MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus sp. WCH70 plasmid pWCH7002

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012790	AGG	2	6	115	120	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239812974
2	NC_012790	ACA	2	6	134	139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239812974
3	NC_012790	GTT	2	6	178	183	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239812974
4	NC_012790	TGT	2	6	361	366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239812975
5	NC_012790	TGT	2	6	376	381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239812975
6	NC_012790	ATC	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239812975
7	NC_012790	GGA	2	6	518	523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239812975
8	NC_012790	GAT	3	9	543	551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812975
9	NC_012790	GTT	2	6	554	559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239812975
10	NC_012790	CAA	2	6	774	779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239812975
11	NC_012790	AGA	2	6	1214	1219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812976
12	NC_012790	ATT	2	6	1260	1265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812976
13	NC_012790	GAA	2	6	1553	1558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812976
14	NC_012790	ATG	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812976
15	NC_012790	CAG	2	6	1770	1775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239812976
16	NC_012790	AAG	2	6	1813	1818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812976
17	NC_012790	GAA	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812976
18	NC_012790	GAA	2	6	2014	2019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812976
19	NC_012790	ACG	2	6	2036	2041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239812976
20	NC_012790	ACA	2	6	2054	2059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239812976
21	NC_012790	GAT	2	6	2073	2078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812976
22	NC_012790	TTA	2	6	2907	2912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812977
23	NC_012790	TAT	2	6	3067	3072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812977
24	NC_012790	AAG	2	6	3099	3104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812977
25	NC_012790	GAA	2	6	3122	3127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812977
26	NC_012790	TGA	2	6	3135	3140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812977
27	NC_012790	AGG	2	6	3142	3147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239812977
28	NC_012790	CAG	2	6	3171	3176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239812977
29	NC_012790	GCT	2	6	3293	3298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812977
30	NC_012790	GGA	3	9	3349	3357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239812977
31	NC_012790	ATG	2	6	3405	3410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812977
32	NC_012790	ATT	2	6	3473	3478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812977
33	NC_012790	CAT	2	6	3605	3610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239812977
34	NC_012790	GAA	2	6	3698	3703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812977
35	NC_012790	CGT	2	6	3764	3769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812977
36	NC_012790	TAA	2	6	3778	3783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239812977
37	NC_012790	GAA	2	6	3866	3871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812977
38	NC_012790	TCC	2	6	3892	3897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239812977
39	NC_012790	CAA	2	6	3926	3931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239812977
40	NC_012790	GAA	2	6	4210	4215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812978
41	NC_012790	ATT	2	6	4327	4332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812978
42	NC_012790	TGC	2	6	4353	4358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812978
43	NC_012790	ATT	2	6	4417	4422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812978
44	NC_012790	CCT	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239812978
45	NC_012790	AGA	2	6	4572	4577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812978
46	NC_012790	ATT	2	6	4580	4585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812978
47	NC_012790	CGG	2	6	4619	4624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	239812978
48	NC_012790	CTG	2	6	4700	4705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812978
49	NC_012790	GAT	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812978
50	NC_012790	GCT	2	6	4839	4844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812978
51	NC_012790	CTG	2	6	4874	4879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812978
52	NC_012790	TGC	2	6	5938	5943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812979
53	NC_012790	GAA	2	6	6017	6022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812979
54	NC_012790	GGA	2	6	6028	6033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	239812979
55	NC_012790	ACG	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239812979
56	NC_012790	GAA	3	9	6149	6157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812979
57	NC_012790	ATT	2	6	7657	7662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812980
58	NC_012790	TAT	2	6	7687	7692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812980
59	NC_012790	TAA	2	6	7769	7774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239812980
60	NC_012790	ATT	2	6	7849	7854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812980
61	NC_012790	TCC	2	6	7859	7864	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	239812980
62	NC_012790	ATT	2	6	7879	7884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	239812980
63	NC_012790	AAG	2	6	7895	7900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812980
64	NC_012790	ATG	2	6	7955	7960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812980
65	NC_012790	AGC	2	6	8009	8014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239812980
66	NC_012790	TAA	2	6	8169	8174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	239812980
67	NC_012790	TGA	2	6	8228	8233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812980
68	NC_012790	GAA	2	6	9130	9135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812981
69	NC_012790	GGT	2	6	9187	9192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239812981
70	NC_012790	GAC	2	6	9196	9201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239812981
71	NC_012790	GAA	2	6	9286	9291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812981
72	NC_012790	TGT	2	6	9296	9301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239812981
73	NC_012790	TGC	2	6	9309	9314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812981
74	NC_012790	TCG	2	6	9329	9334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812981
75	NC_012790	TGG	2	6	9488	9493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	239812981
76	NC_012790	AAG	2	6	9710	9715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812982
77	NC_012790	TGA	2	6	9798	9803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239812982
78	NC_012790	GCA	2	6	9892	9897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	239812982
79	NC_012790	TGT	2	6	9903	9908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	239812982
80	NC_012790	AGA	2	6	10023	10028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812982
81	NC_012790	ACA	2	6	10113	10118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239812982
82	NC_012790	GCT	2	6	10147	10152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	239812982
83	NC_012790	AGA	2	6	10158	10163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239812982

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.