MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Escherichia coli BW2952 chromosome

Total Repeats: 2963

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012759	CGCTG	2	10	693	702	0 %	20 %	40 %	40 %	238899408
2	NC_012759	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	238899409
3	NC_012759	CGCAG	2	10	8360	8369	20 %	0 %	40 %	40 %	238899414
4	NC_012759	CGTAC	2	10	9788	9797	20 %	20 %	20 %	40 %	238899415
5	NC_012759	CGCGC	2	10	10775	10784	0 %	0 %	40 %	60 %	238899417
6	NC_012759	TCTTT	2	10	11868	11877	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_012759	CCGAT	2	10	17841	17850	20 %	20 %	20 %	40 %	238899424
8	NC_012759	AGCGA	2	10	18229	18238	40 %	0 %	40 %	20 %	238899424
9	NC_012759	GATGC	2	10	25714	25723	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_012759	CAGTA	2	10	26673	26682	40 %	20 %	20 %	20 %	238899434
11	NC_012759	GCGCT	2	10	28474	28483	0 %	20 %	40 %	40 %	238899436
12	NC_012759	ATTTA	2	10	29230	29239	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012759	CGATG	2	10	31527	31536	20 %	20 %	40 %	20 %	238899438
14	NC_012759	GCGAA	2	10	32468	32477	40 %	0 %	40 %	20 %	238899438
15	NC_012759	CCGTT	2	10	33362	33371	0 %	40 %	20 %	40 %	238899438
16	NC_012759	CACGG	2	10	33739	33748	20 %	0 %	40 %	40 %	238899438
17	NC_012759	CGAAT	2	10	36449	36458	40 %	20 %	20 %	20 %	238899442
18	NC_012759	CCATG	2	10	37987	37996	20 %	20 %	20 %	40 %	238899443
19	NC_012759	TTCAG	2	10	38169	38178	20 %	40 %	20 %	20 %	238899443
20	NC_012759	CCGTA	2	10	39633	39642	20 %	20 %	20 %	40 %	238899444
21	NC_012759	TTAAA	2	10	40371	40380	60 %	40 %	0 %	0 %	238899444
22	NC_012759	ACCCA	2	10	41114	41123	40 %	0 %	0 %	60 %	238899445
23	NC_012759	TGATC	2	10	42741	42750	20 %	40 %	20 %	20 %	238899446
24	NC_012759	CGGCG	2	10	42990	42999	0 %	0 %	60 %	40 %	238899446
25	NC_012759	AATCA	2	10	43272	43281	60 %	20 %	0 %	20 %	238899447
26	NC_012759	CGGTT	2	10	44227	44236	0 %	40 %	40 %	20 %	238899448
27	NC_012759	TGGCG	2	10	45917	45926	0 %	20 %	60 %	20 %	238899450
28	NC_012759	TGCAC	2	10	47679	47688	20 %	20 %	20 %	40 %	238899451
29	NC_012759	AGGGC	2	10	48764	48773	20 %	0 %	60 %	20 %	238899452
30	NC_012759	GGCGC	2	10	48798	48807	0 %	0 %	60 %	40 %	238899452
31	NC_012759	GAAAC	2	10	49611	49620	60 %	0 %	20 %	20 %	238899452
32	NC_012759	AACGT	2	10	51523	51532	40 %	20 %	20 %	20 %	238899455
33	NC_012759	GCGTC	2	10	54507	54516	0 %	20 %	40 %	40 %	238899458
34	NC_012759	ATGTT	2	10	55321	55330	20 %	60 %	20 %	0 %	238899459
35	NC_012759	CTTCG	2	10	55754	55763	0 %	40 %	20 %	40 %	238899459
36	NC_012759	TGCGT	2	10	56040	56049	0 %	40 %	40 %	20 %	238899459
37	NC_012759	AAAGT	2	10	63165	63174	60 %	20 %	20 %	0 %	238899462
38	NC_012759	GGTGA	2	10	65413	65422	20 %	20 %	60 %	0 %	238899463
39	NC_012759	GTGGC	2	10	66245	66254	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_012759	CAGCG	2	10	66865	66874	20 %	0 %	40 %	40 %	238899464
41	NC_012759	TCGCG	2	10	68135	68144	0 %	20 %	40 %	40 %	238899464
42	NC_012759	TAGTG	2	10	75613	75622	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012759	TTGCT	2	10	75765	75774	0 %	60 %	20 %	20 %	238899471
44	NC_012759	GATGG	2	10	76501	76510	20 %	20 %	60 %	0 %	238899471
45	NC_012759	ATTTT	2	10	77329	77338	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012759	CTGGT	2	10	81694	81703	0 %	40 %	40 %	20 %	238899475
47	NC_012759	GACCG	2	10	82242	82251	20 %	0 %	40 %	40 %	238899476
48	NC_012759	ATGTT	2	10	84791	84800	20 %	60 %	20 %	0 %	238899478
49	NC_012759	AAAAC	2	10	85206	85215	80 %	0 %	0 %	20 %	238899478
50	NC_012759	ATTCC	2	10	85903	85912	20 %	40 %	0 %	40 %	238899479
51	NC_012759	AGTTC	2	10	90996	91005	20 %	40 %	20 %	20 %	238899483
52	NC_012759	CGTGG	2	10	92369	92378	0 %	20 %	60 %	20 %	238899485
53	NC_012759	TATCG	2	10	92876	92885	20 %	40 %	20 %	20 %	238899485
54	NC_012759	GCCTG	2	10	97208	97217	0 %	20 %	40 %	40 %	238899489
55	NC_012759	ACCGT	2	10	99121	99130	20 %	20 %	20 %	40 %	238899490
56	NC_012759	ATCAG	2	10	100894	100903	40 %	20 %	20 %	20 %	238899492
57	NC_012759	AGCCG	2	10	102662	102671	20 %	0 %	40 %	40 %	238899493
58	NC_012759	GCGCA	2	10	104990	104999	20 %	0 %	40 %	40 %	238899495
59	NC_012759	TGGCG	2	10	105984	105993	0 %	20 %	60 %	20 %	238899496
60	NC_012759	CCGGC	2	10	108954	108963	0 %	0 %	40 %	60 %	238899499
61	NC_012759	CGCGG	2	10	112279	112288	0 %	0 %	60 %	40 %	238899502
62	NC_012759	ATCCC	2	10	114523	114532	20 %	20 %	0 %	60 %	238899505
63	NC_012759	CATCG	2	10	114536	114545	20 %	20 %	20 %	40 %	238899505
64	NC_012759	TAACG	2	10	115230	115239	40 %	20 %	20 %	20 %	238899505
65	NC_012759	ATGCC	2	10	115689	115698	20 %	20 %	20 %	40 %	238899505
66	NC_012759	AATGC	2	10	116972	116981	40 %	20 %	20 %	20 %	238899506
67	NC_012759	TCTGT	2	10	117918	117927	0 %	60 %	20 %	20 %	238899508
68	NC_012759	GCATG	2	10	119011	119020	20 %	20 %	40 %	20 %	238899509
69	NC_012759	AGCAG	2	10	120349	120358	40 %	0 %	40 %	20 %	238899511
70	NC_012759	TCAGC	2	10	121217	121226	20 %	20 %	20 %	40 %	238899511
71	NC_012759	CGAAG	2	10	122264	122273	40 %	0 %	40 %	20 %	238899512
72	NC_012759	ACACG	2	10	122397	122406	40 %	0 %	20 %	40 %	238899512
73	NC_012759	TCGCG	2	10	122658	122667	0 %	20 %	40 %	40 %	238899512
74	NC_012759	GCATC	2	10	122748	122757	20 %	20 %	20 %	40 %	238899512
75	NC_012759	GACTG	2	10	124066	124075	20 %	20 %	40 %	20 %	238899513
76	NC_012759	AGAGC	2	10	124476	124485	40 %	0 %	40 %	20 %	238899513
77	NC_012759	AGGCG	2	10	129748	129757	20 %	0 %	60 %	20 %	238899516
78	NC_012759	AGGCG	2	10	129844	129853	20 %	0 %	60 %	20 %	238899516
79	NC_012759	GGTTG	2	10	130501	130510	0 %	40 %	60 %	0 %	238899516
80	NC_012759	TCTGG	2	10	133147	133156	0 %	40 %	40 %	20 %	238899517
81	NC_012759	GGGCA	2	10	134559	134568	20 %	0 %	60 %	20 %	238899518
82	NC_012759	CAGCG	2	10	134838	134847	20 %	0 %	40 %	40 %	238899519
83	NC_012759	GCGCG	2	10	141032	141041	0 %	0 %	60 %	40 %	238899523
84	NC_012759	CCGTC	2	10	141823	141832	0 %	20 %	20 %	60 %	238899524
85	NC_012759	GTGAA	2	10	141833	141842	40 %	20 %	40 %	0 %	238899524
86	NC_012759	GGCAT	2	10	141995	142004	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
87	NC_012759	GTTCA	2	10	142220	142229	20 %	40 %	20 %	20 %	238899525
88	NC_012759	ATCCA	2	10	142546	142555	40 %	20 %	0 %	40 %	238899525
89	NC_012759	GTAAG	2	10	142759	142768	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012759	CTTTA	2	10	143809	143818	20 %	60 %	0 %	20 %	238899527
91	NC_012759	TGGCG	2	10	144036	144045	0 %	20 %	60 %	20 %	238899527
92	NC_012759	TCCTC	2	10	144479	144488	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
93	NC_012759	TTTCA	2	10	146349	146358	20 %	60 %	0 %	20 %	238899530
94	NC_012759	GGGAG	2	10	147674	147683	20 %	0 %	80 %	0 %	238899531
95	NC_012759	GAAAA	2	10	150468	150477	80 %	0 %	20 %	0 %	238899534
96	NC_012759	CAGAC	2	10	150544	150553	40 %	0 %	20 %	40 %	238899534
97	NC_012759	TTTGC	2	10	156614	156623	0 %	60 %	20 %	20 %	238899540
98	NC_012759	AAATT	2	10	157055	157064	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_012759	GCGAG	2	10	158422	158431	20 %	0 %	60 %	20 %	238899542
100	NC_012759	GGCGT	2	10	158860	158869	0 %	20 %	60 %	20 %	238899542
101	NC_012759	ATCAG	2	10	159498	159507	40 %	20 %	20 %	20 %	238899543
102	NC_012759	ACCAC	2	10	161763	161772	40 %	0 %	0 %	60 %	238899546
103	NC_012759	GGCGT	2	10	163466	163475	0 %	20 %	60 %	20 %	238899547
104	NC_012759	CGACG	2	10	164505	164514	20 %	0 %	40 %	40 %	238899547
105	NC_012759	CTGCG	2	10	166641	166650	0 %	20 %	40 %	40 %	238899548
106	NC_012759	TTATC	2	10	167417	167426	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_012759	AAAAC	2	10	168492	168501	80 %	0 %	0 %	20 %	238899549
108	NC_012759	TGGTT	2	10	168749	168758	0 %	60 %	40 %	0 %	238899549
109	NC_012759	AACCT	2	10	170830	170839	40 %	20 %	0 %	40 %	238899551
110	NC_012759	TGGTC	2	10	170872	170881	0 %	40 %	40 %	20 %	238899551
111	NC_012759	TGGCG	2	10	172117	172126	0 %	20 %	60 %	20 %	238899552
112	NC_012759	CGGCG	2	10	172747	172756	0 %	0 %	60 %	40 %	238899552
113	NC_012759	CGGCG	2	10	172828	172837	0 %	0 %	60 %	40 %	238899552
114	NC_012759	TTCCA	2	10	173358	173367	20 %	40 %	0 %	40 %	238899552
115	NC_012759	GGTCC	2	10	177804	177813	0 %	20 %	40 %	40 %	238899557
116	NC_012759	ACGGG	2	10	179721	179730	20 %	0 %	60 %	20 %	238899559
117	NC_012759	GTGAT	2	10	181880	181889	20 %	40 %	40 %	0 %	238899560
118	NC_012759	GTGAT	2	10	182171	182180	20 %	40 %	40 %	0 %	238899560
119	NC_012759	TACGT	2	10	182416	182425	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
120	NC_012759	TGGCC	2	10	184141	184150	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
121	NC_012759	CCACG	2	10	184318	184327	20 %	0 %	20 %	60 %	238899563
122	NC_012759	GCCAG	2	10	186603	186612	20 %	0 %	40 %	40 %	238899565
123	NC_012759	GTTCT	2	10	188044	188053	0 %	60 %	20 %	20 %	238899565
124	NC_012759	CTGAA	2	10	190036	190045	40 %	20 %	20 %	20 %	238899567
125	NC_012759	AAGCG	2	10	190100	190109	40 %	0 %	40 %	20 %	238899567
126	NC_012759	TGGTG	2	10	192006	192015	0 %	40 %	60 %	0 %	238899569
127	NC_012759	TGCAC	2	10	192132	192141	20 %	20 %	20 %	40 %	238899569
128	NC_012759	TGCGC	2	10	192525	192534	0 %	20 %	40 %	40 %	238899569
129	NC_012759	AAATA	2	10	192747	192756	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012759	GTCTG	2	10	192832	192841	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_012759	CATGG	2	10	194368	194377	20 %	20 %	40 %	20 %	238899571
132	NC_012759	CAGAT	2	10	195407	195416	40 %	20 %	20 %	20 %	238899572
133	NC_012759	ACTTT	2	10	195540	195549	20 %	60 %	0 %	20 %	238899572
134	NC_012759	GACGT	2	10	199460	199469	20 %	20 %	40 %	20 %	238899575
135	NC_012759	CGACG	2	10	201287	201296	20 %	0 %	40 %	40 %	238899577
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