MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Eubacterium eligens ATCC 27750 chromosome

Total Repeats: 218

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012778	GAAAG	2	10	2767	2776	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012778	TCGTG	2	10	16615	16624	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_012778	GGGAG	2	10	18134	18143	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012778	CCGTA	2	10	19228	19237	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_012778	CGGGA	2	10	20332	20341	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_012778	GATAT	3	15	20584	20598	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012778	TTAAT	2	10	20976	20985	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012778	TGGTA	2	10	29110	29119	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012778	TTATA	2	10	34179	34188	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012778	ATGTC	2	10	43664	43673	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_012778	ATATT	2	10	43834	43843	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012778	TCCTC	2	10	59726	59735	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_012778	ATGTT	2	10	94871	94880	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012778	ATTAT	2	10	142362	142371	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012778	GAAAG	2	10	165502	165511	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012778	TAATA	2	10	168914	168923	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_012778	CAGAA	2	10	182207	182216	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_012778	TAATA	2	10	186976	186985	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012778	CATTT	2	10	193745	193754	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_012778	TTAAG	2	10	193762	193771	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012778	GAAAA	2	10	209395	209404	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012778	GGAGG	2	10	215962	215971	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012778	AGAGG	2	10	216024	216033	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012778	GGAGG	2	10	216148	216157	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012778	TGGAA	2	10	223344	223353	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012778	GAAGG	2	10	223991	224000	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012778	AAGTC	2	10	228043	228052	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_012778	ATGGA	2	10	232237	232246	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012778	TGGTA	2	10	243223	243232	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012778	GTTTT	2	10	255197	255206	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012778	GTTTT	2	10	262753	262762	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012778	TCTTT	2	10	310988	310997	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_012778	TTTAT	2	10	311015	311024	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012778	AAATT	2	10	319567	319576	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012778	TTAAT	2	10	347291	347300	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012778	TAAAA	2	10	357953	357962	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012778	TCCTC	2	10	364676	364685	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
38	NC_012778	CATAC	2	10	382161	382170	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_012778	GATTT	2	10	391587	391596	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012778	TCCTT	2	10	414159	414168	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_012778	TCGTG	2	10	414208	414217	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_012778	AAATA	2	10	415222	415231	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012778	GGGAG	2	10	415957	415966	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012778	CCGTA	2	10	417050	417059	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_012778	CGGGA	2	10	418154	418163	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_012778	CATAA	2	10	418214	418223	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_012778	AATAA	2	10	419218	419227	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012778	TATAA	2	10	422312	422321	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012778	TTGCG	2	10	422328	422337	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_012778	TTATT	2	10	425601	425610	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012778	AATGT	2	10	427765	427774	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012778	TAAAT	2	10	437448	437457	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012778	TCCTC	2	10	447616	447625	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
54	NC_012778	TTTGT	2	10	452765	452774	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012778	ATGAG	2	10	453924	453933	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012778	AGAAA	2	10	454109	454118	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012778	CTTAA	2	10	466352	466361	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_012778	AGCAG	2	10	477077	477086	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_012778	TTCGT	2	10	488570	488579	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_012778	ATATA	2	10	497217	497226	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012778	TTAAT	2	10	501340	501349	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012778	TCCTC	2	10	507412	507421	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_012778	TGTAG	2	10	520919	520928	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012778	CAAAA	2	10	545631	545640	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_012778	ATAAA	2	10	549210	549219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012778	TACAG	2	10	577024	577033	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_012778	ATGTT	2	10	599577	599586	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012778	GAATA	2	10	599853	599862	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012778	GTATA	2	10	601998	602007	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012778	ATATT	2	10	608681	608690	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012778	TAAAT	2	10	619485	619494	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012778	AAGGA	2	10	641726	641735	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012778	AAAAT	2	10	651212	651221	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012778	TAATA	2	10	671806	671815	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012778	ATATA	2	10	684514	684523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012778	TACAA	2	10	684987	684996	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_012778	TCCTT	2	10	698440	698449	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_012778	TCGTG	2	10	698489	698498	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_012778	GGGAG	2	10	699969	699978	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012778	CCGTA	2	10	701063	701072	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_012778	CGGGA	2	10	702167	702176	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
82	NC_012778	GATAT	2	10	702423	702432	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012778	ATATT	2	10	710584	710593	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012778	AATTA	2	10	746081	746090	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012778	ATTAA	2	10	755986	755995	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012778	AGGGC	2	10	761743	761752	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
87	NC_012778	ATACA	2	10	763332	763341	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_012778	CGCTT	2	10	779099	779108	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_012778	TATTT	2	10	786133	786142	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012778	TTATA	2	10	799929	799938	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012778	AACGC	2	10	816414	816423	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_012778	TGATA	2	10	843066	843075	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012778	TCCTT	2	10	873247	873256	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
94	NC_012778	TCGTG	2	10	873296	873305	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_012778	GGGAG	2	10	875174	875183	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012778	CCGTA	2	10	876267	876276	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_012778	CGGGA	2	10	877371	877380	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_012778	AATTA	2	10	885513	885522	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012778	AATGT	2	10	892328	892337	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012778	TAAAT	2	10	900713	900722	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012778	TATTT	2	10	918035	918044	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_012778	TAATA	2	10	919709	919718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012778	AATTG	2	10	925328	925337	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012778	TATTG	2	10	925687	925696	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012778	ATATA	2	10	925740	925749	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012778	TAAAA	2	10	934476	934485	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012778	TAATA	2	10	940609	940618	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012778	TTACA	2	10	947085	947094	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_012778	TATAA	2	10	1054557	1054566	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012778	CTTTC	2	10	1059306	1059315	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_012778	AAAAC	2	10	1074100	1074109	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_012778	CTCTT	2	10	1074282	1074291	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_012778	ATTTA	2	10	1118192	1118201	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012778	TCGCT	2	10	1119555	1119564	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_012778	TAATA	2	10	1132297	1132306	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012778	TTTGT	2	10	1132428	1132437	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012778	AGTAT	2	10	1156517	1156526	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_012778	AATTA	2	10	1161737	1161746	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012778	CCTTT	2	10	1173057	1173066	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_012778	TATAA	2	10	1184858	1184867	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_012778	ACATT	2	10	1186340	1186349	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_012778	CGAAT	2	10	1186805	1186814	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_012778	ATCCA	2	10	1194772	1194781	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_012778	GCTCC	2	10	1194885	1194894	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
125	NC_012778	TATCT	2	10	1206668	1206677	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_012778	TATCA	2	10	1212910	1212919	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_012778	TCAAA	2	10	1215768	1215777	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_012778	GTATA	2	10	1215846	1215855	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012778	TAGCT	2	10	1215889	1215898	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_012778	CCATA	2	10	1233088	1233097	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_012778	AAGCG	2	10	1233322	1233331	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
132	NC_012778	GCTAT	2	10	1244571	1244580	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
133	NC_012778	TTATA	2	10	1244610	1244619	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_012778	TAGAG	2	10	1248999	1249008	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012778	TCAAT	2	10	1251240	1251249	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_012778	CCTTT	2	10	1281853	1281862	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_012778	AATTA	2	10	1293566	1293575	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_012778	TTCTT	2	10	1313422	1313431	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_012778	AATAG	2	10	1319922	1319931	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012778	ATATT	2	10	1337288	1337297	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012778	ACAAA	2	10	1354115	1354124	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_012778	ATTAA	2	10	1357514	1357523	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_012778	TAATA	2	10	1365339	1365348	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012778	CCATC	2	10	1370742	1370751	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
145	NC_012778	CTTTT	2	10	1391252	1391261	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_012778	TTACA	2	10	1397434	1397443	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.