MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio magneticus RS-1

Total Repeats: 757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012796	GCGCC	2	10	1804	1813	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_012796	CAAGA	2	10	13045	13054	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012796	CTTGG	2	10	16806	16815	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_012796	CGACA	2	10	22464	22473	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_012796	GGCGT	2	10	39108	39117	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_012796	CACGA	2	10	44890	44899	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_012796	CATGG	2	10	46600	46609	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_012796	CGGCG	2	10	51035	51044	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_012796	GGGGA	2	10	51110	51119	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012796	CTGCC	2	10	52014	52023	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_012796	GCCCA	2	10	52072	52081	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_012796	CTCTT	2	10	71350	71359	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_012796	GTTTT	2	10	88114	88123	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012796	TATAA	3	15	93303	93317	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012796	AGCTA	2	10	93553	93562	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012796	AAGTA	2	10	95088	95097	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012796	CATTT	2	10	95191	95200	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012796	TAGGT	2	10	98922	98931	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012796	TTGAT	2	10	108016	108025	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012796	ATATA	2	10	111489	111498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012796	CTTTT	2	10	112131	112140	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_012796	TAAGG	2	10	117511	117520	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012796	AGTCG	2	10	117808	117817	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_012796	GGCAT	2	10	120905	120914	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012796	AGATG	2	10	123298	123307	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012796	TGGCA	2	10	129628	129637	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_012796	TGTTT	2	10	129770	129779	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012796	TTTTC	2	10	145561	145570	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_012796	TGGGG	2	10	150467	150476	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012796	AAGGC	2	10	150814	150823	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_012796	GTTTT	2	10	153672	153681	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012796	ATTGG	2	10	158091	158100	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012796	TGGCA	2	10	159159	159168	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_012796	GTCCT	2	10	159651	159660	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_012796	GGGCT	2	10	171240	171249	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_012796	CGGCC	2	10	174337	174346	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_012796	GCGTG	2	10	175002	175011	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_012796	CTCTT	2	10	180511	180520	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_012796	CAGGC	2	10	194100	194109	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_012796	GGCGC	2	10	194225	194234	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_012796	CGTCG	2	10	195598	195607	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_012796	TGTCC	2	10	195649	195658	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_012796	GGCGG	2	10	208932	208941	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
44	NC_012796	CGGCC	2	10	208979	208988	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
45	NC_012796	CGCGG	2	10	209377	209386	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
46	NC_012796	CCGAC	2	10	223767	223776	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
47	NC_012796	GCGAC	2	10	231926	231935	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
48	NC_012796	GCCGC	2	10	236514	236523	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
49	NC_012796	GCGTT	2	10	241299	241308	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_012796	GGCCG	2	10	248075	248084	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_012796	CAGGA	2	10	262019	262028	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_012796	GTAGG	2	10	270383	270392	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012796	CCGGC	2	10	270471	270480	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
54	NC_012796	GGCCG	2	10	273112	273121	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_012796	GGAGA	2	10	277801	277810	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012796	ACCCC	2	10	278143	278152	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
57	NC_012796	GGAAG	2	10	360786	360795	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012796	AGAGA	2	10	376668	376677	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012796	CCCCG	2	10	390648	390657	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
60	NC_012796	GGGAT	2	10	393038	393047	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012796	ATCCC	2	10	395992	396001	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
62	NC_012796	AAGCC	2	10	396242	396251	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_012796	CCGCC	3	15	405141	405155	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
64	NC_012796	GAAGA	2	10	408373	408382	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012796	GCGTT	2	10	420078	420087	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
66	NC_012796	CGGCT	2	10	426600	426609	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_012796	CGGGC	2	10	441234	441243	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
68	NC_012796	GCCGG	2	10	451265	451274	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_012796	CGTCA	2	10	461482	461491	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_012796	GGACG	2	10	470316	470325	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_012796	GCGTC	2	10	484080	484089	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_012796	CTGTC	2	10	494879	494888	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_012796	GCCGC	2	10	509601	509610	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
74	NC_012796	CGGGC	2	10	509733	509742	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
75	NC_012796	CGGGG	2	10	510221	510230	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
76	NC_012796	TGGCC	2	10	514067	514076	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
77	NC_012796	TGCCT	2	10	514221	514230	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_012796	GGCCG	2	10	526966	526975	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
79	NC_012796	AGGGC	2	10	533662	533671	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_012796	AACAT	2	10	572582	572591	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_012796	GGCCG	2	10	584321	584330	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
82	NC_012796	ACCAG	2	10	584522	584531	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_012796	GCCGC	2	10	587489	587498	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
84	NC_012796	GCGCC	2	10	632791	632800	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
85	NC_012796	AGGGG	2	10	636381	636390	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012796	GAGAA	2	10	642338	642347	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012796	TCTTT	2	10	642719	642728	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_012796	GCCGC	2	10	642947	642956	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
89	NC_012796	TTGTG	2	10	666006	666015	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012796	GGCCC	2	10	684531	684540	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
91	NC_012796	GGCCG	2	10	689773	689782	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
92	NC_012796	TTTGT	2	10	692927	692936	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012796	CAAAA	2	10	695913	695922	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_012796	TATTT	2	10	700717	700726	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012796	AGCAT	2	10	700755	700764	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_012796	CGGGG	2	10	709253	709262	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
97	NC_012796	CGAGT	2	10	720212	720221	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_012796	GCCCG	2	10	723155	723164	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
99	NC_012796	CGGCG	2	10	730590	730599	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
100	NC_012796	GGGCC	2	10	731457	731466	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_012796	GGGTG	2	10	736108	736117	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012796	GGGGC	2	10	736192	736201	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
103	NC_012796	GGCGG	2	10	741672	741681	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
104	NC_012796	GCCGG	2	10	742908	742917	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
105	NC_012796	CGGCC	2	10	750990	750999	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
106	NC_012796	GGCCG	2	10	761291	761300	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
107	NC_012796	TGGGC	2	10	773201	773210	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
108	NC_012796	CGCGG	2	10	791515	791524	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
109	NC_012796	TTTCA	2	10	799779	799788	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_012796	GACTT	2	10	799897	799906	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_012796	TTCCG	2	10	807263	807272	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
112	NC_012796	AGGCG	2	10	807393	807402	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
113	NC_012796	ATTTT	2	10	807758	807767	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012796	CGTGT	2	10	837708	837717	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_012796	CGCGG	2	10	839552	839561	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
116	NC_012796	TCCCG	2	10	842332	842341	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
117	NC_012796	TTGCG	2	10	842367	842376	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_012796	CTCTT	2	10	848598	848607	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_012796	TATAC	2	10	852239	852248	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_012796	CCGGC	2	10	852287	852296	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
121	NC_012796	CTGGT	2	10	854434	854443	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_012796	GGCCG	2	10	856709	856718	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
123	NC_012796	CGGGC	2	10	858143	858152	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124	NC_012796	GGGGT	2	10	897697	897706	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012796	TAGGC	2	10	908474	908483	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_012796	GCGCC	2	10	911231	911240	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
127	NC_012796	TCCAC	2	10	918818	918827	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_012796	CGGGC	2	10	924749	924758	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
129	NC_012796	AGAAA	2	10	927496	927505	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012796	TGCCG	2	10	940624	940633	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_012796	GCAGG	2	10	940653	940662	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
132	NC_012796	CCCCG	2	10	940677	940686	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
133	NC_012796	TTGTA	2	10	943348	943357	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012796	AAGGG	2	10	954620	954629	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012796	TATGG	2	10	955708	955717	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012796	CGCGG	2	10	957098	957107	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_012796	CAGGT	2	10	967389	967398	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_012796	CGGCC	2	10	978435	978444	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
139	NC_012796	TTTAG	2	10	987708	987717	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012796	ATTGG	2	10	1000305	1000314	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012796	GTTTT	2	10	1003568	1003577	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012796	TGGGT	2	10	1004827	1004836	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012796	CTGGG	2	10	1007278	1007287	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
144	NC_012796	AGCGA	2	10	1010235	1010244	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
145	NC_012796	AGAGG	2	10	1015721	1015730	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
146	NC_012796	GATGC	2	10	1029884	1029893	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_012796	AATTT	2	10	1047871	1047880	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_012796	GGCCG	2	10	1822558	1822567	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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423	NC_012796	TCGTC	2	10	3169275	3169284	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
424	NC_012796	AGGCG	2	10	3175586	3175595	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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487	NC_012796	ATCGG	2	10	3535363	3535372	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
488	NC_012796	GGCAG	2	10	3537469	3537478	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
489	NC_012796	CGGGG	2	10	3544895	3544904	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
490	NC_012796	GTTTG	2	10	3548753	3548762	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
491	NC_012796	CGGCG	2	10	3569568	3569577	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
492	NC_012796	CCGGC	2	10	3569582	3569591	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
493	NC_012796	TGACG	2	10	3574585	3574594	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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