MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacillus sp. WCH70 chromosome

Total Repeats: 676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012793	ATTTT	2	10	2725	2734	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012793	TCGTG	2	10	11333	11342	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012793	TAAAA	2	10	20266	20275	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012793	TCGTG	2	10	32180	32189	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_012793	ATTTT	2	10	36727	36736	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012793	ATTTT	2	10	36771	36780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012793	ATTAG	2	10	37168	37177	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012793	AAAAG	2	10	37239	37248	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012793	GGTGT	2	10	45970	45979	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012793	GTAAA	2	10	46013	46022	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012793	TTTTG	2	10	51443	51452	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012793	CTTTT	2	10	69408	69417	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012793	GATAT	2	10	77837	77846	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012793	AGCGG	2	10	82798	82807	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_012793	ATGCG	2	10	89079	89088	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012793	TCGTG	2	10	94066	94075	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012793	TCGTG	2	10	101008	101017	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012793	CCTTT	2	10	105514	105523	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_012793	CAGAG	2	10	115831	115840	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012793	AAACC	2	10	121019	121028	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_012793	TTTAA	2	10	136221	136230	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012793	TATAA	2	10	137548	137557	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012793	AGTAG	2	10	152624	152633	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012793	CGAAT	2	10	160128	160137	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012793	AGGAA	2	10	160294	160303	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012793	GAAAA	2	10	160641	160650	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012793	AAAAC	2	10	160808	160817	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_012793	TCATC	2	10	161168	161177	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_012793	GGCTT	2	10	161544	161553	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_012793	TCGTG	2	10	165289	165298	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_012793	ATAAA	2	10	172530	172539	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012793	ATATG	2	10	173835	173844	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012793	TTACA	2	10	182004	182013	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_012793	TTCGG	2	10	183684	183693	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_012793	TGGTT	2	10	187472	187481	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012793	TTGCA	2	10	194278	194287	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_012793	AGGAT	2	10	196794	196803	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012793	AAAAG	2	10	198566	198575	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012793	TGGAT	2	10	201021	201030	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012793	AAGCG	2	10	208872	208881	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_012793	GTATT	2	10	218458	218467	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012793	GTAGT	2	10	234413	234422	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012793	TCGTG	2	10	236625	236634	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_012793	GAATT	2	10	240977	240986	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012793	GTAGT	2	10	241124	241133	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012793	GAAAC	2	10	241229	241238	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_012793	CGAAG	2	10	246026	246035	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_012793	AAAAC	2	10	249622	249631	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_012793	CTTTT	2	10	256397	256406	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_012793	GAAGA	2	10	256417	256426	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012793	GAAAG	2	10	273042	273051	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012793	CGCTT	2	10	276951	276960	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_012793	ATTTT	2	10	278784	278793	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012793	AACAA	2	10	279118	279127	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_012793	TCGTG	2	10	280312	280321	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_012793	CGAAA	2	10	284507	284516	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_012793	AGAAA	2	10	302385	302394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012793	CTTTT	2	10	303797	303806	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_012793	CTTTT	2	10	310038	310047	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_012793	CGAAG	2	10	310076	310085	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_012793	ATTTT	2	10	316630	316639	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012793	GAATG	2	10	316700	316709	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012793	TTTTC	2	10	318349	318358	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_012793	CAATA	2	10	318383	318392	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_012793	CAAAA	2	10	321434	321443	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_012793	TCTGT	2	10	333686	333695	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_012793	AAATG	2	10	347455	347464	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012793	TTAGT	2	10	348617	348626	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012793	CGCTT	2	10	350067	350076	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_012793	ATTTT	2	10	350366	350375	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012793	AGCGA	2	10	360772	360781	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_012793	TTATT	2	10	372787	372796	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012793	CGAAG	2	10	377420	377429	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_012793	GAAAG	2	10	379632	379641	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012793	ATAAA	2	10	379983	379992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012793	CTGAT	2	10	381451	381460	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_012793	CGAAG	2	10	386378	386387	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
78	NC_012793	TAACA	2	10	391755	391764	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_012793	TAAAA	2	10	396317	396326	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012793	GAAAG	2	10	397760	397769	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012793	TCTTT	2	10	411352	411361	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_012793	TGTAT	2	10	411386	411395	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012793	ATCTT	2	10	418488	418497	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_012793	TAATT	2	10	418558	418567	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012793	AGGAG	2	10	428522	428531	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012793	TTTCA	2	10	435026	435035	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_012793	CACAC	2	10	444775	444784	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
88	NC_012793	TGGGG	2	10	456053	456062	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012793	TAAGA	2	10	463180	463189	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012793	TCTCC	2	10	472802	472811	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
91	NC_012793	TTAAT	2	10	485607	485616	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012793	AGAAA	2	10	489888	489897	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012793	ATTCT	2	10	490411	490420	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_012793	AATTC	2	10	490708	490717	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_012793	TAAAA	2	10	491603	491612	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012793	TTATT	2	10	493418	493427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012793	TAATT	2	10	502985	502994	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012793	CGCTT	2	10	506054	506063	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_012793	ACGGT	2	10	510582	510591	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_012793	ATATT	2	10	511126	511135	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012793	AGGGA	2	10	514301	514310	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012793	TAAAA	2	10	517830	517839	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012793	CGAAG	2	10	523649	523658	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_012793	ATATT	2	10	529818	529827	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012793	AAATA	2	10	529871	529880	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012793	TTTTA	2	10	545190	545199	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012793	ATTAC	2	10	550881	550890	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_012793	TGCAT	2	10	553323	553332	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_012793	TAACA	2	10	554018	554027	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_012793	CGCTT	2	10	560814	560823	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_012793	ATTTT	2	10	561905	561914	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012793	GGTGT	2	10	562095	562104	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012793	TCGTG	2	10	563961	563970	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_012793	GTAGT	2	10	569924	569933	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012793	GACAA	2	10	570100	570109	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_012793	GTTTC	2	10	571727	571736	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_012793	TTTGT	2	10	577376	577385	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012793	GGGAA	2	10	581244	581253	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012793	ACTTT	2	10	587163	587172	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_012793	TTCGC	2	10	608779	608788	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_012793	TAATA	2	10	611591	611600	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012793	TATTT	2	10	616252	616261	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012793	AAATG	2	10	616724	616733	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012793	AACAA	2	10	619478	619487	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_012793	ATAAG	2	10	620854	620863	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_012793	ATGGA	2	10	621060	621069	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012793	ATTTT	2	10	622685	622694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012793	TAAAA	2	10	627323	627332	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012793	TCATT	2	10	632485	632494	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_012793	GGAGA	2	10	632921	632930	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012793	TAAAA	2	10	633050	633059	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012793	GAAAT	2	10	636530	636539	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012793	CAGGA	2	10	636690	636699	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_012793	TGACA	2	10	636991	637000	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_012793	GAAAA	2	10	641556	641565	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012793	TTTCG	2	10	641618	641627	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_012793	TCTCC	2	10	647457	647466	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
138	NC_012793	GAAGG	2	10	648469	648478	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012793	TAAAT	2	10	651857	651866	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012793	TAATA	2	10	663261	663270	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012793	ACGCA	2	10	672140	672149	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
142	NC_012793	GAAAA	2	10	672213	672222	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012793	AGTGG	2	10	672713	672722	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012793	TAACA	2	10	680875	680884	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_012793	ATCGT	2	10	692018	692027	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_012793	TTTTA	2	10	702909	702918	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_012793	GTAAA	2	10	704052	704061	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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