MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Desulfovibrio magneticus RS-1 plasmid pDMC1

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012797	A	6	6	131	136	100 %	0 %	0 %	0 %	239835335
2	NC_012797	T	6	6	2622	2627	0 %	100 %	0 %	0 %	239835337
3	NC_012797	T	8	8	2632	2639	0 %	100 %	0 %	0 %	239835337
4	NC_012797	T	6	6	2755	2760	0 %	100 %	0 %	0 %	239835337
5	NC_012797	T	6	6	3700	3705	0 %	100 %	0 %	0 %	239835337
6	NC_012797	C	6	6	6807	6812	0 %	0 %	0 %	100 %	239835343
7	NC_012797	T	6	6	9910	9915	0 %	100 %	0 %	0 %	239835346
8	NC_012797	G	6	6	10331	10336	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012797	T	6	6	11092	11097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012797	A	7	7	11429	11435	100 %	0 %	0 %	0 %	239835349
11	NC_012797	A	9	9	11576	11584	100 %	0 %	0 %	0 %	239835349
12	NC_012797	A	6	6	11954	11959	100 %	0 %	0 %	0 %	239835349
13	NC_012797	A	6	6	12054	12059	100 %	0 %	0 %	0 %	239835349
14	NC_012797	A	6	6	12550	12555	100 %	0 %	0 %	0 %	239835349
15	NC_012797	T	6	6	12574	12579	0 %	100 %	0 %	0 %	239835349
16	NC_012797	A	6	6	12614	12619	100 %	0 %	0 %	0 %	239835349
17	NC_012797	T	6	6	12667	12672	0 %	100 %	0 %	0 %	239835349
18	NC_012797	A	7	7	12879	12885	100 %	0 %	0 %	0 %	239835350
19	NC_012797	T	9	9	12943	12951	0 %	100 %	0 %	0 %	239835350
20	NC_012797	T	9	9	13040	13048	0 %	100 %	0 %	0 %	239835350
21	NC_012797	T	6	6	13097	13102	0 %	100 %	0 %	0 %	239835350
22	NC_012797	T	6	6	13142	13147	0 %	100 %	0 %	0 %	239835350
23	NC_012797	T	7	7	13350	13356	0 %	100 %	0 %	0 %	239835350
24	NC_012797	A	9	9	13386	13394	100 %	0 %	0 %	0 %	239835350
25	NC_012797	T	7	7	13420	13426	0 %	100 %	0 %	0 %	239835350
26	NC_012797	T	6	6	13497	13502	0 %	100 %	0 %	0 %	239835350
27	NC_012797	T	6	6	13541	13546	0 %	100 %	0 %	0 %	239835350
28	NC_012797	T	6	6	13584	13589	0 %	100 %	0 %	0 %	239835350
29	NC_012797	T	8	8	13870	13877	0 %	100 %	0 %	0 %	239835350
30	NC_012797	A	6	6	13934	13939	100 %	0 %	0 %	0 %	239835350
31	NC_012797	T	7	7	14051	14057	0 %	100 %	0 %	0 %	239835350
32	NC_012797	A	8	8	14118	14125	100 %	0 %	0 %	0 %	239835350
33	NC_012797	T	7	7	14415	14421	0 %	100 %	0 %	0 %	239835351
34	NC_012797	T	7	7	15021	15027	0 %	100 %	0 %	0 %	239835351
35	NC_012797	T	7	7	15029	15035	0 %	100 %	0 %	0 %	239835351
36	NC_012797	T	6	6	15300	15305	0 %	100 %	0 %	0 %	239835351
37	NC_012797	T	7	7	15364	15370	0 %	100 %	0 %	0 %	239835351
38	NC_012797	T	7	7	15775	15781	0 %	100 %	0 %	0 %	239835351
39	NC_012797	A	6	6	15809	15814	100 %	0 %	0 %	0 %	239835351
40	NC_012797	T	6	6	15847	15852	0 %	100 %	0 %	0 %	239835351
41	NC_012797	T	7	7	15947	15953	0 %	100 %	0 %	0 %	239835351
42	NC_012797	A	6	6	16059	16064	100 %	0 %	0 %	0 %	239835351
43	NC_012797	A	6	6	16170	16175	100 %	0 %	0 %	0 %	239835351
44	NC_012797	C	8	8	16219	16226	0 %	0 %	0 %	100 %	239835351
45	NC_012797	A	6	6	16314	16319	100 %	0 %	0 %	0 %	239835351
46	NC_012797	A	6	6	16327	16332	100 %	0 %	0 %	0 %	239835351
47	NC_012797	T	6	6	16357	16362	0 %	100 %	0 %	0 %	239835351
48	NC_012797	T	8	8	16673	16680	0 %	100 %	0 %	0 %	239835351
49	NC_012797	A	6	6	16887	16892	100 %	0 %	0 %	0 %	239835351
50	NC_012797	T	6	6	20788	20793	0 %	100 %	0 %	0 %	239835357
51	NC_012797	G	10	10	22069	22078	0 %	0 %	100 %	0 %	239835358
52	NC_012797	T	6	6	22125	22130	0 %	100 %	0 %	0 %	239835358
53	NC_012797	T	7	7	22318	22324	0 %	100 %	0 %	0 %	239835358
54	NC_012797	T	8	8	22454	22461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012797	A	6	6	22800	22805	100 %	0 %	0 %	0 %	239835359
56	NC_012797	T	6	6	26369	26374	0 %	100 %	0 %	0 %	239835363
57	NC_012797	T	7	7	26479	26485	0 %	100 %	0 %	0 %	239835363
58	NC_012797	T	6	6	27303	27308	0 %	100 %	0 %	0 %	239835363
59	NC_012797	G	6	6	27400	27405	0 %	0 %	100 %	0 %	239835363
60	NC_012797	C	8	8	30457	30464	0 %	0 %	0 %	100 %	239835367
61	NC_012797	C	6	6	32968	32973	0 %	0 %	0 %	100 %	239835369
62	NC_012797	C	6	6	32980	32985	0 %	0 %	0 %	100 %	239835369
63	NC_012797	T	6	6	33474	33479	0 %	100 %	0 %	0 %	239835370
64	NC_012797	T	6	6	34376	34381	0 %	100 %	0 %	0 %	239835371
65	NC_012797	A	6	6	34746	34751	100 %	0 %	0 %	0 %	239835371
66	NC_012797	G	6	6	35762	35767	0 %	0 %	100 %	0 %	239835372
67	NC_012797	T	6	6	36470	36475	0 %	100 %	0 %	0 %	239835372
68	NC_012797	G	6	6	38287	38292	0 %	0 %	100 %	0 %	239835374
69	NC_012797	A	6	6	40224	40229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012797	G	6	6	40341	40346	0 %	0 %	100 %	0 %	239835376
71	NC_012797	T	8	8	40495	40502	0 %	100 %	0 %	0 %	239835376
72	NC_012797	G	6	6	40836	40841	0 %	0 %	100 %	0 %	239835376
73	NC_012797	A	6	6	46513	46518	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012797	G	7	7	46613	46619	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012797	T	6	6	46833	46838	0 %	100 %	0 %	0 %	239835389
76	NC_012797	T	6	6	46936	46941	0 %	100 %	0 %	0 %	239835389
77	NC_012797	A	6	6	47054	47059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012797	T	6	6	47199	47204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012797	C	6	6	50776	50781	0 %	0 %	0 %	100 %	239835391
80	NC_012797	T	6	6	50893	50898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012797	A	6	6	51409	51414	100 %	0 %	0 %	0 %	239835393
82	NC_012797	G	6	6	52722	52727	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012797	G	6	6	52771	52776	0 %	0 %	100 %	0 %	239835394
84	NC_012797	T	6	6	54946	54951	0 %	100 %	0 %	0 %	239835396
85	NC_012797	T	6	6	55803	55808	0 %	100 %	0 %	0 %	239835396
86	NC_012797	G	6	6	56783	56788	0 %	0 %	100 %	0 %	239835397
87	NC_012797	G	6	6	57979	57984	0 %	0 %	100 %	0 %	239835399
88	NC_012797	A	8	8	58668	58675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.