MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Desulfovibrio magneticus RS-1 plasmid pDMC2

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012795	CAT	2	6	311	316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828746
2	NC_012795	GAA	2	6	364	369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828746
3	NC_012795	TAA	2	6	392	397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828746
4	NC_012795	TCA	2	6	439	444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828746
5	NC_012795	TTA	2	6	580	585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239828746
6	NC_012795	TTA	2	6	653	658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239828746
7	NC_012795	TTG	2	6	707	712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828746
8	NC_012795	CAA	3	9	740	748	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828746
9	NC_012795	CAA	2	6	769	774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828746
10	NC_012795	CAG	2	6	821	826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828746
11	NC_012795	TTG	2	6	866	871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828746
12	NC_012795	CAG	2	6	942	947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828747
13	NC_012795	ACT	2	6	957	962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828747
14	NC_012795	GCA	2	6	1022	1027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828747
15	NC_012795	ATA	2	6	1177	1182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828747
16	NC_012795	ATA	2	6	1302	1307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828747
17	NC_012795	ATG	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828747
18	NC_012795	GAA	2	6	1332	1337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828747
19	NC_012795	ACC	2	6	1353	1358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239828747
20	NC_012795	GGT	2	6	1378	1383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239828747
21	NC_012795	AGA	2	6	1509	1514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828747
22	NC_012795	GAT	2	6	1818	1823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828747
23	NC_012795	TGC	2	6	1859	1864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828747
24	NC_012795	AAC	2	6	2527	2532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828748
25	NC_012795	GAT	2	6	2549	2554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828748
26	NC_012795	CTG	2	6	2589	2594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828748
27	NC_012795	GTG	3	9	2976	2984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239828748
28	NC_012795	ATC	2	6	3282	3287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828749
29	NC_012795	ATA	2	6	3330	3335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828749
30	NC_012795	ACA	2	6	3457	3462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828749
31	NC_012795	AAT	2	6	3498	3503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828749
32	NC_012795	TCA	2	6	3532	3537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828749
33	NC_012795	TGC	2	6	3608	3613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828749
34	NC_012795	GCA	2	6	3654	3659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828749
35	NC_012795	CAG	2	6	3660	3665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828749
36	NC_012795	TAG	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828749
37	NC_012795	TCT	2	6	3774	3779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828749
38	NC_012795	TTG	2	6	3865	3870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828749
39	NC_012795	TGT	2	6	4497	4502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828750
40	NC_012795	GCT	2	6	4504	4509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828750
41	NC_012795	TAA	2	6	4593	4598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828750
42	NC_012795	ATT	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239828750
43	NC_012795	ATG	2	6	4838	4843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828750
44	NC_012795	AAT	2	6	4914	4919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828750
45	NC_012795	TTG	2	6	4963	4968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828750
46	NC_012795	AAT	2	6	5049	5054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828750
47	NC_012795	TGT	2	6	5076	5081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239828750
48	NC_012795	AAG	2	6	5125	5130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828750
49	NC_012795	TGA	2	6	5933	5938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828751
50	NC_012795	TTA	2	6	5968	5973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239828751
51	NC_012795	ATG	2	6	6055	6060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828751
52	NC_012795	ACA	2	6	6573	6578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828752
53	NC_012795	CAA	2	6	6597	6602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828752
54	NC_012795	AAG	2	6	6679	6684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828752
55	NC_012795	TAT	3	9	6798	6806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239828752
56	NC_012795	GAA	2	6	6843	6848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828752
57	NC_012795	AGG	2	6	6941	6946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239828752
58	NC_012795	AAT	2	6	6951	6956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828752
59	NC_012795	ATT	2	6	6971	6976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239828752
60	NC_012795	TGC	2	6	7056	7061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828752
61	NC_012795	ACC	2	6	7812	7817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239828753
62	NC_012795	GCA	2	6	7938	7943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239828753
63	NC_012795	TGA	2	6	7991	7996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239828753
64	NC_012795	CTG	3	9	8014	8022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828753
65	NC_012795	AGG	2	6	8071	8076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239828753
66	NC_012795	GGT	2	6	8143	8148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239828753
67	NC_012795	GCT	2	6	8245	8250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828754
68	NC_012795	CTG	2	6	8253	8258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239828754
69	NC_012795	ACA	2	6	8283	8288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239828754
70	NC_012795	AAT	2	6	8314	8319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239828754
71	NC_012795	TTC	2	6	8356	8361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828754
72	NC_012795	GAA	2	6	8370	8375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239828754
73	NC_012795	TCC	2	6	8445	8450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239828754
74	NC_012795	TCA	3	9	8469	8477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239828754
75	NC_012795	TTC	2	6	8481	8486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828754
76	NC_012795	TTC	2	6	8547	8552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828755
77	NC_012795	TTC	2	6	8669	8674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239828755

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.