MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Edwardsiella ictaluri 93-146 chromosome

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012779	TCATAA	2	12	19516	19527	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012779	TAAGAC	2	12	159150	159161	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012779	TAAGAC	2	12	193167	193178	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012779	GGGGAG	2	12	193536	193547	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012779	CACGAT	2	12	223666	223677	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012779	TCAGGA	2	12	229261	229272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_012779	TGGCGG	2	12	243494	243505	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_012779	TGCGCG	2	12	246588	246599	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012779	AAAATA	2	12	257922	257933	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012779	CAGATA	2	12	267144	267155	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_012779	GTAGCG	2	12	336429	336440	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_012779	ATCGCG	2	12	405711	405722	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012779	GTATCC	2	12	432948	432959	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012779	CCGCTG	2	12	496001	496012	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012779	AAAAAT	2	12	501212	501223	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012779	GAAAAA	2	12	519377	519388	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012779	CGGCGT	2	12	524907	524918	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012779	TAGATT	2	12	536532	536543	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012779	GTAAAA	2	12	544468	544479	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012779	TAAGAC	2	12	627490	627501	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_012779	ATATGC	2	12	675462	675473	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_012779	TACGCC	2	12	682140	682151	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_012779	CGGCGT	2	12	701884	701895	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_012779	ATTTTT	2	12	709189	709200	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012779	TTTTTG	2	12	716684	716695	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012779	ACAATG	2	12	763934	763945	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012779	GCAGCG	2	12	796773	796784	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012779	TGGATG	2	12	817984	817995	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012779	TGGGGC	2	12	831792	831803	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012779	AACCAC	2	12	839353	839364	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_012779	AGCGCG	2	12	913441	913452	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_012779	TTCAGC	2	12	923362	923373	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012779	TCCATC	2	12	924454	924465	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_012779	ACCTAT	2	12	969318	969329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012779	GAATAT	2	12	975959	975970	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012779	GATAAC	2	12	976456	976467	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_012779	TCGGCG	2	12	999092	999103	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012779	TGATGG	2	12	1064806	1064817	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012779	TTAAAG	2	12	1090002	1090013	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012779	CACTTG	2	12	1106465	1106476	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_012779	AGCAAA	2	12	1111892	1111903	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_012779	ATCAAA	2	12	1116695	1116706	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_012779	CGCCAT	2	12	1158132	1158143	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
44	NC_012779	AGGCGA	2	12	1231453	1231464	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_012779	CTCTCC	2	12	1236691	1236702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_012779	GATAAC	2	12	1237992	1238003	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_012779	GCAGAT	3	18	1292620	1292637	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_012779	GCCAGG	2	12	1367333	1367344	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012779	AATAAA	2	12	1367416	1367427	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012779	AATTAA	2	12	1411397	1411408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012779	ATTTTT	2	12	1418744	1418755	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012779	TGATAT	2	12	1458945	1458956	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012779	GGCCAA	2	12	1467378	1467389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012779	GCTTAT	2	12	1482532	1482543	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_012779	TTATCT	2	12	1484142	1484153	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_012779	GGCATA	2	12	1485604	1485615	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_012779	TATCAG	2	12	1488849	1488860	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_012779	GCGCGT	2	12	1495568	1495579	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012779	ATTTTT	2	12	1505128	1505139	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012779	GAACTT	2	12	1511506	1511517	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_012779	CGCGTC	2	12	1549565	1549576	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_012779	GCACTC	2	12	1552364	1552375	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_012779	AACATA	2	12	1555352	1555363	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_012779	GGGGCA	2	12	1565266	1565277	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_012779	CTTATT	2	12	1590335	1590346	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_012779	ATTGTG	2	12	1636074	1636085	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012779	GTAGCT	2	12	1679600	1679611	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012779	TGATGG	2	12	1680212	1680223	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012779	GGCTGC	2	12	1714439	1714450	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_012779	AGAGAT	2	12	1721626	1721637	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012779	CTGCCT	15	90	1726744	1726833	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_012779	TAAGTG	2	12	1746008	1746019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012779	GCGGTG	2	12	1751660	1751671	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_012779	CATATT	2	12	1795137	1795148	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_012779	TGTAAA	2	12	1809349	1809360	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012779	CTTTTG	2	12	1818876	1818887	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_012779	GCAGTG	2	12	1830252	1830263	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_012779	CTTAAA	2	12	1878361	1878372	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_012779	CTGATA	2	12	1895754	1895765	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_012779	CGCGCC	2	12	1896538	1896549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_012779	TCTCCC	2	12	1950593	1950604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_012779	TATACA	2	12	1953145	1953156	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_012779	ATTGTA	3	18	1971201	1971218	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012779	AGTTAT	2	12	1979259	1979270	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012779	TGTCAT	2	12	1996451	1996462	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_012779	CTGTGA	2	12	2054709	2054720	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_012779	GTAGGT	2	12	2070143	2070154	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012779	TAATAT	2	12	2086718	2086729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012779	CGGCAC	2	12	2092757	2092768	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
90	NC_012779	GGTGCT	2	12	2092812	2092823	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_012779	CCTGCT	2	12	2095597	2095608	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_012779	GTAAAA	2	12	2104613	2104624	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012779	GGGAGA	2	12	2119931	2119942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012779	CCCAAT	2	12	2196847	2196858	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_012779	AATTAC	2	12	2204478	2204489	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012779	TCTTCA	2	12	2256165	2256176	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_012779	CGCGCC	2	12	2276229	2276240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_012779	ATCAAA	2	12	2286208	2286219	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_012779	GGCTGC	2	12	2296423	2296434	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012779	TATTGG	2	12	2310089	2310100	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012779	ACAGAA	2	12	2317315	2317326	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_012779	CACGCC	2	12	2325114	2325125	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_012779	CGTTAT	2	12	2339702	2339713	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_012779	CAAAAA	2	12	2362608	2362619	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_012779	GAACCG	2	12	2426559	2426570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012779	CTGAAG	2	12	2446629	2446640	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_012779	CACCGC	2	12	2468927	2468938	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_012779	CAGCAT	2	12	2529461	2529472	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012779	CACCAG	2	12	2529712	2529723	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_012779	CTGCAG	2	12	2545713	2545724	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_012779	CTGACG	2	12	2548108	2548119	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012779	TGAGAG	2	12	2557395	2557406	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_012779	AAAAAC	2	12	2578494	2578505	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_012779	AGAAAA	2	12	2609076	2609087	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012779	CTCCGC	2	12	2673396	2673407	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_012779	ATTTTA	2	12	2673483	2673494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012779	CAAGCG	2	12	2679210	2679221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012779	AGAAAA	2	12	2710376	2710387	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012779	AAAAAT	2	12	2712602	2712613	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012779	CTGGCT	2	12	2718576	2718587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012779	TAAAGA	2	12	2763184	2763195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_012779	CATCGC	2	12	2809726	2809737	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_012779	TAATAT	2	12	2871098	2871109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012779	GGGTCA	2	12	2876171	2876182	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_012779	CAACGT	2	12	2878468	2878479	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012779	ATATTC	2	12	2904859	2904870	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_012779	GAAAGG	2	12	2941205	2941216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012779	AATGAC	2	12	2967561	2967572	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_012779	AAAAAG	2	12	2972643	2972654	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012779	TAAAAA	2	12	2974593	2974604	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_012779	CCGCTT	2	12	3018440	3018451	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
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167	NC_012779	GGAGAA	5	30	3607691	3607720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.