MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Eubacterium eligens ATCC 27750 plasmid unnamed

Total Repeats: 260

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012780	ATTTCA	2	12	425	436	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238921768
2	NC_012780	TTCCAA	2	12	2892	2903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238921774
3	NC_012780	TTTTCA	2	12	6639	6650	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238921781
4	NC_012780	TCTGCA	2	12	8545	8556	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238921783
5	NC_012780	ACCTGC	2	12	8983	8994	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238921784
6	NC_012780	ACATGA	2	12	13493	13504	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238921792
7	NC_012780	TCTGAA	2	12	15121	15132	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238921795
8	NC_012780	ACATAT	2	12	20437	20448	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238921802
9	NC_012780	ATAACA	2	12	23141	23152	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	238921808
10	NC_012780	TGATAA	2	12	25027	25038	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238921810
11	NC_012780	CTTATA	2	12	25875	25886	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238921811
12	NC_012780	TAAAAC	2	12	27452	27463	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	238921814
13	NC_012780	CTCATT	2	12	29048	29059	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	238921817
14	NC_012780	CCATAT	2	12	29811	29822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238921817
15	NC_012780	ATTGCA	2	12	30922	30933	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238921819
16	NC_012780	ATGATA	2	12	31378	31389	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238921819
17	NC_012780	TCTCCT	2	12	32935	32946	0 %	50 %	0 %	50 %	238921820
18	NC_012780	ACGTTA	2	12	34542	34553	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238921822
19	NC_012780	TAGCTC	2	12	35350	35361	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238921822
20	NC_012780	CAAGTG	2	12	39270	39281	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238921827
21	NC_012780	CATAAA	2	12	47610	47621	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	238921835
22	NC_012780	ATCCCC	2	12	47982	47993	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	238921835
23	NC_012780	TCTTTT	2	12	52677	52688	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	238921839
24	NC_012780	CTGTAG	2	12	58074	58085	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238921843
25	NC_012780	TTGATG	2	12	65769	65780	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	238921852
26	NC_012780	GGCGTA	2	12	65849	65860	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	238921852
27	NC_012780	TCATTA	2	12	67451	67462	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238921853
28	NC_012780	TCATAT	2	12	71611	71622	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238921859
29	NC_012780	CTTTTC	2	12	86560	86571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238921880
30	NC_012780	CTGTCG	2	12	87487	87498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238921881
31	NC_012780	CCAACC	2	12	87664	87675	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238921881
32	NC_012780	GGATTA	2	12	88174	88185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238921881
33	NC_012780	CTGTCT	2	12	89393	89404	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	238921883
34	NC_012780	CAATAT	2	12	94067	94078	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238921884
35	NC_012780	TTTCAT	2	12	95833	95844	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238921886
36	NC_012780	TCATCC	2	12	97131	97142	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	238921886
37	NC_012780	TAATTG	2	12	97327	97338	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238921886
38	NC_012780	CATAGT	2	12	97375	97386	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238921886
39	NC_012780	TTCCTG	2	12	100727	100738	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	238921890
40	NC_012780	TGCCTT	2	12	102483	102494	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	238921892
41	NC_012780	ACATTG	2	12	103314	103325	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238921893
42	NC_012780	CATGTG	2	12	104658	104669	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238921895
43	NC_012780	TCCTGC	2	12	106758	106769	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	238921897
44	NC_012780	TGCTTC	2	12	110314	110325	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	238921899
45	NC_012780	ATGCAG	2	12	112267	112278	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238921900
46	NC_012780	ATCTGA	2	12	114538	114549	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238921904
47	NC_012780	TTCCTG	2	12	120966	120977	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	238921916
48	NC_012780	CCACAG	2	12	122848	122859	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	238921920
49	NC_012780	GAAAAA	2	12	123577	123588	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	238921921
50	NC_012780	ATTTCA	2	12	125520	125531	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238921924
51	NC_012780	TCATGC	2	12	132191	132202	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238921933
52	NC_012780	ACATTT	2	12	132297	132308	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238921934
53	NC_012780	TTTCCA	2	12	132915	132926	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	238921935
54	NC_012780	GCAACA	2	12	133923	133934	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	238921935
55	NC_012780	GATGTA	2	12	134046	134057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238921935
56	NC_012780	TTTCTG	2	12	135158	135169	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	238921936
57	NC_012780	CTCTTG	2	12	137569	137580	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	238921939
58	NC_012780	TCTTCA	2	12	137997	138008	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	238921939
59	NC_012780	CTACAA	2	12	139263	139274	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	238921940
60	NC_012780	ATATCC	2	12	139373	139384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238921940
61	NC_012780	CACATA	2	12	142006	142017	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	238921944
62	NC_012780	TGCCGC	2	12	143094	143105	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	238921945
63	NC_012780	TTTTTC	2	12	144543	144554	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	238921946
64	NC_012780	TCTTTT	2	12	144854	144865	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	238921946
65	NC_012780	TTTTCA	2	12	146226	146237	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238921947
66	NC_012780	CTGTAG	2	12	148956	148967	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238921950
67	NC_012780	GCATGC	2	12	150026	150037	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238921951
68	NC_012780	GACAAT	2	12	153817	153828	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238921955
69	NC_012780	ATCAGC	2	12	154177	154188	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238921956
70	NC_012780	TTCATT	2	12	155315	155326	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238921956
71	NC_012780	ATGAAA	2	12	160782	160793	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	238921963
72	NC_012780	TTGCAT	2	12	166887	166898	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238921968
73	NC_012780	GCTTGA	2	12	175730	175741	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238921979
74	NC_012780	CAAGCA	2	12	180910	180921	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	238921986
75	NC_012780	TCTTCA	2	12	185521	185532	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	238921990
76	NC_012780	TTGCTG	2	12	187795	187806	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	238921992
77	NC_012780	CTCTGT	2	12	188927	188938	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	238921994
78	NC_012780	TGTATA	2	12	189004	189015	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238921994
79	NC_012780	CATACC	2	12	190900	190911	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	238921996
80	NC_012780	TTTTTC	2	12	191802	191813	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	238921997
81	NC_012780	TTTCAT	2	12	192119	192130	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238921997
82	NC_012780	ATATAA	2	12	192730	192741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238921998
83	NC_012780	CAAAGA	2	12	197557	197568	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	238922004
84	NC_012780	CGATTG	2	12	198237	198248	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238922005
85	NC_012780	GCAGAG	2	12	198854	198865	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	238922005
86	NC_012780	ATCGCA	2	12	199133	199144	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238922005
87	NC_012780	CGGAGA	2	12	201238	201249	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	238922009
88	NC_012780	CTAAAT	2	12	204908	204919	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238922014
89	NC_012780	GTAATC	2	12	207440	207451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238922017
90	NC_012780	ACAAAT	2	12	211015	211026	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	238922023
91	NC_012780	GCAAGT	2	12	224544	224555	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238922041
92	NC_012780	CCTGTC	2	12	224641	224652	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	238922041
93	NC_012780	TTACAG	2	12	224833	224844	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238922041
94	NC_012780	CTGTAA	2	12	226894	226905	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238922044
95	NC_012780	CTGTTC	2	12	229536	229547	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	238922046
96	NC_012780	TGGCAT	2	12	231791	231802	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238922048
97	NC_012780	GTAACC	2	12	233066	233077	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238922050
98	NC_012780	TACATT	2	12	234206	234217	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238922051
99	NC_012780	AATAGA	2	12	234647	234658	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	238922051
100	NC_012780	AACCTT	2	12	243462	243473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238922061
101	NC_012780	TGGCTT	2	12	243849	243860	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	238922061
102	NC_012780	ATTTTA	2	12	246110	246121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238922062
103	NC_012780	TCTGAC	2	12	247464	247475	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238922062
104	NC_012780	TCTTTA	2	12	252816	252827	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238922065
105	NC_012780	ACATCT	2	12	254865	254876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238922069
106	NC_012780	TAAATC	2	12	255338	255349	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238922069
107	NC_012780	TTCCCC	2	12	256006	256017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238922070
108	NC_012780	AATATT	2	12	259085	259096	50 %	50 %	0 %	0 %	238922075
109	NC_012780	TGTGCT	2	12	263539	263550	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	238922079
110	NC_012780	TAATCC	2	12	264131	264142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238922080
111	NC_012780	ATATTT	2	12	266713	266724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238922081
112	NC_012780	ACCAGC	2	12	266915	266926	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	238922082
113	NC_012780	ATTCCA	2	12	268839	268850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238922083
114	NC_012780	ATTAAT	2	12	268860	268871	50 %	50 %	0 %	0 %	238922083
115	NC_012780	GGTACT	2	12	270715	270726	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238922085
116	NC_012780	CTGTAA	2	12	271052	271063	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238922085
117	NC_012780	CTTAAG	2	12	276781	276792	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238922095
118	NC_012780	ATATGT	2	12	278059	278070	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	238922095
119	NC_012780	TTTTCT	2	12	283752	283763	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	238922100
120	NC_012780	TCCAAG	2	12	287710	287721	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238922104
121	NC_012780	TTTCCT	2	12	289172	289183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238922105
122	NC_012780	TAATCT	2	12	290912	290923	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238922107
123	NC_012780	GAAAAG	2	12	292325	292336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238922108
124	NC_012780	TTATCA	2	12	295182	295193	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	238922110
125	NC_012780	ATATTA	2	12	295770	295781	50 %	50 %	0 %	0 %	238922110
126	NC_012780	GATCAG	2	12	299287	299298	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238922113
127	NC_012780	AATATT	2	12	299965	299976	50 %	50 %	0 %	0 %	238922115
128	NC_012780	AACAGG	2	12	302597	302608	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	238922116
129	NC_012780	TGAAGA	2	12	302661	302672	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	238922116
130	NC_012780	TATACA	2	12	302893	302904	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238922116
131	NC_012780	TGAAAC	2	12	303093	303104	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238922116
132	NC_012780	CACTGG	2	12	303640	303651	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238922117
133	NC_012780	GAATCT	2	12	312457	312468	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238922125
134	NC_012780	TCATTC	2	12	312608	312619	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	238922125
135	NC_012780	CAAAAG	2	12	322435	322446	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	238922132
136	NC_012780	GCTGAC	2	12	322518	322529	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238922132
137	NC_012780	TGCACA	2	12	326868	326879	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238922135
138	NC_012780	TATAAT	2	12	329327	329338	50 %	50 %	0 %	0 %	238922138
139	NC_012780	TCCATA	2	12	331986	331997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238922140
140	NC_012780	GGATAT	2	12	332962	332973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238922141
141	NC_012780	ATTCTT	2	12	333154	333165	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	238922142
142	NC_012780	CCAAAG	2	12	333545	333556	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	238922142
143	NC_012780	TCTGAT	2	12	334165	334176	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238922143
144	NC_012780	GCTGAT	2	12	334932	334943	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	238922144
145	NC_012780	TGCACT	2	12	335126	335137	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238922144
146	NC_012780	TGGTCT	2	12	335411	335422	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	238922144
147	NC_012780	TGAAGC	2	12	337364	337375	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	238922146
148	NC_012780	GCACCA	2	12	340142	340153	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	238922148
149	NC_012780	TTCTTT	2	12	341630	341641	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	238922150
150	NC_012780	CTTTTT	2	12	344065	344076	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	238922152
151	NC_012780	CCAGGA	2	12	346403	346414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238922154
152	NC_012780	AATGCA	2	12	347209	347220	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238922155
153	NC_012780	ATCCAA	2	12	349114	349125	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	238922156
154	NC_012780	AATCAT	2	12	354957	354968	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238922161
155	NC_012780	TGCAAC	2	12	356708	356719	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238922162
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157	NC_012780	AGAATC	2	12	366490	366501	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238922173
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178	NC_012780	AAGTAC	2	12	402304	402315	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238922202
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214	NC_012780	ATCAGT	2	12	497162	497173	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238922296
215	NC_012780	CCATCT	2	12	500820	500831	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	238922298
216	NC_012780	ATTAAA	2	12	501533	501544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238922298
217	NC_012780	ATTCAA	2	12	501847	501858	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238922298
218	NC_012780	CTGCTT	2	12	502850	502861	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	238922299
219	NC_012780	TTGCTG	2	12	505711	505722	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	238922305
220	NC_012780	TAAGCT	2	12	507785	507796	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238922308
221	NC_012780	TCCAAG	2	12	509291	509302	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	238922310
222	NC_012780	ATAAGA	2	12	511655	511666	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	238922312
223	NC_012780	CCTGCA	2	12	512066	512077	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	238922312
224	NC_012780	CCAGTG	2	12	513452	513463	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238922313
225	NC_012780	ATGCAA	2	12	514909	514920	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	238922314
226	NC_012780	AGTATA	2	12	515445	515456	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	238922315
227	NC_012780	TCTGAA	2	12	516891	516902	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238922315
228	NC_012780	TTTTTC	2	12	517146	517157	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	238922315
229	NC_012780	ATACAT	2	12	517523	517534	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	238922315
230	NC_012780	TAACAA	2	12	519070	519081	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	238922317
231	NC_012780	ATCTGT	2	12	520232	520243	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238922317
232	NC_012780	AATTAT	2	12	523493	523504	50 %	50 %	0 %	0 %	238922319
233	NC_012780	CTGTGC	2	12	525342	525353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238922321
234	NC_012780	AAAAAG	2	12	528677	528688	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	238922323
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236	NC_012780	TCTTAG	2	12	532218	532229	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	238922327
237	NC_012780	TTGCAA	2	12	532914	532925	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238922327
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.