MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Edwardsiella ictaluri 93-146 chromosome

Total Repeats: 534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012779	CTGCT	2	10	12459	12468	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_012779	GCAAC	2	10	43543	43552	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_012779	TGATT	2	10	49990	49999	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012779	TATCA	2	10	64696	64705	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_012779	TCCGG	2	10	70526	70535	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_012779	TATGG	2	10	70604	70613	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012779	CAGCG	2	10	80009	80018	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
8	NC_012779	GTTAA	2	10	100618	100627	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012779	GTGAT	2	10	115893	115902	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012779	CAGAG	2	10	117168	117177	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_012779	ACTGA	2	10	132103	132112	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_012779	GGCCG	2	10	136333	136342	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13	NC_012779	GCGCT	2	10	149081	149090	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_012779	CGTAT	2	10	149832	149841	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_012779	AGCGA	2	10	157455	157464	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_012779	ATTGC	2	10	159037	159046	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_012779	GACCC	2	10	159555	159564	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_012779	GGTTT	2	10	165117	165126	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012779	AGTGA	2	10	167676	167685	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012779	AGCGA	2	10	191472	191481	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_012779	ATTGC	2	10	193054	193063	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_012779	CAGCG	2	10	197782	197791	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_012779	GCGTG	2	10	198798	198807	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_012779	CTGTT	2	10	204995	205004	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_012779	CCTAC	2	10	209807	209816	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
26	NC_012779	GCCGC	2	10	209868	209877	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
27	NC_012779	TGCCT	2	10	248924	248933	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
28	NC_012779	ATCTT	2	10	256401	256410	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_012779	TGCTC	2	10	284138	284147	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_012779	CGCGC	2	10	287341	287350	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_012779	GTGTA	2	10	288123	288132	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012779	GCTCT	2	10	300679	300688	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_012779	GCAAC	2	10	313170	313179	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_012779	CGCAC	2	10	313283	313292	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
35	NC_012779	TATCC	2	10	318929	318938	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_012779	TGTAT	2	10	360466	360475	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012779	ATTTT	2	10	361030	361039	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012779	AAGCG	2	10	362345	362354	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_012779	AGGGG	2	10	365370	365379	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012779	TAACA	2	10	375302	375311	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_012779	GAGCA	2	10	383911	383920	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_012779	ATTTT	2	10	387314	387323	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012779	AAGTA	2	10	396497	396506	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012779	CGGGC	2	10	404554	404563	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
45	NC_012779	AGCGG	2	10	429064	429073	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_012779	ATTGA	2	10	429190	429199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012779	TCTTT	2	10	457224	457233	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_012779	ATCAC	2	10	476001	476010	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_012779	GGGAT	2	10	485555	485564	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012779	ATGCC	2	10	499732	499741	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
51	NC_012779	TTTGA	2	10	518519	518528	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012779	TTGTT	2	10	518614	518623	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012779	CTTTC	2	10	523344	523353	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_012779	GCCGC	2	10	541765	541774	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_012779	GTAAC	2	10	544856	544865	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_012779	GGGCA	2	10	547226	547235	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_012779	GGCTG	2	10	576813	576822	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_012779	GTTTT	2	10	581414	581423	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012779	CACCT	2	10	583594	583603	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
60	NC_012779	GATAG	2	10	605918	605927	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012779	AGGTA	2	10	612505	612514	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012779	TAGTC	2	10	617588	617597	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_012779	AGCGA	2	10	625795	625804	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_012779	ATTGC	2	10	627377	627386	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_012779	GCGCC	2	10	632249	632258	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_012779	TTCAT	2	10	640034	640043	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_012779	GCTTT	2	10	643057	643066	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_012779	AAGAT	2	10	654745	654754	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012779	CAACA	2	10	654802	654811	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_012779	GCGAC	2	10	674169	674178	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_012779	GACAG	2	10	681470	681479	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_012779	TGCGC	2	10	716163	716172	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
73	NC_012779	TTATT	2	10	723969	723978	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012779	GCCGC	2	10	752884	752893	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
75	NC_012779	GGGCA	2	10	763902	763911	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_012779	CTTTC	2	10	773824	773833	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_012779	TCGGC	2	10	778452	778461	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
78	NC_012779	CAGAG	2	10	780352	780361	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_012779	AGGCG	2	10	780786	780795	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_012779	TGGCG	2	10	780998	781007	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
81	NC_012779	GTAAT	2	10	796681	796690	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012779	ATGTC	2	10	797977	797986	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_012779	CGACG	2	10	798891	798900	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_012779	CTGCG	2	10	828148	828157	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_012779	CGAGG	2	10	829010	829019	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_012779	CGCTG	2	10	839986	839995	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_012779	CGGTG	2	10	849418	849427	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
88	NC_012779	GGTGA	2	10	849575	849584	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012779	GTATT	2	10	858945	858954	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012779	TGCTC	2	10	870270	870279	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_012779	ATGTA	2	10	874245	874254	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_012779	CTCGT	2	10	875256	875265	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_012779	GCGCT	2	10	884310	884319	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_012779	CCTTT	2	10	890389	890398	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_012779	ATGTA	2	10	897182	897191	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012779	TATAA	2	10	899253	899262	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012779	AATGG	2	10	899688	899697	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012779	GAGCG	2	10	899747	899756	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_012779	CATTA	2	10	922681	922690	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_012779	ATAAG	2	10	927637	927646	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012779	TTTAT	2	10	927965	927974	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012779	CAGGT	2	10	948864	948873	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_012779	CCATT	2	10	957177	957186	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_012779	GAGGC	2	10	964974	964983	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_012779	GAGCA	2	10	970914	970923	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_012779	ATTTG	2	10	972852	972861	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012779	TGCCA	2	10	974261	974270	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_012779	ATGGC	2	10	976133	976142	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_012779	GGGGC	2	10	990141	990150	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
110	NC_012779	CCATA	2	10	990234	990243	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_012779	TGGTG	2	10	991234	991243	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012779	TGCAT	2	10	991397	991406	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_012779	GTAAG	2	10	998373	998382	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012779	TTAAA	2	10	1011021	1011030	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_012779	ATTTA	2	10	1015819	1015828	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012779	TATTT	2	10	1024880	1024889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012779	AAACC	2	10	1033942	1033951	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_012779	TGGCG	2	10	1045702	1045711	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
119	NC_012779	CGTGC	2	10	1054712	1054721	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_012779	ACGTC	2	10	1064784	1064793	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
121	NC_012779	CGGCG	3	15	1071710	1071724	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
122	NC_012779	CGGCG	2	10	1072583	1072592	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
123	NC_012779	TTTAT	2	10	1074161	1074170	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012779	TGCGC	2	10	1079468	1079477	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
125	NC_012779	TAATC	2	10	1079647	1079656	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_012779	GGCAT	2	10	1089478	1089487	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_012779	CTCAC	2	10	1089876	1089885	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_012779	TATCA	2	10	1091198	1091207	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_012779	GGAGC	2	10	1101759	1101768	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_012779	TGCTC	2	10	1109203	1109212	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_012779	CTCAT	2	10	1112127	1112136	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_012779	CCACT	2	10	1112819	1112828	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
133	NC_012779	GCAGC	2	10	1113431	1113440	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_012779	TAATT	2	10	1116722	1116731	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012779	TAAAA	2	10	1116792	1116801	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012779	TGCTC	2	10	1117968	1117977	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_012779	CTTTT	2	10	1122368	1122377	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_012779	AAATA	2	10	1123918	1123927	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_012779	TGCTC	2	10	1132578	1132587	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_012779	ATTTG	2	10	1153929	1153938	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012779	ATAAA	2	10	1154572	1154581	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012779	TTTGA	2	10	1155837	1155846	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012779	TCCTA	2	10	1168851	1168860	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_012779	GCGGT	2	10	1170983	1170992	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
145	NC_012779	GGGGA	2	10	1171341	1171350	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_012779	GAGCA	2	10	1914087	1914096	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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499	NC_012779	CAGCG	2	10	3471678	3471687	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
500	NC_012779	TTCAT	2	10	3483150	3483159	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

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