MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfovibrio magneticus RS-1

Total Repeats: 4565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012796	CCCGG	2	10	1217	1226	0 %	0 %	40 %	60 %	239904640
2	NC_012796	GCGCC	2	10	1804	1813	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3	NC_012796	CGGGC	2	10	2745	2754	0 %	0 %	60 %	40 %	239904641
4	NC_012796	GCGCG	2	10	3473	3482	0 %	0 %	60 %	40 %	239904642
5	NC_012796	GGGCC	2	10	6169	6178	0 %	0 %	60 %	40 %	239904643
6	NC_012796	GGTCA	2	10	7682	7691	20 %	20 %	40 %	20 %	239904643
7	NC_012796	GGGCC	2	10	7786	7795	0 %	0 %	60 %	40 %	239904643
8	NC_012796	CGTGG	2	10	8278	8287	0 %	20 %	60 %	20 %	239904644
9	NC_012796	TGGCC	2	10	10011	10020	0 %	20 %	40 %	40 %	239904646
10	NC_012796	CCCTG	2	10	11305	11314	0 %	20 %	20 %	60 %	239904647
11	NC_012796	CCGGC	2	10	11589	11598	0 %	0 %	40 %	60 %	239904647
12	NC_012796	CAAGA	2	10	13045	13054	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012796	CCATC	2	10	14499	14508	20 %	20 %	0 %	60 %	239904650
14	NC_012796	CTTGG	2	10	16806	16815	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_012796	TCACC	2	10	19227	19236	20 %	20 %	0 %	60 %	239904656
16	NC_012796	TGCGC	2	10	19346	19355	0 %	20 %	40 %	40 %	239904657
17	NC_012796	CCTGG	2	10	19419	19428	0 %	20 %	40 %	40 %	239904657
18	NC_012796	CGGGC	2	10	19604	19613	0 %	0 %	60 %	40 %	239904657
19	NC_012796	TCTGG	2	10	19704	19713	0 %	40 %	40 %	20 %	239904657
20	NC_012796	TGCCC	2	10	20399	20408	0 %	20 %	20 %	60 %	239904658
21	NC_012796	CCAGC	2	10	20819	20828	20 %	0 %	20 %	60 %	239904658
22	NC_012796	CGACA	2	10	22464	22473	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_012796	CGGCG	2	10	22978	22987	0 %	0 %	60 %	40 %	239904661
24	NC_012796	CGTGT	2	10	23304	23313	0 %	40 %	40 %	20 %	239904662
25	NC_012796	GGCCC	2	10	24447	24456	0 %	0 %	40 %	60 %	239904662
26	NC_012796	GCCGC	2	10	24960	24969	0 %	0 %	40 %	60 %	239904663
27	NC_012796	GCCGC	2	10	25128	25137	0 %	0 %	40 %	60 %	239904663
28	NC_012796	TGCCG	2	10	25505	25514	0 %	20 %	40 %	40 %	239904663
29	NC_012796	CCGGC	2	10	26898	26907	0 %	0 %	40 %	60 %	239904664
30	NC_012796	TGGGC	2	10	29784	29793	0 %	20 %	60 %	20 %	239904667
31	NC_012796	GGCGC	2	10	32354	32363	0 %	0 %	60 %	40 %	239904669
32	NC_012796	GCCGT	2	10	33199	33208	0 %	20 %	40 %	40 %	239904670
33	NC_012796	GCCCG	2	10	34641	34650	0 %	0 %	40 %	60 %	239904671
34	NC_012796	CCTTC	2	10	37674	37683	0 %	40 %	0 %	60 %	239904673
35	NC_012796	TGCCC	2	10	38155	38164	0 %	20 %	20 %	60 %	239904673
36	NC_012796	GGCGT	2	10	39108	39117	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_012796	TGGCC	2	10	44602	44611	0 %	20 %	40 %	40 %	239904679
38	NC_012796	CACGA	2	10	44890	44899	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_012796	GGCCG	2	10	45169	45178	0 %	0 %	60 %	40 %	239904680
40	NC_012796	GGCGG	2	10	46177	46186	0 %	0 %	80 %	20 %	239904680
41	NC_012796	CATGG	2	10	46600	46609	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_012796	GCCTA	2	10	47440	47449	20 %	20 %	20 %	40 %	239904682
43	NC_012796	CTGCC	2	10	50687	50696	0 %	20 %	20 %	60 %	239904683
44	NC_012796	CGGCG	2	10	51035	51044	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45	NC_012796	GGGGA	2	10	51110	51119	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012796	GTCGG	2	10	51434	51443	0 %	20 %	60 %	20 %	239904684
47	NC_012796	CGGCC	2	10	51631	51640	0 %	0 %	40 %	60 %	239904684
48	NC_012796	CTGCC	2	10	52014	52023	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_012796	GCCCA	2	10	52072	52081	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
50	NC_012796	GGCCG	2	10	53739	53748	0 %	0 %	60 %	40 %	239904688
51	NC_012796	CCCGG	2	10	57541	57550	0 %	0 %	40 %	60 %	239904693
52	NC_012796	CGGCC	2	10	57940	57949	0 %	0 %	40 %	60 %	239904693
53	NC_012796	GGCCA	2	10	58437	58446	20 %	0 %	40 %	40 %	239904693
54	NC_012796	TGGAC	2	10	59800	59809	20 %	20 %	40 %	20 %	239904694
55	NC_012796	GGCCT	2	10	60548	60557	0 %	20 %	40 %	40 %	239904695
56	NC_012796	CGGCC	2	10	61692	61701	0 %	0 %	40 %	60 %	239904695
57	NC_012796	GGCCG	2	10	61771	61780	0 %	0 %	60 %	40 %	239904695
58	NC_012796	GGCCG	2	10	62740	62749	0 %	0 %	60 %	40 %	239904696
59	NC_012796	ATCGT	2	10	64458	64467	20 %	40 %	20 %	20 %	239904698
60	NC_012796	AAACC	2	10	65913	65922	60 %	0 %	0 %	40 %	239904699
61	NC_012796	CGGGC	2	10	69733	69742	0 %	0 %	60 %	40 %	239904703
62	NC_012796	GCCGC	2	10	70134	70143	0 %	0 %	40 %	60 %	239904704
63	NC_012796	CTCTT	2	10	71350	71359	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_012796	GGCGT	2	10	71543	71552	0 %	20 %	60 %	20 %	239904707
65	NC_012796	CGCCA	2	10	73208	73217	20 %	0 %	20 %	60 %	239904708
66	NC_012796	CAGCG	2	10	73913	73922	20 %	0 %	40 %	40 %	239904708
67	NC_012796	GCTCG	2	10	77845	77854	0 %	20 %	40 %	40 %	239904711
68	NC_012796	GCCGC	2	10	79476	79485	0 %	0 %	40 %	60 %	239904713
69	NC_012796	GCGCG	2	10	79842	79851	0 %	0 %	60 %	40 %	239904714
70	NC_012796	GCCGT	2	10	79922	79931	0 %	20 %	40 %	40 %	239904714
71	NC_012796	CGGCC	2	10	80310	80319	0 %	0 %	40 %	60 %	239904714
72	NC_012796	CGGCG	2	10	82370	82379	0 %	0 %	60 %	40 %	239904716
73	NC_012796	TTCTT	2	10	85405	85414	0 %	80 %	0 %	20 %	239904718
74	NC_012796	TAATA	2	10	86574	86583	60 %	40 %	0 %	0 %	239904719
75	NC_012796	AAATT	2	10	86749	86758	60 %	40 %	0 %	0 %	239904719
76	NC_012796	TAAAA	2	10	87991	88000	80 %	20 %	0 %	0 %	239904720
77	NC_012796	GTTTT	2	10	88114	88123	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012796	TTGGT	2	10	91783	91792	0 %	60 %	40 %	0 %	239904725
79	NC_012796	GCTTG	2	10	92539	92548	0 %	40 %	40 %	20 %	239904726
80	NC_012796	TATAA	3	15	93303	93317	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012796	AGCTA	2	10	93553	93562	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_012796	AAGTA	2	10	95088	95097	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012796	CATTT	2	10	95191	95200	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_012796	GAAAA	2	10	95585	95594	80 %	0 %	20 %	0 %	239904729
85	NC_012796	AAGAA	2	10	97812	97821	80 %	0 %	20 %	0 %	239904732
86	NC_012796	TAGGT	2	10	98922	98931	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012796	CCTGG	2	10	99170	99179	0 %	20 %	40 %	40 %	239904734
88	NC_012796	CGTAG	2	10	102225	102234	20 %	20 %	40 %	20 %	239904738
89	NC_012796	CCTGG	2	10	102449	102458	0 %	20 %	40 %	40 %	239904738
90	NC_012796	GGGAG	2	10	104500	104509	20 %	0 %	80 %	0 %	239904740
91	NC_012796	TTGAT	2	10	108016	108025	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012796	AGTTG	2	10	109702	109711	20 %	40 %	40 %	0 %	239904748
93	NC_012796	ATATA	2	10	111489	111498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012796	CTTTT	2	10	112131	112140	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_012796	AAATT	2	10	112554	112563	60 %	40 %	0 %	0 %	239904750
96	NC_012796	AAAGA	2	10	114541	114550	80 %	0 %	20 %	0 %	239904754
97	NC_012796	TAAGG	2	10	117511	117520	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012796	GAGAT	2	10	117662	117671	40 %	20 %	40 %	0 %	239904757
99	NC_012796	AGTCG	2	10	117808	117817	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_012796	TCATT	2	10	118191	118200	20 %	60 %	0 %	20 %	239904758
101	NC_012796	TGGTG	2	10	118622	118631	0 %	40 %	60 %	0 %	239904759
102	NC_012796	CTTCG	2	10	119179	119188	0 %	40 %	20 %	40 %	239904760
103	NC_012796	GGCAT	2	10	120905	120914	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_012796	CAAGG	2	10	122346	122355	40 %	0 %	40 %	20 %	239904762
105	NC_012796	AGATG	2	10	123298	123307	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012796	GCCCG	2	10	123455	123464	0 %	0 %	40 %	60 %	239904765
107	NC_012796	CAATC	2	10	123859	123868	40 %	20 %	0 %	40 %	239904765
108	NC_012796	CGCCA	2	10	127741	127750	20 %	0 %	20 %	60 %	239904769
109	NC_012796	TGGCA	2	10	129628	129637	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_012796	TGTTT	2	10	129770	129779	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012796	AGCGG	2	10	131069	131078	20 %	0 %	60 %	20 %	239904771
112	NC_012796	TCGGA	2	10	134689	134698	20 %	20 %	40 %	20 %	239904774
113	NC_012796	GTTTG	2	10	134936	134945	0 %	60 %	40 %	0 %	239904774
114	NC_012796	GGCAT	2	10	135305	135314	20 %	20 %	40 %	20 %	239904775
115	NC_012796	AAGAA	2	10	135590	135599	80 %	0 %	20 %	0 %	239904775
116	NC_012796	TTTTC	2	10	145561	145570	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_012796	TGGCG	2	10	146767	146776	0 %	20 %	60 %	20 %	239904791
118	NC_012796	GGCGC	2	10	146784	146793	0 %	0 %	60 %	40 %	239904791
119	NC_012796	TGCCG	2	10	147885	147894	0 %	20 %	40 %	40 %	239904792
120	NC_012796	TGGGG	2	10	150467	150476	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012796	AAGGC	2	10	150814	150823	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_012796	CCGCG	2	10	152365	152374	0 %	0 %	40 %	60 %	239904795
123	NC_012796	GTTTT	2	10	153672	153681	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012796	GGGCC	2	10	155352	155361	0 %	0 %	60 %	40 %	239904796
125	NC_012796	ATTGG	2	10	158091	158100	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012796	TCTGG	2	10	158233	158242	0 %	40 %	40 %	20 %	239904797
127	NC_012796	TGGCA	2	10	159159	159168	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_012796	GTCCT	2	10	159651	159660	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_012796	ACGCC	2	10	160105	160114	20 %	0 %	20 %	60 %	239904799
130	NC_012796	AGCCG	2	10	160414	160423	20 %	0 %	40 %	40 %	239904800
131	NC_012796	TCGGT	2	10	161760	161769	0 %	40 %	40 %	20 %	239904801
132	NC_012796	CAGAC	2	10	163704	163713	40 %	0 %	20 %	40 %	239904801
133	NC_012796	CGCCA	2	10	166792	166801	20 %	0 %	20 %	60 %	239904805
134	NC_012796	GCAAA	2	10	169958	169967	60 %	0 %	20 %	20 %	239904806
135	NC_012796	GGGCT	2	10	171240	171249	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_012796	AGCCC	2	10	173034	173043	20 %	0 %	20 %	60 %	239904807
137	NC_012796	CGGCC	2	10	174337	174346	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_012796	GCGTG	2	10	175002	175011	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
139	NC_012796	CCCGG	2	10	175855	175864	0 %	0 %	40 %	60 %	239904810
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