MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 5832

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012751	TTTA	2	8	25	32	25 %	75 %	0 %	0 %	238897252
2	NC_012751	GCTC	2	8	339	346	0 %	25 %	25 %	50 %	238897252
3	NC_012751	AGAA	2	8	469	476	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012751	GTTT	2	8	567	574	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012751	CTTT	2	8	630	637	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_012751	TTTA	2	8	642	649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_012751	TAAT	2	8	1502	1509	50 %	50 %	0 %	0 %	238897253
8	NC_012751	GCTT	2	8	2841	2848	0 %	50 %	25 %	25 %	238897255
9	NC_012751	TCAA	2	8	3008	3015	50 %	25 %	0 %	25 %	238897255
10	NC_012751	TTAT	2	8	3143	3150	25 %	75 %	0 %	0 %	238897255
11	NC_012751	CTTT	2	8	3863	3870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_012751	TGCT	2	8	3982	3989	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_012751	GAAA	2	8	4528	4535	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012751	AAAC	2	8	4657	4664	75 %	0 %	0 %	25 %	238897256
15	NC_012751	GAAA	2	8	5225	5232	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012751	TGAG	2	8	5454	5461	25 %	25 %	50 %	0 %	238897257
17	NC_012751	CTTC	2	8	5589	5596	0 %	50 %	0 %	50 %	238897257
18	NC_012751	AATA	2	8	5639	5646	75 %	25 %	0 %	0 %	238897257
19	NC_012751	ACTT	2	8	6263	6270	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_012751	AATA	2	8	6446	6453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_012751	TATG	2	8	6602	6609	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012751	TATT	2	8	6810	6817	25 %	75 %	0 %	0 %	238897259
23	NC_012751	TCAA	2	8	7456	7463	50 %	25 %	0 %	25 %	238897259
24	NC_012751	GATT	2	8	7553	7560	25 %	50 %	25 %	0 %	238897259
25	NC_012751	TCTT	2	8	9336	9343	0 %	75 %	0 %	25 %	238897260
26	NC_012751	GAAT	2	8	9840	9847	50 %	25 %	25 %	0 %	238897262
27	NC_012751	ATTT	2	8	10034	10041	25 %	75 %	0 %	0 %	238897262
28	NC_012751	TGTC	2	8	10945	10952	0 %	50 %	25 %	25 %	238897262
29	NC_012751	ATTC	2	8	11056	11063	25 %	50 %	0 %	25 %	238897262
30	NC_012751	TCAA	2	8	11559	11566	50 %	25 %	0 %	25 %	238897262
31	NC_012751	AAAG	2	8	11623	11630	75 %	0 %	25 %	0 %	238897262
32	NC_012751	TTGA	2	8	11894	11901	25 %	50 %	25 %	0 %	238897262
33	NC_012751	GAAA	2	8	12704	12711	75 %	0 %	25 %	0 %	238897263
34	NC_012751	GAAA	2	8	12713	12720	75 %	0 %	25 %	0 %	238897263
35	NC_012751	TCCC	2	8	13076	13083	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_012751	TTTA	2	8	13094	13101	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012751	TTCG	2	8	13196	13203	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_012751	AATT	2	8	13262	13269	50 %	50 %	0 %	0 %	238897264
39	NC_012751	ACTC	2	8	13339	13346	25 %	25 %	0 %	50 %	238897264
40	NC_012751	ATTT	2	8	13390	13397	25 %	75 %	0 %	0 %	238897264
41	NC_012751	CATT	2	8	13790	13797	25 %	50 %	0 %	25 %	238897264
42	NC_012751	AAAT	2	8	13939	13946	75 %	25 %	0 %	0 %	238897264
43	NC_012751	GGGC	2	8	14087	14094	0 %	0 %	75 %	25 %	238897264
44	NC_012751	GATT	2	8	14157	14164	25 %	50 %	25 %	0 %	238897264
45	NC_012751	ATTT	2	8	15061	15068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012751	CTTA	2	8	15878	15885	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_012751	AAAT	2	8	15891	15898	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012751	TTTA	2	8	16574	16581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_012751	TAAA	2	8	17055	17062	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012751	ATGA	2	8	17555	17562	50 %	25 %	25 %	0 %	238897267
51	NC_012751	ATTG	2	8	17719	17726	25 %	50 %	25 %	0 %	238897267
52	NC_012751	TAAA	2	8	17913	17920	75 %	25 %	0 %	0 %	238897267
53	NC_012751	TTTA	2	8	18901	18908	25 %	75 %	0 %	0 %	238897269
54	NC_012751	TGTC	2	8	19136	19143	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_012751	TGCA	2	8	19732	19739	25 %	25 %	25 %	25 %	238897270
56	NC_012751	GTTG	2	8	19807	19814	0 %	50 %	50 %	0 %	238897270
57	NC_012751	ATCG	2	8	20089	20096	25 %	25 %	25 %	25 %	238897270
58	NC_012751	GTTC	2	8	20192	20199	0 %	50 %	25 %	25 %	238897270
59	NC_012751	TCAA	2	8	20383	20390	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_012751	AATT	3	12	20395	20406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012751	ATTT	2	8	20459	20466	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012751	CAAT	2	8	20737	20744	50 %	25 %	0 %	25 %	238897271
63	NC_012751	AGAA	2	8	21060	21067	75 %	0 %	25 %	0 %	238897271
64	NC_012751	CAAC	2	8	21211	21218	50 %	0 %	0 %	50 %	238897271
65	NC_012751	AACC	2	8	21343	21350	50 %	0 %	0 %	50 %	238897271
66	NC_012751	TAAT	2	8	21517	21524	50 %	50 %	0 %	0 %	238897271
67	NC_012751	ATGG	2	8	21772	21779	25 %	25 %	50 %	0 %	238897272
68	NC_012751	ATCA	2	8	21888	21895	50 %	25 %	0 %	25 %	238897272
69	NC_012751	TGTT	2	8	22696	22703	0 %	75 %	25 %	0 %	238897272
70	NC_012751	AAAT	2	8	23778	23785	75 %	25 %	0 %	0 %	238897274
71	NC_012751	TCAG	2	8	23797	23804	25 %	25 %	25 %	25 %	238897274
72	NC_012751	GCCA	2	8	24083	24090	25 %	0 %	25 %	50 %	238897274
73	NC_012751	CAAT	2	8	24362	24369	50 %	25 %	0 %	25 %	238897274
74	NC_012751	CCAA	2	8	25093	25100	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_012751	CATG	2	8	25111	25118	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_012751	TTAA	2	8	25182	25189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012751	ATTC	2	8	25417	25424	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_012751	ATAA	2	8	25804	25811	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012751	TGAA	2	8	26171	26178	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012751	CATG	2	8	26582	26589	25 %	25 %	25 %	25 %	238897275
81	NC_012751	AATT	2	8	28006	28013	50 %	50 %	0 %	0 %	238897275
82	NC_012751	AAAC	2	8	28442	28449	75 %	0 %	0 %	25 %	238897276
83	NC_012751	TTAA	2	8	29236	29243	50 %	50 %	0 %	0 %	238897276
84	NC_012751	GGAG	2	8	29564	29571	25 %	0 %	75 %	0 %	238897277
85	NC_012751	ATTC	2	8	31469	31476	25 %	50 %	0 %	25 %	238897278
86	NC_012751	AAAT	2	8	31559	31566	75 %	25 %	0 %	0 %	238897278
87	NC_012751	AAAC	2	8	31789	31796	75 %	0 %	0 %	25 %	238897278
88	NC_012751	AAAT	2	8	32063	32070	75 %	25 %	0 %	0 %	238897279
89	NC_012751	ATCG	2	8	32405	32412	25 %	25 %	25 %	25 %	238897279
90	NC_012751	GTTG	2	8	32901	32908	0 %	50 %	50 %	0 %	238897279
91	NC_012751	ATGT	2	8	33041	33048	25 %	50 %	25 %	0 %	238897279
92	NC_012751	TCTT	2	8	33161	33168	0 %	75 %	0 %	25 %	238897279
93	NC_012751	ACAT	2	8	34009	34016	50 %	25 %	0 %	25 %	238897279
94	NC_012751	ATAG	2	8	34361	34368	50 %	25 %	25 %	0 %	238897279
95	NC_012751	TTTG	2	8	34471	34478	0 %	75 %	25 %	0 %	238897279
96	NC_012751	TAAG	2	8	34958	34965	50 %	25 %	25 %	0 %	238897279
97	NC_012751	TGAA	2	8	35100	35107	50 %	25 %	25 %	0 %	238897279
98	NC_012751	TGTT	2	8	35108	35115	0 %	75 %	25 %	0 %	238897279
99	NC_012751	TCAA	2	8	35496	35503	50 %	25 %	0 %	25 %	238897279
100	NC_012751	AATA	2	8	35599	35606	75 %	25 %	0 %	0 %	238897280
101	NC_012751	ATTG	2	8	35646	35653	25 %	50 %	25 %	0 %	238897280
102	NC_012751	TGTA	2	8	35668	35675	25 %	50 %	25 %	0 %	238897280
103	NC_012751	GACT	2	8	35931	35938	25 %	25 %	25 %	25 %	238897280
104	NC_012751	CCAG	2	8	36081	36088	25 %	0 %	25 %	50 %	238897280
105	NC_012751	TCTG	2	8	36151	36158	0 %	50 %	25 %	25 %	238897280
106	NC_012751	ATCG	2	8	36827	36834	25 %	25 %	25 %	25 %	238897280
107	NC_012751	TTCA	2	8	36921	36928	25 %	50 %	0 %	25 %	238897280
108	NC_012751	GCTG	2	8	37010	37017	0 %	25 %	50 %	25 %	238897280
109	NC_012751	AGAT	2	8	37142	37149	50 %	25 %	25 %	0 %	238897280
110	NC_012751	AAAT	2	8	37182	37189	75 %	25 %	0 %	0 %	238897280
111	NC_012751	TCTG	2	8	37641	37648	0 %	50 %	25 %	25 %	238897280
112	NC_012751	AAAT	2	8	37776	37783	75 %	25 %	0 %	0 %	238897280
113	NC_012751	AAGT	2	8	37959	37966	50 %	25 %	25 %	0 %	238897280
114	NC_012751	TTTA	2	8	38310	38317	25 %	75 %	0 %	0 %	238897280
115	NC_012751	CTTT	2	8	38656	38663	0 %	75 %	0 %	25 %	238897280
116	NC_012751	CTTG	2	8	39161	39168	0 %	50 %	25 %	25 %	238897281
117	NC_012751	CAAT	2	8	39258	39265	50 %	25 %	0 %	25 %	238897281
118	NC_012751	GTTT	2	8	39471	39478	0 %	75 %	25 %	0 %	238897282
119	NC_012751	ATTG	2	8	39584	39591	25 %	50 %	25 %	0 %	238897282
120	NC_012751	TAAA	2	8	39714	39721	75 %	25 %	0 %	0 %	238897282
121	NC_012751	TTTG	2	8	40317	40324	0 %	75 %	25 %	0 %	238897283
122	NC_012751	TTGT	2	8	40423	40430	0 %	75 %	25 %	0 %	238897283
123	NC_012751	TCAT	2	8	41044	41051	25 %	50 %	0 %	25 %	238897285
124	NC_012751	CAGC	2	8	41443	41450	25 %	0 %	25 %	50 %	238897286
125	NC_012751	ATAA	2	8	41669	41676	75 %	25 %	0 %	0 %	238897286
126	NC_012751	TTGC	2	8	42522	42529	0 %	50 %	25 %	25 %	238897286
127	NC_012751	ATTC	2	8	43356	43363	25 %	50 %	0 %	25 %	238897287
128	NC_012751	GCAG	2	8	43427	43434	25 %	0 %	50 %	25 %	238897287
129	NC_012751	AAAG	2	8	43507	43514	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_012751	TTCA	2	8	43733	43740	25 %	50 %	0 %	25 %	238897288
131	NC_012751	CATG	2	8	44107	44114	25 %	25 %	25 %	25 %	238897288
132	NC_012751	AATT	2	8	44135	44142	50 %	50 %	0 %	0 %	238897288
133	NC_012751	CCAG	2	8	45895	45902	25 %	0 %	25 %	50 %	238897289
134	NC_012751	GATC	2	8	47359	47366	25 %	25 %	25 %	25 %	238897290
135	NC_012751	TTGA	2	8	47624	47631	25 %	50 %	25 %	0 %	238897290
136	NC_012751	CAAA	2	8	47658	47665	75 %	0 %	0 %	25 %	238897290
137	NC_012751	TAAA	2	8	47981	47988	75 %	25 %	0 %	0 %	238897292
138	NC_012751	GCTT	2	8	48326	48333	0 %	50 %	25 %	25 %	238897292
139	NC_012751	ATCA	2	8	48621	48628	50 %	25 %	0 %	25 %	238897292
140	NC_012751	TAAT	2	8	48781	48788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_012751	TGAA	2	8	48797	48804	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012751	GCAA	2	8	49266	49273	50 %	0 %	25 %	25 %	238897293
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