MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) plasmid pHD5AT

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012752	TTGA	2	8	1148	1155	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012752	AGCG	2	8	1177	1184	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_012752	TGAT	2	8	1360	1367	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012752	TTTC	2	8	1582	1589	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_012752	GCCG	2	8	1824	1831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012752	GTAT	2	8	2241	2248	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012752	CATT	2	8	2989	2996	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012752	ATTT	2	8	3231	3238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012752	CTTA	2	8	6492	6499	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_012752	TATT	2	8	6670	6677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012752	ATTA	2	8	7327	7334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012752	AGTT	2	8	7745	7752	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012752	TAGG	2	8	7847	7854	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012752	AAGC	2	8	8312	8319	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_012752	CATT	2	8	8390	8397	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_012752	AGTC	2	8	8608	8615	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012752	CTGT	2	8	8650	8657	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_012752	GCTT	2	8	8691	8698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_012752	CATT	2	8	9258	9265	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012752	TAAT	2	8	9337	9344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012752	GTAT	2	8	9829	9836	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012752	AATT	2	8	9865	9872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012752	CGTA	3	12	9874	9885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012752	TAAA	2	8	9945	9952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012752	TCTT	2	8	10083	10090	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_012752	CTTT	2	8	10462	10469	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_012752	TATT	2	8	10533	10540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012752	GTTG	2	8	11668	11675	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012752	TTTA	2	8	12037	12044	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012752	ATCA	2	8	12301	12308	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_012752	GCAA	2	8	12561	12568	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012752	TTTC	2	8	15384	15391	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_012752	GAAA	2	8	15429	15436	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012752	CCTT	2	8	15488	15495	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_012752	TTTG	2	8	16649	16656	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012752	TTCT	2	8	16754	16761	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_012752	GAAA	2	8	17134	17141	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012752	TGAG	2	8	22682	22689	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012752	ATTA	2	8	25240	25247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012752	ATTT	2	8	33643	33650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012752	ATCA	2	8	47404	47411	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_012752	TGTA	2	8	52330	52337	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012752	TATT	2	8	56115	56122	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012752	AATG	2	8	56874	56881	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012752	ATTA	2	8	57763	57770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012752	ATTA	2	8	58385	58392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.