MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) plasmid pHD5AT

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012752	GC	3	6	5165	5170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_012752	AT	3	6	7523	7528	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012752	TA	3	6	8660	8665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012752	TA	3	6	9448	9453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012752	GC	3	6	9625	9630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_012752	AT	3	6	9835	9840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012752	AT	3	6	9859	9864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012752	CT	3	6	16578	16583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_012752	AT	3	6	16848	16853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012752	CT	3	6	16875	16880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_012752	GA	3	6	22653	22658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012752	AG	3	6	23848	23853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012752	AG	3	6	44821	44826	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012752	TC	4	8	47321	47328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_012752	TC	3	6	56162	56167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_012752	GC	3	6	58312	58317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_012752	AG	3	6	58397	58402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012752	AT	3	6	58467	58472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012752	GA	3	6	58760	58765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.