MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Escherichia coli BW2952 chromosome

Total Repeats: 183

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012759	GAAAAT	2	12	10613	10624	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012759	TAAAAA	2	12	58377	58388	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012759	ACGCGT	2	12	75579	75590	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012759	AAGGGA	2	12	84330	84341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012759	TCTCCC	2	12	164543	164554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_012759	TCACCC	2	12	164594	164605	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_012759	GTAGTG	2	12	200379	200390	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012759	TCCGCC	2	12	249456	249467	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_012759	TGCGCC	2	12	249921	249932	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_012759	TGGAGA	2	12	250336	250347	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012759	AGCAAC	2	12	254083	254094	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012759	TATTGA	2	12	286977	286988	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012759	GTTTGT	2	12	291978	291989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012759	GTGATG	2	12	292682	292693	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012759	TACGGT	2	12	295184	295195	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_012759	CTGGCG	2	12	295335	295346	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012759	AACAAT	2	12	309250	309261	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_012759	TATTGA	2	12	312096	312107	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012759	TTTTCA	2	12	374461	374472	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_012759	CAGGCG	2	12	393304	393315	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012759	AACCGG	2	12	430085	430096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012759	TTATAT	2	12	470668	470679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012759	GATTTT	2	12	474263	474274	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012759	AATAAA	2	12	478985	478996	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012759	CTGTCA	2	12	482127	482138	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012759	GCAGAA	2	12	483847	483858	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_012759	ATGGAA	2	12	484433	484444	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012759	TGCAAA	2	12	514636	514647	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012759	GCTGGC	2	12	560474	560485	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012759	ATTTTT	2	12	610255	610266	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012759	TTTTCT	2	12	697141	697152	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_012759	AATATT	2	12	722950	722961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012759	CAGAAA	2	12	735181	735192	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_012759	TAACCG	2	12	825076	825087	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012759	AAATAA	2	12	856803	856814	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012759	CTGGAA	2	12	866367	866378	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_012759	AAAGAT	2	12	889334	889345	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012759	TGTCCA	2	12	909967	909978	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_012759	TAAGGA	2	12	932235	932246	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012759	ATAATG	2	12	933649	933660	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012759	TTTTGT	2	12	1107450	1107461	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012759	AGCGAT	2	12	1107851	1107862	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_012759	CACAGG	2	12	1109802	1109813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_012759	ACGCTT	2	12	1128070	1128081	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012759	ACTCGA	2	12	1128090	1128101	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_012759	CAGGCT	2	12	1128222	1128233	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012759	CTTATT	2	12	1181146	1181157	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_012759	CAAAAG	2	12	1188042	1188053	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_012759	GGGGGT	2	12	1197613	1197624	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012759	CTGATC	2	12	1199871	1199882	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012759	CTATAA	2	12	1246138	1246149	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_012759	ATTTAA	2	12	1308587	1308598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012759	TGGCAA	2	12	1313175	1313186	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_012759	TGCCTT	2	12	1316241	1316252	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_012759	GGCACC	2	12	1356408	1356419	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012759	TATCAA	2	12	1361324	1361335	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_012759	GATGGT	2	12	1363422	1363433	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012759	AGCGCT	2	12	1363842	1363853	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012759	GCAGGC	2	12	1363911	1363922	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012759	TGTCGC	2	12	1418877	1418888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012759	AAAAAC	2	12	1445844	1445855	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_012759	TTCATA	2	12	1457435	1457446	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_012759	ACCGTT	2	12	1460708	1460719	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_012759	TGGTTA	2	12	1469538	1469549	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012759	CAAAAA	2	12	1519208	1519219	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_012759	TAAATA	2	12	1521007	1521018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012759	TTTTTC	2	12	1522729	1522740	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_012759	AAAAAC	2	12	1535107	1535118	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_012759	CTGTAA	2	12	1541977	1541988	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_012759	GCGAAG	2	12	1584273	1584284	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_012759	ATACTT	2	12	1631217	1631228	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_012759	AAAATA	2	12	1644873	1644884	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012759	TGTTTT	2	12	1645506	1645517	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012759	AAGACT	2	12	1645766	1645777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_012759	GAACAG	2	12	1693546	1693557	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_012759	TATTAC	2	12	1761994	1762005	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_012759	TTTCTT	2	12	1780009	1780020	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_012759	ATAAAC	2	12	1783952	1783963	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_012759	ACTGTC	2	12	1827610	1827621	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_012759	TTAATG	2	12	1870025	1870036	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012759	AATTCA	2	12	1877150	1877161	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_012759	TCTTAT	2	12	1890968	1890979	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_012759	ATATTT	2	12	1924362	1924373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012759	CGACTT	2	12	1925184	1925195	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_012759	ATTTTT	2	12	1948480	1948491	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_012759	CTGATA	2	12	1958769	1958780	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_012759	GCACAG	2	12	1961362	1961373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012759	TCCCCC	2	12	2043836	2043847	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
89	NC_012759	GAAAAA	2	12	2088523	2088534	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012759	ATACCG	2	12	2088900	2088911	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_012759	GCAAAT	2	12	2172318	2172329	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_012759	CGCAGG	2	12	2214249	2214260	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_012759	CCATGC	2	12	2214819	2214830	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012759	CAGCGT	2	12	2215311	2215322	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_012759	GCAGTT	2	12	2216816	2216827	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_012759	CCACTA	2	12	2233453	2233464	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_012759	TAAATG	2	12	2290728	2290739	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012759	TGTCAC	2	12	2304362	2304373	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012759	AGAAAA	2	12	2314642	2314653	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_012759	GAAACA	2	12	2336196	2336207	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_012759	CTGATG	2	12	2378832	2378843	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_012759	GTTATG	2	12	2396672	2396683	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012759	CAAGTG	2	12	2415134	2415145	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_012759	TCCTTC	2	12	2523115	2523126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_012759	TGGACA	2	12	2573385	2573396	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_012759	CAGTTT	2	12	2587972	2587983	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_012759	GGTTTT	2	12	2649205	2649216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_012759	ATTAAA	2	12	2655716	2655727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012759	TTTTAC	2	12	2666928	2666939	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_012759	ATTAAC	2	12	2671866	2671877	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_012759	TCAGCC	2	12	2693208	2693219	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
112	NC_012759	ATCTTA	2	12	2740676	2740687	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_012759	GGTTTT	2	12	2803198	2803209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012759	ACAAGA	2	12	2807529	2807540	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_012759	TTTGTT	2	12	2832465	2832476	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012759	AATTTT	2	12	2880245	2880256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012759	ATCGCG	2	12	2926324	2926335	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012759	GTAAGG	2	12	2942019	2942030	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_012759	ACTGAG	2	12	2967008	2967019	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_012759	GCCAGC	2	12	2996980	2996991	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
121	NC_012759	CACAGG	2	12	2997860	2997871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012759	ACGCAG	2	12	3006622	3006633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_012759	TTTTCG	2	12	3013268	3013279	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_012759	GAAAAA	2	12	3072903	3072914	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012759	AGTTGT	2	12	3096199	3096210	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.