MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Eubacterium rectale ATCC 33656

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012781	AAATTA	2	12	17515	17526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012781	AGTAGC	2	12	141834	141845	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012781	GAAAAT	2	12	159396	159407	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012781	GAAAAT	2	12	165354	165365	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012781	AAATAT	2	12	206393	206404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012781	TTAAAA	2	12	208549	208560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012781	AATATA	2	12	264196	264207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012781	ATAAAA	2	12	291966	291977	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012781	AAATTG	2	12	360694	360705	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012781	AAATAA	2	12	364430	364441	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012781	TTTATG	2	12	399239	399250	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012781	GAGAAA	2	12	410982	410993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012781	CAAGAT	2	12	416384	416395	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012781	TACAGA	2	12	416486	416497	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_012781	TCAAAT	2	12	422344	422355	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012781	ATAAAA	2	12	430109	430120	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012781	TTTTTA	2	12	511972	511983	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012781	GATATA	2	12	579606	579617	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012781	CTTTTT	2	12	616929	616940	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012781	TATGAT	2	12	630269	630280	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012781	ATAGTA	2	12	643090	643101	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012781	TATAAA	2	12	683000	683011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012781	TAAAAA	2	12	684849	684860	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012781	TCCGGT	2	12	717106	717117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012781	AAAAAG	2	12	723202	723213	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012781	GTTTAG	2	12	737673	737684	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012781	TTTTCT	2	12	767991	768002	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_012781	GGAAAA	2	12	776728	776739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012781	AAGAAA	2	12	865388	865399	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012781	GTTTTG	2	12	866486	866497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012781	AAAAAT	2	12	872247	872258	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012781	TGTATG	2	12	882117	882128	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012781	TGAAAA	2	12	920947	920958	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012781	GCAACC	2	12	1061967	1061978	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012781	AAAAAG	2	12	1121500	1121511	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012781	AAAAAT	2	12	1136052	1136063	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012781	AGAGCC	2	12	1175990	1176001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012781	ATATTT	2	12	1197258	1197269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012781	ATATAA	2	12	1213312	1213323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012781	CATAAT	2	12	1253072	1253083	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_012781	TTAAAA	2	12	1271411	1271422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012781	AATTAA	2	12	1322671	1322682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012781	TAACAT	2	12	1322690	1322701	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_012781	AGGAAT	2	12	1348057	1348068	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012781	AGGTTG	2	12	1366861	1366872	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012781	AAGAAT	2	12	1404471	1404482	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012781	AAATTA	2	12	1423794	1423805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012781	TGACAA	2	12	1452057	1452068	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_012781	ATAAGT	2	12	1475042	1475053	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012781	TAAAAA	2	12	1581979	1581990	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012781	GCAAAC	2	12	1582025	1582036	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012781	TTTATA	2	12	1587083	1587094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012781	TGGATT	2	12	1598795	1598806	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012781	TATTTT	2	12	1611371	1611382	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012781	ATAAAA	2	12	1638371	1638382	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012781	GTTAAT	2	12	1724772	1724783	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012781	GACAAA	2	12	1733431	1733442	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_012781	ACTTCT	2	12	1792628	1792639	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012781	TAATTA	2	12	1821977	1821988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012781	TTCCTA	2	12	1870718	1870729	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012781	CGTCTT	2	12	1877865	1877876	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012781	ATAAAT	2	12	1919090	1919101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012781	TATGAT	2	12	1926239	1926250	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012781	TTCGCT	2	12	1950320	1950331	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012781	TAAATA	2	12	1996100	1996111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012781	AAATAT	2	12	2031115	2031126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012781	ATCAAA	2	12	2075942	2075953	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012781	CGGAGT	2	12	2075988	2075999	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_012781	CTTTCG	2	12	2161989	2162000	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012781	TTGATT	2	12	2194893	2194904	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012781	GGTGGC	2	12	2202886	2202897	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012781	ATTTAT	2	12	2207298	2207309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012781	TCCGCT	2	12	2237000	2237011	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_012781	ACTAAA	2	12	2250903	2250914	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_012781	TCACAA	2	12	2255161	2255172	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012781	TATAAG	2	12	2296331	2296342	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012781	ATAACT	2	12	2331275	2331286	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_012781	GGTGCA	2	12	2381589	2381600	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_012781	TATAAA	2	12	2385296	2385307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012781	TAGTTT	2	12	2475799	2475810	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012781	TCATAA	2	12	2480886	2480897	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_012781	ATAAAT	2	12	2487062	2487073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012781	ACTTAA	2	12	2509371	2509382	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_012781	TCCCAT	2	12	2524757	2524768	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_012781	CTAAAC	2	12	2561075	2561086	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012781	CTTTTT	2	12	2575546	2575557	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_012781	TACAAT	2	12	2615783	2615794	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_012781	GATTCA	2	12	2672470	2672481	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_012781	TTTCAT	2	12	2676945	2676956	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_012781	ACAAAA	2	12	2701164	2701175	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_012781	GCATAT	2	12	2706801	2706812	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_012781	TTTTAT	2	12	2761550	2761561	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012781	ATACTT	2	12	2840706	2840717	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_012781	TAATTT	2	12	2846527	2846538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012781	TTCACA	2	12	2869256	2869267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_012781	TACTTG	2	12	2910854	2910865	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_012781	CCTTTC	2	12	2935583	2935594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_012781	GTCATT	2	12	2935693	2935704	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_012781	TATAAT	2	12	2962893	2962904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012781	TATTTT	2	12	2977699	2977710	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012781	GTATTG	2	12	2987505	2987516	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012781	TATTTT	2	12	2999255	2999266	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012781	ATATTC	2	12	3015089	3015100	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_012781	CTTTAT	2	12	3083404	3083415	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_012781	GCCACG	2	12	3120386	3120397	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_012781	TTTTGC	2	12	3140553	3140564	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_012781	TCATTT	2	12	3149695	3149706	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_012781	TTTTAT	2	12	3168695	3168706	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012781	TTTTAT	2	12	3190743	3190754	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012781	TTCTTA	2	12	3268784	3268795	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_012781	AATGGG	2	12	3393392	3393403	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012781	TTTTTC	2	12	3398916	3398927	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_012781	ATTTTT	2	12	3401074	3401085	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012781	ATTTTA	2	12	3415247	3415258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012781	TTTTCC	2	12	3431836	3431847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012781	ATACTT	2	12	3438259	3438270	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_012781	ATGTAT	2	12	3438650	3438661	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012781	ATGTAT	2	12	3439361	3439372	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.