MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacillus sp. WCH70 chromosome

Total Repeats: 243

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012793	TGTGTC	2	12	12348	12359	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012793	TGCGTC	2	12	12549	12560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012793	ATTTTT	2	12	23710	23721	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012793	TTTTAT	2	12	30770	30781	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012793	AGAGGG	2	12	47024	47035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012793	TAATTT	2	12	51102	51113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012793	TTATAA	2	12	51138	51149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012793	TTTATA	2	12	91394	91405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012793	TGCGTC	2	12	94856	94867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012793	GTCTGC	2	12	95114	95125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012793	TGCGTC	2	12	95193	95204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012793	AGTCAA	2	12	105643	105654	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_012793	GTTTGC	2	12	137475	137486	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012793	TCGGTG	2	12	164171	164182	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012793	GTCTGC	2	12	166243	166254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012793	TGCGTC	2	12	166322	166333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012793	TAAAAA	2	12	179817	179828	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012793	ATTCCT	2	12	185740	185751	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012793	AAAACT	2	12	209821	209832	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012793	GATATT	2	12	215553	215564	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012793	TCTTTT	2	12	218542	218553	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_012793	AAATTT	2	12	230540	230551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012793	TATTTT	2	12	230804	230815	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012793	GCTGAA	2	12	235511	235522	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_012793	TGCGTC	2	12	237182	237193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012793	TTTTTA	2	12	265149	265160	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012793	ATTTGG	2	12	266534	266545	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012793	TTTTTA	2	12	327542	327553	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012793	ACGATG	2	12	359915	359926	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012793	AAGAAA	2	12	393330	393341	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012793	GCCTTT	2	12	396508	396519	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012793	ACAAAT	2	12	398530	398541	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012793	CTTTGT	2	12	407511	407522	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012793	TTTTTG	2	12	407573	407584	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012793	TTTATT	2	12	438401	438412	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012793	AAAATA	2	12	480520	480531	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012793	TTTTTA	2	12	480542	480553	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012793	AAGGGG	2	12	480622	480633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012793	TGGAGA	2	12	509195	509206	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012793	ATTATA	2	12	517999	518010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012793	TAATTT	2	12	529799	529810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012793	ATTAAA	2	12	529859	529870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012793	TGCTTC	2	12	553493	553504	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012793	CGATTA	2	12	554113	554124	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012793	GTCTGC	2	12	564574	564585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012793	TGCGTC	2	12	564703	564714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012793	GTCTGC	2	12	564829	564840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012793	TGCGTC	2	12	564908	564919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012793	ATTTTT	2	12	571764	571775	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012793	AAGCAA	2	12	580593	580604	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_012793	TATTTT	2	12	595140	595151	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012793	GTATAT	2	12	628368	628379	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012793	TTTTAT	2	12	635364	635375	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012793	ATATTT	2	12	635397	635408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012793	GATTTA	2	12	640766	640777	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012793	AAATCA	2	12	647552	647563	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_012793	TGGCGG	2	12	658938	658949	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_012793	AAGGAA	2	12	677380	677391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012793	CGAAGG	2	12	692721	692732	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_012793	AAGGGG	2	12	704324	704335	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012793	AAAATG	2	12	706385	706396	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012793	GGAGTG	2	12	725519	725530	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012793	TCTTTT	2	12	746097	746108	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_012793	AATGAA	2	12	762284	762295	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012793	GTAATT	2	12	833422	833433	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012793	GCCAAT	2	12	856321	856332	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012793	TTTGAT	2	12	869443	869454	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012793	TATGAG	2	12	871732	871743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012793	ATGAAT	2	12	885819	885830	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012793	ATTCAT	2	12	894488	894499	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_012793	AGAAAA	2	12	900541	900552	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012793	AAAAGA	2	12	903461	903472	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012793	AAAAGG	2	12	919783	919794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012793	TAACAT	2	12	934511	934522	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_012793	AAAAAG	2	12	935809	935820	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012793	TTTGAC	2	12	953064	953075	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_012793	GAATAA	2	12	960891	960902	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012793	TTTTGT	2	12	965320	965331	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012793	CAGTAC	2	12	983146	983157	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012793	ATCAAA	2	12	1001545	1001556	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_012793	AAAATG	2	12	1009013	1009024	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012793	ATAAAA	2	12	1019864	1019875	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012793	AGAGGG	2	12	1044538	1044549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012793	ATTTTT	2	12	1048607	1048618	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012793	AAGGAA	2	12	1086751	1086762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012793	ATCAAT	2	12	1092020	1092031	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_012793	TCCATT	2	12	1206461	1206472	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012793	CTATAG	2	12	1249869	1249880	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_012793	TAGTAT	2	12	1271309	1271320	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012793	CATAAA	2	12	1292421	1292432	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_012793	GAAAAA	2	12	1300806	1300817	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012793	AATAAA	2	12	1300861	1300872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012793	ATATGC	2	12	1301996	1302007	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_012793	GGGATG	2	12	1315846	1315857	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012793	GCTTTT	2	12	1371967	1371978	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012793	GTTAAA	2	12	1383016	1383027	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012793	GTATCC	2	12	1388968	1388979	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_012793	AATGTT	2	12	1412433	1412444	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012793	AAAATA	2	12	1420186	1420197	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012793	ATTTTA	2	12	1425284	1425295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012793	GAAGAG	2	12	1427935	1427946	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012793	TAGAAA	2	12	1430061	1430072	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012793	TCTTTT	2	12	1435013	1435024	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_012793	TTAGTA	2	12	1447898	1447909	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012793	TTTCTT	2	12	1458766	1458777	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_012793	GGGTGT	2	12	1464661	1464672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012793	ATAACG	2	12	1478400	1478411	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_012793	AAATTT	2	12	1482918	1482929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012793	TTTACT	2	12	1508878	1508889	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_012793	AAACCA	2	12	1516249	1516260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012793	ATTTAA	2	12	1542539	1542550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012793	AAAAGT	2	12	1552964	1552975	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012793	TTTGTT	2	12	1565944	1565955	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012793	AACAAA	2	12	1570173	1570184	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_012793	TTGAAT	2	12	1582421	1582432	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012793	TTCCTT	2	12	1601918	1601929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012793	GAAGCG	2	12	1601999	1602010	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_012793	AACGAA	2	12	1606804	1606815	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_012793	AAAGGC	2	12	1607778	1607789	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_012793	AGCCAT	2	12	1608419	1608430	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012793	AGGAAG	2	12	1608631	1608642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012793	GTGTTG	2	12	1612076	1612087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012793	GGCTTT	2	12	1616571	1616582	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_012793	AAAAAG	2	12	1649336	1649347	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012793	GAAGCG	2	12	1664657	1664668	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_012793	GATAGA	2	12	1668600	1668611	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012793	TATTTT	2	12	1673575	1673586	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012793	GCAACA	2	12	1682963	1682974	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012793	TGAAGA	2	12	1684045	1684056	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012793	TAATAT	2	12	1703626	1703637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012793	TGTCAG	2	12	1704941	1704952	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_012793	GAAGGG	2	12	1712490	1712501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012793	ACAAAA	2	12	1727717	1727728	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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149	NC_012793	GTATCC	2	12	1795505	1795516	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_012793	TATCCC	2	12	2059338	2059349	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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240	NC_012793	TTTCGT	2	12	3422384	3422395	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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242	NC_012793	CTTTAT	2	12	3448460	3448471	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
243	NC_012793	AAGCGC	2	12	3450934	3450945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.