MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 4516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012751	TTTA	2	8	25	32	25 %	75 %	0 %	0 %	238897252
2	NC_012751	GCTC	2	8	339	346	0 %	25 %	25 %	50 %	238897252
3	NC_012751	TAAT	2	8	1502	1509	50 %	50 %	0 %	0 %	238897253
4	NC_012751	GCTT	2	8	2841	2848	0 %	50 %	25 %	25 %	238897255
5	NC_012751	TCAA	2	8	3008	3015	50 %	25 %	0 %	25 %	238897255
6	NC_012751	TTAT	2	8	3143	3150	25 %	75 %	0 %	0 %	238897255
7	NC_012751	AAAC	2	8	4657	4664	75 %	0 %	0 %	25 %	238897256
8	NC_012751	TGAG	2	8	5454	5461	25 %	25 %	50 %	0 %	238897257
9	NC_012751	CTTC	2	8	5589	5596	0 %	50 %	0 %	50 %	238897257
10	NC_012751	AATA	2	8	5639	5646	75 %	25 %	0 %	0 %	238897257
11	NC_012751	TATT	2	8	6810	6817	25 %	75 %	0 %	0 %	238897259
12	NC_012751	TCAA	2	8	7456	7463	50 %	25 %	0 %	25 %	238897259
13	NC_012751	GATT	2	8	7553	7560	25 %	50 %	25 %	0 %	238897259
14	NC_012751	TCTT	2	8	9336	9343	0 %	75 %	0 %	25 %	238897260
15	NC_012751	GAAT	2	8	9840	9847	50 %	25 %	25 %	0 %	238897262
16	NC_012751	ATTT	2	8	10034	10041	25 %	75 %	0 %	0 %	238897262
17	NC_012751	TGTC	2	8	10945	10952	0 %	50 %	25 %	25 %	238897262
18	NC_012751	ATTC	2	8	11056	11063	25 %	50 %	0 %	25 %	238897262
19	NC_012751	TCAA	2	8	11559	11566	50 %	25 %	0 %	25 %	238897262
20	NC_012751	AAAG	2	8	11623	11630	75 %	0 %	25 %	0 %	238897262
21	NC_012751	TTGA	2	8	11894	11901	25 %	50 %	25 %	0 %	238897262
22	NC_012751	GAAA	2	8	12704	12711	75 %	0 %	25 %	0 %	238897263
23	NC_012751	GAAA	2	8	12713	12720	75 %	0 %	25 %	0 %	238897263
24	NC_012751	AATT	2	8	13262	13269	50 %	50 %	0 %	0 %	238897264
25	NC_012751	ACTC	2	8	13339	13346	25 %	25 %	0 %	50 %	238897264
26	NC_012751	ATTT	2	8	13390	13397	25 %	75 %	0 %	0 %	238897264
27	NC_012751	CATT	2	8	13790	13797	25 %	50 %	0 %	25 %	238897264
28	NC_012751	AAAT	2	8	13939	13946	75 %	25 %	0 %	0 %	238897264
29	NC_012751	GGGC	2	8	14087	14094	0 %	0 %	75 %	25 %	238897264
30	NC_012751	GATT	2	8	14157	14164	25 %	50 %	25 %	0 %	238897264
31	NC_012751	ATGA	2	8	17555	17562	50 %	25 %	25 %	0 %	238897267
32	NC_012751	ATTG	2	8	17719	17726	25 %	50 %	25 %	0 %	238897267
33	NC_012751	TAAA	2	8	17913	17920	75 %	25 %	0 %	0 %	238897267
34	NC_012751	TTTA	2	8	18901	18908	25 %	75 %	0 %	0 %	238897269
35	NC_012751	TGCA	2	8	19732	19739	25 %	25 %	25 %	25 %	238897270
36	NC_012751	GTTG	2	8	19807	19814	0 %	50 %	50 %	0 %	238897270
37	NC_012751	ATCG	2	8	20089	20096	25 %	25 %	25 %	25 %	238897270
38	NC_012751	GTTC	2	8	20192	20199	0 %	50 %	25 %	25 %	238897270
39	NC_012751	CAAT	2	8	20737	20744	50 %	25 %	0 %	25 %	238897271
40	NC_012751	AGAA	2	8	21060	21067	75 %	0 %	25 %	0 %	238897271
41	NC_012751	CAAC	2	8	21211	21218	50 %	0 %	0 %	50 %	238897271
42	NC_012751	AACC	2	8	21343	21350	50 %	0 %	0 %	50 %	238897271
43	NC_012751	TAAT	2	8	21517	21524	50 %	50 %	0 %	0 %	238897271
44	NC_012751	ATGG	2	8	21772	21779	25 %	25 %	50 %	0 %	238897272
45	NC_012751	ATCA	2	8	21888	21895	50 %	25 %	0 %	25 %	238897272
46	NC_012751	TGTT	2	8	22696	22703	0 %	75 %	25 %	0 %	238897272
47	NC_012751	AAAT	2	8	23778	23785	75 %	25 %	0 %	0 %	238897274
48	NC_012751	TCAG	2	8	23797	23804	25 %	25 %	25 %	25 %	238897274
49	NC_012751	GCCA	2	8	24083	24090	25 %	0 %	25 %	50 %	238897274
50	NC_012751	CAAT	2	8	24362	24369	50 %	25 %	0 %	25 %	238897274
51	NC_012751	CATG	2	8	26582	26589	25 %	25 %	25 %	25 %	238897275
52	NC_012751	AATT	2	8	28006	28013	50 %	50 %	0 %	0 %	238897275
53	NC_012751	AAAC	2	8	28442	28449	75 %	0 %	0 %	25 %	238897276
54	NC_012751	TTAA	2	8	29236	29243	50 %	50 %	0 %	0 %	238897276
55	NC_012751	GGAG	2	8	29564	29571	25 %	0 %	75 %	0 %	238897277
56	NC_012751	ATTC	2	8	31469	31476	25 %	50 %	0 %	25 %	238897278
57	NC_012751	AAAT	2	8	31559	31566	75 %	25 %	0 %	0 %	238897278
58	NC_012751	AAAC	2	8	31789	31796	75 %	0 %	0 %	25 %	238897278
59	NC_012751	AAAT	2	8	32063	32070	75 %	25 %	0 %	0 %	238897279
60	NC_012751	ATCG	2	8	32405	32412	25 %	25 %	25 %	25 %	238897279
61	NC_012751	GTTG	2	8	32901	32908	0 %	50 %	50 %	0 %	238897279
62	NC_012751	ATGT	2	8	33041	33048	25 %	50 %	25 %	0 %	238897279
63	NC_012751	TCTT	2	8	33161	33168	0 %	75 %	0 %	25 %	238897279
64	NC_012751	ACAT	2	8	34009	34016	50 %	25 %	0 %	25 %	238897279
65	NC_012751	ATAG	2	8	34361	34368	50 %	25 %	25 %	0 %	238897279
66	NC_012751	TTTG	2	8	34471	34478	0 %	75 %	25 %	0 %	238897279
67	NC_012751	TAAG	2	8	34958	34965	50 %	25 %	25 %	0 %	238897279
68	NC_012751	TGAA	2	8	35100	35107	50 %	25 %	25 %	0 %	238897279
69	NC_012751	TGTT	2	8	35108	35115	0 %	75 %	25 %	0 %	238897279
70	NC_012751	TCAA	2	8	35496	35503	50 %	25 %	0 %	25 %	238897279
71	NC_012751	AATA	2	8	35599	35606	75 %	25 %	0 %	0 %	238897280
72	NC_012751	ATTG	2	8	35646	35653	25 %	50 %	25 %	0 %	238897280
73	NC_012751	TGTA	2	8	35668	35675	25 %	50 %	25 %	0 %	238897280
74	NC_012751	GACT	2	8	35931	35938	25 %	25 %	25 %	25 %	238897280
75	NC_012751	CCAG	2	8	36081	36088	25 %	0 %	25 %	50 %	238897280
76	NC_012751	TCTG	2	8	36151	36158	0 %	50 %	25 %	25 %	238897280
77	NC_012751	ATCG	2	8	36827	36834	25 %	25 %	25 %	25 %	238897280
78	NC_012751	TTCA	2	8	36921	36928	25 %	50 %	0 %	25 %	238897280
79	NC_012751	GCTG	2	8	37010	37017	0 %	25 %	50 %	25 %	238897280
80	NC_012751	AGAT	2	8	37142	37149	50 %	25 %	25 %	0 %	238897280
81	NC_012751	AAAT	2	8	37182	37189	75 %	25 %	0 %	0 %	238897280
82	NC_012751	TCTG	2	8	37641	37648	0 %	50 %	25 %	25 %	238897280
83	NC_012751	AAAT	2	8	37776	37783	75 %	25 %	0 %	0 %	238897280
84	NC_012751	AAGT	2	8	37959	37966	50 %	25 %	25 %	0 %	238897280
85	NC_012751	TTTA	2	8	38310	38317	25 %	75 %	0 %	0 %	238897280
86	NC_012751	CTTT	2	8	38656	38663	0 %	75 %	0 %	25 %	238897280
87	NC_012751	CTTG	2	8	39161	39168	0 %	50 %	25 %	25 %	238897281
88	NC_012751	CAAT	2	8	39258	39265	50 %	25 %	0 %	25 %	238897281
89	NC_012751	GTTT	2	8	39471	39478	0 %	75 %	25 %	0 %	238897282
90	NC_012751	ATTG	2	8	39584	39591	25 %	50 %	25 %	0 %	238897282
91	NC_012751	TAAA	2	8	39714	39721	75 %	25 %	0 %	0 %	238897282
92	NC_012751	TTTG	2	8	40317	40324	0 %	75 %	25 %	0 %	238897283
93	NC_012751	TTGT	2	8	40423	40430	0 %	75 %	25 %	0 %	238897283
94	NC_012751	TCAT	2	8	41044	41051	25 %	50 %	0 %	25 %	238897285
95	NC_012751	CAGC	2	8	41443	41450	25 %	0 %	25 %	50 %	238897286
96	NC_012751	ATAA	2	8	41669	41676	75 %	25 %	0 %	0 %	238897286
97	NC_012751	TTGC	2	8	42522	42529	0 %	50 %	25 %	25 %	238897286
98	NC_012751	ATTC	2	8	43356	43363	25 %	50 %	0 %	25 %	238897287
99	NC_012751	GCAG	2	8	43427	43434	25 %	0 %	50 %	25 %	238897287
100	NC_012751	TTCA	2	8	43733	43740	25 %	50 %	0 %	25 %	238897288
101	NC_012751	CATG	2	8	44107	44114	25 %	25 %	25 %	25 %	238897288
102	NC_012751	AATT	2	8	44135	44142	50 %	50 %	0 %	0 %	238897288
103	NC_012751	CCAG	2	8	45895	45902	25 %	0 %	25 %	50 %	238897289
104	NC_012751	GATC	2	8	47359	47366	25 %	25 %	25 %	25 %	238897290
105	NC_012751	TTGA	2	8	47624	47631	25 %	50 %	25 %	0 %	238897290
106	NC_012751	CAAA	2	8	47658	47665	75 %	0 %	0 %	25 %	238897290
107	NC_012751	TAAA	2	8	47981	47988	75 %	25 %	0 %	0 %	238897292
108	NC_012751	GCTT	2	8	48326	48333	0 %	50 %	25 %	25 %	238897292
109	NC_012751	ATCA	2	8	48621	48628	50 %	25 %	0 %	25 %	238897292
110	NC_012751	GCAA	2	8	49266	49273	50 %	0 %	25 %	25 %	238897293
111	NC_012751	TTTG	2	8	49965	49972	0 %	75 %	25 %	0 %	238897294
112	NC_012751	GCAA	2	8	52583	52590	50 %	0 %	25 %	25 %	238897296
113	NC_012751	AATT	2	8	53136	53143	50 %	50 %	0 %	0 %	238897296
114	NC_012751	CTTG	2	8	54029	54036	0 %	50 %	25 %	25 %	238897297
115	NC_012751	TGTT	2	8	54091	54098	0 %	75 %	25 %	0 %	238897297
116	NC_012751	CTAT	2	8	54503	54510	25 %	50 %	0 %	25 %	238897297
117	NC_012751	GTTG	2	8	54736	54743	0 %	50 %	50 %	0 %	238897297
118	NC_012751	TTGG	2	8	55204	55211	0 %	50 %	50 %	0 %	238897298
119	NC_012751	TTTC	2	8	55889	55896	0 %	75 %	0 %	25 %	238897299
120	NC_012751	GTAA	2	8	56102	56109	50 %	25 %	25 %	0 %	238897299
121	NC_012751	CAGC	2	8	56183	56190	25 %	0 %	25 %	50 %	238897299
122	NC_012751	TCAA	2	8	56501	56508	50 %	25 %	0 %	25 %	238897300
123	NC_012751	AATG	2	8	56528	56535	50 %	25 %	25 %	0 %	238897300
124	NC_012751	GATA	2	8	56566	56573	50 %	25 %	25 %	0 %	238897300
125	NC_012751	AAAT	2	8	56870	56877	75 %	25 %	0 %	0 %	238897300
126	NC_012751	TAAA	2	8	57009	57016	75 %	25 %	0 %	0 %	238897300
127	NC_012751	GTCC	2	8	57019	57026	0 %	25 %	25 %	50 %	238897300
128	NC_012751	AACT	2	8	57424	57431	50 %	25 %	0 %	25 %	238897302
129	NC_012751	TGAT	2	8	58280	58287	25 %	50 %	25 %	0 %	238897302
130	NC_012751	GATT	2	8	58451	58458	25 %	50 %	25 %	0 %	238897302
131	NC_012751	ATTC	2	8	58956	58963	25 %	50 %	0 %	25 %	238897302
132	NC_012751	TAAT	2	8	59880	59887	50 %	50 %	0 %	0 %	238897304
133	NC_012751	AAAG	2	8	60002	60009	75 %	0 %	25 %	0 %	238897304
134	NC_012751	TGGC	2	8	63687	63694	0 %	25 %	50 %	25 %	238897307
135	NC_012751	GGCA	2	8	63810	63817	25 %	0 %	50 %	25 %	238897308
136	NC_012751	TTTA	2	8	64167	64174	25 %	75 %	0 %	0 %	238897308
137	NC_012751	CGAG	2	8	64424	64431	25 %	0 %	50 %	25 %	238897308
138	NC_012751	GCTT	2	8	64527	64534	0 %	50 %	25 %	25 %	238897308
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