MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 2

Total Repeats: 241

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012792	T	6	6	356	361	0 %	100 %	0 %	0 %	239819986
2	NC_012792	C	6	6	2880	2885	0 %	0 %	0 %	100 %	239819989
3	NC_012792	T	6	6	3657	3662	0 %	100 %	0 %	0 %	239819989
4	NC_012792	G	6	6	9089	9094	0 %	0 %	100 %	0 %	239819995
5	NC_012792	G	6	6	11454	11459	0 %	0 %	100 %	0 %	239819997
6	NC_012792	G	6	6	15013	15018	0 %	0 %	100 %	0 %	239819999
7	NC_012792	T	6	6	19631	19636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012792	C	6	6	22240	22245	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_012792	T	6	6	54134	54139	0 %	100 %	0 %	0 %	239820032
10	NC_012792	T	6	6	57641	57646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012792	T	6	6	58392	58397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012792	A	6	6	66085	66090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012792	A	6	6	71885	71890	100 %	0 %	0 %	0 %	239820047
14	NC_012792	A	6	6	81378	81383	100 %	0 %	0 %	0 %	239820058
15	NC_012792	A	6	6	87326	87331	100 %	0 %	0 %	0 %	239820063
16	NC_012792	A	7	7	96877	96883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012792	A	6	6	97188	97193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012792	T	6	6	98454	98459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012792	C	7	7	99678	99684	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_012792	C	7	7	108476	108482	0 %	0 %	0 %	100 %	239820081
21	NC_012792	A	6	6	112094	112099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012792	C	7	7	115269	115275	0 %	0 %	0 %	100 %	239820086
23	NC_012792	C	6	6	122414	122419	0 %	0 %	0 %	100 %	239820092
24	NC_012792	T	7	7	125179	125185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012792	G	6	6	127252	127257	0 %	0 %	100 %	0 %	239820098
26	NC_012792	C	6	6	137215	137220	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_012792	A	6	6	138534	138539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012792	A	7	7	145450	145456	100 %	0 %	0 %	0 %	239820119
29	NC_012792	C	6	6	148033	148038	0 %	0 %	0 %	100 %	239820121
30	NC_012792	A	6	6	150146	150151	100 %	0 %	0 %	0 %	239820123
31	NC_012792	C	6	6	151406	151411	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
32	NC_012792	G	6	6	160866	160871	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012792	G	6	6	173065	173070	0 %	0 %	100 %	0 %	239820146
34	NC_012792	A	7	7	174159	174165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012792	A	6	6	185381	185386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012792	C	6	6	188269	188274	0 %	0 %	0 %	100 %	239820160
37	NC_012792	C	6	6	188415	188420	0 %	0 %	0 %	100 %	239820160
38	NC_012792	C	6	6	189445	189450	0 %	0 %	0 %	100 %	239820163
39	NC_012792	T	6	6	189565	189570	0 %	100 %	0 %	0 %	239820163
40	NC_012792	G	6	6	208363	208368	0 %	0 %	100 %	0 %	239820180
41	NC_012792	T	6	6	211105	211110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012792	A	6	6	215286	215291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012792	T	6	6	215307	215312	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012792	C	6	6	243069	243074	0 %	0 %	0 %	100 %	239820213
45	NC_012792	A	6	6	243757	243762	100 %	0 %	0 %	0 %	239820214
46	NC_012792	T	6	6	255192	255197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012792	C	6	6	259183	259188	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
48	NC_012792	A	7	7	274348	274354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012792	C	6	6	278310	278315	0 %	0 %	0 %	100 %	239820243
50	NC_012792	C	7	7	278436	278442	0 %	0 %	0 %	100 %	239820243
51	NC_012792	T	8	8	290123	290130	0 %	100 %	0 %	0 %	239820256
52	NC_012792	A	6	6	296924	296929	100 %	0 %	0 %	0 %	239820261
53	NC_012792	A	7	7	306258	306264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012792	C	6	6	319289	319294	0 %	0 %	0 %	100 %	239820285
55	NC_012792	C	6	6	322456	322461	0 %	0 %	0 %	100 %	239820288
56	NC_012792	C	6	6	323878	323883	0 %	0 %	0 %	100 %	239820290
57	NC_012792	C	8	8	324666	324673	0 %	0 %	0 %	100 %	239820291
58	NC_012792	G	6	6	326582	326587	0 %	0 %	100 %	0 %	239820294
59	NC_012792	A	7	7	332125	332131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012792	T	6	6	334478	334483	0 %	100 %	0 %	0 %	239820302
61	NC_012792	A	7	7	336312	336318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012792	C	6	6	336384	336389	0 %	0 %	0 %	100 %	239820304
63	NC_012792	T	6	6	350591	350596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012792	A	6	6	360930	360935	100 %	0 %	0 %	0 %	239820328
65	NC_012792	C	6	6	365283	365288	0 %	0 %	0 %	100 %	239820331
66	NC_012792	C	6	6	372457	372462	0 %	0 %	0 %	100 %	239820337
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68	NC_012792	C	6	6	383942	383947	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_012792	T	7	7	385645	385651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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71	NC_012792	A	6	6	390614	390619	100 %	0 %	0 %	0 %	239820353
72	NC_012792	C	6	6	391189	391194	0 %	0 %	0 %	100 %	239820353
73	NC_012792	A	7	7	395045	395051	100 %	0 %	0 %	0 %	239820354
74	NC_012792	A	6	6	395078	395083	100 %	0 %	0 %	0 %	239820354
75	NC_012792	A	6	6	395803	395808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012792	A	6	6	396057	396062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012792	A	6	6	396213	396218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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80	NC_012792	A	6	6	396844	396849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012792	A	6	6	396851	396856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012792	T	6	6	397616	397621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012792	T	6	6	397709	397714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012792	A	7	7	398990	398996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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86	NC_012792	G	6	6	421034	421039	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012792	A	6	6	424730	424735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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89	NC_012792	A	7	7	439333	439339	100 %	0 %	0 %	0 %	239820397
90	NC_012792	A	6	6	440704	440709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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95	NC_012792	A	7	7	502646	502652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012792	G	6	6	509937	509942	0 %	0 %	100 %	0 %	239820474
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99	NC_012792	C	7	7	518631	518637	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_012792	T	6	6	520648	520653	0 %	100 %	0 %	0 %	239820486
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103	NC_012792	T	6	6	524137	524142	0 %	100 %	0 %	0 %	239820488
104	NC_012792	A	6	6	542816	542821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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106	NC_012792	A	6	6	552505	552510	100 %	0 %	0 %	0 %	239820509
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108	NC_012792	C	6	6	556689	556694	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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110	NC_012792	T	6	6	565676	565681	0 %	100 %	0 %	0 %	239820520
111	NC_012792	A	6	6	569996	570001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012792	A	6	6	571321	571326	100 %	0 %	0 %	0 %	239820523
113	NC_012792	A	8	8	575491	575498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012792	A	6	6	575561	575566	100 %	0 %	0 %	0 %	239820532
115	NC_012792	A	6	6	577439	577444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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117	NC_012792	G	6	6	583638	583643	0 %	0 %	100 %	0 %	239820539
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121	NC_012792	A	6	6	604518	604523	100 %	0 %	0 %	0 %	239820556
122	NC_012792	G	6	6	604904	604909	0 %	0 %	100 %	0 %	239820557
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125	NC_012792	T	6	6	611895	611900	0 %	100 %	0 %	0 %	239820564
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128	NC_012792	A	6	6	616453	616458	100 %	0 %	0 %	0 %	239820570
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131	NC_012792	G	6	6	625452	625457	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012792	T	6	6	632495	632500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_012792	A	6	6	661914	661919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.