MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 1224

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012751	TTGGT	2	10	1572	1581	0 %	60 %	40 %	0 %	238897253
2	NC_012751	ACTTT	2	10	2107	2116	20 %	60 %	0 %	20 %	238897254
3	NC_012751	TTTAT	3	15	3146	3160	20 %	80 %	0 %	0 %	238897255
4	NC_012751	CTTTT	2	10	10896	10905	0 %	80 %	0 %	20 %	238897262
5	NC_012751	AGACA	2	10	11191	11200	60 %	0 %	20 %	20 %	238897262
6	NC_012751	CTTTA	2	10	17299	17308	20 %	60 %	0 %	20 %	238897267
7	NC_012751	CAATA	2	10	21443	21452	60 %	20 %	0 %	20 %	238897271
8	NC_012751	CAGCT	2	10	21759	21768	20 %	20 %	20 %	40 %	238897272
9	NC_012751	ATTTT	2	10	21964	21973	20 %	80 %	0 %	0 %	238897272
10	NC_012751	TGGCT	2	10	22193	22202	0 %	40 %	40 %	20 %	238897272
11	NC_012751	TAACG	2	10	24399	24408	40 %	20 %	20 %	20 %	238897274
12	NC_012751	GGGCA	2	10	24446	24455	20 %	0 %	60 %	20 %	238897274
13	NC_012751	AAAGC	2	10	27342	27351	60 %	0 %	20 %	20 %	238897275
14	NC_012751	CAAAT	2	10	28600	28609	60 %	20 %	0 %	20 %	238897276
15	NC_012751	GATTT	2	10	29746	29755	20 %	60 %	20 %	0 %	238897277
16	NC_012751	AATCA	2	10	33356	33365	60 %	20 %	0 %	20 %	238897279
17	NC_012751	CATGT	2	10	37938	37947	20 %	40 %	20 %	20 %	238897280
18	NC_012751	TTTCA	2	10	40172	40181	20 %	60 %	0 %	20 %	238897283
19	NC_012751	GATTT	2	10	40981	40990	20 %	60 %	20 %	0 %	238897285
20	NC_012751	AATTA	2	10	41211	41220	60 %	40 %	0 %	0 %	238897286
21	NC_012751	ATTGA	2	10	44159	44168	40 %	40 %	20 %	0 %	238897288
22	NC_012751	ATAAG	2	10	44703	44712	60 %	20 %	20 %	0 %	238897288
23	NC_012751	AGACA	2	10	49095	49104	60 %	0 %	20 %	20 %	238897293
24	NC_012751	ATTTT	2	10	50159	50168	20 %	80 %	0 %	0 %	238897294
25	NC_012751	GAATT	2	10	53370	53379	40 %	40 %	20 %	0 %	238897296
26	NC_012751	TCAGA	2	10	56622	56631	40 %	20 %	20 %	20 %	238897300
27	NC_012751	ATAAA	2	10	56769	56778	80 %	20 %	0 %	0 %	238897300
28	NC_012751	TCGCC	2	10	58070	58079	0 %	20 %	20 %	60 %	238897302
29	NC_012751	AACAG	2	10	58868	58877	60 %	0 %	20 %	20 %	238897302
30	NC_012751	TAGAT	2	10	61536	61545	40 %	40 %	20 %	0 %	238897306
31	NC_012751	GAAGA	2	10	63110	63119	60 %	0 %	40 %	0 %	238897307
32	NC_012751	TGGAT	2	10	63486	63495	20 %	40 %	40 %	0 %	238897307
33	NC_012751	TTTAT	2	10	66531	66540	20 %	80 %	0 %	0 %	238897310
34	NC_012751	GTAAA	2	10	67271	67280	60 %	20 %	20 %	0 %	238897311
35	NC_012751	ATAAA	2	10	67844	67853	80 %	20 %	0 %	0 %	238897313
36	NC_012751	AGGAG	2	10	68962	68971	40 %	0 %	60 %	0 %	238897315
37	NC_012751	GAAAA	2	10	70702	70711	80 %	0 %	20 %	0 %	238897316
38	NC_012751	GGCAT	2	10	70964	70973	20 %	20 %	40 %	20 %	238897316
39	NC_012751	CTTTT	2	10	72381	72390	0 %	80 %	0 %	20 %	238897317
40	NC_012751	AAAAC	2	10	73913	73922	80 %	0 %	0 %	20 %	238897318
41	NC_012751	TCTGC	2	10	73935	73944	0 %	40 %	20 %	40 %	238897318
42	NC_012751	TTGAA	2	10	74254	74263	40 %	40 %	20 %	0 %	238897319
43	NC_012751	CTGGG	2	10	74408	74417	0 %	20 %	60 %	20 %	238897319
44	NC_012751	TAAAA	2	10	82286	82295	80 %	20 %	0 %	0 %	238897326
45	NC_012751	AAAGA	2	10	82449	82458	80 %	0 %	20 %	0 %	238897327
46	NC_012751	AATGA	2	10	82833	82842	60 %	20 %	20 %	0 %	238897327
47	NC_012751	AATAA	2	10	83388	83397	80 %	20 %	0 %	0 %	238897327
48	NC_012751	ACCAG	2	10	84183	84192	40 %	0 %	20 %	40 %	238897328
49	NC_012751	ATAAA	2	10	86683	86692	80 %	20 %	0 %	0 %	238897330
50	NC_012751	TTTGA	2	10	90394	90403	20 %	60 %	20 %	0 %	238897334
51	NC_012751	TTTTG	2	10	94450	94459	0 %	80 %	20 %	0 %	238897336
52	NC_012751	TTTCA	2	10	95551	95560	20 %	60 %	0 %	20 %	238897338
53	NC_012751	TCAGG	2	10	97158	97167	20 %	20 %	40 %	20 %	238897340
54	NC_012751	GACAG	2	10	98277	98286	40 %	0 %	40 %	20 %	238897340
55	NC_012751	TCTTT	2	10	103572	103581	0 %	80 %	0 %	20 %	238897349
56	NC_012751	GATAG	2	10	104406	104415	40 %	20 %	40 %	0 %	238897349
57	NC_012751	AAAAT	2	10	106367	106376	80 %	20 %	0 %	0 %	238897349
58	NC_012751	CCAGA	2	10	109135	109144	40 %	0 %	20 %	40 %	238897351
59	NC_012751	TTTAG	2	10	109410	109419	20 %	60 %	20 %	0 %	238897351
60	NC_012751	GGCAG	2	10	113867	113876	20 %	0 %	60 %	20 %	238897353
61	NC_012751	TACAA	2	10	114361	114370	60 %	20 %	0 %	20 %	238897353
62	NC_012751	TAAAT	2	10	116922	116931	60 %	40 %	0 %	0 %	238897357
63	NC_012751	TGATT	2	10	118438	118447	20 %	60 %	20 %	0 %	238897359
64	NC_012751	TAAAA	2	10	130042	130051	80 %	20 %	0 %	0 %	238897368
65	NC_012751	CATCA	2	10	133312	133321	40 %	20 %	0 %	40 %	238897372
66	NC_012751	AAGTA	2	10	133348	133357	60 %	20 %	20 %	0 %	238897372
67	NC_012751	ATTCG	2	10	133706	133715	20 %	40 %	20 %	20 %	238897372
68	NC_012751	TTCAT	2	10	134892	134901	20 %	60 %	0 %	20 %	238897373
69	NC_012751	AAGGC	2	10	135678	135687	40 %	0 %	40 %	20 %	238897373
70	NC_012751	TCCAT	2	10	136206	136215	20 %	40 %	0 %	40 %	238897374
71	NC_012751	AAATT	2	10	138029	138038	60 %	40 %	0 %	0 %	238897377
72	NC_012751	GCCAG	2	10	138461	138470	20 %	0 %	40 %	40 %	238897377
73	NC_012751	AAATA	2	10	140771	140780	80 %	20 %	0 %	0 %	238897382
74	NC_012751	TTAAA	2	10	141333	141342	60 %	40 %	0 %	0 %	238897383
75	NC_012751	TTATT	2	10	143145	143154	20 %	80 %	0 %	0 %	238897383
76	NC_012751	GGGTT	2	10	143805	143814	0 %	40 %	60 %	0 %	238897384
77	NC_012751	CCATA	2	10	144323	144332	40 %	20 %	0 %	40 %	238897385
78	NC_012751	AAATT	2	10	146849	146858	60 %	40 %	0 %	0 %	238897386
79	NC_012751	CATTT	2	10	149087	149096	20 %	60 %	0 %	20 %	238897390
80	NC_012751	CAGAT	2	10	149421	149430	40 %	20 %	20 %	20 %	238897390
81	NC_012751	TTTTC	2	10	149620	149629	0 %	80 %	0 %	20 %	238897390
82	NC_012751	AATAA	2	10	154931	154940	80 %	20 %	0 %	0 %	238897393
83	NC_012751	ATTAC	2	10	155991	156000	40 %	40 %	0 %	20 %	238897395
84	NC_012751	CAAAA	2	10	157486	157495	80 %	0 %	0 %	20 %	238897396
85	NC_012751	ATTTT	2	10	157864	157873	20 %	80 %	0 %	0 %	238897397
86	NC_012751	CCTGC	2	10	163580	163589	0 %	20 %	20 %	60 %	238897402
87	NC_012751	TCTGG	2	10	167380	167389	0 %	40 %	40 %	20 %	238897407
88	NC_012751	TAAAT	2	10	168457	168466	60 %	40 %	0 %	0 %	238897409
89	NC_012751	AAATG	2	10	171314	171323	60 %	20 %	20 %	0 %	238897412
90	NC_012751	AAAGC	2	10	171996	172005	60 %	0 %	20 %	20 %	238897412
91	NC_012751	TGTTT	2	10	175865	175874	0 %	80 %	20 %	0 %	238897415
92	NC_012751	GGCAA	2	10	175878	175887	40 %	0 %	40 %	20 %	238897415
93	NC_012751	ATAAA	2	10	178136	178145	80 %	20 %	0 %	0 %	238897417
94	NC_012751	GCAGA	2	10	181499	181508	40 %	0 %	40 %	20 %	238897421
95	NC_012751	CTTTT	2	10	181842	181851	0 %	80 %	0 %	20 %	238897422
96	NC_012751	CGTTT	2	10	182813	182822	0 %	60 %	20 %	20 %	238897423
97	NC_012751	AAGGA	2	10	184064	184073	60 %	0 %	40 %	0 %	238897425
98	NC_012751	CATAG	2	10	184761	184770	40 %	20 %	20 %	20 %	238897425
99	NC_012751	TAATT	2	10	191926	191935	40 %	60 %	0 %	0 %	238897428
100	NC_012751	CCTTG	2	10	191949	191958	0 %	40 %	20 %	40 %	238897428
101	NC_012751	AGATC	2	10	192944	192953	40 %	20 %	20 %	20 %	238897429
102	NC_012751	ATAAA	2	10	196096	196105	80 %	20 %	0 %	0 %	238897431
103	NC_012751	ATAAA	2	10	196462	196471	80 %	20 %	0 %	0 %	238897431
104	NC_012751	TTACC	2	10	196683	196692	20 %	40 %	0 %	40 %	238897432
105	NC_012751	AATGT	2	10	196822	196831	40 %	40 %	20 %	0 %	238897432
106	NC_012751	ATATT	2	10	197803	197812	40 %	60 %	0 %	0 %	238897433
107	NC_012751	TATCA	2	10	200475	200484	40 %	40 %	0 %	20 %	238897436
108	NC_012751	ATTTT	2	10	200879	200888	20 %	80 %	0 %	0 %	238897436
109	NC_012751	ATAAA	2	10	203759	203768	80 %	20 %	0 %	0 %	238897439
110	NC_012751	ATTCT	2	10	203950	203959	20 %	60 %	0 %	20 %	238897439
111	NC_012751	GCTGT	2	10	207758	207767	0 %	40 %	40 %	20 %	238897442
112	NC_012751	GAAAA	2	10	209613	209622	80 %	0 %	20 %	0 %	238897444
113	NC_012751	TTTGT	2	10	211082	211091	0 %	80 %	20 %	0 %	238897446
114	NC_012751	GAAAG	2	10	211357	211366	60 %	0 %	40 %	0 %	238897446
115	NC_012751	AACGC	2	10	212615	212624	40 %	0 %	20 %	40 %	238897447
116	NC_012751	AGAAA	2	10	215627	215636	80 %	0 %	20 %	0 %	238897448
117	NC_012751	AAGAT	2	10	216006	216015	60 %	20 %	20 %	0 %	238897448
118	NC_012751	CAGGG	2	10	216321	216330	20 %	0 %	60 %	20 %	238897448
119	NC_012751	AACCA	2	10	216399	216408	60 %	0 %	0 %	40 %	238897448
120	NC_012751	TTTTG	2	10	219268	219277	0 %	80 %	20 %	0 %	238897451
121	NC_012751	GCGTT	2	10	220677	220686	0 %	40 %	40 %	20 %	238897452
122	NC_012751	TTTTG	2	10	223544	223553	0 %	80 %	20 %	0 %	238897456
123	NC_012751	TTTGC	2	10	223611	223620	0 %	60 %	20 %	20 %	238897456
124	NC_012751	CTCTT	2	10	224261	224270	0 %	60 %	0 %	40 %	238897456
125	NC_012751	CAACT	2	10	224288	224297	40 %	20 %	0 %	40 %	238897456
126	NC_012751	GTGGG	2	10	226568	226577	0 %	20 %	80 %	0 %	238897458
127	NC_012751	TGGAT	2	10	228829	228838	20 %	40 %	40 %	0 %	238897459
128	NC_012751	TTCAG	2	10	229486	229495	20 %	40 %	20 %	20 %	238897460
129	NC_012751	ATTTC	2	10	229544	229553	20 %	60 %	0 %	20 %	238897460
130	NC_012751	TGATT	2	10	229943	229952	20 %	60 %	20 %	0 %	238897460
131	NC_012751	TTCTT	2	10	232707	232716	0 %	80 %	0 %	20 %	238897462
132	NC_012751	TTGAA	2	10	233716	233725	40 %	40 %	20 %	0 %	238897463
133	NC_012751	TTATC	2	10	233921	233930	20 %	60 %	0 %	20 %	238897463
134	NC_012751	TCAAA	2	10	236730	236739	60 %	20 %	0 %	20 %	238897465
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