MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Eubacterium eligens ATCC 27750 plasmid unnamed

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012780	AAAAT	2	10	10572	10581	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012780	TCAGC	2	10	24726	24735	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_012780	AAAAT	2	10	25265	25274	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012780	ATCTT	2	10	25434	25443	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_012780	ATATA	2	10	36660	36669	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012780	TCTTT	2	10	41197	41206	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_012780	ATCAA	2	10	65526	65535	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_012780	TTTCT	2	10	78808	78817	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_012780	CCAGA	2	10	88796	88805	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_012780	CCCTG	2	10	89105	89114	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_012780	TTTTA	2	10	127460	127469	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012780	CTTCT	2	10	127640	127649	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_012780	TTATA	2	10	130156	130165	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012780	TTATT	2	10	131980	131989	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012780	TTGCT	2	10	160305	160314	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012780	ATTAT	2	10	160442	160451	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012780	TTTTC	2	10	165256	165265	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012780	AGATA	2	10	165355	165364	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012780	TAATA	2	10	168990	168999	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012780	ATATT	2	10	172850	172859	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012780	ATTTT	2	10	172892	172901	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012780	CATAT	2	10	175039	175048	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_012780	TAAAC	2	10	195117	195126	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_012780	ACACT	2	10	204029	204038	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_012780	ACTAA	2	10	208138	208147	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_012780	TGCAA	2	10	225044	225053	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_012780	TTGTT	2	10	237626	237635	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012780	ACATA	2	10	239987	239996	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_012780	TTTTA	2	10	248042	248051	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012780	TAAAA	2	10	251771	251780	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012780	ATATC	2	10	257576	257585	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_012780	TTTAT	2	10	296657	296666	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012780	AACTA	2	10	296731	296740	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_012780	AAGCG	2	10	317769	317778	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_012780	CTGCT	2	10	345042	345051	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_012780	CTTCT	2	10	350814	350823	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_012780	ATATT	2	10	375070	375079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012780	ATTTT	2	10	415714	415723	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012780	ATATT	2	10	417985	417994	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012780	TGTAT	2	10	428685	428694	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012780	AATTC	2	10	429423	429432	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_012780	AAAAT	2	10	432103	432112	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012780	ATATC	2	10	439017	439026	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_012780	CATAA	2	10	439075	439084	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_012780	AATTA	2	10	442187	442196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012780	AGCAA	2	10	442476	442485	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_012780	ATTAT	2	10	458508	458517	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012780	ATAGC	2	10	459888	459897	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_012780	TGCTT	2	10	459996	460005	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_012780	TTTAT	2	10	475206	475215	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012780	CATAC	2	10	475465	475474	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_012780	CGCTT	2	10	500133	500142	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_012780	CATAT	2	10	500214	500223	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_012780	TTCTG	2	10	505826	505835	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_012780	GGGAT	2	10	508876	508885	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012780	TAATT	2	10	550131	550140	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012780	ATCAT	2	10	580832	580841	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_012780	TATTG	2	10	587446	587455	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012780	ATATT	2	10	592687	592696	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012780	TACAA	2	10	617196	617205	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_012780	ATACT	2	10	619144	619153	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_012780	CAATA	2	10	619211	619220	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_012780	CTTTC	2	10	621656	621665	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
64	NC_012780	CTGAT	2	10	621784	621793	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_012780	TAAAT	2	10	626651	626660	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.