MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Kosmotoga olearia TBF 19.5.1

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012785	TATTTT	2	12	82408	82419	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012785	TATTTT	2	12	88206	88217	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012785	GAGGCT	2	12	97583	97594	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012785	GAGGCT	2	12	98735	98746	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_012785	CTTTTT	2	12	113386	113397	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_012785	TATTTT	2	12	113408	113419	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012785	AGCCTC	2	12	160248	160259	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_012785	AAATTA	2	12	173576	173587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012785	AAAAAC	2	12	220867	220878	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012785	GAAAAG	2	12	253022	253033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012785	GAGGCT	2	12	258751	258762	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012785	AGATTA	2	12	285105	285116	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012785	TTTTCA	2	12	438779	438790	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012785	AATGGA	2	12	439716	439727	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012785	TGTTTC	2	12	440819	440830	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012785	AAATAG	2	12	442595	442606	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012785	AAAGGT	2	12	460106	460117	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012785	CAAAAG	2	12	475023	475034	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_012785	TCGTTT	2	12	479001	479012	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012785	TTTTAA	2	12	509340	509351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012785	TCTCAA	2	12	529688	529699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012785	TTTACA	2	12	529753	529764	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_012785	AATTTT	2	12	540475	540486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012785	AACCTC	2	12	545825	545836	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_012785	TAGGAT	2	12	592061	592072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012785	AAGCTA	2	12	617822	617833	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012785	TATATT	2	12	653935	653946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012785	AAAGAT	2	12	658494	658505	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012785	AACGAA	2	12	720764	720775	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012785	TTCCGC	2	12	722520	722531	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012785	AGCGAT	2	12	722788	722799	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_012785	CTTTTT	2	12	774473	774484	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_012785	ATTCTT	2	12	775071	775082	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012785	AGAATG	2	12	817499	817510	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012785	AACCTC	2	12	917750	917761	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_012785	AACCTC	2	12	929579	929590	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_012785	GAGGTT	2	12	965189	965200	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012785	ATTGAA	2	12	977800	977811	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012785	TTTCCA	2	12	1012600	1012611	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012785	TATATT	2	12	1022119	1022130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012785	TGGTGC	2	12	1068899	1068910	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_012785	GTTAGA	2	12	1081314	1081325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012785	GGTTTA	2	12	1108017	1108028	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012785	GAGGCT	2	12	1109444	1109455	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012785	GCAGCG	2	12	1113079	1113090	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012785	GCAATA	2	12	1114843	1114854	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_012785	AACCAA	2	12	1114875	1114886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012785	ATCACG	2	12	1119051	1119062	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012785	TTAACT	2	12	1123028	1123039	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_012785	ATAAAA	2	12	1125520	1125531	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012785	AGGTTC	2	12	1136821	1136832	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_012785	TTTCAA	2	12	1188265	1188276	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_012785	TCCTAC	2	12	1206448	1206459	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_012785	AAGGTA	2	12	1207736	1207747	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012785	AATTCT	2	12	1271825	1271836	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_012785	AGTACG	2	12	1313049	1313060	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_012785	ATTTTG	2	12	1323757	1323768	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012785	CGCTTT	2	12	1335479	1335490	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012785	TTTCCA	2	12	1349279	1349290	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012785	TTGTAA	2	12	1357632	1357643	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012785	TACCAA	2	12	1364846	1364857	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012785	CATTTT	2	12	1366618	1366629	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012785	GAGGCT	2	12	1377023	1377034	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_012785	TTTTGG	2	12	1377200	1377211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012785	GAGGCT	2	12	1380927	1380938	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_012785	GAGGCT	2	12	1460985	1460996	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_012785	TTTCTA	2	12	1494959	1494970	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012785	AAGAAA	2	12	1527190	1527201	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012785	ACCTCA	2	12	1533068	1533079	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_012785	AAAATA	2	12	1612219	1612230	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012785	GAGGCT	2	12	1626809	1626820	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012785	TTCAAA	2	12	1663650	1663661	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_012785	TTTTTC	2	12	1734761	1734772	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_012785	TTCAAC	2	12	1764701	1764712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_012785	GGTAAT	2	12	1770433	1770444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012785	TCCTAC	2	12	1770846	1770857	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_012785	AAGGTA	2	12	1772309	1772320	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012785	TTGGGT	2	12	1820554	1820565	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012785	GAGGCT	2	12	1909614	1909625	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_012785	TTCTTT	2	12	1923027	1923038	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_012785	GAGGCT	2	12	1944275	1944286	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_012785	CAATAA	2	12	1954198	1954209	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_012785	TTCACT	2	12	1975376	1975387	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_012785	TTTCTT	2	12	2000585	2000596	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.