	54328	54335	25 %	0 %	25 %	50 %	239835395
132	NC_012797	CCAG	2	8	56429	56436	25 %	0 %	25 %	50 %	239835396
133	NC_012797	CGCA	2	8	56582	56589	25 %	0 %	25 %	50 %	239835397
134	NC_012797	GACG	2	8	56609	56616	25 %	0 %	50 %	25 %	239835397
135	NC_012797	GCTC	2	8	57162	57169	0 %	25 %	25 %	50 %	239835398
136	NC_012797	AGCG	2	8	58128	58135	25 %	0 %	50 %	25 %	239835399

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.