MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 1

Total Repeats: 13931

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012791	GGCC	2	8	360	367	0 %	0 %	50 %	50 %	239813020
2	NC_012791	CTCG	2	8	693	700	0 %	25 %	25 %	50 %	239813020
3	NC_012791	CGCA	2	8	745	752	25 %	0 %	25 %	50 %	239813020
4	NC_012791	TGGC	2	8	1558	1565	0 %	25 %	50 %	25 %	239813021
5	NC_012791	GCCG	2	8	1754	1761	0 %	0 %	50 %	50 %	239813021
6	NC_012791	GCCG	2	8	1841	1848	0 %	0 %	50 %	50 %	239813021
7	NC_012791	CGAG	2	8	2332	2339	25 %	0 %	50 %	25 %	239813021
8	NC_012791	ACCT	2	8	2475	2482	25 %	25 %	0 %	50 %	239813021
9	NC_012791	CGCC	2	8	2835	2842	0 %	0 %	25 %	75 %	239813022
10	NC_012791	GCCG	2	8	3628	3635	0 %	0 %	50 %	50 %	239813022
11	NC_012791	GCAC	2	8	3657	3664	25 %	0 %	25 %	50 %	239813022
12	NC_012791	CACC	2	8	3754	3761	25 %	0 %	0 %	75 %	239813022
13	NC_012791	GCGG	2	8	4373	4380	0 %	0 %	75 %	25 %	239813022
14	NC_012791	GCCG	2	8	4876	4883	0 %	0 %	50 %	50 %	239813022
15	NC_012791	GCGG	2	8	5347	5354	0 %	0 %	75 %	25 %	239813022
16	NC_012791	GGAC	2	8	5714	5721	25 %	0 %	50 %	25 %	239813023
17	NC_012791	GCCG	2	8	5894	5901	0 %	0 %	50 %	50 %	239813023
18	NC_012791	ATCG	2	8	6118	6125	25 %	25 %	25 %	25 %	239813023
19	NC_012791	CTGC	2	8	6776	6783	0 %	25 %	25 %	50 %	239813024
20	NC_012791	GGCC	2	8	8173	8180	0 %	0 %	50 %	50 %	239813026
21	NC_012791	CTGG	2	8	8935	8942	0 %	25 %	50 %	25 %	239813027
22	NC_012791	TGCG	2	8	9294	9301	0 %	25 %	50 %	25 %	239813027
23	NC_012791	GGCG	2	8	9481	9488	0 %	0 %	75 %	25 %	239813027
24	NC_012791	CACG	2	8	9655	9662	25 %	0 %	25 %	50 %	239813027
25	NC_012791	GGCG	2	8	10333	10340	0 %	0 %	75 %	25 %	239813028
26	NC_012791	GGCA	2	8	11033	11040	25 %	0 %	50 %	25 %	239813029
27	NC_012791	CGCA	2	8	11173	11180	25 %	0 %	25 %	50 %	239813030
28	NC_012791	CGTG	2	8	11337	11344	0 %	25 %	50 %	25 %	239813030
29	NC_012791	CGGC	2	8	11625	11632	0 %	0 %	50 %	50 %	239813030
30	NC_012791	GCCA	2	8	11930	11937	25 %	0 %	25 %	50 %	239813030
31	NC_012791	CAGC	2	8	12216	12223	25 %	0 %	25 %	50 %	239813031
32	NC_012791	GCGG	2	8	12494	12501	0 %	0 %	75 %	25 %	239813031
33	NC_012791	GAAA	2	8	12665	12672	75 %	0 %	25 %	0 %	239813031
34	NC_012791	CGGC	2	8	13670	13677	0 %	0 %	50 %	50 %	239813032
35	NC_012791	GGCC	2	8	14433	14440	0 %	0 %	50 %	50 %	239813033
36	NC_012791	TCCG	2	8	14799	14806	0 %	25 %	25 %	50 %	239813033
37	NC_012791	CATG	2	8	14990	14997	25 %	25 %	25 %	25 %	239813034
38	NC_012791	TGCG	2	8	15178	15185	0 %	25 %	50 %	25 %	239813034
39	NC_012791	CTGG	2	8	15195	15202	0 %	25 %	50 %	25 %	239813034
40	NC_012791	CGGT	2	8	16062	16069	0 %	25 %	50 %	25 %	239813035
41	NC_012791	GATG	2	8	16258	16265	25 %	25 %	50 %	0 %	239813035
42	NC_012791	TGGT	2	8	16956	16963	0 %	50 %	50 %	0 %	239813036
43	NC_012791	CGGC	2	8	17376	17383	0 %	0 %	50 %	50 %	239813036
44	NC_012791	TCGG	2	8	17679	17686	0 %	25 %	50 %	25 %	239813036
45	NC_012791	GCCG	2	8	18019	18026	0 %	0 %	50 %	50 %	239813037
46	NC_012791	GCAC	2	8	18086	18093	25 %	0 %	25 %	50 %	239813037
47	NC_012791	GCCG	2	8	18187	18194	0 %	0 %	50 %	50 %	239813037
48	NC_012791	CGGC	2	8	18371	18378	0 %	0 %	50 %	50 %	239813037
49	NC_012791	CCTT	2	8	18964	18971	0 %	50 %	0 %	50 %	239813038
50	NC_012791	TCGA	2	8	18982	18989	25 %	25 %	25 %	25 %	239813038
51	NC_012791	CAGC	2	8	19065	19072	25 %	0 %	25 %	50 %	239813038
52	NC_012791	CGCC	2	8	19526	19533	0 %	0 %	25 %	75 %	239813038
53	NC_012791	GAAT	2	8	19575	19582	50 %	25 %	25 %	0 %	239813038
54	NC_012791	GGCC	2	8	19661	19668	0 %	0 %	50 %	50 %	239813038
55	NC_012791	GGCG	2	8	20455	20462	0 %	0 %	75 %	25 %	239813040
56	NC_012791	GGCC	2	8	20872	20879	0 %	0 %	50 %	50 %	239813040
57	NC_012791	AGCC	2	8	21201	21208	25 %	0 %	25 %	50 %	239813040
58	NC_012791	CCGT	2	8	22098	22105	0 %	25 %	25 %	50 %	239813041
59	NC_012791	GGCC	2	8	22578	22585	0 %	0 %	50 %	50 %	239813041
60	NC_012791	CCAC	2	8	22750	22757	25 %	0 %	0 %	75 %	239813041
61	NC_012791	CCTT	2	8	22959	22966	0 %	50 %	0 %	50 %	239813041
62	NC_012791	CAGC	2	8	23716	23723	25 %	0 %	25 %	50 %	239813042
63	NC_012791	TGGA	2	8	23810	23817	25 %	25 %	50 %	0 %	239813042
64	NC_012791	GCGA	2	8	24077	24084	25 %	0 %	50 %	25 %	239813042
65	NC_012791	CGCT	2	8	24216	24223	0 %	25 %	25 %	50 %	239813042
66	NC_012791	CTCG	2	8	24424	24431	0 %	25 %	25 %	50 %	239813042
67	NC_012791	TCGC	2	8	24566	24573	0 %	25 %	25 %	50 %	239813042
68	NC_012791	GCAG	2	8	24675	24682	25 %	0 %	50 %	25 %	239813042
69	NC_012791	CTGG	2	8	24772	24779	0 %	25 %	50 %	25 %	239813042
70	NC_012791	CGGC	2	8	24792	24799	0 %	0 %	50 %	50 %	239813042
71	NC_012791	ACGC	2	8	25576	25583	25 %	0 %	25 %	50 %	239813043
72	NC_012791	GGCC	2	8	25771	25778	0 %	0 %	50 %	50 %	239813043
73	NC_012791	CGCC	2	8	25831	25838	0 %	0 %	25 %	75 %	239813043
74	NC_012791	GAGC	2	8	27406	27413	25 %	0 %	50 %	25 %	239813043
75	NC_012791	GCCG	2	8	27424	27431	0 %	0 %	50 %	50 %	239813043
76	NC_012791	ATCG	2	8	28512	28519	25 %	25 %	25 %	25 %	239813045
77	NC_012791	CGTG	2	8	28868	28875	0 %	25 %	50 %	25 %	239813045
78	NC_012791	CCAG	2	8	29045	29052	25 %	0 %	25 %	50 %	239813045
79	NC_012791	CCCA	2	8	29101	29108	25 %	0 %	0 %	75 %	239813045
80	NC_012791	GCCG	2	8	29330	29337	0 %	0 %	50 %	50 %	239813045
81	NC_012791	CGGT	2	8	29365	29372	0 %	25 %	50 %	25 %	239813045
82	NC_012791	TCGC	2	8	29799	29806	0 %	25 %	25 %	50 %	239813046
83	NC_012791	GCTC	2	8	31321	31328	0 %	25 %	25 %	50 %	239813047
84	NC_012791	GCGT	2	8	32022	32029	0 %	25 %	50 %	25 %	239813048
85	NC_012791	CGCC	2	8	32911	32918	0 %	0 %	25 %	75 %	239813050
86	NC_012791	GGGC	2	8	33180	33187	0 %	0 %	75 %	25 %	239813050
87	NC_012791	GGTC	2	8	33436	33443	0 %	25 %	50 %	25 %	239813050
88	NC_012791	GGTG	2	8	33670	33677	0 %	25 %	75 %	0 %	239813050
89	NC_012791	GCTG	2	8	33816	33823	0 %	25 %	50 %	25 %	239813050
90	NC_012791	TGCC	2	8	33880	33887	0 %	25 %	25 %	50 %	239813050
91	NC_012791	GGCG	2	8	34072	34079	0 %	0 %	75 %	25 %	239813050
92	NC_012791	TGCA	2	8	34452	34459	25 %	25 %	25 %	25 %	239813050
93	NC_012791	GCGG	2	8	34691	34698	0 %	0 %	75 %	25 %	239813050
94	NC_012791	GCAC	2	8	34784	34791	25 %	0 %	25 %	50 %	239813050
95	NC_012791	GCAC	2	8	35906	35913	25 %	0 %	25 %	50 %	239813052
96	NC_012791	TCGA	2	8	36535	36542	25 %	25 %	25 %	25 %	239813052
97	NC_012791	CTTT	3	12	37056	37067	0 %	75 %	0 %	25 %	239813054
98	NC_012791	GCAC	2	8	37443	37450	25 %	0 %	25 %	50 %	239813054
99	NC_012791	CGTT	2	8	37452	37459	0 %	50 %	25 %	25 %	239813054
100	NC_012791	CGCA	2	8	38780	38787	25 %	0 %	25 %	50 %	239813056
101	NC_012791	GCCG	2	8	38788	38795	0 %	0 %	50 %	50 %	239813056
102	NC_012791	GGCG	2	8	38980	38987	0 %	0 %	75 %	25 %	239813056
103	NC_012791	GCGT	2	8	39507	39514	0 %	25 %	50 %	25 %	239813056
104	NC_012791	TGCG	3	12	40257	40268	0 %	25 %	50 %	25 %	239813057
105	NC_012791	CCTT	2	8	40842	40849	0 %	50 %	0 %	50 %	239813058
106	NC_012791	CCAT	2	8	40891	40898	25 %	25 %	0 %	50 %	239813058
107	NC_012791	AGGG	2	8	41784	41791	25 %	0 %	75 %	0 %	239813058
108	NC_012791	GCTG	2	8	42127	42134	0 %	25 %	50 %	25 %	239813059
109	NC_012791	GCCG	2	8	42473	42480	0 %	0 %	50 %	50 %	239813059
110	NC_012791	GCAT	2	8	43149	43156	25 %	25 %	25 %	25 %	239813059
111	NC_012791	CGAT	2	8	43830	43837	25 %	25 %	25 %	25 %	239813060
112	NC_012791	TCGC	2	8	45774	45781	0 %	25 %	25 %	50 %	239813063
113	NC_012791	GGCC	2	8	46495	46502	0 %	0 %	50 %	50 %	239813064
114	NC_012791	CGGG	2	8	46653	46660	0 %	0 %	75 %	25 %	239813064
115	NC_012791	GCCG	2	8	47719	47726	0 %	0 %	50 %	50 %	239813064
116	NC_012791	CGCC	2	8	47832	47839	0 %	0 %	25 %	75 %	239813064
117	NC_012791	GCCC	2	8	47929	47936	0 %	0 %	25 %	75 %	239813064
118	NC_012791	CTGG	2	8	48435	48442	0 %	25 %	50 %	25 %	239813065
119	NC_012791	GGCG	2	8	48871	48878	0 %	0 %	75 %	25 %	239813066
120	NC_012791	CCAA	2	8	49339	49346	50 %	0 %	0 %	50 %	239813067
121	NC_012791	GAGC	2	8	49919	49926	25 %	0 %	50 %	25 %	239813067
122	NC_012791	CTCA	2	8	51259	51266	25 %	25 %	0 %	50 %	239813069
123	NC_012791	TCGA	2	8	51679	51686	25 %	25 %	25 %	25 %	239813069
124	NC_012791	GGGC	2	8	52323	52330	0 %	0 %	75 %	25 %	239813070
125	NC_012791	GGCC	2	8	52494	52501	0 %	0 %	50 %	50 %	239813070
126	NC_012791	GCCG	2	8	52698	52705	0 %	0 %	50 %	50 %	239813070
127	NC_012791	GCAG	2	8	53143	53150	25 %	0 %	50 %	25 %	239813071
128	NC_012791	GTCG	2	8	53180	53187	0 %	25 %	50 %	25 %	239813071
129	NC_012791	GCCG	2	8	53348	53355	0 %	0 %	50 %	50 %	239813071
130	NC_012791	GCCG	2	8	53636	53643	0 %	0 %	50 %	50 %	239813071
131	NC_012791	TCGA	2	8	54559	54566	25 %	25 %	25 %	25 %	239813072
132	NC_012791	GACG	2	8	54675	54682	25 %	0 %	50 %	25 %	239813072
133	NC_012791	TGGC	2	8	54790	54797	0 %	25 %	50 %	25 %	239813072
134	NC_012791	CTCG	2	8	55207	55214	0 %	25 %	25 %	50 %	239813073
135	NC_012791	GAAG	2	8	55445	55452	50 %	0 %	50 %	0 %	239813073
136	NC_012791	AGCC	2	8	55716	55723	25 %	0 %	25 %	50 %	239813074
137	NC_012791	CAGC	2	8	57051	57058	25 %	0 %	25 %	50 %	239813076
138	NC_012791	TCAG	2	8	57338	57345	25 %	25 %	25 %	25 %	239813077
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