MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Eubacterium eligens ATCC 27750 plasmid unnamed

Total Repeats: 435

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012780	ATATG	2	10	2858	2867	40 %	40 %	20 %	0 %	238921774
2	NC_012780	CAGAA	2	10	5095	5104	60 %	0 %	20 %	20 %	238921779
3	NC_012780	GCTGC	2	10	5322	5331	0 %	20 %	40 %	40 %	238921779
4	NC_012780	AGGCA	2	10	5357	5366	40 %	0 %	40 %	20 %	238921779
5	NC_012780	GCGGT	2	10	5572	5581	0 %	20 %	60 %	20 %	238921779
6	NC_012780	ATGGC	2	10	6091	6100	20 %	20 %	40 %	20 %	238921780
7	NC_012780	ATTGT	2	10	7656	7665	20 %	60 %	20 %	0 %	238921782
8	NC_012780	TCATA	2	10	7969	7978	40 %	40 %	0 %	20 %	238921783
9	NC_012780	TCCAA	2	10	8768	8777	40 %	20 %	0 %	40 %	238921783
10	NC_012780	TCTCG	2	10	8903	8912	0 %	40 %	20 %	40 %	238921784
11	NC_012780	ATTCC	2	10	10212	10221	20 %	40 %	0 %	40 %	238921786
12	NC_012780	CTTCA	2	10	11037	11046	20 %	40 %	0 %	40 %	238921788
13	NC_012780	ATATT	2	10	11554	11563	40 %	60 %	0 %	0 %	238921789
14	NC_012780	TTTCA	2	10	11684	11693	20 %	60 %	0 %	20 %	238921789
15	NC_012780	AATTC	2	10	14633	14642	40 %	40 %	0 %	20 %	238921794
16	NC_012780	TCGGT	2	10	14758	14767	0 %	40 %	40 %	20 %	238921794
17	NC_012780	TCTGC	2	10	15668	15677	0 %	40 %	20 %	40 %	238921795
18	NC_012780	TCTTT	2	10	15976	15985	0 %	80 %	0 %	20 %	238921796
19	NC_012780	AGAAA	2	10	17986	17995	80 %	0 %	20 %	0 %	238921799
20	NC_012780	CTCTT	2	10	18515	18524	0 %	60 %	0 %	40 %	238921800
21	NC_012780	TTTTC	2	10	18784	18793	0 %	80 %	0 %	20 %	238921800
22	NC_012780	CTTTT	2	10	19871	19880	0 %	80 %	0 %	20 %	238921801
23	NC_012780	TATTT	2	10	20376	20385	20 %	80 %	0 %	0 %	238921802
24	NC_012780	ATTCC	2	10	20777	20786	20 %	40 %	0 %	40 %	238921803
25	NC_012780	TGAGC	2	10	21466	21475	20 %	20 %	40 %	20 %	238921804
26	NC_012780	CCTTG	2	10	24586	24595	0 %	40 %	20 %	40 %	238921809
27	NC_012780	GCTCA	2	10	26468	26477	20 %	20 %	20 %	40 %	238921812
28	NC_012780	CTATG	2	10	30256	30265	20 %	40 %	20 %	20 %	238921818
29	NC_012780	AAAGT	2	10	30813	30822	60 %	20 %	20 %	0 %	238921819
30	NC_012780	TCTGC	2	10	34729	34738	0 %	40 %	20 %	40 %	238921822
31	NC_012780	ATCTG	2	10	35976	35985	20 %	40 %	20 %	20 %	238921822
32	NC_012780	CTCTT	2	10	35990	35999	0 %	60 %	0 %	40 %	238921822
33	NC_012780	TCACA	2	10	37452	37461	40 %	20 %	0 %	40 %	238921824
34	NC_012780	ATAGT	2	10	39029	39038	40 %	40 %	20 %	0 %	238921827
35	NC_012780	GCTTT	2	10	39324	39333	0 %	60 %	20 %	20 %	238921827
36	NC_012780	TATCA	2	10	39367	39376	40 %	40 %	0 %	20 %	238921827
37	NC_012780	ATCAC	2	10	42516	42525	40 %	20 %	0 %	40 %	238921829
38	NC_012780	CATAT	2	10	43294	43303	40 %	40 %	0 %	20 %	238921830
39	NC_012780	TTTCT	2	10	44850	44859	0 %	80 %	0 %	20 %	238921831
40	NC_012780	ATTAT	2	10	46402	46411	40 %	60 %	0 %	0 %	238921834
41	NC_012780	ATATG	2	10	46610	46619	40 %	40 %	20 %	0 %	238921834
42	NC_012780	CTATA	2	10	47143	47152	40 %	40 %	0 %	20 %	238921835
43	NC_012780	AGCAT	2	10	47208	47217	40 %	20 %	20 %	20 %	238921835
44	NC_012780	CCTTT	2	10	47300	47309	0 %	60 %	0 %	40 %	238921835
45	NC_012780	CTTTT	2	10	47556	47565	0 %	80 %	0 %	20 %	238921835
46	NC_012780	TCCTG	2	10	47997	48006	0 %	40 %	20 %	40 %	238921836
47	NC_012780	TTATC	2	10	49691	49700	20 %	60 %	0 %	20 %	238921837
48	NC_012780	ATATA	2	10	51594	51603	60 %	40 %	0 %	0 %	238921838
49	NC_012780	ATAAG	2	10	51741	51750	60 %	20 %	20 %	0 %	238921838
50	NC_012780	GGATT	2	10	53755	53764	20 %	40 %	40 %	0 %	238921841
51	NC_012780	TTTCT	2	10	54949	54958	0 %	80 %	0 %	20 %	238921841
52	NC_012780	ATCTG	2	10	55487	55496	20 %	40 %	20 %	20 %	238921842
53	NC_012780	TTCGC	2	10	57061	57070	0 %	40 %	20 %	40 %	238921842
54	NC_012780	TCTGC	2	10	57270	57279	0 %	40 %	20 %	40 %	238921842
55	NC_012780	CAACA	2	10	59340	59349	60 %	0 %	0 %	40 %	238921844
56	NC_012780	GCATT	2	10	62200	62209	20 %	40 %	20 %	20 %	238921847
57	NC_012780	TCCAT	2	10	63297	63306	20 %	40 %	0 %	40 %	238921848
58	NC_012780	ACCTC	2	10	64010	64019	20 %	20 %	0 %	60 %	238921850
59	NC_012780	AAGAT	2	10	65634	65643	60 %	20 %	20 %	0 %	238921852
60	NC_012780	AAGGC	2	10	66393	66402	40 %	0 %	40 %	20 %	238921852
61	NC_012780	TCCAT	2	10	68176	68185	20 %	40 %	0 %	40 %	238921854
62	NC_012780	GCATA	2	10	68393	68402	40 %	20 %	20 %	20 %	238921854
63	NC_012780	AAATA	2	10	68511	68520	80 %	20 %	0 %	0 %	238921854
64	NC_012780	GTAAT	2	10	70654	70663	40 %	40 %	20 %	0 %	238921857
65	NC_012780	ATATC	2	10	71657	71666	40 %	40 %	0 %	20 %	238921859
66	NC_012780	ATTAT	2	10	72616	72625	40 %	60 %	0 %	0 %	238921860
67	NC_012780	ACCGT	2	10	78254	78263	20 %	20 %	20 %	40 %	238921867
68	NC_012780	TGGAT	2	10	78671	78680	20 %	40 %	40 %	0 %	238921867
69	NC_012780	TTTAT	2	10	79138	79147	20 %	80 %	0 %	0 %	238921868
70	NC_012780	TTCTT	2	10	79447	79456	0 %	80 %	0 %	20 %	238921868
71	NC_012780	TACAT	2	10	80880	80889	40 %	40 %	0 %	20 %	238921871
72	NC_012780	ATAGC	2	10	82752	82761	40 %	20 %	20 %	20 %	238921875
73	NC_012780	CTTTT	2	10	83185	83194	0 %	80 %	0 %	20 %	238921876
74	NC_012780	CACAG	2	10	85992	86001	40 %	0 %	20 %	40 %	238921879
75	NC_012780	TGAAT	2	10	88694	88703	40 %	40 %	20 %	0 %	238921882
76	NC_012780	CAGAC	2	10	88747	88756	40 %	0 %	20 %	40 %	238921882
77	NC_012780	CCATT	2	10	93061	93070	20 %	40 %	0 %	40 %	238921883
78	NC_012780	ATTGA	2	10	96543	96552	40 %	40 %	20 %	0 %	238921886
79	NC_012780	ATCTG	2	10	100122	100131	20 %	40 %	20 %	20 %	238921890
80	NC_012780	CCAGC	2	10	101072	101081	20 %	0 %	20 %	60 %	238921891
81	NC_012780	AAAGC	2	10	104081	104090	60 %	0 %	20 %	20 %	238921895
82	NC_012780	TTAAG	2	10	104934	104943	40 %	40 %	20 %	0 %	238921895
83	NC_012780	TATCA	2	10	106296	106305	40 %	40 %	0 %	20 %	238921896
84	NC_012780	TTAAC	2	10	106321	106330	40 %	40 %	0 %	20 %	238921897
85	NC_012780	CTTCT	2	10	107604	107613	0 %	60 %	0 %	40 %	238921897
86	NC_012780	CATAA	2	10	109396	109405	60 %	20 %	0 %	20 %	238921899
87	NC_012780	TAAGA	2	10	109494	109503	60 %	20 %	20 %	0 %	238921899
88	NC_012780	ATATT	2	10	109964	109973	40 %	60 %	0 %	0 %	238921899
89	NC_012780	GATTA	2	10	110524	110533	40 %	40 %	20 %	0 %	238921899
90	NC_012780	TTTTA	2	10	113140	113149	20 %	80 %	0 %	0 %	238921902
91	NC_012780	TCCTT	2	10	113227	113236	0 %	60 %	0 %	40 %	238921902
92	NC_012780	TCATA	2	10	114125	114134	40 %	40 %	0 %	20 %	238921903
93	NC_012780	TCCAT	2	10	116296	116305	20 %	40 %	0 %	40 %	238921906
94	NC_012780	TTATC	2	10	117508	117517	20 %	60 %	0 %	20 %	238921909
95	NC_012780	CTTCT	2	10	117875	117884	0 %	60 %	0 %	40 %	238921910
96	NC_012780	TCAAA	2	10	119408	119417	60 %	20 %	0 %	20 %	238921914
97	NC_012780	TTTCT	2	10	120069	120078	0 %	80 %	0 %	20 %	238921914
98	NC_012780	TGATA	2	10	127317	127326	40 %	40 %	20 %	0 %	238921928
99	NC_012780	TTCCA	2	10	127782	127791	20 %	40 %	0 %	40 %	238921929
100	NC_012780	CGGCA	2	10	127881	127890	20 %	0 %	40 %	40 %	238921929
101	NC_012780	AGGCA	2	10	127997	128006	40 %	0 %	40 %	20 %	238921929
102	NC_012780	TGTTC	2	10	132090	132099	0 %	60 %	20 %	20 %	238921933
103	NC_012780	GTAAT	2	10	132259	132268	40 %	40 %	20 %	0 %	238921934
104	NC_012780	TCCTA	2	10	132870	132879	20 %	40 %	0 %	40 %	238921935
105	NC_012780	TAATG	2	10	133130	133139	40 %	40 %	20 %	0 %	238921935
106	NC_012780	CTCTT	2	10	136277	136286	0 %	60 %	0 %	40 %	238921938
107	NC_012780	CATTC	2	10	139065	139074	20 %	40 %	0 %	40 %	238921940
108	NC_012780	TAATA	2	10	140571	140580	60 %	40 %	0 %	0 %	238921941
109	NC_012780	ACTGC	2	10	141498	141507	20 %	20 %	20 %	40 %	238921943
110	NC_012780	TCCTG	2	10	143971	143980	0 %	40 %	20 %	40 %	238921946
111	NC_012780	ATTCC	2	10	144130	144139	20 %	40 %	0 %	40 %	238921946
112	NC_012780	GCTGT	2	10	144340	144349	0 %	40 %	40 %	20 %	238921946
113	NC_012780	TTCTC	2	10	147252	147261	0 %	60 %	0 %	40 %	238921948
114	NC_012780	TTCTT	2	10	147855	147864	0 %	80 %	0 %	20 %	238921949
115	NC_012780	GCCAT	2	10	148022	148031	20 %	20 %	20 %	40 %	238921949
116	NC_012780	TGCGC	2	10	148381	148390	0 %	20 %	40 %	40 %	238921950
117	NC_012780	CCATT	2	10	148781	148790	20 %	40 %	0 %	40 %	238921950
118	NC_012780	CTTTA	2	10	153606	153615	20 %	60 %	0 %	20 %	238921955
119	NC_012780	TTTTA	2	10	154139	154148	20 %	80 %	0 %	0 %	238921956
120	NC_012780	ACTCT	2	10	154668	154677	20 %	40 %	0 %	40 %	238921956
121	NC_012780	TTTCT	2	10	155230	155239	0 %	80 %	0 %	20 %	238921956
122	NC_012780	CTGCT	2	10	156241	156250	0 %	40 %	20 %	40 %	238921957
123	NC_012780	CATAT	2	10	157846	157855	40 %	40 %	0 %	20 %	238921961
124	NC_012780	GAAAA	2	10	159324	159333	80 %	0 %	20 %	0 %	238921962
125	NC_012780	TAACC	2	10	160797	160806	40 %	20 %	0 %	40 %	238921963
126	NC_012780	ATTGC	2	10	162521	162530	20 %	40 %	20 %	20 %	238921964
127	NC_012780	ACCGG	2	10	165731	165740	20 %	0 %	40 %	40 %	238921968
128	NC_012780	CGTAT	2	10	172072	172081	20 %	40 %	20 %	20 %	238921975
129	NC_012780	TATCA	2	10	173019	173028	40 %	40 %	0 %	20 %	238921977
130	NC_012780	GTTTA	2	10	173184	173193	20 %	60 %	20 %	0 %	238921977
131	NC_012780	AGACA	2	10	174192	174201	60 %	0 %	20 %	20 %	238921978
132	NC_012780	GCATA	2	10	177669	177678	40 %	20 %	20 %	20 %	238921981
133	NC_012780	GCGGA	2	10	178630	178639	20 %	0 %	60 %	20 %	238921982
134	NC_012780	AATCA	2	10	184274	184283	60 %	20 %	0 %	20 %	238921989
135	NC_012780	TGATT	2	10	184298	184307	20 %	60 %	20 %	0 %	238921989
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434	NC_012780	TATGT	2	10	624214	624223	20 %	60 %	20 %	0 %	238922429
435	NC_012780	CTTCT	2	10	625760	625769	0 %	60 %	0 %	40 %	238922430

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.