MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Kosmotoga olearia TBF 19.5.1

Total Repeats: 235

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012785	CCCCT	2	10	34733	34742	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2	NC_012785	TTTTG	2	10	62512	62521	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012785	AGTAT	2	10	84208	84217	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012785	CTTTC	2	10	84947	84956	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_012785	AGCGA	2	10	89842	89851	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_012785	GCTTT	2	10	103040	103049	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_012785	GGGGA	2	10	104372	104381	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012785	TTTTA	2	10	105155	105164	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012785	TAAAA	2	10	113252	113261	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012785	TCCCT	2	10	125225	125234	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
11	NC_012785	AGTGA	2	10	125402	125411	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012785	AGTAC	2	10	130022	130031	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_012785	TTTAT	2	10	130915	130924	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012785	AATGC	2	10	131109	131118	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_012785	GAAAG	2	10	153852	153861	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012785	TTTGA	2	10	162743	162752	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012785	AATAT	2	10	216320	216329	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012785	TCTGT	2	10	218734	218743	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_012785	CTTTT	2	10	224422	224431	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012785	TAAAA	2	10	224580	224589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012785	TATAA	2	10	259163	259172	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012785	GCTGC	2	10	260508	260517	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_012785	CCGGT	2	10	317745	317754	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_012785	CAAAA	2	10	318378	318387	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012785	TAAGT	2	10	324359	324368	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012785	GCCTT	2	10	338592	338601	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_012785	TGTTA	2	10	412961	412970	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012785	GAATA	2	10	439025	439034	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012785	CGCTT	2	10	439321	439330	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_012785	GCCAT	2	10	445183	445192	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_012785	ATTAT	2	10	445221	445230	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012785	CAAAA	2	10	459955	459964	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_012785	AGGAA	2	10	460182	460191	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012785	ATAAA	2	10	475147	475156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012785	GTGAA	2	10	520380	520389	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012785	TCAAA	2	10	525134	525143	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_012785	AAGCA	2	10	525274	525283	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_012785	TTTTA	2	10	530466	530475	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012785	CCTTA	2	10	545669	545678	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_012785	TTTCG	2	10	546695	546704	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_012785	CAAAG	2	10	550597	550606	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_012785	AACCT	2	10	551824	551833	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
43	NC_012785	ATTTT	2	10	553095	553104	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012785	TGGTG	2	10	568374	568383	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012785	ATAAA	2	10	569051	569060	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012785	TTTAT	2	10	569075	569084	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012785	GACAG	2	10	576810	576819	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_012785	ATAGA	2	10	598379	598388	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012785	AGTAA	2	10	602945	602954	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012785	AAGAA	2	10	603583	603592	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012785	ATTTT	2	10	603631	603640	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012785	TAAAA	2	10	603830	603839	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012785	AACCA	2	10	615811	615820	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_012785	CGATT	2	10	616596	616605	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_012785	CATAT	2	10	617218	617227	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_012785	GAAAC	2	10	617296	617305	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_012785	ACACA	2	10	624266	624275	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_012785	GTAAT	2	10	624369	624378	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012785	CTTTA	2	10	655690	655699	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_012785	ACTCT	2	10	665515	665524	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_012785	ATAAA	2	10	672931	672940	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012785	TTCAA	2	10	677483	677492	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_012785	TAAAA	2	10	680649	680658	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012785	AAAGA	2	10	680851	680860	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012785	ATATA	2	10	685677	685686	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012785	AATTC	2	10	703172	703181	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_012785	TTTCT	2	10	723631	723640	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_012785	GAAAC	2	10	724404	724413	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_012785	GCGCT	2	10	726051	726060	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_012785	TTGAC	2	10	749649	749658	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_012785	AAAAC	2	10	791021	791030	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_012785	AAAAG	2	10	794071	794080	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012785	CTTTT	2	10	794097	794106	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_012785	GGGAG	2	10	802405	802414	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012785	CTTCT	2	10	808376	808385	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_012785	TTTGT	2	10	808694	808703	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012785	TTTAT	2	10	820791	820800	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012785	TTCAC	2	10	825003	825012	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_012785	CTTTT	2	10	826612	826621	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_012785	TAATC	2	10	828128	828137	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_012785	TTCAC	2	10	828498	828507	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_012785	CTTTA	2	10	831933	831942	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_012785	TGGTA	2	10	834118	834127	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012785	TTTAT	2	10	835448	835457	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012785	TAGAA	2	10	838762	838771	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012785	CTTTA	2	10	845797	845806	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_012785	TAGAA	2	10	851650	851659	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012785	ATTTT	2	10	861078	861087	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012785	TTCCA	2	10	868177	868186	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
90	NC_012785	TATAA	2	10	874062	874071	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012785	TTTGT	2	10	875839	875848	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012785	AGGAG	2	10	878638	878647	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012785	TGTAA	2	10	896419	896428	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012785	ACAGG	2	10	898270	898279	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_012785	AAGGA	2	10	904868	904877	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012785	CCCCA	2	10	920743	920752	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
97	NC_012785	ACCCC	2	10	974207	974216	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
98	NC_012785	TTTCC	2	10	983321	983330	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_012785	TCCTC	2	10	987347	987356	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_012785	ATAGA	2	10	996518	996527	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012785	TTTTG	2	10	1005449	1005458	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012785	CTCAT	2	10	1005536	1005545	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_012785	CTTTC	2	10	1027974	1027983	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_012785	TTTGA	2	10	1042097	1042106	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012785	ATATA	2	10	1054503	1054512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012785	TTATT	2	10	1061360	1061369	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012785	TTGTA	2	10	1068145	1068154	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012785	ATCCT	2	10	1068213	1068222	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_012785	GACAA	2	10	1068801	1068810	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_012785	TTCGC	2	10	1073624	1073633	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_012785	ATATT	2	10	1078708	1078717	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012785	ATCGA	2	10	1098422	1098431	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_012785	ATGCT	2	10	1109386	1109395	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_012785	ATTCA	2	10	1114751	1114760	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_012785	TTCAA	2	10	1114900	1114909	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_012785	CAAAA	2	10	1115459	1115468	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_012785	AATGT	2	10	1115638	1115647	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012785	GAAAT	2	10	1128587	1128596	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012785	TTAAT	2	10	1148893	1148902	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012785	ACCCC	2	10	1152139	1152148	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
121	NC_012785	TTAGT	2	10	1155250	1155259	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012785	ATATA	2	10	1165890	1165899	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_012785	TCTTT	2	10	1171664	1171673	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_012785	GTCAT	2	10	1176382	1176391	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_012785	CCCAA	2	10	1191730	1191739	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
126	NC_012785	ATGAA	2	10	1205972	1205981	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012785	AGTGG	2	10	1206337	1206346	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012785	GTGGA	2	10	1206573	1206582	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012785	GTGAA	2	10	1207912	1207921	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012785	GGGAG	2	10	1208298	1208307	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
131	NC_012785	GAGAG	2	10	1209075	1209084	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012785	AGGGG	2	10	1209654	1209663	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
133	NC_012785	TTGTA	2	10	1214402	1214411	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012785	TAAAA	2	10	1215335	1215344	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012785	CTATA	2	10	1217588	1217597	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_012785	TTTTC	2	10	1225018	1225027	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_012785	GTATA	2	10	1230899	1230908	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012785	TTTGT	2	10	1256849	1256858	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012785	AATTC	2	10	1259220	1259229	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_012785	TTCGT	2	10	1259341	1259350	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_012785	CAACT	2	10	1267094	1267103	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_012785	CGCTT	2	10	1267116	1267125	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
143	NC_012785	TATGT	2	10	1267434	1267443	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012785	TCGCT	2	10	1281437	1281446	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
145	NC_012785	CAGCT	2	10	1290221	1290230	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_012785	GGGGA	2	10	1291160	1291169	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_012785	AGTAG	2	10	1316113	1316122	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.