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Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) plasmid pHD5AT

Total Repeats: 573

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012752	CTG	2	6	130	135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899347
2	NC_012752	CGT	2	6	169	174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899347
3	NC_012752	GTT	2	6	444	449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238899347
4	NC_012752	GTC	2	6	468	473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899347
5	NC_012752	CGT	2	6	568	573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899347
6	NC_012752	AGC	2	6	584	589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238899347
7	NC_012752	CTT	2	6	697	702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899347
8	NC_012752	ATC	2	6	2351	2356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899348
9	NC_012752	ATT	2	6	2421	2426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238899348
10	NC_012752	TTG	2	6	2603	2608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238899348
11	NC_012752	CTT	2	6	2619	2624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899348
12	NC_012752	TGA	2	6	2625	2630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238899348
13	NC_012752	AAG	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238899348
14	NC_012752	TGA	2	6	2865	2870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238899348
15	NC_012752	TCA	2	6	2883	2888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899348
16	NC_012752	ACA	2	6	3320	3325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238899349
17	NC_012752	CAT	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899349
18	NC_012752	ATA	2	6	3709	3714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238899349
19	NC_012752	TGT	2	6	3721	3726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238899349
20	NC_012752	AAT	2	6	3781	3786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238899349
21	NC_012752	TCA	2	6	3873	3878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899349
22	NC_012752	ATA	2	6	3891	3896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238899349
23	NC_012752	AAC	2	6	3965	3970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238899349
24	NC_012752	CAG	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238899349
25	NC_012752	AGA	2	6	4004	4009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238899349
26	NC_012752	TGA	2	6	4077	4082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238899349
27	NC_012752	CTT	2	6	4090	4095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899349
28	NC_012752	TGG	2	6	4099	4104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238899349
29	NC_012752	AAT	2	6	4229	4234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238899349
30	NC_012752	TAA	2	6	4243	4248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238899349
31	NC_012752	GAA	2	6	4372	4377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238899349
32	NC_012752	TAA	2	6	4424	4429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238899349
33	NC_012752	ACC	2	6	4488	4493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238899349
34	NC_012752	TCA	2	6	4494	4499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899349
35	NC_012752	TTC	2	6	4537	4542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899349
36	NC_012752	TAT	2	6	4552	4557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238899349
37	NC_012752	TCT	2	6	4656	4661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899349
38	NC_012752	TCT	2	6	4812	4817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899349
39	NC_012752	TCC	2	6	4862	4867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238899349
40	NC_012752	GAC	2	6	4931	4936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238899349
41	NC_012752	ACT	2	6	4953	4958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899349
42	NC_012752	TGA	2	6	5315	5320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238899350
43	NC_012752	AGG	2	6	5540	5545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238899350
44	NC_012752	TCA	2	6	5609	5614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899350
45	NC_012752	GTC	2	6	5658	5663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899350
46	NC_012752	TGT	2	6	5756	5761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238899350
47	NC_012752	GGC	2	6	5790	5795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238899350
48	NC_012752	ACA	2	6	5837	5842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238899350
49	NC_012752	CCA	2	6	5867	5872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238899350
50	NC_012752	GCT	2	6	5943	5948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899350
51	NC_012752	CCG	2	6	6004	6009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238899350
52	NC_012752	GTC	2	6	6025	6030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899350
53	NC_012752	TTC	2	6	6033	6038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899350
54	NC_012752	TTC	2	6	6078	6083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899350
55	NC_012752	AGC	2	6	6084	6089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238899350
56	NC_012752	TGG	2	6	6100	6105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238899350
57	NC_012752	CTT	2	6	6193	6198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899350
58	NC_012752	GTG	3	9	6315	6323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238899350
59	NC_012752	TGA	3	9	6341	6349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238899350
60	NC_012752	TGA	2	6	6941	6946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238899351
61	NC_012752	CGC	2	6	7197	7202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238899351
62	NC_012752	GTT	2	6	7203	7208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238899351
63	NC_012752	TGT	2	6	8022	8027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238899352
64	NC_012752	CGC	2	6	8171	8176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238899352
65	NC_012752	TGA	2	6	8219	8224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238899352
66	NC_012752	GGT	2	6	10632	10637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238899353
67	NC_012752	ACT	3	9	10647	10655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899353
68	NC_012752	GCT	2	6	10740	10745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899353
69	NC_012752	GTC	2	6	10774	10779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899353
70	NC_012752	ACT	2	6	10794	10799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899353
71	NC_012752	TGC	2	6	10958	10963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899353
72	NC_012752	TTA	2	6	10977	10982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238899353
73	NC_012752	AAT	2	6	11097	11102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238899353
74	NC_012752	AGA	2	6	11174	11179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238899353
75	NC_012752	TAT	2	6	11236	11241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238899353
76	NC_012752	CTT	2	6	11253	11258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899354
77	NC_012752	ATT	2	6	11435	11440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238899354
78	NC_012752	ATT	3	9	12678	12686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238899355
79	NC_012752	AGA	2	6	12705	12710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238899355
80	NC_012752	AGC	2	6	12854	12859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238899355
81	NC_012752	CAG	2	6	13159	13164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238899356
82	NC_012752	TCA	2	6	13166	13171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899356
83	NC_012752	CCT	2	6	13250	13255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238899356
84	NC_012752	AAT	2	6	13279	13284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238899356
85	NC_012752	CGT	2	6	13285	13290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899356
86	NC_012752	GAA	2	6	13333	13338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238899356
87	NC_012752	ATC	2	6	13403	13408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899356
88	NC_012752	GGC	2	6	13458	13463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238899356
89	NC_012752	ACG	2	6	13508	13513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238899356
90	NC_012752	ATC	2	6	13598	13603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899356
91	NC_012752	ATT	2	6	13606	13611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238899356
92	NC_012752	CAG	2	6	13863	13868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238899356
93	NC_012752	ATG	2	6	14000	14005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238899356
94	NC_012752	ATC	2	6	14024	14029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899356
95	NC_012752	CAG	2	6	14353	14358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238899356
96	NC_012752	GCG	2	6	14377	14382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238899356
97	NC_012752	GAT	2	6	14473	14478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238899356
98	NC_012752	CAT	2	6	14509	14514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899356
99	NC_012752	TGG	2	6	14624	14629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238899356
100	NC_012752	CAG	2	6	14770	14775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238899356
101	NC_012752	TGA	2	6	14979	14984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238899357
102	NC_012752	TAT	2	6	15073	15078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238899357
103	NC_012752	ATC	2	6	15110	15115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899357
104	NC_012752	GAA	2	6	15301	15306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238899357
105	NC_012752	ATT	2	6	15656	15661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238899358
106	NC_012752	TCT	2	6	15681	15686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899358
107	NC_012752	CTT	2	6	15703	15708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899358
108	NC_012752	CTT	2	6	15715	15720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899358
109	NC_012752	CTT	2	6	15727	15732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899358
110	NC_012752	CTT	2	6	15739	15744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899358
111	NC_012752	CTT	2	6	15751	15756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899358
112	NC_012752	TTC	2	6	15776	15781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899358
113	NC_012752	TCA	2	6	15790	15795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899358
114	NC_012752	GAA	2	6	15816	15821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238899358
115	NC_012752	CTT	2	6	15859	15864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899358
116	NC_012752	ATA	2	6	15872	15877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238899358
117	NC_012752	CAA	2	6	15878	15883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238899358
118	NC_012752	CAT	2	6	15950	15955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899358
119	NC_012752	TCT	2	6	16020	16025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899358
120	NC_012752	TGC	2	6	16203	16208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899358
121	NC_012752	CAT	2	6	16244	16249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899358
122	NC_012752	TCG	2	6	16254	16259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899358
123	NC_012752	CCT	2	6	16294	16299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238899358
124	NC_012752	AGA	2	6	16415	16420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238899358
125	NC_012752	AAT	2	6	17337	17342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238899359
126	NC_012752	TTC	2	6	17351	17356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899359
127	NC_012752	TGT	2	6	17380	17385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238899359
128	NC_012752	GTT	2	6	17455	17460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238899359
129	NC_012752	GCG	2	6	17499	17504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238899359
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133	NC_012752	CAT	2	6	17924	17929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899359
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253	NC_012752	CCT	2	6	28187	28192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238899367
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256	NC_012752	GCC	2	6	28405	28410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238899367
257	NC_012752	GGC	2	6	28467	28472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238899367
258	NC_012752	GGA	2	6	28526	28531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238899367
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281	NC_012752	CTG	2	6	30618	30623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899368
282	NC_012752	GTC	2	6	30624	30629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899368
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