MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 2

Total Repeats: 914

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012792	AGGCC	2	10	209	218	20 %	0 %	40 %	40 %	239819986
2	NC_012792	CGGCA	2	10	1537	1546	20 %	0 %	40 %	40 %	239819987
3	NC_012792	GCCAG	2	10	2191	2200	20 %	0 %	40 %	40 %	239819988
4	NC_012792	GCGCG	2	10	3166	3175	0 %	0 %	60 %	40 %	239819989
5	NC_012792	CTTGC	2	10	3277	3286	0 %	40 %	20 %	40 %	239819989
6	NC_012792	GCGTC	2	10	6044	6053	0 %	20 %	40 %	40 %	239819992
7	NC_012792	TCGCT	2	10	6096	6105	0 %	40 %	20 %	40 %	239819992
8	NC_012792	GCATC	2	10	7533	7542	20 %	20 %	20 %	40 %	239819994
9	NC_012792	CTGGG	2	10	9755	9764	0 %	20 %	60 %	20 %	239819995
10	NC_012792	CGGCG	2	10	13794	13803	0 %	0 %	60 %	40 %	239819998
11	NC_012792	GCGCG	2	10	13876	13885	0 %	0 %	60 %	40 %	239819998
12	NC_012792	CGGCA	2	10	17065	17074	20 %	0 %	40 %	40 %	239820001
13	NC_012792	GACCA	2	10	19160	19169	40 %	0 %	20 %	40 %	239820003
14	NC_012792	GGCCA	2	10	20414	20423	20 %	0 %	40 %	40 %	239820004
15	NC_012792	GCGCG	2	10	20593	20602	0 %	0 %	60 %	40 %	239820004
16	NC_012792	CGCGG	2	10	20843	20852	0 %	0 %	60 %	40 %	239820004
17	NC_012792	CATCG	2	10	21279	21288	20 %	20 %	20 %	40 %	239820005
18	NC_012792	GGGCA	2	10	21397	21406	20 %	0 %	60 %	20 %	239820005
19	NC_012792	GGATC	2	10	22095	22104	20 %	20 %	40 %	20 %	239820006
20	NC_012792	CGCGA	2	10	26731	26740	20 %	0 %	40 %	40 %	239820011
21	NC_012792	GAGCA	2	10	28731	28740	40 %	0 %	40 %	20 %	239820012
22	NC_012792	TGCCC	2	10	28826	28835	0 %	20 %	20 %	60 %	239820012
23	NC_012792	GGGCT	2	10	30915	30924	0 %	20 %	60 %	20 %	239820015
24	NC_012792	CTGGC	2	10	31200	31209	0 %	20 %	40 %	40 %	239820015
25	NC_012792	GCGCC	2	10	34613	34622	0 %	0 %	40 %	60 %	239820017
26	NC_012792	CCTGG	2	10	35081	35090	0 %	20 %	40 %	40 %	239820017
27	NC_012792	CGACC	2	10	35228	35237	20 %	0 %	20 %	60 %	239820017
28	NC_012792	GCAAT	2	10	35946	35955	40 %	20 %	20 %	20 %	239820018
29	NC_012792	GCCGG	2	10	36308	36317	0 %	0 %	60 %	40 %	239820018
30	NC_012792	TGCGC	2	10	37838	37847	0 %	20 %	40 %	40 %	239820019
31	NC_012792	ACCTC	2	10	40008	40017	20 %	20 %	0 %	60 %	239820021
32	NC_012792	AAGGC	2	10	40107	40116	40 %	0 %	40 %	20 %	239820021
33	NC_012792	GTGCT	2	10	40790	40799	0 %	40 %	40 %	20 %	239820021
34	NC_012792	GGGCC	2	10	41467	41476	0 %	0 %	60 %	40 %	239820021
35	NC_012792	CGCGA	2	10	41531	41540	20 %	0 %	40 %	40 %	239820021
36	NC_012792	GGCGC	2	10	42005	42014	0 %	0 %	60 %	40 %	239820021
37	NC_012792	ACCTG	2	10	42877	42886	20 %	20 %	20 %	40 %	239820022
38	NC_012792	GCACC	2	10	43687	43696	20 %	0 %	20 %	60 %	239820023
39	NC_012792	TCGAA	2	10	43986	43995	40 %	20 %	20 %	20 %	239820023
40	NC_012792	GCACC	2	10	44137	44146	20 %	0 %	20 %	60 %	239820023
41	NC_012792	GGCCT	2	10	46063	46072	0 %	20 %	40 %	40 %	239820024
42	NC_012792	GGGCG	2	10	47563	47572	0 %	0 %	80 %	20 %	239820026
43	NC_012792	CCGGC	2	10	47655	47664	0 %	0 %	40 %	60 %	239820027
44	NC_012792	CCGGC	2	10	48044	48053	0 %	0 %	40 %	60 %	239820027
45	NC_012792	GGGCA	2	10	48105	48114	20 %	0 %	60 %	20 %	239820027
46	NC_012792	GCTGC	2	10	48663	48672	0 %	20 %	40 %	40 %	239820027
47	NC_012792	CCGGG	2	10	49237	49246	0 %	0 %	60 %	40 %	239820027
48	NC_012792	GCGCG	2	10	51136	51145	0 %	0 %	60 %	40 %	239820029
49	NC_012792	CGGAT	2	10	51254	51263	20 %	20 %	40 %	20 %	239820029
50	NC_012792	GCCGA	2	10	51446	51455	20 %	0 %	40 %	40 %	239820029
51	NC_012792	CATCG	2	10	53094	53103	20 %	20 %	20 %	40 %	239820032
52	NC_012792	TGCCG	2	10	53831	53840	0 %	20 %	40 %	40 %	239820032
53	NC_012792	CGTGG	2	10	55120	55129	0 %	20 %	60 %	20 %	239820033
54	NC_012792	GCGCA	2	10	55404	55413	20 %	0 %	40 %	40 %	239820034
55	NC_012792	CGATG	2	10	57074	57083	20 %	20 %	40 %	20 %	239820035
56	NC_012792	TGCGC	2	10	58895	58904	0 %	20 %	40 %	40 %	239820037
57	NC_012792	CCCGG	2	10	60221	60230	0 %	0 %	40 %	60 %	239820039
58	NC_012792	GATCG	2	10	60308	60317	20 %	20 %	40 %	20 %	239820039
59	NC_012792	GGGCC	2	10	63816	63825	0 %	0 %	60 %	40 %	239820041
60	NC_012792	GCCCG	2	10	65788	65797	0 %	0 %	40 %	60 %	239820043
61	NC_012792	GGGCA	2	10	66035	66044	20 %	0 %	60 %	20 %	239820043
62	NC_012792	CCGCG	2	10	66408	66417	0 %	0 %	40 %	60 %	239820044
63	NC_012792	CAGCT	2	10	66709	66718	20 %	20 %	20 %	40 %	239820044
64	NC_012792	CGGCC	2	10	68247	68256	0 %	0 %	40 %	60 %	239820046
65	NC_012792	AGCGC	2	10	68444	68453	20 %	0 %	40 %	40 %	239820046
66	NC_012792	GCTCG	2	10	69155	69164	0 %	20 %	40 %	40 %	239820046
67	NC_012792	CGTGC	2	10	71435	71444	0 %	20 %	40 %	40 %	239820047
68	NC_012792	CGCGC	2	10	71653	71662	0 %	0 %	40 %	60 %	239820047
69	NC_012792	CCGCA	2	10	72005	72014	20 %	0 %	20 %	60 %	239820048
70	NC_012792	CGCTT	2	10	72370	72379	0 %	40 %	20 %	40 %	239820048
71	NC_012792	GCGCC	2	10	72442	72451	0 %	0 %	40 %	60 %	239820048
72	NC_012792	TCGCC	2	10	73502	73511	0 %	20 %	20 %	60 %	239820050
73	NC_012792	GGCCC	2	10	75368	75377	0 %	0 %	40 %	60 %	239820051
74	NC_012792	GCCGC	2	10	76209	76218	0 %	0 %	40 %	60 %	239820052
75	NC_012792	TGCGC	2	10	76511	76520	0 %	20 %	40 %	40 %	239820052
76	NC_012792	GCGCA	2	10	76604	76613	20 %	0 %	40 %	40 %	239820052
77	NC_012792	GCGCC	2	10	78108	78117	0 %	0 %	40 %	60 %	239820054
78	NC_012792	AGTGC	2	10	83449	83458	20 %	20 %	40 %	20 %	239820060
79	NC_012792	CCGCA	2	10	83803	83812	20 %	0 %	20 %	60 %	239820061
80	NC_012792	GGCCT	2	10	84223	84232	0 %	20 %	40 %	40 %	239820061
81	NC_012792	CGCAG	2	10	87817	87826	20 %	0 %	40 %	40 %	239820064
82	NC_012792	GCGCC	2	10	90063	90072	0 %	0 %	40 %	60 %	239820066
83	NC_012792	GCAAG	2	10	90760	90769	40 %	0 %	40 %	20 %	239820068
84	NC_012792	CGGCG	2	10	91174	91183	0 %	0 %	60 %	40 %	239820068
85	NC_012792	CGCTG	2	10	92004	92013	0 %	20 %	40 %	40 %	239820069
86	NC_012792	TGGCG	2	10	92056	92065	0 %	20 %	60 %	20 %	239820069
87	NC_012792	CCGCG	2	10	93360	93369	0 %	0 %	40 %	60 %	239820070
88	NC_012792	CGATG	2	10	97595	97604	20 %	20 %	40 %	20 %	239820074
89	NC_012792	TCGCC	2	10	98288	98297	0 %	20 %	20 %	60 %	239820074
90	NC_012792	GCAGC	2	10	99835	99844	20 %	0 %	40 %	40 %	239820077
91	NC_012792	CGATG	2	10	99941	99950	20 %	20 %	40 %	20 %	239820077
92	NC_012792	GCAGC	2	10	100595	100604	20 %	0 %	40 %	40 %	239820078
93	NC_012792	GCCAC	2	10	100694	100703	20 %	0 %	20 %	60 %	239820078
94	NC_012792	CGGCG	2	10	101974	101983	0 %	0 %	60 %	40 %	239820078
95	NC_012792	GCCGC	2	10	103943	103952	0 %	0 %	40 %	60 %	239820079
96	NC_012792	CGCGC	2	10	106347	106356	0 %	0 %	40 %	60 %	239820080
97	NC_012792	GAGCA	2	10	106836	106845	40 %	0 %	40 %	20 %	239820080
98	NC_012792	TCCAG	2	10	107075	107084	20 %	20 %	20 %	40 %	239820080
99	NC_012792	GGCGA	2	10	107820	107829	20 %	0 %	60 %	20 %	239820080
100	NC_012792	CGAGA	2	10	108772	108781	40 %	0 %	40 %	20 %	239820081
101	NC_012792	CGGCG	2	10	109184	109193	0 %	0 %	60 %	40 %	239820082
102	NC_012792	CGGGC	2	10	109254	109263	0 %	0 %	60 %	40 %	239820082
103	NC_012792	GCGAT	2	10	109385	109394	20 %	20 %	40 %	20 %	239820082
104	NC_012792	GGCCT	2	10	109441	109450	0 %	20 %	40 %	40 %	239820082
105	NC_012792	GCCGA	2	10	110000	110009	20 %	0 %	40 %	40 %	239820083
106	NC_012792	CGCGG	2	10	110650	110659	0 %	0 %	60 %	40 %	239820084
107	NC_012792	CTGGA	2	10	113403	113412	20 %	20 %	40 %	20 %	239820085
108	NC_012792	TGGGA	2	10	114895	114904	20 %	20 %	60 %	0 %	239820085
109	NC_012792	GCGCA	2	10	115043	115052	20 %	0 %	40 %	40 %	239820085
110	NC_012792	CGCGC	2	10	120613	120622	0 %	0 %	40 %	60 %	239820091
111	NC_012792	TCGAT	2	10	120857	120866	20 %	40 %	20 %	20 %	239820091
112	NC_012792	ATCGC	2	10	121995	122004	20 %	20 %	20 %	40 %	239820092
113	NC_012792	GCGCG	2	10	122087	122096	0 %	0 %	60 %	40 %	239820092
114	NC_012792	TGGGC	2	10	124088	124097	0 %	20 %	60 %	20 %	239820094
115	NC_012792	CGGGA	2	10	126683	126692	20 %	0 %	60 %	20 %	239820097
116	NC_012792	CCCGG	2	10	129154	129163	0 %	0 %	40 %	60 %	239820099
117	NC_012792	CGCGG	2	10	129644	129653	0 %	0 %	60 %	40 %	239820100
118	NC_012792	CAAAT	2	10	130344	130353	60 %	20 %	0 %	20 %	239820101
119	NC_012792	TCGGC	2	10	130509	130518	0 %	20 %	40 %	40 %	239820101
120	NC_012792	CTGCG	2	10	131200	131209	0 %	20 %	40 %	40 %	239820102
121	NC_012792	CGCGC	2	10	131880	131889	0 %	0 %	40 %	60 %	239820103
122	NC_012792	GCATC	2	10	132298	132307	20 %	20 %	20 %	40 %	239820103
123	NC_012792	CTGGC	2	10	132486	132495	0 %	20 %	40 %	40 %	239820103
124	NC_012792	CCACC	2	10	133973	133982	20 %	0 %	0 %	80 %	239820105
125	NC_012792	GCACG	2	10	135716	135725	20 %	0 %	40 %	40 %	239820107
126	NC_012792	CCTGG	2	10	138362	138371	0 %	20 %	40 %	40 %	239820111
127	NC_012792	GCCGC	2	10	140468	140477	0 %	0 %	40 %	60 %	239820114
128	NC_012792	GCGCG	2	10	141692	141701	0 %	0 %	60 %	40 %	239820116
129	NC_012792	GCGCC	2	10	142528	142537	0 %	0 %	40 %	60 %	239820116
130	NC_012792	GCGCC	2	10	143259	143268	0 %	0 %	40 %	60 %	239820117
131	NC_012792	CCCGG	2	10	144377	144386	0 %	0 %	40 %	60 %	239820118
132	NC_012792	CGCGA	2	10	144784	144793	20 %	0 %	40 %	40 %	239820119
133	NC_012792	CGCGG	2	10	147807	147816	0 %	0 %	60 %	40 %	239820121
134	NC_012792	TCTGG	2	10	150474	150483	0 %	40 %	40 %	20 %	239820123
135	NC_012792	CTTGC	2	10	151601	151610	0 %	40 %	20 %	40 %	239820124
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252	NC_012792	AGGCC	2	10	291645	291654	20 %	0 %	40 %	40 %	239820257
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263	NC_012792	GCGGT	2	10	307154	307163	0 %	20 %	60 %	20 %	239820274
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