MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Eubacterium eligens ATCC 27750 chromosome

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012778	TCTTTT	2	12	14382	14393	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_012778	GAAAGC	2	12	17326	17337	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_012778	AAGCGA	2	12	18271	18282	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_012778	TGAAAT	2	12	19613	19624	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012778	ACCTTA	2	12	36230	36241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_012778	TATTTT	2	12	56984	56995	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012778	TTTTAT	2	12	194923	194934	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012778	CAAAGG	2	12	214017	214028	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_012778	AAATTC	2	12	236601	236612	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_012778	TATATG	2	12	240132	240143	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012778	AGAAGT	2	12	347025	347036	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012778	TTCCGG	2	12	354924	354935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012778	ACAAAA	2	12	377137	377148	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_012778	TTATTT	2	12	412537	412548	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012778	AGCGAA	2	12	414793	414804	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012778	AAGCGA	2	12	416094	416105	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_012778	TGAAAT	2	12	417435	417446	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012778	CCGTTC	2	12	436389	436400	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
19	NC_012778	GATGTC	2	12	437480	437491	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012778	TATATT	2	12	461533	461544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012778	TATAAA	2	12	605253	605264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012778	AATGTA	2	12	617005	617016	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012778	CAGGAG	2	12	622232	622243	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_012778	TGATAT	2	12	622312	622323	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012778	ATTAAT	2	12	624908	624919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012778	ATAAAT	2	12	630970	630981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012778	TAAAAT	2	12	673183	673194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012778	AATATT	2	12	681161	681172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012778	AAGCGA	2	12	700106	700117	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_012778	TGAAAT	2	12	701448	701459	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012778	GATATA	2	12	801985	801996	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012778	GCAGTC	2	12	873834	873845	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012778	AGCGAA	2	12	873881	873892	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012778	AAGCGA	2	12	875311	875322	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_012778	TGAAAT	2	12	876652	876663	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012778	TGAAAT	2	12	923952	923963	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012778	AAAAAT	2	12	929862	929873	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012778	GCTTAT	2	12	954331	954342	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_012778	AATATT	2	12	1023104	1023115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012778	GAGCGG	2	12	1027082	1027093	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_012778	TTACCC	2	12	1144412	1144423	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_012778	ACAGCT	2	12	1147422	1147433	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_012778	GTAAAA	2	12	1198145	1198156	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012778	GAATGT	2	12	1249103	1249114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012778	TTTTAT	2	12	1260985	1260996	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012778	CTTATG	2	12	1345501	1345512	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_012778	ATGCAT	2	12	1360934	1360945	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_012778	ATCTTT	2	12	1392562	1392573	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_012778	ATATAA	2	12	1397376	1397387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012778	TCTGTG	2	12	1426962	1426973	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_012778	AGATTC	2	12	1446306	1446317	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_012778	TTCATT	2	12	1489194	1489205	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_012778	ATATTA	2	12	1512733	1512744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_012778	TTTATT	2	12	1542488	1542499	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012778	TTATCT	2	12	1545441	1545452	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_012778	AGATTA	2	12	1616872	1616883	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012778	ATATGT	2	12	1642618	1642629	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012778	ATAATT	2	12	1695222	1695233	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012778	TGTAAT	2	12	1700735	1700746	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012778	TAATTT	2	12	1702543	1702554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012778	TTGCTT	2	12	1748685	1748696	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_012778	TAAATG	2	12	1759726	1759737	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012778	TCCAAT	2	12	1761007	1761018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012778	AATTTG	2	12	1842664	1842675	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012778	TGAAAA	2	12	1842716	1842727	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012778	CATTTT	2	12	1862844	1862855	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_012778	CTGTTT	2	12	1944435	1944446	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012778	TAAATG	2	12	2020770	2020781	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012778	ATTTCA	2	12	2027318	2027329	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_012778	TCGCTT	2	12	2028660	2028671	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_012778	GCTTTC	2	12	2029605	2029616	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012778	ATTCAG	2	12	2041208	2041219	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_012778	ATAAAA	2	12	2106750	2106761	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012778	ATATTT	2	12	2107093	2107104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.