MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Variovorax paradoxus S110 chromosome 1

Total Repeats: 108874

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012791	AGC	2	6	107	112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813020
2	NC_012791	GAC	2	6	154	159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813020
3	NC_012791	CGC	2	6	234	239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813020
4	NC_012791	GAG	2	6	373	378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813020
5	NC_012791	TGG	2	6	434	439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813020
6	NC_012791	CGC	3	9	465	473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813020
7	NC_012791	CGG	2	6	525	530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813020
8	NC_012791	GCT	2	6	576	581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813020
9	NC_012791	CGA	2	6	669	674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813020
10	NC_012791	CGA	2	6	714	719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813020
11	NC_012791	TTC	2	6	727	732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813020
12	NC_012791	CAA	2	6	735	740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813020
13	NC_012791	GAA	2	6	754	759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813020
14	NC_012791	TTC	2	6	760	765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813020
15	NC_012791	CTG	2	6	781	786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813020
16	NC_012791	AAG	2	6	790	795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813020
17	NC_012791	TGA	2	6	806	811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813020
18	NC_012791	GCC	2	6	897	902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813020
19	NC_012791	CAA	2	6	933	938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813020
20	NC_012791	GAA	2	6	967	972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813020
21	NC_012791	CTT	2	6	978	983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813020
22	NC_012791	CTG	2	6	1108	1113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813020
23	NC_012791	AGA	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813020
24	NC_012791	ACT	2	6	1166	1171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813020
25	NC_012791	AAG	2	6	1201	1206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813020
26	NC_012791	AGA	2	6	1268	1273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813020
27	NC_012791	CGG	2	6	1299	1304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813020
28	NC_012791	ACG	2	6	1315	1320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813020
29	NC_012791	TGC	2	6	1322	1327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813020
30	NC_012791	CAG	2	6	1357	1362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813020
31	NC_012791	CAG	2	6	1378	1383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813020
32	NC_012791	GAA	2	6	1497	1502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012791	CGC	2	6	1541	1546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813021
34	NC_012791	GCG	2	6	1574	1579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813021
35	NC_012791	CGG	2	6	1622	1627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813021
36	NC_012791	ACC	2	6	1641	1646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813021
37	NC_012791	CAC	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813021
38	NC_012791	CGG	2	6	1685	1690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813021
39	NC_012791	CGA	2	6	1691	1696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813021
40	NC_012791	CAC	3	9	1706	1714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813021
41	NC_012791	GGC	2	6	1809	1814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813021
42	NC_012791	GCC	2	6	1872	1877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813021
43	NC_012791	CTA	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813021
44	NC_012791	AGC	2	6	2005	2010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813021
45	NC_012791	TGG	2	6	2017	2022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813021
46	NC_012791	TCG	2	6	2049	2054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813021
47	NC_012791	TTC	2	6	2092	2097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813021
48	NC_012791	CTG	2	6	2127	2132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813021
49	NC_012791	AAC	2	6	2169	2174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813021
50	NC_012791	GGC	2	6	2193	2198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813021
51	NC_012791	AAC	2	6	2394	2399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813021
52	NC_012791	CGG	2	6	2441	2446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813021
53	NC_012791	CGT	2	6	2588	2593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813021
54	NC_012791	AGA	2	6	2755	2760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813022
55	NC_012791	CAC	2	6	2948	2953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813022
56	NC_012791	GGT	2	6	2965	2970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813022
57	NC_012791	CGA	2	6	2983	2988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
58	NC_012791	CGA	2	6	3007	3012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
59	NC_012791	TCG	2	6	3015	3020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813022
60	NC_012791	GAC	2	6	3092	3097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
61	NC_012791	GGC	2	6	3152	3157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813022
62	NC_012791	GGC	2	6	3188	3193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813022
63	NC_012791	TGC	2	6	3237	3242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813022
64	NC_012791	TGG	2	6	3246	3251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813022
65	NC_012791	GCG	2	6	3253	3258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813022
66	NC_012791	ATC	2	6	3353	3358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813022
67	NC_012791	AAC	2	6	3479	3484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813022
68	NC_012791	GAC	2	6	3527	3532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
69	NC_012791	CGG	2	6	3544	3549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813022
70	NC_012791	TCA	2	6	3570	3575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813022
71	NC_012791	CGG	2	6	3643	3648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813022
72	NC_012791	CAA	2	6	3727	3732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813022
73	NC_012791	CGG	2	6	3748	3753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813022
74	NC_012791	TCA	2	6	3792	3797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813022
75	NC_012791	GAA	2	6	3809	3814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813022
76	NC_012791	AAG	2	6	3827	3832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813022
77	NC_012791	GAC	2	6	3854	3859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
78	NC_012791	TGC	2	6	3875	3880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813022
79	NC_012791	TCG	2	6	3972	3977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813022
80	NC_012791	GCC	2	6	3978	3983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813022
81	NC_012791	ACG	2	6	4014	4019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
82	NC_012791	ATC	2	6	4025	4030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813022
83	NC_012791	TCG	2	6	4041	4046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813022
84	NC_012791	GCC	2	6	4049	4054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813022
85	NC_012791	CGC	2	6	4094	4099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813022
86	NC_012791	TGG	2	6	4182	4187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813022
87	NC_012791	CCG	2	6	4197	4202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813022
88	NC_012791	GCT	2	6	4297	4302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813022
89	NC_012791	CCA	2	6	4365	4370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813022
90	NC_012791	GAC	2	6	4388	4393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
91	NC_012791	ACC	2	6	4416	4421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813022
92	NC_012791	CAT	4	12	4423	4434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239813022
93	NC_012791	GCT	3	9	4471	4479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813022
94	NC_012791	CTT	2	6	4483	4488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813022
95	NC_012791	GCC	2	6	4540	4545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813022
96	NC_012791	CGG	2	6	4651	4656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813022
97	NC_012791	ACC	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813022
98	NC_012791	ACC	2	6	4865	4870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813022
99	NC_012791	AGC	2	6	4889	4894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
100	NC_012791	GCT	2	6	4921	4926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813022
101	NC_012791	GCC	3	9	4935	4943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813022
102	NC_012791	AGC	2	6	4961	4966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
103	NC_012791	CGC	2	6	5002	5007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813022
104	NC_012791	GCC	2	6	5018	5023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813022
105	NC_012791	CCT	2	6	5038	5043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239813022
106	NC_012791	AGC	2	6	5045	5050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
107	NC_012791	CCG	2	6	5065	5070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813022
108	NC_012791	GAA	2	6	5093	5098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813022
109	NC_012791	ACC	2	6	5213	5218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813022
110	NC_012791	GCC	2	6	5235	5240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813022
111	NC_012791	TGC	2	6	5241	5246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813022
112	NC_012791	CGA	2	6	5257	5262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
113	NC_012791	CGA	2	6	5302	5307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813022
114	NC_012791	GAA	2	6	5377	5382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012791	TTC	2	6	5442	5447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012791	CAG	2	6	5553	5558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_012791	ACG	2	6	5698	5703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813023
118	NC_012791	CAC	2	6	5761	5766	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813023
119	NC_012791	GCA	2	6	5912	5917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813023
120	NC_012791	TTC	2	6	5926	5931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813023
121	NC_012791	GGA	2	6	5940	5945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813023
122	NC_012791	TCG	2	6	5953	5958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813023
123	NC_012791	ACA	2	6	5969	5974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813023
124	NC_012791	CTG	2	6	6001	6006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813023
125	NC_012791	GGT	2	6	6012	6017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239813023
126	NC_012791	TCG	2	6	6035	6040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813023
127	NC_012791	AGC	2	6	6047	6052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813023
128	NC_012791	TCT	2	6	6083	6088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813023
129	NC_012791	GCC	2	6	6093	6098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813023
130	NC_012791	AAC	2	6	6130	6135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239813023
131	NC_012791	ACC	2	6	6179	6184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813023
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386	NC_012791	CGT	2	6	18429	18434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813037
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406	NC_012791	CGG	3	9	19370	19378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813038
407	NC_012791	GCG	2	6	19391	19396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813038
408	NC_012791	AGC	2	6	19508	19513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813038
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415	NC_012791	CGA	2	6	19914	19919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813039
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418	NC_012791	GCA	2	6	20058	20063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813039
419	NC_012791	GCT	2	6	20154	20159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813039
420	NC_012791	GCG	2	6	20247	20252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813039
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423	NC_012791	TGA	2	6	20331	20336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813039
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435	NC_012791	GCG	2	6	20889	20894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813040
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453	NC_012791	CGA	2	6	21736	21741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813041
454	NC_012791	CGT	2	6	21841	21846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813041
455	NC_012791	CCG	2	6	21858	21863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813041
456	NC_012791	CCA	2	6	21898	21903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813041
457	NC_012791	GCG	2	6	21905	21910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813041
458	NC_012791	TGA	3	9	21949	21957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239813041
459	NC_012791	CGA	2	6	22010	22015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813041
460	NC_012791	CAC	2	6	22112	22117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813041
461	NC_012791	TCC	2	6	22134	22139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239813041
462	NC_012791	TGC	2	6	22183	22188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813041
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468	NC_012791	GGC	2	6	22430	22435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813041
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470	NC_012791	GAA	2	6	22466	22471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813041
471	NC_012791	CTT	2	6	22628	22633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239813041
472	NC_012791	GAG	2	6	22653	22658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813041
473	NC_012791	CCT	2	6	22663	22668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239813041
474	NC_012791	TGT	2	6	22786	22791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239813041
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477	NC_012791	CGT	2	6	22879	22884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813041
478	NC_012791	TGC	2	6	22932	22937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813041
479	NC_012791	AGC	2	6	22941	22946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813041
480	NC_012791	GCG	2	6	22947	22952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813041
481	NC_012791	CTG	2	6	22994	22999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813041
482	NC_012791	GCC	2	6	23061	23066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813041
483	NC_012791	TCG	2	6	23214	23219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813041
484	NC_012791	GAA	2	6	23228	23233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239813041
485	NC_012791	CGA	2	6	23302	23307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813041
486	NC_012791	CCG	2	6	23311	23316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	239813041
487	NC_012791	GCG	2	6	23482	23487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
488	NC_012791	CCG	2	6	23510	23515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
489	NC_012791	CGA	2	6	23573	23578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
490	NC_012791	CTG	2	6	23645	23650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813042
491	NC_012791	CTG	2	6	23663	23668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813042
492	NC_012791	GCT	3	9	23782	23790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813042
493	NC_012791	AGG	2	6	23853	23858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813042
494	NC_012791	GCA	2	6	23862	23867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813042
495	NC_012791	GCG	2	6	23985	23990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813042
496	NC_012791	GAC	2	6	24167	24172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239813042
497	NC_012791	CTG	2	6	24176	24181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239813042
498	NC_012791	GAG	2	6	24308	24313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239813042
499	NC_012791	ACC	2	6	24314	24319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	239813042
500	NC_012791	CGG	2	6	24355	24360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239813042

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