MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Kosmotoga olearia TBF 19.5.1

Total Repeats: 605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012785	TTTCGG	2	12	1686	1697	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	239616413
2	NC_012785	GCTGTA	2	12	8253	8264	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	239616420
3	NC_012785	GAAAGA	2	12	9573	9584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239616420
4	NC_012785	AAGTAA	2	12	11755	11766	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	239616422
5	NC_012785	TATTAC	2	12	20368	20379	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	239616425
6	NC_012785	GGTAAG	2	12	22103	22114	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	239616427
7	NC_012785	TTATCT	2	12	29745	29756	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	239616432
8	NC_012785	ACTGTA	2	12	31182	31193	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	239616433
9	NC_012785	AGCTAC	2	12	34550	34561	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	239616436
10	NC_012785	TGAGGT	2	12	35751	35762	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	239616438
11	NC_012785	GAAAGA	2	12	37453	37464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239616440
12	NC_012785	CTTCAC	2	12	40072	40083	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	239616442
13	NC_012785	CTTTAT	2	12	44888	44899	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	239616449
14	NC_012785	TGTTCC	2	12	51887	51898	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	239616456
15	NC_012785	TCAACC	2	12	56515	56526	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	239616458
16	NC_012785	TCCAGC	2	12	64477	64488	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	239616464
17	NC_012785	AGAAAA	2	12	64882	64893	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	239616464
18	NC_012785	AAAAAC	2	12	70216	70227	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	239616467
19	NC_012785	TTTACC	2	12	71506	71517	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	239616469
20	NC_012785	TAAAGA	2	12	76006	76017	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	239616472
21	NC_012785	TTCTAC	2	12	77317	77328	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	239616473
22	NC_012785	TCTTTT	2	12	80216	80227	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	239616477
23	NC_012785	TCTTTT	2	12	81183	81194	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	239616478
24	NC_012785	TATTTT	2	12	81229	81240	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	239616478
25	NC_012785	TATTCT	2	12	85155	85166	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	239616481
26	NC_012785	GTGGAA	2	12	91319	91330	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	239616487
27	NC_012785	CGATTC	2	12	92449	92460	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	239616488
28	NC_012785	TCAAAG	2	12	94122	94133	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	239616489
29	NC_012785	GGATTT	2	12	95535	95546	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	239616490
30	NC_012785	AGGGAA	2	12	100551	100562	50 %	0 %	50 %	0 %	239616495
31	NC_012785	GAAGAT	2	12	107919	107930	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	239616503
32	NC_012785	AGAAAA	2	12	109958	109969	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	239616505
33	NC_012785	AAAATG	2	12	111197	111208	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	239616506
34	NC_012785	GGATCA	2	12	120064	120075	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	239616513
35	NC_012785	CTTTTT	2	12	120992	121003	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	239616515
36	NC_012785	TACATT	2	12	127233	127244	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	239616520
37	NC_012785	CTGACA	2	12	137104	137115	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	239616529
38	NC_012785	AATAGC	2	12	151353	151364	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	239616542
39	NC_012785	AATCGC	2	12	151875	151886	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	239616542
40	NC_012785	TGGTAA	2	12	152339	152350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239616543
41	NC_012785	TGCTGT	2	12	152901	152912	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	239616543
42	NC_012785	TTTTCT	2	12	156224	156235	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	239616546
43	NC_012785	ATCGAA	2	12	161075	161086	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	239616551
44	NC_012785	GGAATT	2	12	161431	161442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239616551
45	NC_012785	AACACA	2	12	168988	168999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239616559
46	NC_012785	CCTTTC	2	12	176061	176072	0 %	50 %	0 %	50 %	239616567
47	NC_012785	TGAATG	2	12	180301	180312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239616571
48	NC_012785	TAAATG	2	12	180502	180513	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	239616571
49	NC_012785	ACTTTT	2	12	181675	181686	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	239616573
50	NC_012785	CAGGAA	2	12	195326	195337	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	239616581
51	NC_012785	GCCAAA	2	12	196913	196924	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	239616582
52	NC_012785	TCAAGT	2	12	201876	201887	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	239616587
53	NC_012785	GGTGCC	2	12	203962	203973	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	239616590
54	NC_012785	GTGGCT	2	12	209644	209655	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	239616595
55	NC_012785	GGAATG	2	12	210346	210357	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	239616595
56	NC_012785	TTCAAG	2	12	210389	210400	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	239616595
57	NC_012785	TCTTTC	2	12	212314	212325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239616597
58	NC_012785	CATTAT	2	12	217971	217982	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	239616600
59	NC_012785	CGTGAA	2	12	224019	224030	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	239616606
60	NC_012785	GTCTCT	2	12	224712	224723	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	239616607
61	NC_012785	TCACCG	2	12	228098	228109	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	239616609
62	NC_012785	GATCTG	2	12	250950	250961	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	239616628
63	NC_012785	TTTTCC	2	12	251511	251522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239616629
64	NC_012785	GAGTTC	2	12	254744	254755	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	239616633
65	NC_012785	AAAAAG	2	12	256253	256264	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	239616633
66	NC_012785	TGCGGC	2	12	256773	256784	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	239616635
67	NC_012785	TTTCTT	2	12	258048	258059	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	239616636
68	NC_012785	TTTCGA	2	12	265868	265879	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	239616645
69	NC_012785	TATAAT	2	12	267989	268000	50 %	50 %	0 %	0 %	239616647
70	NC_012785	TCACAC	2	12	272268	272279	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	239616650
71	NC_012785	GCAACT	2	12	276018	276029	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	239616654
72	NC_012785	TTTTGA	2	12	276526	276537	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	239616654
73	NC_012785	AACATA	2	12	281976	281987	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	239616660
74	NC_012785	TTCTCT	2	12	284994	285005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	239616665
75	NC_012785	ATTGAA	2	12	285794	285805	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	239616666
76	NC_012785	GATCTC	2	12	300133	300144	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	239616681
77	NC_012785	CACAGA	2	12	301264	301275	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	239616681
78	NC_012785	TGCCTT	2	12	305603	305614	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	239616684
79	NC_012785	GGAAAG	2	12	308483	308494	50 %	0 %	50 %	0 %	239616689
80	NC_012785	AAAGGA	2	12	308717	308728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239616689
81	NC_012785	ACGATA	2	12	317055	317066	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	239616698
82	NC_012785	TGAAAA	2	12	320217	320228	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	239616701
83	NC_012785	TCAAAA	2	12	327056	327067	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	239616707
84	NC_012785	GTACAT	2	12	328514	328525	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	239616709
85	NC_012785	AATATG	2	12	329238	329249	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	239616709
86	NC_012785	CTTCAA	2	12	332630	332641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239616713
87	NC_012785	TCAAAC	2	12	339162	339173	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	239616723
88	NC_012785	CCTCAA	2	12	342890	342901	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	239616729
89	NC_012785	CTTTTA	2	12	344669	344680	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	239616731
90	NC_012785	CCAAAA	2	12	346771	346782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	239616733
91	NC_012785	TCTCCA	2	12	349076	349087	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	239616735
92	NC_012785	CAAAAA	2	12	349266	349277	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	239616736
93	NC_012785	AAAAAG	2	12	350790	350801	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	239616736
94	NC_012785	ATTGAA	2	12	352127	352138	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	239616738
95	NC_012785	GAGGTG	2	12	359352	359363	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	239616745
96	NC_012785	AAAAAC	2	12	363453	363464	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	239616750
97	NC_012785	GATTAA	2	12	366687	366698	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	239616755
98	NC_012785	CGGTGT	2	12	368802	368813	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	239616758
99	NC_012785	CAACTT	2	12	371084	371095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	239616760
100	NC_012785	TTGGTG	2	12	372340	372351	0 %	50 %	50 %	0 %	239616761
101	NC_012785	ATAGGT	2	12	372972	372983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	239616761
102	NC_012785	TAGATA	2	12	376645	376656	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	239616765
103	NC_012785	ACTTCT	2	12	384052	384063	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	239616773
104	NC_012785	GATGGC	2	12	386266	386277	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	239616775
105	NC_012785	GTTATT	2	12	388069	388080	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	239616777
106	NC_012785	AAAAAC	2	12	388557	388568	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	239616777
107	NC_012785	GGTTGT	2	12	390001	390012	0 %	50 %	50 %	0 %	239616778
108	NC_012785	GTTGTG	2	12	390949	390960	0 %	50 %	50 %	0 %	239616780
109	NC_012785	TACAGG	2	12	392894	392905	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	239616782
110	NC_012785	AAGGAA	2	12	395429	395440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	239616784
111	NC_012785	CGATTA	2	12	397992	398003	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	239616787
112	NC_012785	TACGAA	2	12	400046	400057	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	239616789
113	NC_012785	TCAAGA	2	12	422643	422654	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	239616809
114	NC_012785	CGGATA	2	12	436094	436105	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	239616819
115	NC_012785	AATAAG	2	12	444384	444395	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	239616824
116	NC_012785	CAAAAA	2	12	446264	446275	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	239616825
117	NC_012785	ACCATC	2	12	448859	448870	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	239616826
118	NC_012785	AACCAG	2	12	449751	449762	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	239616827
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230	NC_012785	TGAAAA	2	12	951730	951741	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	239617290
231	NC_012785	GAAATG	2	12	958422	958433	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	239617296
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455	NC_012785	TCCGGC	2	12	1725872	1725883	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	239617980
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