MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio magneticus RS-1

Total Repeats: 283

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012796	TGGAAT	2	12	33009	33020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012796	TCCCTC	2	12	65206	65217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_012796	TTTAAT	2	12	84560	84571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012796	ATATAA	2	12	95212	95223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012796	GTCGAA	2	12	108208	108219	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012796	TTTAAT	2	12	111477	111488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012796	TCCTTC	2	12	111502	111513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012796	TTGCTG	2	12	117843	117854	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_012796	ATGGTG	2	12	117878	117889	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012796	TTTTCT	2	12	143719	143730	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_012796	AGGCCC	2	12	244780	244791	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_012796	GGTGTT	2	12	250780	250791	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012796	AGGCAG	2	12	260805	260816	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012796	CGGGGA	2	12	268951	268962	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012796	GGGCTG	2	12	272134	272145	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012796	CCGCTC	2	12	291337	291348	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_012796	CTCTTG	2	12	336393	336404	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012796	CTGGGC	2	12	385965	385976	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012796	AATAAA	2	12	397569	397580	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012796	GGGAAG	2	12	453935	453946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012796	GCTCCG	2	12	454403	454414	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
22	NC_012796	TCGGGA	2	12	489955	489966	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_012796	GGAAGA	2	12	494565	494576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012796	GACCCG	2	12	509921	509932	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012796	GCCGTC	2	12	517746	517757	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_012796	GGGCCT	2	12	520530	520541	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012796	TCGGGC	2	12	561925	561936	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012796	GGGGGA	2	12	571701	571712	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012796	CCTTGC	2	12	572435	572446	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_012796	ACGAAG	2	12	577332	577343	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_012796	CGACGC	2	12	602782	602793	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_012796	GCGACG	2	12	650687	650698	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012796	GAAGAG	2	12	661860	661871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012796	GAAGAG	2	12	673987	673998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012796	GGGAGT	2	12	692844	692855	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012796	ATTTTC	2	12	696781	696792	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_012796	AGGCGA	2	12	710035	710046	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_012796	GGCCGG	2	12	710290	710301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012796	TGCCCT	2	12	725492	725503	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_012796	GGCCAG	3	18	773022	773039	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012796	CTTGCG	2	12	773169	773180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012796	GGGGCG	2	12	773225	773236	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_012796	GTCGGC	2	12	773319	773330	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012796	GAACTT	2	12	783923	783934	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012796	CCGAAA	2	12	795214	795225	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012796	TCTTGG	2	12	795758	795769	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_012796	CGGTCA	2	12	805348	805359	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012796	GGCCGA	2	12	807859	807870	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012796	GTCTTC	2	12	850852	850863	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012796	AGGCAG	2	12	854555	854566	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_012796	CATCCC	2	12	870248	870259	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_012796	CCCGCG	2	12	876619	876630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_012796	GGATGG	2	12	954607	954618	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012796	TGCCGC	2	12	982903	982914	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_012796	CGGCGT	2	12	982987	982998	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012796	TTTGGT	2	12	987827	987838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012796	CGCTCC	2	12	1022354	1022365	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_012796	GCCGAA	2	12	1038173	1038184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012796	ACCGGA	2	12	1047847	1047858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012796	CTGCAA	2	12	1070417	1070428	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012796	CTTTTT	2	12	1070976	1070987	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_012796	TCAAAA	2	12	1104568	1104579	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012796	AGTCAA	2	12	1104630	1104641	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_012796	TGCTGA	2	12	1105074	1105085	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_012796	TCCTGG	2	12	1111713	1111724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_012796	CTGGGG	2	12	1142690	1142701	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_012796	TAGTTT	2	12	1154444	1154455	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012796	GTCATG	2	12	1204810	1204821	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_012796	CCGGCT	2	12	1229354	1229365	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012796	CGGGGC	2	12	1234425	1234436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012796	TATTTT	2	12	1264009	1264020	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012796	TTGCGG	2	12	1273068	1273079	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_012796	TTCCCT	2	12	1277613	1277624	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012796	AGCAAA	2	12	1287415	1287426	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_012796	CCCCCT	2	12	1295996	1296007	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
76	NC_012796	GCGGTT	2	12	1299887	1299898	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_012796	TTCCGC	2	12	1311188	1311199	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_012796	CGGAGC	2	12	1335373	1335384	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012796	GTTGCC	2	12	1358626	1358637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012796	GACCGG	2	12	1384756	1384767	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_012796	AAGGGG	2	12	1399791	1399802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012796	GGGCCA	2	12	1449859	1449870	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012796	GCTTCG	2	12	1495430	1495441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012796	TCTTCC	2	12	1542899	1542910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012796	GTCGAA	2	12	1564320	1564331	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_012796	GGGGCC	2	12	1573038	1573049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_012796	AAAGAG	2	12	1598396	1598407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012796	TAAACA	2	12	1616006	1616017	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_012796	GGGCGT	2	12	1620013	1620024	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_012796	GGGCCA	2	12	1626909	1626920	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012796	GAAAAA	2	12	1630427	1630438	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012796	GAAAAT	2	12	1637442	1637453	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012796	GGATGC	2	12	1650457	1650468	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_012796	AACCAT	2	12	1672471	1672482	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012796	ATTTCG	2	12	1676504	1676515	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012796	CTCAGT	2	12	1684808	1684819	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012796	TATTGA	2	12	1699050	1699061	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012796	TGCAGG	2	12	1704143	1704154	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_012796	TGGGGC	2	12	1705590	1705601	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_012796	GAACAC	2	12	1710804	1710815	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_012796	GGCCGG	2	12	1722970	1722981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012796	TGGCAT	2	12	1735459	1735470	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_012796	AAGGGG	2	12	1748402	1748413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012796	CCACGG	2	12	1759107	1759118	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_012796	GGCCGG	2	12	1816245	1816256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012796	CACGGT	2	12	1829947	1829958	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_012796	CAGCCG	2	12	1834601	1834612	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
108	NC_012796	TGACAA	2	12	1840483	1840494	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_012796	TTTCAA	2	12	1841911	1841922	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_012796	GGGCCG	2	12	1855590	1855601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012796	GCGCGG	2	12	1859993	1860004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012796	CAAGGA	2	12	1874377	1874388	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_012796	GCGAAG	2	12	1900823	1900834	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_012796	GCCCGC	2	12	1903789	1903800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_012796	CCCTTT	2	12	1918410	1918421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012796	CTCTTC	2	12	1918477	1918488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_012796	TTCCCC	2	12	1918502	1918513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_012796	GATTTT	2	12	1961091	1961102	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012796	CCGGAG	2	12	1967751	1967762	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_012796	AAAAAG	2	12	1981551	1981562	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012796	AAGGGA	2	12	2011924	2011935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012796	AGGCTG	2	12	2026143	2026154	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_012796	TCGGCG	2	12	2026170	2026181	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012796	CAACAG	2	12	2031444	2031455	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_012796	CAGCAA	2	12	2031603	2031614	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012796	GTGAGC	2	12	2031633	2031644	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_012796	GCCCTT	2	12	2035570	2035581	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_012796	GGCGGT	2	12	2041379	2041390	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_012796	ACCAGA	2	12	2088500	2088511	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012796	AAAAGC	2	12	2116828	2116839	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_012796	CCGGCC	2	12	2154345	2154356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_012796	GATGTC	2	12	2156271	2156282	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_012796	GCATCG	2	12	2189480	2189491	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_012796	GGAAGA	2	12	2204829	2204840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_012796	CGGGGA	2	12	2333067	2333078	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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142	NC_012796	GAAGAT	2	12	2425456	2425467	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_012796	TCCGTT	2	12	4469601	4469612	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_012796	AACCCC	2	12	4502858	4502869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
252	NC_012796	GCCTCG	2	12	4513530	4513541	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
253	NC_012796	GCGTGT	2	12	4532578	4532589	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
254	NC_012796	CACCGA	2	12	4580587	4580598	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
255	NC_012796	CCGTTT	2	12	4608913	4608924	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_012796	TCCGCC	2	12	4632472	4632483	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
257	NC_012796	ATCCGC	2	12	4641915	4641926	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
258	NC_012796	GCTGCG	2	12	4652561	4652572	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_012796	GCCAAC	2	12	4659293	4659304	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
260	NC_012796	ACGCCG	2	12	4663812	4663823	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
261	NC_012796	GAGGGG	2	12	4679834	4679845	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_012796	CGACCG	2	12	4725507	4725518	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
263	NC_012796	GGCATC	2	12	4749174	4749185	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_012796	GCCCCC	2	12	4781264	4781275	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
265	NC_012796	AGCCTG	2	12	4782222	4782233	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_012796	TCCCCC	2	12	4788658	4788669	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
267	NC_012796	CATCTT	2	12	4888498	4888509	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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271	NC_012796	GCCCGC	2	12	4976874	4976885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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276	NC_012796	CCGGGG	2	12	5038122	5038133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_012796	GCCCAG	2	12	5076072	5076083	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
279	NC_012796	CCGTTC	2	12	5103803	5103814	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
280	NC_012796	GCCCGC	2	12	5120654	5120665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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282	NC_012796	TTCCCC	2	12	5144777	5144788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
283	NC_012796	CCCGCC	2	12	5179797	5179808	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.